MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 1547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011981	CCAG	2	8	161	168	25 %	0 %	25 %	50 %	222102413
2	NC_011981	TGCT	2	8	533	540	0 %	50 %	25 %	25 %	222102413
3	NC_011981	AAGG	2	8	766	773	50 %	0 %	50 %	0 %	222102413
4	NC_011981	ATCC	2	8	1546	1553	25 %	25 %	0 %	50 %	222102414
5	NC_011981	TCGA	2	8	1878	1885	25 %	25 %	25 %	25 %	222102414
6	NC_011981	GTGA	2	8	2431	2438	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011981	CTTG	2	8	2616	2623	0 %	50 %	25 %	25 %	222102415
8	NC_011981	TCGT	2	8	2807	2814	0 %	50 %	25 %	25 %	222102415
9	NC_011981	GTCC	2	8	3470	3477	0 %	25 %	25 %	50 %	222102415
10	NC_011981	TGAA	2	8	3690	3697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011981	TGCC	2	8	4254	4261	0 %	25 %	25 %	50 %	222102416
12	NC_011981	GATA	2	8	4391	4398	50 %	25 %	25 %	0 %	222102416
13	NC_011981	TCCT	2	8	5142	5149	0 %	50 %	0 %	50 %	222102416
14	NC_011981	CTCA	2	8	5191	5198	25 %	25 %	0 %	50 %	222102416
15	NC_011981	GTCG	2	8	5494	5501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011981	TCTG	2	8	5778	5785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011981	CTTG	2	8	6697	6704	0 %	50 %	25 %	25 %	222102417
18	NC_011981	ATGC	2	8	6734	6741	25 %	25 %	25 %	25 %	222102417
19	NC_011981	CTGT	2	8	6742	6749	0 %	50 %	25 %	25 %	222102417
20	NC_011981	CTTC	2	8	8578	8585	0 %	50 %	0 %	50 %	222102418
21	NC_011981	CGGG	3	12	8590	8601	0 %	0 %	75 %	25 %	222102418
22	NC_011981	GCTG	2	8	9254	9261	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011981	TCGT	2	8	10261	10268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011981	TTGA	2	8	11128	11135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011981	GATC	2	8	12136	12143	25 %	25 %	25 %	25 %	222102420
26	NC_011981	AATT	2	8	13216	13223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011981	CGAA	2	8	13884	13891	50 %	0 %	25 %	25 %	222102421
28	NC_011981	GTAA	2	8	14862	14869	50 %	25 %	25 %	0 %	222102421
29	NC_011981	GCGA	2	8	14913	14920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011981	CGTT	2	8	15612	15619	0 %	50 %	25 %	25 %	222102422
31	NC_011981	GACC	2	8	15740	15747	25 %	0 %	25 %	50 %	222102422
32	NC_011981	GCCT	2	8	16042	16049	0 %	25 %	25 %	50 %	222102422
33	NC_011981	CATC	2	8	16135	16142	25 %	25 %	0 %	50 %	222102422
34	NC_011981	TGCT	2	8	16347	16354	0 %	50 %	25 %	25 %	222102422
35	NC_011981	AGCG	2	8	16538	16545	25 %	0 %	50 %	25 %	222102422
36	NC_011981	TTCG	2	8	16546	16553	0 %	50 %	25 %	25 %	222102422
37	NC_011981	CACG	2	8	16786	16793	25 %	0 %	25 %	50 %	222102422
38	NC_011981	AGCC	2	8	18466	18473	25 %	0 %	25 %	50 %	222102423
39	NC_011981	CGCA	2	8	18713	18720	25 %	0 %	25 %	50 %	222102423
40	NC_011981	GTCG	2	8	18966	18973	0 %	25 %	50 %	25 %	222102424
41	NC_011981	CTTC	2	8	19541	19548	0 %	50 %	0 %	50 %	222102424
42	NC_011981	AGGG	2	8	19612	19619	25 %	0 %	75 %	0 %	222102424
43	NC_011981	TACA	2	8	19811	19818	50 %	25 %	0 %	25 %	222102425
44	NC_011981	TGAT	2	8	20493	20500	25 %	50 %	25 %	0 %	222102425
45	NC_011981	CAGG	2	8	20509	20516	25 %	0 %	50 %	25 %	222102425
46	NC_011981	TGGA	2	8	20723	20730	25 %	25 %	50 %	0 %	222102426
47	NC_011981	GCAA	2	8	20996	21003	50 %	0 %	25 %	25 %	222102426
