MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009922	CTTCT	2	10	2211755	2211764	0 %	60 %	0 %	40 %	158321102
2002	NC_009922	AAAAT	2	10	2212032	2212041	80 %	20 %	0 %	0 %	158321102
2003	NC_009922	TATTT	2	10	2212742	2212751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_009922	ATTTT	2	10	2212822	2212831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_009922	AAAAT	2	10	2216526	2216535	80 %	20 %	0 %	0 %	158321106
2006	NC_009922	CAATC	2	10	2217597	2217606	40 %	20 %	0 %	40 %	158321108
2007	NC_009922	CTTCC	2	10	2222972	2222981	0 %	40 %	0 %	60 %	158321113
2008	NC_009922	ATAAA	2	10	2224544	2224553	80 %	20 %	0 %	0 %	158321114
2009	NC_009922	TTAAT	2	10	2226381	2226390	40 %	60 %	0 %	0 %	158321116
2010	NC_009922	CCAAG	2	10	2227587	2227596	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2011	NC_009922	ATTCT	2	10	2228599	2228608	20 %	60 %	0 %	20 %	158321119
2012	NC_009922	ATGCC	2	10	2228885	2228894	20 %	20 %	20 %	40 %	158321119
2013	NC_009922	CCATC	2	10	2229648	2229657	20 %	20 %	0 %	60 %	158321120
2014	NC_009922	GATTT	2	10	2231230	2231239	20 %	60 %	20 %	0 %	158321121
2015	NC_009922	CATTT	2	10	2233693	2233702	20 %	60 %	0 %	20 %	158321123
2016	NC_009922	GAATT	2	10	2233771	2233780	40 %	40 %	20 %	0 %	158321123
2017	NC_009922	ATTTA	2	10	2234384	2234393	40 %	60 %	0 %	0 %	158321124
2018	NC_009922	ATAAA	2	10	2235540	2235549	80 %	20 %	0 %	0 %	158321124
2019	NC_009922	TTTTC	2	10	2236750	2236759	0 %	80 %	0 %	20 %	158321125
2020	NC_009922	TTAAC	2	10	2236913	2236922	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2021	NC_009922	GCTTG	2	10	2239404	2239413	0 %	40 %	40 %	20 %	158321128
2022	NC_009922	TTTAC	2	10	2240320	2240329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2023	NC_009922	TCTTT	2	10	2241746	2241755	0 %	80 %	0 %	20 %	158321130
2024	NC_009922	ATATT	2	10	2241911	2241920	40 %	60 %	0 %	0 %	158321130
2025	NC_009922	TTTTC	2	10	2243283	2243292	0 %	80 %	0 %	20 %	158321131
2026	NC_009922	GGTAT	2	10	2244134	2244143	20 %	40 %	40 %	0 %	158321131
2027	NC_009922	CCTTG	2	10	2244462	2244471	0 %	40 %	20 %	40 %	158321131
2028	NC_009922	ATTTT	2	10	2246972	2246981	20 %	80 %	0 %	0 %	158321133
2029	NC_009922	TTCTC	2	10	2247134	2247143	0 %	60 %	0 %	40 %	158321133
2030	NC_009922	AAAAC	2	10	2247415	2247424	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2031	NC_009922	AAATA	2	10	2248452	2248461	80 %	20 %	0 %	0 %	158321134
2032	NC_009922	AAATA	2	10	2248671	2248680	80 %	20 %	0 %	0 %	158321134
2033	NC_009922	ACACT	2	10	2249133	2249142	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2034	NC_009922	ATATT	2	10	2249271	2249280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_009922	CAATT	2	10	2250266	2250275	40 %	40 %	0 %	20 %	158321137
2036	NC_009922	ATATT	2	10	2251071	2251080	40 %	60 %	0 %	0 %	158321138
2037	NC_009922	TTCCC	2	10	2252065	2252074	0 %	40 %	0 %	60 %	158321139
2038	NC_009922	TGATA	2	10	2253989	2253998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_009922	ATATA	2	10	2254092	2254101	60 %	40 %	0 %	0 %	158321143
2040	NC_009922	GAATA	2	10	2259171	2259180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_009922	CTTCT	2	10	2259357	2259366	0 %	60 %	0 %	40 %	158321149
