MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 1547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011981	TGCC	2	8	199698	199705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_011981	CCGA	2	8	201113	201120	25 %	0 %	25 %	50 %	222102594
503	NC_011981	CGAT	2	8	201345	201352	25 %	25 %	25 %	25 %	222102594
504	NC_011981	ATCT	2	8	202179	202186	25 %	50 %	0 %	25 %	222102595
505	NC_011981	GGCG	2	8	202601	202608	0 %	0 %	75 %	25 %	222102595
506	NC_011981	CGCT	2	8	202734	202741	0 %	25 %	25 %	50 %	222102596
507	NC_011981	ATCT	2	8	203276	203283	25 %	50 %	0 %	25 %	222102596
508	NC_011981	CGCT	2	8	203480	203487	0 %	25 %	25 %	50 %	222102597
509	NC_011981	TCTT	2	8	203918	203925	0 %	75 %	0 %	25 %	222102597
510	NC_011981	GATC	2	8	204387	204394	25 %	25 %	25 %	25 %	222102597
511	NC_011981	GATT	2	8	204924	204931	25 %	50 %	25 %	0 %	222102597
512	NC_011981	CGGC	2	8	205083	205090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_011981	TGTC	2	8	206186	206193	0 %	50 %	25 %	25 %	222102599
514	NC_011981	GTAT	2	8	206374	206381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011981	ACTG	2	8	206489	206496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_011981	ATGG	2	8	206637	206644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011981	TGGT	2	8	206709	206716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011981	TTTC	2	8	207619	207626	0 %	75 %	0 %	25 %	222102600
519	NC_011981	CAGC	2	8	207780	207787	25 %	0 %	25 %	50 %	222102600
520	NC_011981	GGCA	2	8	208225	208232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_011981	CACC	2	8	208444	208451	25 %	0 %	0 %	75 %	222102601
522	NC_011981	CCCG	2	8	208502	208509	0 %	0 %	25 %	75 %	222102601
523	NC_011981	CGAT	2	8	208515	208522	25 %	25 %	25 %	25 %	222102601
524	NC_011981	GGCA	2	8	209001	209008	25 %	0 %	50 %	25 %	222102601
525	NC_011981	GCTG	2	8	209286	209293	0 %	25 %	50 %	25 %	222102602
526	NC_011981	TCGA	2	8	209334	209341	25 %	25 %	25 %	25 %	222102602
527	NC_011981	CCCG	2	8	209678	209685	0 %	0 %	25 %	75 %	222102602
528	NC_011981	CTGT	2	8	210957	210964	0 %	50 %	25 %	25 %	222102603
529	NC_011981	CTGC	2	8	211021	211028	0 %	25 %	25 %	50 %	222102604
530	NC_011981	CAGA	2	8	212029	212036	50 %	0 %	25 %	25 %	222102604
531	NC_011981	CCAT	2	8	212442	212449	25 %	25 %	0 %	50 %	222102605
532	NC_011981	GCCA	2	8	213265	213272	25 %	0 %	25 %	50 %	222102606
533	NC_011981	GGCA	2	8	213574	213581	25 %	0 %	50 %	25 %	222102606
534	NC_011981	CGGA	2	8	214047	214054	25 %	0 %	50 %	25 %	222102606
535	NC_011981	AACG	2	8	214376	214383	50 %	0 %	25 %	25 %	222102606
536	NC_011981	CTTC	2	8	215285	215292	0 %	50 %	0 %	50 %	222102607
537	NC_011981	CAGC	2	8	215657	215664	25 %	0 %	25 %	50 %	222102607
538	NC_011981	CATG	2	8	217067	217074	25 %	25 %	25 %	25 %	222102609
539	NC_011981	GATC	2	8	217118	217125	25 %	25 %	25 %	25 %	222102609
540	NC_011981	CAAA	2	8	217696	217703	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_011981	TGAT	2	8	217912	217919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011981	TCGG	2	8	218242	218249	0 %	25 %	50 %	25 %	222102610