48	NC_011981	GACG	2	8	21555	21562	25 %	0 %	50 %	25 %	222102426
49	NC_011981	CCCG	2	8	21723	21730	0 %	0 %	25 %	75 %	222102427
50	NC_011981	GTCC	2	8	22214	22221	0 %	25 %	25 %	50 %	222102427
51	NC_011981	CGAT	2	8	22489	22496	25 %	25 %	25 %	25 %	222102427
52	NC_011981	GCCT	2	8	22599	22606	0 %	25 %	25 %	50 %	222102427
53	NC_011981	AGCC	2	8	22924	22931	25 %	0 %	25 %	50 %	222102428
54	NC_011981	GATC	2	8	23429	23436	25 %	25 %	25 %	25 %	222102428
55	NC_011981	CATG	2	8	23477	23484	25 %	25 %	25 %	25 %	222102428
56	NC_011981	ATGG	2	8	23967	23974	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011981	TTTC	2	8	24285	24292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011981	GGCA	2	8	24734	24741	25 %	0 %	50 %	25 %	222102429
59	NC_011981	CGTG	2	8	26029	26036	0 %	25 %	50 %	25 %	222102430
60	NC_011981	CAAT	2	8	26137	26144	50 %	25 %	0 %	25 %	222102430
61	NC_011981	GATG	2	8	26955	26962	25 %	25 %	50 %	0 %	222102431
62	NC_011981	CCGC	2	8	27184	27191	0 %	0 %	25 %	75 %	222102431
63	NC_011981	AGGC	2	8	27798	27805	25 %	0 %	50 %	25 %	222102432
64	NC_011981	CCAG	2	8	28134	28141	25 %	0 %	25 %	50 %	222102432
65	NC_011981	TAAA	2	8	28274	28281	75 %	25 %	0 %	0 %	222102432
66	NC_011981	AGGA	2	8	28445	28452	50 %	0 %	50 %	0 %	222102432
67	NC_011981	AGGT	2	8	29296	29303	25 %	25 %	50 %	0 %	222102433
68	NC_011981	TCAT	2	8	29971	29978	25 %	50 %	0 %	25 %	222102433
69	NC_011981	AGAA	2	8	30437	30444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011981	GTGA	2	8	30522	30529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011981	GGTT	2	8	30958	30965	0 %	50 %	50 %	0 %	222102434
72	NC_011981	AGCG	2	8	31337	31344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011981	CGGG	2	8	32710	32717	0 %	0 %	75 %	25 %	222102436
74	NC_011981	TTCG	2	8	33226	33233	0 %	50 %	25 %	25 %	222102436
75	NC_011981	GTCC	2	8	33747	33754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011981	TGGC	2	8	34530	34537	0 %	25 %	50 %	25 %	222102437
77	NC_011981	CTGC	2	8	34596	34603	0 %	25 %	25 %	50 %	222102437
78	NC_011981	CGGA	2	8	34830	34837	25 %	0 %	50 %	25 %	222102437
79	NC_011981	CAGT	2	8	35969	35976	25 %	25 %	25 %	25 %	222102438
80	NC_011981	CCAG	2	8	36056	36063	25 %	0 %	25 %	50 %	222102438
81	NC_011981	TGGG	2	8	36088	36095	0 %	25 %	75 %	0 %	222102438
82	NC_011981	CGAA	2	8	36359	36366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011981	TCGA	2	8	36477	36484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011981	CGGC	2	8	36627	36634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011981	CCGT	2	8	37609	37616	0 %	25 %	25 %	50 %	222102440
86	NC_011981	ACTG	2	8	37788	37795	25 %	25 %	25 %	25 %	222102440
87	NC_011981	TTGC	2	8	38823	38830	0 %	50 %	25 %	25 %	222102441
88	NC_011981	GATG	2	8	38936	38943	25 %	25 %	50 %	0 %	222102441
89	NC_011981	GGTC	2	8	39050	39057	0 %	25 %	50 %	25 %	222102441
90	NC_011981	GGCA	2	8	39173	39180	25 %	0 %	50 %	25 %	222102441
91	NC_011981	CGGC	2	8	39673	39680	0 %	0 %	50 %	50 %	222102442
92	NC_011981	CGAA	2	8	40036	40043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011981	CGTA	2	8	40501	40508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011981	TGAT	2	8	41666	41673	25 %	50 %	25 %	0 %	222102446
95	NC_011981	AGCG	2	8	41709	41716	25 %	0 %	50 %	25 %	222102446
