MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009922	TAAAG	2	10	1133468	1133477	60 %	20 %	20 %	0 %	158320073
1002	NC_009922	ATTAT	2	10	1135047	1135056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009922	AATTT	2	10	1135455	1135464	40 %	60 %	0 %	0 %	158320074
1004	NC_009922	TTAAT	2	10	1137578	1137587	40 %	60 %	0 %	0 %	158320075
1005	NC_009922	GAAAA	2	10	1138627	1138636	80 %	0 %	20 %	0 %	158320075
1006	NC_009922	ATTGA	2	10	1139516	1139525	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009922	GGTAT	2	10	1140341	1140350	20 %	40 %	40 %	0 %	158320076
1008	NC_009922	AAAGG	2	10	1140467	1140476	60 %	0 %	40 %	0 %	158320076
1009	NC_009922	GTATG	2	10	1141510	1141519	20 %	40 %	40 %	0 %	158320077
1010	NC_009922	AATTC	2	10	1141982	1141991	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1011	NC_009922	ATTTT	2	10	1142080	1142089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009922	TAATA	2	10	1143799	1143808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009922	GAGAA	2	10	1145408	1145417	60 %	0 %	40 %	0 %	158320081
1014	NC_009922	ATTTT	2	10	1147106	1147115	20 %	80 %	0 %	0 %	158320082
1015	NC_009922	ATTGT	2	10	1147150	1147159	20 %	60 %	20 %	0 %	158320082
1016	NC_009922	GGATT	2	10	1149818	1149827	20 %	40 %	40 %	0 %	158320087
1017	NC_009922	CATTT	2	10	1150056	1150065	20 %	60 %	0 %	20 %	158320088
1018	NC_009922	GAAAT	2	10	1150344	1150353	60 %	20 %	20 %	0 %	158320089
1019	NC_009922	TAAAG	2	10	1154143	1154152	60 %	20 %	20 %	0 %	158320092
1020	NC_009922	TAAAA	2	10	1154573	1154582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009922	TGACT	2	10	1154614	1154623	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_009922	TACTT	2	10	1157261	1157270	20 %	60 %	0 %	20 %	158320094
1023	NC_009922	TATAT	2	10	1157759	1157768	40 %	60 %	0 %	0 %	158320094
1024	NC_009922	TATAA	2	10	1160892	1160901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009922	TACTT	2	10	1161251	1161260	20 %	60 %	0 %	20 %	158320099
1026	NC_009922	TAAAT	2	10	1162026	1162035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009922	ATTAT	2	10	1162464	1162473	40 %	60 %	0 %	0 %	158320100
1028	NC_009922	TAATG	2	10	1162579	1162588	40 %	40 %	20 %	0 %	158320100
1029	NC_009922	AAAGT	2	10	1162869	1162878	60 %	20 %	20 %	0 %	158320100
1030	NC_009922	AAATT	2	10	1163065	1163074	60 %	40 %	0 %	0 %	158320100
1031	NC_009922	ATAAA	2	10	1164973	1164982	80 %	20 %	0 %	0 %	158320102
1032	NC_009922	ATGAA	2	10	1166021	1166030	60 %	20 %	20 %	0 %	158320103
1033	NC_009922	TTTAA	2	10	1168083	1168092	40 %	60 %	0 %	0 %	158320105
1034	NC_009922	CTGGG	2	10	1170402	1170411	0 %	20 %	60 %	20 %	158320108
1035	NC_009922	GTTAT	2	10	1170462	1170471	20 %	60 %	20 %	0 %	158320108
1036	NC_009922	TTAGA	2	10	1172111	1172120	40 %	40 %	20 %	0 %	158320110
1037	NC_009922	CTGAT	2	10	1173194	1173203	20 %	40 %	20 %	20 %	158320111
1038	NC_009922	AAGAA	2	10	1173776	1173785	80 %	0 %	20 %	0 %	158320112
1039	NC_009922	AATTA	2	10	1174313	1174322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009922	ATTAC	2	10	1174917	1174926	40 %	40 %	0 %	20 %	158320114
1041	NC_009922	TTATA	2	10	1174972	1174981	40 %	60 %	0 %	0 %	158320114
1042	NC_009922	GGAAA	2	10	1175404	1175413	60 %	0 %	40 %	0 %	158320114
1043	NC_009922	AAAAT	2	10	1175897	1175906	80 %	20 %	0 %	0 %	158320114
1044	NC_009922	ATATT	2	10	1175945	1175954	40 %	60 %	0 %	0 %	158320114