2042	NC_009922	AATAA	2	10	2260986	2260995	80 %	20 %	0 %	0 %	158321150
2043	NC_009922	TAATT	2	10	2264241	2264250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_009922	CGAAG	2	10	2265209	2265218	40 %	0 %	40 %	20 %	158321153
2045	NC_009922	CATGG	2	10	2265570	2265579	20 %	20 %	40 %	20 %	158321153
2046	NC_009922	ATGCA	2	10	2267664	2267673	40 %	20 %	20 %	20 %	158321157
2047	NC_009922	ATAAA	2	10	2269079	2269088	80 %	20 %	0 %	0 %	158321159
2048	NC_009922	TTCGT	2	10	2269600	2269609	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2049	NC_009922	TAAAA	2	10	2271423	2271432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_009922	TTAAA	2	10	2273998	2274007	60 %	40 %	0 %	0 %	158321164
2051	NC_009922	AAATA	2	10	2274035	2274044	80 %	20 %	0 %	0 %	158321164
2052	NC_009922	CATCC	2	10	2274743	2274752	20 %	20 %	0 %	60 %	158321165
2053	NC_009922	TGTCC	2	10	2275975	2275984	0 %	40 %	20 %	40 %	158321165
2054	NC_009922	CCATC	2	10	2276416	2276425	20 %	20 %	0 %	60 %	158321165
2055	NC_009922	TGCTT	2	10	2277126	2277135	0 %	60 %	20 %	20 %	158321166
2056	NC_009922	TATAA	2	10	2277702	2277711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_009922	AACAT	2	10	2279782	2279791	60 %	20 %	0 %	20 %	158321168
2058	NC_009922	CCCAG	2	10	2281227	2281236	20 %	0 %	20 %	60 %	158321168
2059	NC_009922	ACAGG	2	10	2281590	2281599	40 %	0 %	40 %	20 %	158321169
2060	NC_009922	AAAAC	2	10	2282524	2282533	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2061	NC_009922	CTGTC	2	10	2285929	2285938	0 %	40 %	20 %	40 %	158321173
2062	NC_009922	CAGTG	2	10	2286159	2286168	20 %	20 %	40 %	20 %	158321173
2063	NC_009922	CATTT	2	10	2287003	2287012	20 %	60 %	0 %	20 %	158321174
2064	NC_009922	AATGG	2	10	2290311	2290320	40 %	20 %	40 %	0 %	158321177
2065	NC_009922	GCTTT	2	10	2290711	2290720	0 %	60 %	20 %	20 %	158321178
2066	NC_009922	TTCTA	2	10	2293377	2293386	20 %	60 %	0 %	20 %	158321179
2067	NC_009922	TATCT	2	10	2293578	2293587	20 %	60 %	0 %	20 %	158321179
2068	NC_009922	AATCA	2	10	2294879	2294888	60 %	20 %	0 %	20 %	158321180
2069	NC_009922	TATAA	2	10	2295941	2295950	60 %	40 %	0 %	0 %	158321180
2070	NC_009922	AAAAT	2	10	2297197	2297206	80 %	20 %	0 %	0 %	158321181
2071	NC_009922	GGAAA	2	10	2299112	2299121	60 %	0 %	40 %	0 %	158321182
2072	NC_009922	AAAAT	2	10	2301497	2301506	80 %	20 %	0 %	0 %	158321185
2073	NC_009922	ATAGA	2	10	2301535	2301544	60 %	20 %	20 %	0 %	158321185
2074	NC_009922	ACTTT	2	10	2302497	2302506	20 %	60 %	0 %	20 %	158321186
2075	NC_009922	GTTAA	2	10	2303828	2303837	40 %	40 %	20 %	0 %	158321186
2076	NC_009922	ACAAT	2	10	2304429	2304438	60 %	20 %	0 %	20 %	158321186
2077	NC_009922	AAACA	2	10	2304664	2304673	80 %	0 %	0 %	20 %	158321186
2078	NC_009922	CTTTC	2	10	2305261	2305270	0 %	60 %	0 %	40 %	158321187
2079	NC_009922	TATAG	2	10	2307613	2307622	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_009922	CAATC	2	10	2308497	2308506	40 %	20 %	0 %	40 %	158321190
2081	NC_009922	TCATT	2	10	2309483	2309492	20 %	60 %	0 %	20 %	158321190
2082	NC_009922	ACTAT	2	10	2310543	2310552	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2083	NC_009922	ACTAC	2	10	2311287	2311296	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2084	NC_009922	ATATT	2	10	2314128	2314137	40 %	60 %	0 %	0 %	158321196
