MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009922	CCTAT	2	10	1658069	1658078	20 %	40 %	0 %	40 %	158320581
1502	NC_009922	TTTTC	2	10	1659816	1659825	0 %	80 %	0 %	20 %	158320583
1503	NC_009922	ATATA	2	10	1662758	1662767	60 %	40 %	0 %	0 %	158320586
1504	NC_009922	ATCTT	2	10	1663806	1663815	20 %	60 %	0 %	20 %	158320586
1505	NC_009922	TGCTT	2	10	1665191	1665200	0 %	60 %	20 %	20 %	158320586
1506	NC_009922	ATCCT	2	10	1665976	1665985	20 %	40 %	0 %	40 %	158320587
1507	NC_009922	CTTTT	2	10	1667250	1667259	0 %	80 %	0 %	20 %	158320588
1508	NC_009922	GATTT	2	10	1669214	1669223	20 %	60 %	20 %	0 %	158320590
1509	NC_009922	TTTAT	2	10	1670090	1670099	20 %	80 %	0 %	0 %	158320591
1510	NC_009922	TTTAT	2	10	1671164	1671173	20 %	80 %	0 %	0 %	158320592
1511	NC_009922	ATTCT	2	10	1671582	1671591	20 %	60 %	0 %	20 %	158320592
1512	NC_009922	CAAAA	2	10	1673733	1673742	80 %	0 %	0 %	20 %	158320594
1513	NC_009922	TTTTA	2	10	1673900	1673909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_009922	TTTAC	2	10	1674072	1674081	20 %	60 %	0 %	20 %	158320595
1515	NC_009922	GTCAG	2	10	1677468	1677477	20 %	20 %	40 %	20 %	158320599
1516	NC_009922	AATCG	2	10	1678864	1678873	40 %	20 %	20 %	20 %	158320601
1517	NC_009922	TAAAT	2	10	1680653	1680662	60 %	40 %	0 %	0 %	158320603
1518	NC_009922	ATACC	2	10	1681823	1681832	40 %	20 %	0 %	40 %	158320605
1519	NC_009922	TGTTA	2	10	1681879	1681888	20 %	60 %	20 %	0 %	158320605
1520	NC_009922	ATATC	2	10	1684293	1684302	40 %	40 %	0 %	20 %	158320607
1521	NC_009922	TCTAT	2	10	1684544	1684553	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1522	NC_009922	ATTTA	2	10	1684591	1684600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009922	TTTTG	2	10	1687263	1687272	0 %	80 %	20 %	0 %	158320611
1524	NC_009922	ATGAT	2	10	1692680	1692689	40 %	40 %	20 %	0 %	158320617
1525	NC_009922	TAGTT	2	10	1693637	1693646	20 %	60 %	20 %	0 %	158320619
1526	NC_009922	AGTAG	2	10	1694329	1694338	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_009922	GTGCT	2	10	1696798	1696807	0 %	40 %	40 %	20 %	158320621
1528	NC_009922	CTAAT	2	10	1697080	1697089	40 %	40 %	0 %	20 %	158320622
1529	NC_009922	TTTAT	2	10	1698651	1698660	20 %	80 %	0 %	0 %	158320623
1530	NC_009922	TTTGT	2	10	1699093	1699102	0 %	80 %	20 %	0 %	158320624
1531	NC_009922	TAGGT	2	10	1699768	1699777	20 %	40 %	40 %	0 %	158320624
1532	NC_009922	TATTT	2	10	1701816	1701825	20 %	80 %	0 %	0 %	158320627
1533	NC_009922	GTAAA	2	10	1703546	1703555	60 %	20 %	20 %	0 %	158320629
1534	NC_009922	CTCCA	2	10	1705136	1705145	20 %	20 %	0 %	60 %	158320631
1535	NC_009922	TATTT	2	10	1705658	1705667	20 %	80 %	0 %	0 %	158320631
1536	NC_009922	AACTT	2	10	1711036	1711045	40 %	40 %	0 %	20 %	158320636
1537	NC_009922	GTATC	2	10	1711872	1711881	20 %	40 %	20 %	20 %	158320636
1538	NC_009922	TTTCT	3	15	1715727	1715741	0 %	80 %	0 %	20 %	158320640
1539	NC_009922	GCTTC	2	10	1716283	1716292	0 %	40 %	20 %	40 %	158320641
1540	NC_009922	GTTTT	2	10	1717570	1717579	0 %	80 %	20 %	0 %	158320643
1541	NC_009922	AAGTG	2	10	1718100	1718109	40 %	20 %	40 %	0 %	158320643
1542	NC_009922	TTTGA	2	10	1724444	1724453	20 %	60 %	20 %	0 %	158320653
1543	NC_009922	TAAAA	2	10	1727073	1727082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_009922	TTTAT	2	10	1727947	1727956	20 %	80 %	0 %	0 %	158320658
1545	NC_009922	AAAAG	2	10	1729845	1729854	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009922	AAGCC	2	10	1730925	1730934	40 %	0 %	20 %	40 %	158320662
1547	NC_009922	GATAA	2	10	1732589	1732598	60 %	20 %	20 %	0 %	158320663
