MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 2096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009922	TTAAT	2	10	86	95	40 %	60 %	0 %	0 %	158319060
2	NC_009922	AAGAA	2	10	1186	1195	80 %	0 %	20 %	0 %	158319060
3	NC_009922	ACAAT	2	10	2702	2711	60 %	20 %	0 %	20 %	158319061
4	NC_009922	AATCG	2	10	3352	3361	40 %	20 %	20 %	20 %	158319063
5	NC_009922	TAAAG	2	10	3451	3460	60 %	20 %	20 %	0 %	158319063
6	NC_009922	AAAGA	2	10	3947	3956	80 %	0 %	20 %	0 %	158319063
7	NC_009922	TCAAA	2	10	4637	4646	60 %	20 %	0 %	20 %	158319064
8	NC_009922	AGAAC	2	10	4736	4745	60 %	0 %	20 %	20 %	158319064
9	NC_009922	AAAAG	2	10	5804	5813	80 %	0 %	20 %	0 %	158319065
10	NC_009922	AAATC	2	10	10182	10191	60 %	20 %	0 %	20 %	158319068
11	NC_009922	AACAG	2	10	17189	17198	60 %	0 %	20 %	20 %	158319071
12	NC_009922	ATTTT	2	10	17866	17875	20 %	80 %	0 %	0 %	158319071
13	NC_009922	AGAGA	2	10	19009	19018	60 %	0 %	40 %	0 %	158319073
14	NC_009922	TTCGA	2	10	20886	20895	20 %	40 %	20 %	20 %	158319075
15	NC_009922	AGGGT	2	10	24362	24371	20 %	20 %	60 %	0 %	158319078
16	NC_009922	ACTTT	2	10	24385	24394	20 %	60 %	0 %	20 %	158319078
17	NC_009922	ATTGG	2	10	25653	25662	20 %	40 %	40 %	0 %	158319079
18	NC_009922	TGGAA	2	10	27327	27336	40 %	20 %	40 %	0 %	158319081
19	NC_009922	GAAAA	2	10	30156	30165	80 %	0 %	20 %	0 %	158319085
20	NC_009922	AAAAT	2	10	31256	31265	80 %	20 %	0 %	0 %	158319085
21	NC_009922	AAATT	2	10	32476	32485	60 %	40 %	0 %	0 %	158319086
22	NC_009922	GAGAA	2	10	32631	32640	60 %	0 %	40 %	0 %	158319086
23	NC_009922	AGCTA	2	10	33424	33433	40 %	20 %	20 %	20 %	158319087
24	NC_009922	GCAGA	2	10	33689	33698	40 %	0 %	40 %	20 %	158319087
25	NC_009922	GAAAA	2	10	36780	36789	80 %	0 %	20 %	0 %	158319090
26	NC_009922	CAATA	2	10	37216	37225	60 %	20 %	0 %	20 %	158319091
27	NC_009922	TGGTA	2	10	37762	37771	20 %	40 %	40 %	0 %	158319092
28	NC_009922	ATACT	2	10	39959	39968	40 %	40 %	0 %	20 %	158319094
29	NC_009922	AAAAG	2	10	40203	40212	80 %	0 %	20 %	0 %	158319095
30	NC_009922	TGCCA	2	10	41969	41978	20 %	20 %	20 %	40 %	158319097
31	NC_009922	AAGCC	2	10	42474	42483	40 %	0 %	20 %	40 %	158319097
32	NC_009922	GAAAT	2	10	45453	45462	60 %	20 %	20 %	0 %	158319099
33	NC_009922	TCCAT	2	10	46153	46162	20 %	40 %	0 %	40 %	158319100
34	NC_009922	GAAAC	2	10	46688	46697	60 %	0 %	20 %	20 %	158319101
35	NC_009922	AAAAC	2	10	47220	47229	80 %	0 %	0 %	20 %	158319101
36	NC_009922	GATTT	2	10	47354	47363	20 %	60 %	20 %	0 %	158319101
37	NC_009922	GGAGA	2	10	49479	49488	40 %	0 %	60 %	0 %	158319104
38	NC_009922	CTTTG	2	10	55479	55488	0 %	60 %	20 %	20 %	158319105
39	NC_009922	TATAT	2	10	57112	57121	40 %	60 %	0 %	0 %	158319106
40	NC_009922	TGGGT	2	10	57163	57172	0 %	40 %	60 %	0 %	158319106
41	NC_009922	TCCTT	2	10	62258	62267	0 %	60 %	0 %	40 %	158319110
42	NC_009922	ACAAA	2	10	62796	62805	80 %	0 %	0 %	20 %	158319110
43	NC_009922	AATGA	2	10	69912	69921	60 %	20 %	20 %	0 %	158319111
44	NC_009922	CTGCA	2	10	70563	70572	20 %	20 %	20 %	40 %	158319112
45	NC_009922	CTGCT	2	10	71213	71222	0 %	40 %	20 %	40 %	158319113
46	NC_009922	AGCAA	2	10	72950	72959	60 %	0 %	20 %	20 %	158319113
