MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 1547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011981	GATT	2	8	398119	398126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011981	ATGG	2	8	398426	398433	25 %	25 %	50 %	0 %	222102743
1003	NC_011981	GGGC	2	8	398572	398579	0 %	0 %	75 %	25 %	222102743
1004	NC_011981	CCTG	2	8	399852	399859	0 %	25 %	25 %	50 %	222102745
1005	NC_011981	CCCT	2	8	399998	400005	0 %	25 %	0 %	75 %	222102745
1006	NC_011981	GAGG	2	8	400452	400459	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011981	CCAC	2	8	402187	402194	25 %	0 %	0 %	75 %	222102748
1008	NC_011981	AGAT	2	8	402271	402278	50 %	25 %	25 %	0 %	222102748
1009	NC_011981	CTTG	2	8	402404	402411	0 %	50 %	25 %	25 %	222102748
1010	NC_011981	CGCC	2	8	402716	402723	0 %	0 %	25 %	75 %	222102748
1011	NC_011981	CCGA	2	8	402811	402818	25 %	0 %	25 %	50 %	222102748
1012	NC_011981	AATC	2	8	402819	402826	50 %	25 %	0 %	25 %	222102748
1013	NC_011981	CCGC	2	8	403196	403203	0 %	0 %	25 %	75 %	222102749
1014	NC_011981	CAGC	2	8	403696	403703	25 %	0 %	25 %	50 %	222102749
1015	NC_011981	AGAT	2	8	404651	404658	50 %	25 %	25 %	0 %	222102751
1016	NC_011981	GTCG	2	8	406160	406167	0 %	25 %	50 %	25 %	222102752
1017	NC_011981	CATT	2	8	408041	408048	25 %	50 %	0 %	25 %	222102753
1018	NC_011981	TCAT	2	8	408434	408441	25 %	50 %	0 %	25 %	222102753
1019	NC_011981	TGGT	2	8	408635	408642	0 %	50 %	50 %	0 %	222102753
1020	NC_011981	GCGT	2	8	409104	409111	0 %	25 %	50 %	25 %	222102754
1021	NC_011981	CGGA	2	8	409243	409250	25 %	0 %	50 %	25 %	222102754
1022	NC_011981	TGGC	2	8	410483	410490	0 %	25 %	50 %	25 %	222102755
1023	NC_011981	AATC	2	8	410627	410634	50 %	25 %	0 %	25 %	222102755
1024	NC_011981	CGGA	2	8	411567	411574	25 %	0 %	50 %	25 %	222102757
1025	NC_011981	GTTT	3	12	412413	412424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011981	TGGC	2	8	413312	413319	0 %	25 %	50 %	25 %	222102758
1027	NC_011981	GCTG	2	8	413778	413785	0 %	25 %	50 %	25 %	222102758
1028	NC_011981	CCGT	2	8	414055	414062	0 %	25 %	25 %	50 %	222102758
1029	NC_011981	CAGG	2	8	414584	414591	25 %	0 %	50 %	25 %	222102758
1030	NC_011981	TCAG	2	8	415399	415406	25 %	25 %	25 %	25 %	222102758
1031	NC_011981	AAGC	2	8	415442	415449	50 %	0 %	25 %	25 %	222102758
1032	NC_011981	GTCG	2	8	415476	415483	0 %	25 %	50 %	25 %	222102758
1033	NC_011981	TTTG	2	8	416164	416171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011981	CAAA	2	8	416530	416537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_011981	TCCA	2	8	417313	417320	25 %	25 %	0 %	50 %	222102759
1036	NC_011981	GACC	2	8	417549	417556	25 %	0 %	25 %	50 %	222102759
1037	NC_011981	ATCC	2	8	417633	417640	25 %	25 %	0 %	50 %	222102759
1038	NC_011981	TGTT	2	8	418067	418074	0 %	75 %	25 %	0 %	222102760
1039	NC_011981	GCGT	2	8	418475	418482	0 %	25 %	50 %	25 %	222102760
1040	NC_011981	GCCC	2	8	418767	418774	0 %	0 %	25 %	75 %	222102761
1041	NC_011981	CTGC	2	8	418844	418851	0 %	25 %	25 %	50 %	222102761
1042	NC_011981	CTGC	2	8	419543	419550	0 %	25 %	25 %	50 %	222102762