1548	NC_009922	TAAAA	2	10	1735677	1735686	80 %	20 %	0 %	0 %	158320666
1549	NC_009922	AAAAT	2	10	1735757	1735766	80 %	20 %	0 %	0 %	158320666
1550	NC_009922	TTTCA	2	10	1736152	1736161	20 %	60 %	0 %	20 %	158320667
1551	NC_009922	CTTTT	3	15	1736475	1736489	0 %	80 %	0 %	20 %	158320667
1552	NC_009922	TATTG	3	15	1736748	1736762	20 %	60 %	20 %	0 %	158320668
1553	NC_009922	ATTTT	3	15	1737460	1737474	20 %	80 %	0 %	0 %	158320668
1554	NC_009922	GATCC	2	10	1738294	1738303	20 %	20 %	20 %	40 %	158320669
1555	NC_009922	TGCCA	2	10	1738729	1738738	20 %	20 %	20 %	40 %	158320669
1556	NC_009922	CAATT	2	10	1738996	1739005	40 %	40 %	0 %	20 %	158320669
1557	NC_009922	TTTTC	2	10	1739302	1739311	0 %	80 %	0 %	20 %	158320670
1558	NC_009922	CCATC	2	10	1740703	1740712	20 %	20 %	0 %	60 %	158320670
1559	NC_009922	ATTGT	2	10	1741478	1741487	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_009922	AAAAT	2	10	1742774	1742783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_009922	TAAAA	2	10	1743272	1743281	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_009922	TTTAC	2	10	1744031	1744040	20 %	60 %	0 %	20 %	158320675
1563	NC_009922	TTTTC	2	10	1744990	1744999	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_009922	AGCTA	2	10	1745544	1745553	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1565	NC_009922	TTTCG	2	10	1745614	1745623	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1566	NC_009922	TCGGC	2	10	1745730	1745739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1567	NC_009922	ACTAA	2	10	1747202	1747211	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1568	NC_009922	TATAA	2	10	1748333	1748342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_009922	TTATA	2	10	1749030	1749039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_009922	ATTAT	2	10	1750796	1750805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_009922	ATTTT	2	10	1751223	1751232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009922	TAGAA	2	10	1752722	1752731	60 %	20 %	20 %	0 %	158320681
1573	NC_009922	CTTTT	2	10	1755576	1755585	0 %	80 %	0 %	20 %	158320684
1574	NC_009922	AGCTC	2	10	1756668	1756677	20 %	20 %	20 %	40 %	158320685
1575	NC_009922	ATATT	2	10	1757880	1757889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_009922	ATTTG	2	10	1758016	1758025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_009922	ATTTA	2	10	1761172	1761181	40 %	60 %	0 %	0 %	158320690
1578	NC_009922	TCCAT	2	10	1761395	1761404	20 %	40 %	0 %	40 %	158320690
1579	NC_009922	ATTAT	2	10	1761870	1761879	40 %	60 %	0 %	0 %	158320692
1580	NC_009922	CTAGG	2	10	1762859	1762868	20 %	20 %	40 %	20 %	158320693
1581	NC_009922	ATTCA	2	10	1764507	1764516	40 %	40 %	0 %	20 %	158320693
1582	NC_009922	CTGTA	2	10	1765733	1765742	20 %	40 %	20 %	20 %	158320695
1583	NC_009922	TAAAA	2	10	1767833	1767842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_009922	TCAAA	2	10	1769406	1769415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1585	NC_009922	CTCTT	2	10	1771304	1771313	0 %	60 %	0 %	40 %	158320699
1586	NC_009922	GTTTA	2	10	1772718	1772727	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_009922	TTATT	2	10	1774351	1774360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_009922	AACAA	2	10	1774811	1774820	80 %	0 %	0 %	20 %	158320703
1589	NC_009922	TTGTC	2	10	1775980	1775989	0 %	60 %	20 %	20 %	158320704
1590	NC_009922	GTTTC	2	10	1778266	1778275	0 %	60 %	20 %	20 %	158320705
1591	NC_009922	TTCTT	2	10	1778514	1778523	0 %	80 %	0 %	20 %	158320706