543	NC_011981	GCGA	2	8	218945	218952	25 %	0 %	50 %	25 %	222102611
544	NC_011981	CGAT	2	8	219131	219138	25 %	25 %	25 %	25 %	222102612
545	NC_011981	GAGC	2	8	219366	219373	25 %	0 %	50 %	25 %	222102613
546	NC_011981	CGAT	2	8	219543	219550	25 %	25 %	25 %	25 %	222102613
547	NC_011981	CATG	2	8	219756	219763	25 %	25 %	25 %	25 %	222102613
548	NC_011981	TGCT	2	8	220020	220027	0 %	50 %	25 %	25 %	222102613
549	NC_011981	TGAG	2	8	220194	220201	25 %	25 %	50 %	0 %	222102613
550	NC_011981	TCCA	2	8	220581	220588	25 %	25 %	0 %	50 %	222102614
551	NC_011981	TGCC	2	8	221517	221524	0 %	25 %	25 %	50 %	222102615
552	NC_011981	AACC	2	8	222264	222271	50 %	0 %	0 %	50 %	222102615
553	NC_011981	GCCC	2	8	222853	222860	0 %	0 %	25 %	75 %	222102616
554	NC_011981	CAGG	2	8	222959	222966	25 %	0 %	50 %	25 %	222102616
555	NC_011981	GGAT	2	8	223171	223178	25 %	25 %	50 %	0 %	222102616
556	NC_011981	TTGT	2	8	223287	223294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011981	GTCT	2	8	223326	223333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
558	NC_011981	CCAT	2	8	223986	223993	25 %	25 %	0 %	50 %	222102617
559	NC_011981	CCGC	2	8	224267	224274	0 %	0 %	25 %	75 %	222102617
560	NC_011981	AAAC	2	8	224546	224553	75 %	0 %	0 %	25 %	222102617
561	NC_011981	GGGA	2	8	224720	224727	25 %	0 %	75 %	0 %	222102617
562	NC_011981	ACCG	2	8	224853	224860	25 %	0 %	25 %	50 %	222102617
563	NC_011981	AGCG	2	8	225807	225814	25 %	0 %	50 %	25 %	222102618
564	NC_011981	GCAC	2	8	225903	225910	25 %	0 %	25 %	50 %	222102618
565	NC_011981	GATC	2	8	226040	226047	25 %	25 %	25 %	25 %	222102618
566	NC_011981	GACA	2	8	226396	226403	50 %	0 %	25 %	25 %	222102619
567	NC_011981	AGCC	2	8	226532	226539	25 %	0 %	25 %	50 %	222102619
568	NC_011981	CCTT	2	8	227214	227221	0 %	50 %	0 %	50 %	222102620
569	NC_011981	GTTC	2	8	227566	227573	0 %	50 %	25 %	25 %	222102620
570	NC_011981	GGAA	2	8	228204	228211	50 %	0 %	50 %	0 %	222102620
571	NC_011981	TCGG	2	8	228306	228313	0 %	25 %	50 %	25 %	222102620
572	NC_011981	CCGC	2	8	229271	229278	0 %	0 %	25 %	75 %	222102621
573	NC_011981	CGAG	2	8	229384	229391	25 %	0 %	50 %	25 %	222102621
574	NC_011981	TTCG	2	8	229467	229474	0 %	50 %	25 %	25 %	222102621
575	NC_011981	TACA	2	8	229994	230001	50 %	25 %	0 %	25 %	222102621
576	NC_011981	ATGG	2	8	230083	230090	25 %	25 %	50 %	0 %	222102621
577	NC_011981	TAGC	2	8	230143	230150	25 %	25 %	25 %	25 %	222102621
578	NC_011981	GCGG	2	8	230638	230645	0 %	0 %	75 %	25 %	222102622
579	NC_011981	GGCA	2	8	231687	231694	25 %	0 %	50 %	25 %	222102622
580	NC_011981	GGGC	2	8	231858	231865	0 %	0 %	75 %	25 %	222102622
581	NC_011981	GGTG	2	8	232080	232087	0 %	25 %	75 %	0 %	222102622
582	NC_011981	CCAG	2	8	232790	232797	25 %	0 %	25 %	50 %	222102622
583	NC_011981	ATTG	2	8	233548	233555	25 %	50 %	25 %	0 %	222102623
584	NC_011981	ATGG	2	8	234330	234337	25 %	25 %	50 %	0 %	222102624