2085	NC_009922	GGTAT	2	10	2314197	2314206	20 %	40 %	40 %	0 %	158321196
2086	NC_009922	CAATA	2	10	2323838	2323847	60 %	20 %	0 %	20 %	158321204
2087	NC_009922	TACCC	2	10	2324260	2324269	20 %	20 %	0 %	60 %	158321204
2088	NC_009922	ATTTT	2	10	2326207	2326216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_009922	TCTCT	2	10	2328822	2328831	0 %	60 %	0 %	40 %	158321209
2090	NC_009922	TCACC	2	10	2330139	2330148	20 %	20 %	0 %	60 %	158321211
2091	NC_009922	GCAAT	2	10	2330847	2330856	40 %	20 %	20 %	20 %	158321211
2092	NC_009922	CTTTG	2	10	2331271	2331280	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2093	NC_009922	AAAGG	2	10	2332302	2332311	60 %	0 %	40 %	0 %	158321212
2094	NC_009922	TATTT	2	10	2333498	2333507	20 %	80 %	0 %	0 %	158321214
2095	NC_009922	ATATT	2	10	2334125	2334134	40 %	60 %	0 %	0 %	158321215
2096	NC_009922	TCGTA	2	10	2334711	2334720	20 %	40 %	20 %	20 %	158321215
2097	NC_009922	TTTCA	2	10	2335795	2335804	20 %	60 %	0 %	20 %	158321217
2098	NC_009922	TTGGA	2	10	2336175	2336184	20 %	40 %	40 %	0 %	158321217
2099	NC_009922	ATGGA	2	10	2336793	2336802	40 %	20 %	40 %	0 %	158321218
2100	NC_009922	TAAAG	2	10	2337213	2337222	60 %	20 %	20 %	0 %	158321218
2101	NC_009922	GCAAT	2	10	2339024	2339033	40 %	20 %	20 %	20 %	158321219
2102	NC_009922	CTGAG	2	10	2339973	2339982	20 %	20 %	40 %	20 %	158321220
2103	NC_009922	ATTTT	2	10	2340901	2340910	20 %	80 %	0 %	0 %	158321221
2104	NC_009922	GCTTT	2	10	2342794	2342803	0 %	60 %	20 %	20 %	158321221
2105	NC_009922	CTTTT	2	10	2343289	2343298	0 %	80 %	0 %	20 %	158321221
2106	NC_009922	ATAAA	2	10	2343847	2343856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_009922	AGTCA	2	10	2344250	2344259	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2108	NC_009922	TTCAC	2	10	2344393	2344402	20 %	40 %	0 %	40 %	158321222
2109	NC_009922	ATTTT	2	10	2348697	2348706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_009922	TCCTT	2	10	2351205	2351214	0 %	60 %	0 %	40 %	158321224
2111	NC_009922	ATATT	2	10	2351678	2351687	40 %	60 %	0 %	0 %	158321224
2112	NC_009922	TTTTC	2	10	2351711	2351720	0 %	80 %	0 %	20 %	158321224
2113	NC_009922	TTCTT	2	10	2352212	2352221	0 %	80 %	0 %	20 %	158321225
2114	NC_009922	AAATT	2	10	2355722	2355731	60 %	40 %	0 %	0 %	158321228
2115	NC_009922	AGGTG	2	10	2356089	2356098	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_009922	GGATT	2	10	2357845	2357854	20 %	40 %	40 %	0 %	158321232
2117	NC_009922	TTCTC	2	10	2359695	2359704	0 %	60 %	0 %	40 %	158321235
2118	NC_009922	ATGAT	2	10	2360786	2360795	40 %	40 %	20 %	0 %	158321236
2119	NC_009922	ATAAA	2	10	2361187	2361196	80 %	20 %	0 %	0 %	158321236
2120	NC_009922	CTTCC	2	10	2361863	2361872	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2121	NC_009922	AATTT	2	10	2362083	2362092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_009922	TACCG	2	10	2363046	2363055	20 %	20 %	20 %	40 %	158321237
2123	NC_009922	GAAAA	2	10	2363386	2363395	80 %	0 %	20 %	0 %	158321237
2124	NC_009922	AATAA	2	10	2365280	2365289	80 %	20 %	0 %	0 %	158321240
2125	NC_009922	ATCAG	2	10	2370932	2370941	40 %	20 %	20 %	20 %	158321246
