MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009922	TTAAT	2	10	86	95	40 %	60 %	0 %	0 %	158319060
2	NC_009922	AAGAA	2	10	1186	1195	80 %	0 %	20 %	0 %	158319060
3	NC_009922	ACAAT	2	10	2702	2711	60 %	20 %	0 %	20 %	158319061
4	NC_009922	AATCG	2	10	3352	3361	40 %	20 %	20 %	20 %	158319063
5	NC_009922	TAAAG	2	10	3451	3460	60 %	20 %	20 %	0 %	158319063
6	NC_009922	AAAGA	2	10	3947	3956	80 %	0 %	20 %	0 %	158319063
7	NC_009922	TCAAA	2	10	4637	4646	60 %	20 %	0 %	20 %	158319064
8	NC_009922	AGAAC	2	10	4736	4745	60 %	0 %	20 %	20 %	158319064
9	NC_009922	TTTAT	2	10	4814	4823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009922	AAAAG	2	10	5804	5813	80 %	0 %	20 %	0 %	158319065
11	NC_009922	AAATC	2	10	9424	9433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009922	AAATC	2	10	10182	10191	60 %	20 %	0 %	20 %	158319068
13	NC_009922	AGGAG	2	10	11992	12001	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009922	CCTTC	2	10	12352	12361	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009922	TCGTG	2	10	12401	12410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009922	AAGAT	2	10	15913	15922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009922	AACAG	2	10	17189	17198	60 %	0 %	20 %	20 %	158319071
18	NC_009922	ATTTT	2	10	17866	17875	20 %	80 %	0 %	0 %	158319071
19	NC_009922	AGAGA	2	10	19009	19018	60 %	0 %	40 %	0 %	158319073
20	NC_009922	AAAAG	2	10	20684	20693	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009922	TTCGA	2	10	20886	20895	20 %	40 %	20 %	20 %	158319075
22	NC_009922	AGGGT	2	10	24362	24371	20 %	20 %	60 %	0 %	158319078
23	NC_009922	ACTTT	2	10	24385	24394	20 %	60 %	0 %	20 %	158319078
24	NC_009922	ATTGG	2	10	25653	25662	20 %	40 %	40 %	0 %	158319079
25	NC_009922	AAAAT	3	15	26305	26319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009922	TGGAA	2	10	27327	27336	40 %	20 %	40 %	0 %	158319081
27	NC_009922	ATGAT	2	10	29779	29788	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009922	GAAAA	2	10	30156	30165	80 %	0 %	20 %	0 %	158319085
29	NC_009922	AAAAT	2	10	31256	31265	80 %	20 %	0 %	0 %	158319085
30	NC_009922	AAATT	2	10	32476	32485	60 %	40 %	0 %	0 %	158319086
31	NC_009922	GAGAA	2	10	32631	32640	60 %	0 %	40 %	0 %	158319086
32	NC_009922	CACAG	2	10	33162	33171	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009922	AGCTA	2	10	33424	33433	40 %	20 %	20 %	20 %	158319087
34	NC_009922	GCAGA	2	10	33689	33698	40 %	0 %	40 %	20 %	158319087
35	NC_009922	GAAAA	2	10	36780	36789	80 %	0 %	20 %	0 %	158319090
36	NC_009922	CAATA	2	10	37216	37225	60 %	20 %	0 %	20 %	158319091
37	NC_009922	TGGTA	2	10	37762	37771	20 %	40 %	40 %	0 %	158319092
38	NC_009922	ATACT	2	10	39959	39968	40 %	40 %	0 %	20 %	158319094
39	NC_009922	AAAAG	2	10	40203	40212	80 %	0 %	20 %	0 %	158319095
40	NC_009922	TGCCA	2	10	41969	41978	20 %	20 %	20 %	40 %	158319097
41	NC_009922	AAGCC	2	10	42474	42483	40 %	0 %	20 %	40 %	158319097
42	NC_009922	GAAAT	2	10	45453	45462	60 %	20 %	20 %	0 %	158319099
43	NC_009922	TCCAT	2	10	46153	46162	20 %	40 %	0 %	40 %	158319100
44	NC_009922	GAAAC	2	10	46688	46697	60 %	0 %	20 %	20 %	158319101
45	NC_009922	AAAAC	2	10	47220	47229	80 %	0 %	0 %	20 %	158319101
46	NC_009922	GATTT	2	10	47354	47363	20 %	60 %	20 %	0 %	158319101
47	NC_009922	TAAAA	2	10	48861	48870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009922	GGAGA	2	10	49479	49488	40 %	0 %	60 %	0 %	158319104
49	NC_009922	AGGAG	2	10	50543	50552	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009922	CCTTC	2	10	50903	50912	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_009922	TCGTG	2	10	50952	50961	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009922	AAGAT	2	10	54464	54473	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009922	ATTTT	2	10	54869	54878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009922	TATTC	2	10	55005	55014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009922	CTTTG	2	10	55479	55488	0 %	60 %	20 %	20 %	158319105
56	NC_009922	AAATA	2	10	56047	56056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009922	TATAT	2	10	57112	57121	40 %	60 %	0 %	0 %	158319106
58	NC_009922	TGGGT	2	10	57163	57172	0 %	40 %	60 %	0 %	158319106