1592	NC_009922	TGGAC	2	10	1779897	1779906	20 %	20 %	40 %	20 %	158320707
1593	NC_009922	AAAAT	2	10	1780507	1780516	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009922	TAATT	2	10	1780923	1780932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_009922	ATTAT	2	10	1781400	1781409	40 %	60 %	0 %	0 %	158320709
1596	NC_009922	CTGTA	2	10	1782724	1782733	20 %	40 %	20 %	20 %	158320710
1597	NC_009922	AATGA	2	10	1783193	1783202	60 %	20 %	20 %	0 %	158320711
1598	NC_009922	TTTTA	2	10	1784447	1784456	20 %	80 %	0 %	0 %	158320712
1599	NC_009922	CGATC	2	10	1785627	1785636	20 %	20 %	20 %	40 %	158320715
1600	NC_009922	ATAAA	2	10	1788011	1788020	80 %	20 %	0 %	0 %	158320717
1601	NC_009922	CTTAT	2	10	1788038	1788047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1602	NC_009922	CAATG	2	10	1788370	1788379	40 %	20 %	20 %	20 %	158320718
1603	NC_009922	CATCG	2	10	1789439	1789448	20 %	20 %	20 %	40 %	158320719
1604	NC_009922	AAAAG	2	10	1789713	1789722	80 %	0 %	20 %	0 %	158320719
1605	NC_009922	GTTCT	2	10	1791239	1791248	0 %	60 %	20 %	20 %	158320721
1606	NC_009922	GGATT	2	10	1792023	1792032	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_009922	AAGTT	2	10	1792678	1792687	40 %	40 %	20 %	0 %	158320722
1608	NC_009922	TCATA	2	10	1794255	1794264	40 %	40 %	0 %	20 %	158320723
1609	NC_009922	GGTGT	2	10	1796951	1796960	0 %	40 %	60 %	0 %	158320725
1610	NC_009922	TCTGC	2	10	1796994	1797003	0 %	40 %	20 %	40 %	158320725
1611	NC_009922	ATTTT	2	10	1799612	1799621	20 %	80 %	0 %	0 %	158320728
1612	NC_009922	AATTT	2	10	1799630	1799639	40 %	60 %	0 %	0 %	158320728
1613	NC_009922	GTATT	2	10	1800327	1800336	20 %	60 %	20 %	0 %	158320729
1614	NC_009922	AATTA	2	10	1801493	1801502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_009922	CTAAA	2	10	1801984	1801993	60 %	20 %	0 %	20 %	158320730
1616	NC_009922	GTTTT	2	10	1802407	1802416	0 %	80 %	20 %	0 %	158320730
1617	NC_009922	TTTTG	2	10	1803303	1803312	0 %	80 %	20 %	0 %	158320732
1618	NC_009922	TAAAT	2	10	1803350	1803359	60 %	40 %	0 %	0 %	158320732
1619	NC_009922	GTGCA	2	10	1804465	1804474	20 %	20 %	40 %	20 %	158320733
1620	NC_009922	AAAGG	2	10	1804556	1804565	60 %	0 %	40 %	0 %	158320733
1621	NC_009922	ATTAA	2	10	1805663	1805672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_009922	TTTAT	2	10	1807150	1807159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_009922	GATTT	2	10	1807474	1807483	20 %	60 %	20 %	0 %	158320737
1624	NC_009922	TGCTT	2	10	1807484	1807493	0 %	60 %	20 %	20 %	158320737
1625	NC_009922	AAAAT	2	10	1807771	1807780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_009922	GTGAA	2	10	1808440	1808449	40 %	20 %	40 %	0 %	158320738
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1981	NC_009922	CTACA	2	10	2189456	2189465	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1986	NC_009922	TCCAT	2	10	2197388	2197397	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1987	NC_009922	TATAT	2	10	2202337	2202346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1989	NC_009922	AATTA	2	10	2204493	2204502	60 %	40 %	0 %	0 %	158321096
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1997	NC_009922	AAAAT	2	10	2207749	2207758	80 %	20 %	0 %	0 %	158321099
1998	NC_009922	ACCAA	2	10	2207940	2207949	60 %	0 %	0 %	40 %	158321099
1999	NC_009922	CAAAA	2	10	2210634	2210643	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2000	NC_009922	TGGAT	2	10	2211710	2211719	20 %	40 %	40 %	0 %	158321102

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