47	NC_009922	CCTCT	2	10	74671	74680	0 %	40 %	0 %	60 %	158319115
48	NC_009922	ACAAA	2	10	74851	74860	80 %	0 %	0 %	20 %	158319115
49	NC_009922	GCAGG	3	15	76313	76327	20 %	0 %	60 %	20 %	158319115
50	NC_009922	CTAAA	2	10	77074	77083	60 %	20 %	0 %	20 %	158319116
51	NC_009922	TTTTC	2	10	78379	78388	0 %	80 %	0 %	20 %	158319117
52	NC_009922	CCTAC	2	10	80773	80782	20 %	20 %	0 %	60 %	158319118
53	NC_009922	TACCC	2	10	81568	81577	20 %	20 %	0 %	60 %	158319118
54	NC_009922	CTTGG	2	10	84213	84222	0 %	40 %	40 %	20 %	158319122
55	NC_009922	AAATC	2	10	85131	85140	60 %	20 %	0 %	20 %	158319123
56	NC_009922	AAAGC	2	10	85214	85223	60 %	0 %	20 %	20 %	158319123
57	NC_009922	ATATC	2	10	85939	85948	40 %	40 %	0 %	20 %	158319123
58	NC_009922	GTTAA	2	10	87625	87634	40 %	40 %	20 %	0 %	158319124
59	NC_009922	GAAAA	2	10	87690	87699	80 %	0 %	20 %	0 %	158319124
60	NC_009922	TGCAA	2	10	89434	89443	40 %	20 %	20 %	20 %	158319126
61	NC_009922	AAGTG	2	10	89868	89877	40 %	20 %	40 %	0 %	158319127
62	NC_009922	AAATC	2	10	90286	90295	60 %	20 %	0 %	20 %	158319127
63	NC_009922	GAATG	2	10	94272	94281	40 %	20 %	40 %	0 %	158319129
64	NC_009922	TTCGA	2	10	95269	95278	20 %	40 %	20 %	20 %	158319129
65	NC_009922	ATCGA	2	10	96769	96778	40 %	20 %	20 %	20 %	158319131
66	NC_009922	TGGAT	2	10	96922	96931	20 %	40 %	40 %	0 %	158319131
67	NC_009922	AGGGT	2	10	97790	97799	20 %	20 %	60 %	0 %	158319132
68	NC_009922	ATAAA	2	10	100600	100609	80 %	20 %	0 %	0 %	158319134
69	NC_009922	GAAGG	2	10	103457	103466	40 %	0 %	60 %	0 %	158319137
70	NC_009922	ACAGA	2	10	104868	104877	60 %	0 %	20 %	20 %	158319139
71	NC_009922	CCTTA	2	10	106101	106110	20 %	40 %	0 %	40 %	158319139
72	NC_009922	ATTTT	2	10	107276	107285	20 %	80 %	0 %	0 %	158319140
73	NC_009922	CGAAC	2	10	107290	107299	40 %	0 %	20 %	40 %	158319140
74	NC_009922	CATCC	2	10	108073	108082	20 %	20 %	0 %	60 %	158319140
75	NC_009922	TATGG	2	10	108410	108419	20 %	40 %	40 %	0 %	158319140
76	NC_009922	TATAA	2	10	108609	108618	60 %	40 %	0 %	0 %	158319141
77	NC_009922	TGGGA	2	10	111196	111205	20 %	20 %	60 %	0 %	158319143
78	NC_009922	AGTTG	2	10	113705	113714	20 %	40 %	40 %	0 %	158319145
79	NC_009922	AGAAT	2	10	118596	118605	60 %	20 %	20 %	0 %	158319149
80	NC_009922	AGAGC	2	10	123599	123608	40 %	0 %	40 %	20 %	158319155
81	NC_009922	ATTTT	2	10	124648	124657	20 %	80 %	0 %	0 %	158319155
82	NC_009922	AAAAG	2	10	124709	124718	80 %	0 %	20 %	0 %	158319155
83	NC_009922	TGGAA	2	10	126047	126056	40 %	20 %	40 %	0 %	158319156
84	NC_009922	TAAGA	2	10	126323	126332	60 %	20 %	20 %	0 %	158319156
85	NC_009922	TGGAA	2	10	128701	128710	40 %	20 %	40 %	0 %	158319159
86	NC_009922	AAGGG	2	10	130417	130426	40 %	0 %	60 %	0 %	158319160
87	NC_009922	AAGGA	2	10	130996	131005	60 %	0 %	40 %	0 %	158319160
88	NC_009922	AGAAA	2	10	132079	132088	80 %	0 %	20 %	0 %	158319161
89	NC_009922	AATAC	2	10	134617	134626	60 %	20 %	0 %	20 %	158319163
90	NC_009922	ATCAA	2	10	137516	137525	60 %	20 %	0 %	20 %	158319166
91	NC_009922	AAGAA	2	10	140640	140649	80 %	0 %	20 %	0 %	158319170
92	NC_009922	AGATT	2	10	142480	142489	40 %	40 %	20 %	0 %	158319172
93	NC_009922	GGTCC	2	10	151646	151655	0 %	20 %	40 %	40 %	158319182