585	NC_011981	GCGG	2	8	234563	234570	0 %	0 %	75 %	25 %	222102624
586	NC_011981	GTCG	2	8	235226	235233	0 %	25 %	50 %	25 %	222102625
587	NC_011981	GTCG	2	8	235777	235784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
588	NC_011981	AGCA	2	8	235872	235879	50 %	0 %	25 %	25 %	222102626
589	NC_011981	CAGC	2	8	236097	236104	25 %	0 %	25 %	50 %	222102626
590	NC_011981	CGCC	2	8	236294	236301	0 %	0 %	25 %	75 %	222102626
591	NC_011981	GCCA	2	8	236436	236443	25 %	0 %	25 %	50 %	222102626
592	NC_011981	CTCA	2	8	237130	237137	25 %	25 %	0 %	50 %	222102627
593	NC_011981	TCGC	2	8	237269	237276	0 %	25 %	25 %	50 %	222102627
594	NC_011981	GAAG	2	8	237277	237284	50 %	0 %	50 %	0 %	222102627
595	NC_011981	CGGG	2	8	237783	237790	0 %	0 %	75 %	25 %	222102627
596	NC_011981	CGCT	2	8	238275	238282	0 %	25 %	25 %	50 %	222102628
597	NC_011981	TCAA	2	8	238797	238804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
598	NC_011981	GCAA	2	8	239128	239135	50 %	0 %	25 %	25 %	222102629
599	NC_011981	GGTG	2	8	239455	239462	0 %	25 %	75 %	0 %	222102629
600	NC_011981	CCTC	2	8	239963	239970	0 %	25 %	0 %	75 %	222102630
601	NC_011981	GGCT	2	8	240158	240165	0 %	25 %	50 %	25 %	222102630
602	NC_011981	GATG	2	8	240303	240310	25 %	25 %	50 %	0 %	222102630
603	NC_011981	TCAG	2	8	240879	240886	25 %	25 %	25 %	25 %	222102631
604	NC_011981	ATCG	2	8	241155	241162	25 %	25 %	25 %	25 %	222102631
605	NC_011981	TCTG	2	8	241256	241263	0 %	50 %	25 %	25 %	222102631
606	NC_011981	GCTT	2	8	241427	241434	0 %	50 %	25 %	25 %	222102631
607	NC_011981	CCGA	2	8	241587	241594	25 %	0 %	25 %	50 %	222102631
608	NC_011981	TGGG	2	8	241966	241973	0 %	25 %	75 %	0 %	222102631
609	NC_011981	AATC	2	8	242981	242988	50 %	25 %	0 %	25 %	222102631
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611	NC_011981	GGAT	2	8	243798	243805	25 %	25 %	50 %	0 %	222102632
612	NC_011981	AAGC	2	8	243859	243866	50 %	0 %	25 %	25 %	222102632
613	NC_011981	GGTC	2	8	244251	244258	0 %	25 %	50 %	25 %	222102632
614	NC_011981	TTGG	2	8	244664	244671	0 %	50 %	50 %	0 %	222102632
615	NC_011981	AGTC	2	8	245047	245054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_011981	CTGA	2	8	245070	245077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
617	NC_011981	ACGC	2	8	245109	245116	25 %	0 %	25 %	50 %	222102633
618	NC_011981	CTTC	2	8	245349	245356	0 %	50 %	0 %	50 %	222102633
619	NC_011981	AAGC	2	8	245838	245845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_011981	GACG	2	8	246392	246399	25 %	0 %	50 %	25 %	222102634
621	NC_011981	CCGG	2	8	246770	246777	0 %	0 %	50 %	50 %	222102635
622	NC_011981	GGCA	2	8	246831	246838	25 %	0 %	50 %	25 %	222102635
623	NC_011981	GCAA	2	8	247942	247949	50 %	0 %	25 %	25 %	222102636
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630	NC_011981	GCCT	2	8	249008	249015	0 %	25 %	25 %	50 %	222102637
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632	NC_011981	ACAG	2	8	249613	249620	50 %	0 %	25 %	25 %	222102637
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