59	NC_009922	TAAGA	2	10	62119	62128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009922	TCCTT	2	10	62258	62267	0 %	60 %	0 %	40 %	158319110
61	NC_009922	ACAAA	2	10	62796	62805	80 %	0 %	0 %	20 %	158319110
62	NC_009922	AGGAG	2	10	63798	63807	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009922	CCTTC	2	10	64158	64167	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_009922	TCGTG	2	10	64207	64216	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009922	AAGAT	2	10	67804	67813	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009922	TCAAA	2	10	68502	68511	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009922	AATGA	2	10	69912	69921	60 %	20 %	20 %	0 %	158319111
68	NC_009922	GGTAT	2	10	70349	70358	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009922	CTGCA	2	10	70563	70572	20 %	20 %	20 %	40 %	158319112
70	NC_009922	CTGCT	2	10	71213	71222	0 %	40 %	20 %	40 %	158319113
71	NC_009922	AGCAA	2	10	72950	72959	60 %	0 %	20 %	20 %	158319113
72	NC_009922	CCTCT	2	10	74671	74680	0 %	40 %	0 %	60 %	158319115
73	NC_009922	ACAAA	2	10	74851	74860	80 %	0 %	0 %	20 %	158319115
74	NC_009922	GCAGG	3	15	76313	76327	20 %	0 %	60 %	20 %	158319115
75	NC_009922	AAAAC	2	10	76472	76481	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009922	CTAAA	2	10	77074	77083	60 %	20 %	0 %	20 %	158319116
77	NC_009922	AAATA	2	10	77568	77577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009922	TTTTC	2	10	78379	78388	0 %	80 %	0 %	20 %	158319117
79	NC_009922	CCTTT	2	10	79809	79818	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009922	TAAAA	2	10	80055	80064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009922	CCTAC	2	10	80773	80782	20 %	20 %	0 %	60 %	158319118
82	NC_009922	TACCC	2	10	81568	81577	20 %	20 %	0 %	60 %	158319118
83	NC_009922	CTTGG	2	10	84213	84222	0 %	40 %	40 %	20 %	158319122
84	NC_009922	AAATC	2	10	85131	85140	60 %	20 %	0 %	20 %	158319123
85	NC_009922	AAAGC	2	10	85214	85223	60 %	0 %	20 %	20 %	158319123
86	NC_009922	ATATC	2	10	85939	85948	40 %	40 %	0 %	20 %	158319123
87	NC_009922	GTTAA	2	10	87625	87634	40 %	40 %	20 %	0 %	158319124
88	NC_009922	GAAAA	2	10	87690	87699	80 %	0 %	20 %	0 %	158319124
89	NC_009922	TGCAA	2	10	89434	89443	40 %	20 %	20 %	20 %	158319126
90	NC_009922	AAGTG	2	10	89868	89877	40 %	20 %	40 %	0 %	158319127
91	NC_009922	AAATC	2	10	90286	90295	60 %	20 %	0 %	20 %	158319127
92	NC_009922	AATTG	2	10	93501	93510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009922	GAATG	2	10	94272	94281	40 %	20 %	40 %	0 %	158319129
94	NC_009922	TTCGA	2	10	95269	95278	20 %	40 %	20 %	20 %	158319129
95	NC_009922	ATCGA	2	10	96769	96778	40 %	20 %	20 %	20 %	158319131
96	NC_009922	TGGAT	2	10	96922	96931	20 %	40 %	40 %	0 %	158319131
97	NC_009922	AGGGT	2	10	97790	97799	20 %	20 %	60 %	0 %	158319132
98	NC_009922	ACTAT	2	10	98745	98754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009922	ATAAA	2	10	100600	100609	80 %	20 %	0 %	0 %	158319134
100	NC_009922	GAAGG	2	10	103457	103466	40 %	0 %	60 %	0 %	158319137
101	NC_009922	TAAAA	2	10	104026	104035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009922	ATTTT	2	10	104774	104783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009922	ACAGA	2	10	104868	104877	60 %	0 %	20 %	20 %	158319139
104	NC_009922	CCTTA	2	10	106101	106110	20 %	40 %	0 %	40 %	158319139
105	NC_009922	ATTTT	2	10	107276	107285	20 %	80 %	0 %	0 %	158319140
106	NC_009922	CGAAC	2	10	107290	107299	40 %	0 %	20 %	40 %	158319140
107	NC_009922	CATCC	2	10	108073	108082	20 %	20 %	0 %	60 %	158319140
108	NC_009922	TATGG	2	10	108410	108419	20 %	40 %	40 %	0 %	158319140
109	NC_009922	TATAA	2	10	108609	108618	60 %	40 %	0 %	0 %	158319141
110	NC_009922	TAGTA	2	10	108936	108945	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009922	TGGGA	2	10	111196	111205	20 %	20 %	60 %	0 %	158319143
112	NC_009922	AAATT	2	10	111434	111443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009922	CAAAT	2	10	113108	113117	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009922	AGTTG	2	10	113705	113714	20 %	40 %	40 %	0 %	158319145
115	NC_009922	TTATT	2	10	117969	117978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009922	TTATT	2	10	117995	118004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009922	AGAAT	2	10	118596	118605	60 %	20 %	20 %	0 %	158319149