1043	NC_011981	TGAT	2	8	419629	419636	25 %	50 %	25 %	0 %	222102762
1044	NC_011981	GGCG	2	8	420230	420237	0 %	0 %	75 %	25 %	222102762
1045	NC_011981	AAGG	2	8	420405	420412	50 %	0 %	50 %	0 %	222102762
1046	NC_011981	GCCA	2	8	420793	420800	25 %	0 %	25 %	50 %	222102763
1047	NC_011981	AGAA	2	8	420900	420907	75 %	0 %	25 %	0 %	222102763
1048	NC_011981	AGAT	2	8	421486	421493	50 %	25 %	25 %	0 %	222102763
1049	NC_011981	AAAG	2	8	422237	422244	75 %	0 %	25 %	0 %	222102764
1050	NC_011981	AAAG	2	8	422775	422782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011981	TTGA	2	8	423213	423220	25 %	50 %	25 %	0 %	222102765
1052	NC_011981	CAGA	2	8	423276	423283	50 %	0 %	25 %	25 %	222102765
1053	NC_011981	GGAT	2	8	425074	425081	25 %	25 %	50 %	0 %	222102767
1054	NC_011981	AGCG	2	8	425186	425193	25 %	0 %	50 %	25 %	222102767
1055	NC_011981	CTGT	2	8	425723	425730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_011981	ACCG	2	8	426303	426310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_011981	TCTT	2	8	426373	426380	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_011981	TGTC	2	8	426609	426616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_011981	CGAC	2	8	427340	427347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_011981	GCCT	2	8	427475	427482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_011981	GTCT	2	8	427653	427660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_011981	GATG	2	8	428046	428053	25 %	25 %	50 %	0 %	222102769
1063	NC_011981	GCCT	2	8	428178	428185	0 %	25 %	25 %	50 %	222102769
1064	NC_011981	GCGG	2	8	428539	428546	0 %	0 %	75 %	25 %	222102769
1065	NC_011981	GATG	2	8	428554	428561	25 %	25 %	50 %	0 %	222102769
1066	NC_011981	GAAG	2	8	428997	429004	50 %	0 %	50 %	0 %	222102769
1067	NC_011981	CAGA	2	8	429186	429193	50 %	0 %	25 %	25 %	222102769
1068	NC_011981	CGAT	2	8	429280	429287	25 %	25 %	25 %	25 %	222102770
1069	NC_011981	ATCG	2	8	429482	429489	25 %	25 %	25 %	25 %	222102770
1070	NC_011981	GTCG	2	8	429933	429940	0 %	25 %	50 %	25 %	222102770
1071	NC_011981	CCAG	2	8	431111	431118	25 %	0 %	25 %	50 %	222102771
1072	NC_011981	TCAA	2	8	431488	431495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_011981	TTGA	2	8	431614	431621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011981	GCTC	2	8	431847	431854	0 %	25 %	25 %	50 %	222102772
1075	NC_011981	GGAG	2	8	432472	432479	25 %	0 %	75 %	0 %	222102772
1076	NC_011981	ATCA	2	8	432939	432946	50 %	25 %	0 %	25 %	222102773
1077	NC_011981	ATCA	2	8	432969	432976	50 %	25 %	0 %	25 %	222102773
1078	NC_011981	CTGC	2	8	433188	433195	0 %	25 %	25 %	50 %	222102773
1079	NC_011981	AGCA	2	8	433539	433546	50 %	0 %	25 %	25 %	222102773
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1081	NC_011981	GCTG	2	8	434985	434992	0 %	25 %	50 %	25 %	222102775
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1083	NC_011981	CGGG	2	8	435392	435399	0 %	0 %	75 %	25 %	222102775
1084	NC_011981	GGCC	2	8	435645	435652	0 %	0 %	50 %	50 %	222102776