1045	NC_009922	AAGAG	2	10	1176637	1176646	60 %	0 %	40 %	0 %	158320115
1046	NC_009922	CTATA	2	10	1177142	1177151	40 %	40 %	0 %	20 %	158320115
1047	NC_009922	GGAAA	2	10	1177241	1177250	60 %	0 %	40 %	0 %	158320115
1048	NC_009922	AAGCA	2	10	1177673	1177682	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1049	NC_009922	TATAT	2	10	1177683	1177692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009922	AATGA	2	10	1177738	1177747	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009922	TGTTC	2	10	1178456	1178465	0 %	60 %	20 %	20 %	158320116
1052	NC_009922	GAAGG	2	10	1181929	1181938	40 %	0 %	60 %	0 %	158320120
1053	NC_009922	AGAAA	2	10	1182915	1182924	80 %	0 %	20 %	0 %	158320122
1054	NC_009922	TATAT	2	10	1183304	1183313	40 %	60 %	0 %	0 %	158320122
1055	NC_009922	ATTAA	2	10	1184384	1184393	60 %	40 %	0 %	0 %	158320122
1056	NC_009922	ACATT	2	10	1188526	1188535	40 %	40 %	0 %	20 %	158320127
1057	NC_009922	ATTTA	2	10	1188677	1188686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009922	TTACT	2	10	1192117	1192126	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_009922	ACAAA	2	10	1192651	1192660	80 %	0 %	0 %	20 %	158320130
1060	NC_009922	GAAAT	2	10	1197077	1197086	60 %	20 %	20 %	0 %	158320133
1061	NC_009922	ATACC	2	10	1197859	1197868	40 %	20 %	0 %	40 %	158320134
1062	NC_009922	AAAAG	2	10	1199835	1199844	80 %	0 %	20 %	0 %	158320137
1063	NC_009922	GAAGT	2	10	1200086	1200095	40 %	20 %	40 %	0 %	158320137
1064	NC_009922	TAGAA	2	10	1200105	1200114	60 %	20 %	20 %	0 %	158320137
1065	NC_009922	AAAGA	2	10	1201896	1201905	80 %	0 %	20 %	0 %	158320139
1066	NC_009922	AAATA	2	10	1202408	1202417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009922	TGATA	2	10	1203314	1203323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009922	TTAAA	2	10	1203890	1203899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009922	TGAAT	2	10	1203911	1203920	40 %	40 %	20 %	0 %	158320142
1070	NC_009922	TGGTT	2	10	1204088	1204097	0 %	60 %	40 %	0 %	158320142
1071	NC_009922	GATGG	2	10	1205187	1205196	20 %	20 %	60 %	0 %	158320143
1072	NC_009922	AAGAA	2	10	1208612	1208621	80 %	0 %	20 %	0 %	158320147
1073	NC_009922	AAGTA	2	10	1210702	1210711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009922	AGATG	2	10	1211439	1211448	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009922	CTAGA	2	10	1212573	1212582	40 %	20 %	20 %	20 %	158320151
1076	NC_009922	AGAAA	2	10	1212844	1212853	80 %	0 %	20 %	0 %	158320152
1077	NC_009922	AATTA	2	10	1215514	1215523	60 %	40 %	0 %	0 %	158320155
1078	NC_009922	CAAGA	2	10	1216382	1216391	60 %	0 %	20 %	20 %	158320156
1079	NC_009922	TATTG	2	10	1217127	1217136	20 %	60 %	20 %	0 %	158320157
1080	NC_009922	ATAAA	2	10	1217284	1217293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009922	ATATA	2	10	1217521	1217530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009922	AATGG	2	10	1217613	1217622	40 %	20 %	40 %	0 %	158320158
1083	NC_009922	TAGGT	2	10	1217679	1217688	20 %	40 %	40 %	0 %	158320158
1084	NC_009922	ATTTA	2	10	1221293	1221302	40 %	60 %	0 %	0 %	158320165
1085	NC_009922	AATAT	2	10	1222074	1222083	60 %	40 %	0 %	0 %	158320166
1086	NC_009922	TAACT	2	10	1222258	1222267	40 %	40 %	0 %	20 %	158320166