96	NC_011981	GCAG	2	8	41733	41740	25 %	0 %	50 %	25 %	222102446
97	NC_011981	GCAT	2	8	42071	42078	25 %	25 %	25 %	25 %	222102446
98	NC_011981	GATC	2	8	42120	42127	25 %	25 %	25 %	25 %	222102446
99	NC_011981	CATG	2	8	42705	42712	25 %	25 %	25 %	25 %	222102446
100	NC_011981	GGAT	2	8	43360	43367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011981	CATA	2	8	44459	44466	50 %	25 %	0 %	25 %	222102449
102	NC_011981	GGCT	2	8	44563	44570	0 %	25 %	50 %	25 %	222102450
103	NC_011981	GCTG	2	8	44749	44756	0 %	25 %	50 %	25 %	222102450
104	NC_011981	GATC	2	8	44891	44898	25 %	25 %	25 %	25 %	222102450
105	NC_011981	GTGC	2	8	45080	45087	0 %	25 %	50 %	25 %	222102451
106	NC_011981	CGGC	2	8	45369	45376	0 %	0 %	50 %	50 %	222102451
107	NC_011981	GTGC	2	8	46137	46144	0 %	25 %	50 %	25 %	222102452
108	NC_011981	GCCA	2	8	46349	46356	25 %	0 %	25 %	50 %	222102452
109	NC_011981	TCGG	2	8	46489	46496	0 %	25 %	50 %	25 %	222102452
110	NC_011981	CCTG	2	8	46820	46827	0 %	25 %	25 %	50 %	222102452
111	NC_011981	CTGC	2	8	47445	47452	0 %	25 %	25 %	50 %	222102453
112	NC_011981	TCCG	3	12	47699	47710	0 %	25 %	25 %	50 %	222102453
113	NC_011981	GTTG	2	8	47780	47787	0 %	50 %	50 %	0 %	222102453
114	NC_011981	GTTG	2	8	47820	47827	0 %	50 %	50 %	0 %	222102453
115	NC_011981	GATC	2	8	47936	47943	25 %	25 %	25 %	25 %	222102453
116	NC_011981	ATCC	2	8	47983	47990	25 %	25 %	0 %	50 %	222102453
117	NC_011981	TCGG	2	8	48009	48016	0 %	25 %	50 %	25 %	222102453
118	NC_011981	AATC	2	8	49209	49216	50 %	25 %	0 %	25 %	222102454
119	NC_011981	GCCG	2	8	49955	49962	0 %	0 %	50 %	50 %	222102455
120	NC_011981	ATCG	2	8	50219	50226	25 %	25 %	25 %	25 %	222102455
121	NC_011981	GCGG	2	8	51523	51530	0 %	0 %	75 %	25 %	222102455
122	NC_011981	CGGC	2	8	51605	51612	0 %	0 %	50 %	50 %	222102455
123	NC_011981	ATCA	2	8	52167	52174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011981	GCAA	2	8	52419	52426	50 %	0 %	25 %	25 %	222102456
125	NC_011981	TTGA	2	8	52558	52565	25 %	50 %	25 %	0 %	222102456
126	NC_011981	CAGG	2	8	52888	52895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011981	ACTC	2	8	53020	53027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011981	GGGC	2	8	53037	53044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011981	CAAA	2	8	53049	53056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011981	GCGT	2	8	53881	53888	0 %	25 %	50 %	25 %	222102458
131	NC_011981	GCGG	2	8	54347	54354	0 %	0 %	75 %	25 %	222102458
132	NC_011981	TGTC	2	8	54370	54377	0 %	50 %	25 %	25 %	222102458
133	NC_011981	TCGC	2	8	54761	54768	0 %	25 %	25 %	50 %	222102458
134	NC_011981	CGCT	2	8	54845	54852	0 %	25 %	25 %	50 %	222102458
135	NC_011981	GAAC	2	8	55285	55292	50 %	0 %	25 %	25 %	222102458
136	NC_011981	GCCC	2	8	55536	55543	0 %	0 %	25 %	75 %	222102459
137	NC_011981	CAGC	2	8	56093	56100	25 %	0 %	25 %	50 %	222102461
138	NC_011981	CGAT	2	8	56189	56196	25 %	25 %	25 %	25 %	222102461
139	NC_011981	GATG	2	8	56659	56666	25 %	25 %	50 %	0 %	222102461
140	NC_011981	CCAT	2	8	56762	56769	25 %	25 %	0 %	50 %	222102461
141	NC_011981	GCGT	2	8	56816	56823	0 %	25 %	50 %	25 %	222102461
142	NC_011981	CGAT	2	8	57053	57060	25 %	25 %	25 %	25 %	222102461
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