118	NC_009922	AGAGC	2	10	123599	123608	40 %	0 %	40 %	20 %	158319155
119	NC_009922	ATTTT	2	10	124648	124657	20 %	80 %	0 %	0 %	158319155
120	NC_009922	AAAAG	2	10	124709	124718	80 %	0 %	20 %	0 %	158319155
121	NC_009922	TGGAA	2	10	126047	126056	40 %	20 %	40 %	0 %	158319156
122	NC_009922	TAAGA	2	10	126323	126332	60 %	20 %	20 %	0 %	158319156
123	NC_009922	AGTTG	2	10	128533	128542	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009922	ATTAA	3	15	128634	128648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009922	TGGAA	2	10	128701	128710	40 %	20 %	40 %	0 %	158319159
126	NC_009922	TAAAA	2	10	130019	130028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009922	AAGGG	2	10	130417	130426	40 %	0 %	60 %	0 %	158319160
128	NC_009922	AAGGA	2	10	130996	131005	60 %	0 %	40 %	0 %	158319160
129	NC_009922	AGAAA	2	10	132079	132088	80 %	0 %	20 %	0 %	158319161
130	NC_009922	GTTGC	2	10	132791	132800	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009922	TAAAA	2	10	133745	133754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009922	AATAC	2	10	134617	134626	60 %	20 %	0 %	20 %	158319163
133	NC_009922	AGATG	2	10	134819	134828	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009922	AAATG	2	10	134847	134856	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009922	ATTAA	2	10	135023	135032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009922	CAAAA	2	10	135907	135916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009922	ACTGC	2	10	136951	136960	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_009922	ATCAA	2	10	137516	137525	60 %	20 %	0 %	20 %	158319166
139	NC_009922	AAAGA	2	10	139498	139507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009922	AAGAA	2	10	140640	140649	80 %	0 %	20 %	0 %	158319170
141	NC_009922	AGATT	2	10	142480	142489	40 %	40 %	20 %	0 %	158319172
142	NC_009922	ATACT	2	10	142565	142574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009922	AAATC	2	10	144401	144410	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009922	AAAAT	2	10	146177	146186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009922	GAAGA	2	10	149885	149894	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_009922	AGAAA	2	10	155422	155431	80 %	0 %	20 %	0 %	158319186
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161	NC_009922	AAGTA	2	10	173959	173968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009922	AAGAT	2	10	174021	174030	60 %	20 %	20 %	0 %	158319203
163	NC_009922	AAAAT	3	15	177068	177082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009922	AATAG	2	10	178053	178062	60 %	20 %	20 %	0 %	158319206
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201	NC_009922	TAATT	2	10	223619	223628	40 %	60 %	0 %	0 %	158319245
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256	NC_009922	ATAAA	2	10	283165	283174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_009922	TTTAA	2	10	283495	283504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_009922	CTGTG	2	10	285794	285803	0 %	40 %	40 %	20 %	158319294
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266	NC_009922	ATGAA	2	10	292229	292238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_009922	AGGGA	2	10	297507	297516	40 %	0 %	60 %	0 %	158319303
271	NC_009922	ATTTA	2	10	297798	297807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_009922	TGAGG	2	10	297811	297820	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
273	NC_009922	AAATT	2	10	302671	302680	60 %	40 %	0 %	0 %	158319308
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275	NC_009922	AAAAT	2	10	303480	303489	80 %	20 %	0 %	0 %	158319308
276	NC_009922	ATTTT	2	10	304061	304070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_009922	ATTTT	2	10	427447	427456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_009922	TACTG	2	10	440185	440194	20 %	40 %	20 %	20 %	158319438
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403	NC_009922	ATTTT	2	10	445619	445628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_009922	ACGAT	2	10	446616	446625	40 %	20 %	20 %	20 %	158319442
405	NC_009922	TCCTA	2	10	446786	446795	20 %	40 %	0 %	40 %	158319443
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