94	NC_009922	AGATC	2	10	154427	154436	40 %	20 %	20 %	20 %	158319185
95	NC_009922	AGAAA	2	10	155422	155431	80 %	0 %	20 %	0 %	158319186
96	NC_009922	AAATA	2	10	156857	156866	80 %	20 %	0 %	0 %	158319188
97	NC_009922	AAATC	2	10	158044	158053	60 %	20 %	0 %	20 %	158319189
98	NC_009922	AATCA	2	10	160531	160540	60 %	20 %	0 %	20 %	158319193
99	NC_009922	AAGAA	2	10	160774	160783	80 %	0 %	20 %	0 %	158319193
100	NC_009922	TGTAG	2	10	162786	162795	20 %	40 %	40 %	0 %	158319194
101	NC_009922	ACTGA	2	10	167175	167184	40 %	20 %	20 %	20 %	158319197
102	NC_009922	GAAAT	2	10	168101	168110	60 %	20 %	20 %	0 %	158319198
103	NC_009922	AAGCT	2	10	170253	170262	40 %	20 %	20 %	20 %	158319199
104	NC_009922	AGAAA	2	10	170425	170434	80 %	0 %	20 %	0 %	158319200
105	NC_009922	TGGCT	2	10	171850	171859	0 %	40 %	40 %	20 %	158319201
106	NC_009922	AAGAT	2	10	174021	174030	60 %	20 %	20 %	0 %	158319203
107	NC_009922	AATAG	2	10	178053	178062	60 %	20 %	20 %	0 %	158319206
108	NC_009922	TGCAA	2	10	184531	184540	40 %	20 %	20 %	20 %	158319212
109	NC_009922	TCAAT	2	10	185572	185581	40 %	40 %	0 %	20 %	158319214
110	NC_009922	TAATT	2	10	185978	185987	40 %	60 %	0 %	0 %	158319214
111	NC_009922	AATTT	2	10	186440	186449	40 %	60 %	0 %	0 %	158319215
112	NC_009922	ATTTC	2	10	187136	187145	20 %	60 %	0 %	20 %	158319216
113	NC_009922	CTGTT	2	10	191831	191840	0 %	60 %	20 %	20 %	158319221
114	NC_009922	TTTAC	2	10	194331	194340	20 %	60 %	0 %	20 %	158319222
115	NC_009922	ATTAC	2	10	194490	194499	40 %	40 %	0 %	20 %	158319222
116	NC_009922	CTAAA	2	10	195715	195724	60 %	20 %	0 %	20 %	158319223
117	NC_009922	GAAAA	2	10	196649	196658	80 %	0 %	20 %	0 %	158319224
118	NC_009922	AGGAA	2	10	198514	198523	60 %	0 %	40 %	0 %	158319226
119	NC_009922	TCTTT	2	10	199638	199647	0 %	80 %	0 %	20 %	158319227
120	NC_009922	GAAAT	2	10	199903	199912	60 %	20 %	20 %	0 %	158319227
121	NC_009922	GATTG	2	10	202616	202625	20 %	40 %	40 %	0 %	158319229
122	NC_009922	CGTGC	2	10	204672	204681	0 %	20 %	40 %	40 %	158319231
123	NC_009922	TTATT	2	10	205592	205601	20 %	80 %	0 %	0 %	158319231
124	NC_009922	TTATT	2	10	206564	206573	20 %	80 %	0 %	0 %	158319232
125	NC_009922	TTTAT	2	10	207441	207450	20 %	80 %	0 %	0 %	158319232
126	NC_009922	GGAGG	2	10	210558	210567	20 %	0 %	80 %	0 %	158319234
127	NC_009922	TAAAT	2	10	211858	211867	60 %	40 %	0 %	0 %	158319235
128	NC_009922	GAAGA	2	10	212880	212889	60 %	0 %	40 %	0 %	158319237
129	NC_009922	TTGTT	2	10	213301	213310	0 %	80 %	20 %	0 %	158319237
130	NC_009922	GAAAA	2	10	213631	213640	80 %	0 %	20 %	0 %	158319238
131	NC_009922	AAAAT	2	10	214655	214664	80 %	20 %	0 %	0 %	158319239
132	NC_009922	ATATG	2	10	218463	218472	40 %	40 %	20 %	0 %	158319242
133	NC_009922	AATTT	2	10	219293	219302	40 %	60 %	0 %	0 %	158319242
134	NC_009922	GAAAT	2	10	221260	221269	60 %	20 %	20 %	0 %	158319244
135	NC_009922	TAATT	2	10	223619	223628	40 %	60 %	0 %	0 %	158319245
136	NC_009922	AACAA	2	10	224901	224910	80 %	0 %	0 %	20 %	158319248
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262	NC_009922	TTGAC	2	10	419436	419445	20 %	40 %	20 %	20 %	158319416
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