1087	NC_009922	ACGCT	2	10	1223855	1223864	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1088	NC_009922	TAATT	2	10	1224809	1224818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009922	TTATT	2	10	1226632	1226641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009922	TTTTA	2	10	1227119	1227128	20 %	80 %	0 %	0 %	158320168
1091	NC_009922	TTTAT	2	10	1227396	1227405	20 %	80 %	0 %	0 %	158320169
1092	NC_009922	GCATT	2	10	1228565	1228574	20 %	40 %	20 %	20 %	158320169
1093	NC_009922	ATTAT	2	10	1229782	1229791	40 %	60 %	0 %	0 %	158320171
1094	NC_009922	TAAAT	2	10	1230527	1230536	60 %	40 %	0 %	0 %	158320172
1095	NC_009922	AAAAG	2	10	1231587	1231596	80 %	0 %	20 %	0 %	158320172
1096	NC_009922	AGAAA	2	10	1232528	1232537	80 %	0 %	20 %	0 %	158320173
1097	NC_009922	GAACT	2	10	1234879	1234888	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_009922	TCCTT	2	10	1235459	1235468	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1099	NC_009922	CAATC	2	10	1238327	1238336	40 %	20 %	0 %	40 %	158320179
1100	NC_009922	ATAAA	2	10	1238601	1238610	80 %	20 %	0 %	0 %	158320179
1101	NC_009922	ACCAT	2	10	1239667	1239676	40 %	20 %	0 %	40 %	158320179
1102	NC_009922	GAAAA	2	10	1240439	1240448	80 %	0 %	20 %	0 %	158320180
1103	NC_009922	GAATA	2	10	1240638	1240647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009922	AAAGA	2	10	1241152	1241161	80 %	0 %	20 %	0 %	158320181
1105	NC_009922	GTATT	2	10	1241895	1241904	20 %	60 %	20 %	0 %	158320182
1106	NC_009922	TTTCT	2	10	1243023	1243032	0 %	80 %	0 %	20 %	158320183
1107	NC_009922	TTAAA	2	10	1243514	1243523	60 %	40 %	0 %	0 %	158320183
1108	NC_009922	AAGGA	2	10	1244303	1244312	60 %	0 %	40 %	0 %	158320185
1109	NC_009922	GGATA	2	10	1246111	1246120	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009922	ACAGA	2	10	1246553	1246562	60 %	0 %	20 %	20 %	158320189
1111	NC_009922	TATCA	2	10	1247711	1247720	40 %	40 %	0 %	20 %	158320191
1112	NC_009922	AAGAG	2	10	1248176	1248185	60 %	0 %	40 %	0 %	158320191
1113	NC_009922	AGATT	2	10	1248198	1248207	40 %	40 %	20 %	0 %	158320191
1114	NC_009922	ACTTT	2	10	1248916	1248925	20 %	60 %	0 %	20 %	158320191
1115	NC_009922	GACTA	2	10	1249027	1249036	40 %	20 %	20 %	20 %	158320191
1116	NC_009922	TAAAG	2	10	1249820	1249829	60 %	20 %	20 %	0 %	158320192
1117	NC_009922	GAAGG	2	10	1254057	1254066	40 %	0 %	60 %	0 %	158320196
1118	NC_009922	ACAAG	2	10	1255845	1255854	60 %	0 %	20 %	20 %	158320198
1119	NC_009922	ATGAA	2	10	1256428	1256437	60 %	20 %	20 %	0 %	158320198
1120	NC_009922	GAAAA	2	10	1256664	1256673	80 %	0 %	20 %	0 %	158320199
1121	NC_009922	GAGAA	2	10	1256932	1256941	60 %	0 %	40 %	0 %	158320199
1122	NC_009922	GAAAC	2	10	1257676	1257685	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1123	NC_009922	ATCAT	2	10	1258192	1258201	40 %	40 %	0 %	20 %	158320200
1124	NC_009922	CATTG	2	10	1260555	1260564	20 %	40 %	20 %	20 %	158320201
1125	NC_009922	CAAAA	2	10	1260753	1260762	80 %	0 %	0 %	20 %	158320201
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1127	NC_009922	TTTTA	2	10	1261808	1261817	20 %	80 %	0 %	0 %	158320203
1128	NC_009922	TCTGA	2	10	1262883	1262892	20 %	40 %	20 %	20 %	158320205
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1156	NC_009922	CAATT	2	10	1287994	1288003	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1499	NC_009922	ACCTT	2	10	1653973	1653982	20 %	40 %	0 %	40 %	158320579
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