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1086	NC_011981	TGCC	2	8	436841	436848	0 %	25 %	25 %	50 %	222102777
1087	NC_011981	CCTG	2	8	437117	437124	0 %	25 %	25 %	50 %	222102777
1088	NC_011981	ATCG	2	8	438126	438133	25 %	25 %	25 %	25 %	222102778
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1091	NC_011981	CAGC	2	8	439526	439533	25 %	0 %	25 %	50 %	222102780
1092	NC_011981	GGCG	2	8	439539	439546	0 %	0 %	75 %	25 %	222102780
1093	NC_011981	GGGC	2	8	440840	440847	0 %	0 %	75 %	25 %	222102781
1094	NC_011981	GGCA	2	8	440856	440863	25 %	0 %	50 %	25 %	222102781
1095	NC_011981	GCTG	2	8	441062	441069	0 %	25 %	50 %	25 %	222102781
1096	NC_011981	ATTG	2	8	441823	441830	25 %	50 %	25 %	0 %	222102781
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1099	NC_011981	TTCA	2	8	443227	443234	25 %	50 %	0 %	25 %	222102781
1100	NC_011981	TTCA	2	8	443353	443360	25 %	50 %	0 %	25 %	222102781
1101	NC_011981	AGGA	2	8	443713	443720	50 %	0 %	50 %	0 %	222102782
1102	NC_011981	GATG	2	8	444110	444117	25 %	25 %	50 %	0 %	222102782
1103	NC_011981	CTTG	2	8	444282	444289	0 %	50 %	25 %	25 %	222102782
1104	NC_011981	GTCT	2	8	444327	444334	0 %	50 %	25 %	25 %	222102782
1105	NC_011981	ATGG	2	8	444724	444731	25 %	25 %	50 %	0 %	222102782
1106	NC_011981	CCCG	2	8	444977	444984	0 %	0 %	25 %	75 %	222102783
1107	NC_011981	GGCG	2	8	445777	445784	0 %	0 %	75 %	25 %	222102783
1108	NC_011981	TTGA	2	8	446431	446438	25 %	50 %	25 %	0 %	222102784
1109	NC_011981	TGAG	2	8	446465	446472	25 %	25 %	50 %	0 %	222102784
1110	NC_011981	CTGG	2	8	447137	447144	0 %	25 %	50 %	25 %	222102785
1111	NC_011981	GGTC	2	8	447545	447552	0 %	25 %	50 %	25 %	222102785
1112	NC_011981	TGCC	2	8	449695	449702	0 %	25 %	25 %	50 %	222102786
1113	NC_011981	CTGG	2	8	450143	450150	0 %	25 %	50 %	25 %	222102786
1114	NC_011981	GCTC	2	8	450184	450191	0 %	25 %	25 %	50 %	222102786
1115	NC_011981	CGGG	2	8	450872	450879	0 %	0 %	75 %	25 %	222102787
1116	NC_011981	GCAA	2	8	451387	451394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_011981	TCAG	2	8	451727	451734	25 %	25 %	25 %	25 %	222102788
1118	NC_011981	ATAA	2	8	452700	452707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011981	AGGC	2	8	453013	453020	25 %	0 %	50 %	25 %	222102789
1120	NC_011981	AAAG	2	8	453488	453495	75 %	0 %	25 %	0 %	222102789
1121	NC_011981	TCGA	2	8	453817	453824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_011981	ATCC	2	8	454030	454037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_011981	GGCC	2	8	455112	455119	0 %	0 %	50 %	50 %	222102790
1124	NC_011981	GGAA	2	8	455302	455309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011981	CATC	2	8	455433	455440	25 %	25 %	0 %	50 %	222102791
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1129	NC_011981	GCAA	2	8	456266	456273	50 %	0 %	25 %	25 %	222102792
1130	NC_011981	TCGC	2	8	456835	456842	0 %	25 %	25 %	50 %	222102793
1131	NC_011981	ATCA	2	8	456920	456927	50 %	25 %	0 %	25 %	222102793
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