2126	NC_009922	ATTCT	2	10	2371238	2371247	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2127	NC_009922	CTATT	2	10	2371289	2371298	20 %	60 %	0 %	20 %	158321247
2128	NC_009922	CGCAG	2	10	2372434	2372443	20 %	0 %	40 %	40 %	158321247
2129	NC_009922	GGATC	2	10	2372470	2372479	20 %	20 %	40 %	20 %	158321247
2130	NC_009922	TCCGT	2	10	2373416	2373425	0 %	40 %	20 %	40 %	158321247
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2132	NC_009922	CCAAT	2	10	2373837	2373846	40 %	20 %	0 %	40 %	158321247
2133	NC_009922	GTTTC	2	10	2374417	2374426	0 %	60 %	20 %	20 %	158321247
2134	NC_009922	TATTT	2	10	2375176	2375185	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_009922	ACTTG	2	10	2376242	2376251	20 %	40 %	20 %	20 %	158321248
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2138	NC_009922	ATATT	2	10	2379486	2379495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_009922	ACAAT	2	10	2379683	2379692	60 %	20 %	0 %	20 %	158321252
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2142	NC_009922	TTGTA	2	10	2382775	2382784	20 %	60 %	20 %	0 %	158321256
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2145	NC_009922	AATTA	2	10	2384611	2384620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2153	NC_009922	CTATA	2	10	2388972	2388981	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2154	NC_009922	ATTTA	2	10	2390162	2390171	40 %	60 %	0 %	0 %	158321264
2155	NC_009922	TTCTT	2	10	2391363	2391372	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2159	NC_009922	TTGTT	2	10	2394710	2394719	0 %	80 %	20 %	0 %	158321268
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2194	NC_009922	TATTT	2	10	2433098	2433107	20 %	80 %	0 %	0 %	158321300
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2244	NC_009922	AATAC	2	10	2479443	2479452	60 %	20 %	0 %	20 %	158321332
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2246	NC_009922	TTTTC	2	10	2480275	2480284	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2247	NC_009922	TACGC	2	10	2480376	2480385	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2248	NC_009922	TTTAA	2	10	2482535	2482544	40 %	60 %	0 %	0 %	158321334
2249	NC_009922	TTTGT	3	15	2482886	2482900	0 %	80 %	20 %	0 %	158321334
2250	NC_009922	AGTAA	2	10	2483593	2483602	60 %	20 %	20 %	0 %	158321335
2251	NC_009922	TCTTA	2	10	2485392	2485401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2252	NC_009922	ATAAA	2	10	2485505	2485514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2254	NC_009922	CTACC	2	10	2488630	2488639	20 %	20 %	0 %	60 %	158321339
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2362	NC_009922	CTCTC	2	10	2609386	2609395	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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2367	NC_009922	CTCTC	2	10	2616800	2616809	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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2369	NC_009922	TGATT	2	10	2617756	2617765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2377	NC_009922	AGCTC	2	10	2627912	2627921	20 %	20 %	20 %	40 %	158321452
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2380	NC_009922	TAAAA	2	10	2633516	2633525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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