MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 2096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009922	ATTCA	2	10	1502203	1502212	40 %	40 %	0 %	20 %	158320424
1002	NC_009922	AAAGG	2	10	1502452	1502461	60 %	0 %	40 %	0 %	158320424
1003	NC_009922	TATTC	2	10	1502918	1502927	20 %	60 %	0 %	20 %	158320424
1004	NC_009922	AGGTG	2	10	1502985	1502994	20 %	20 %	60 %	0 %	158320424
1005	NC_009922	CAAAA	2	10	1503007	1503016	80 %	0 %	0 %	20 %	158320425
1006	NC_009922	AAAGA	2	10	1503414	1503423	80 %	0 %	20 %	0 %	158320425
1007	NC_009922	GCGGT	2	10	1504888	1504897	0 %	20 %	60 %	20 %	158320426
1008	NC_009922	CAATT	2	10	1505186	1505195	40 %	40 %	0 %	20 %	158320426
1009	NC_009922	AAAGA	2	10	1506285	1506294	80 %	0 %	20 %	0 %	158320427
1010	NC_009922	CGATT	2	10	1508242	1508251	20 %	40 %	20 %	20 %	158320430
1011	NC_009922	TATGA	2	10	1509203	1509212	40 %	40 %	20 %	0 %	158320431
1012	NC_009922	CAATT	2	10	1509447	1509456	40 %	40 %	0 %	20 %	158320431
1013	NC_009922	AAAAT	2	10	1511092	1511101	80 %	20 %	0 %	0 %	158320432
1014	NC_009922	AGTAT	2	10	1511836	1511845	40 %	40 %	20 %	0 %	158320434
1015	NC_009922	AAGCA	2	10	1513637	1513646	60 %	0 %	20 %	20 %	158320435
1016	NC_009922	ATTGT	2	10	1516922	1516931	20 %	60 %	20 %	0 %	158320437
1017	NC_009922	AATGA	2	10	1517588	1517597	60 %	20 %	20 %	0 %	158320437
1018	NC_009922	AACGA	2	10	1517645	1517654	60 %	0 %	20 %	20 %	158320437
1019	NC_009922	AGAAA	2	10	1518573	1518582	80 %	0 %	20 %	0 %	158320439
1020	NC_009922	ATTTC	2	10	1518630	1518639	20 %	60 %	0 %	20 %	158320439
1021	NC_009922	ATAGA	2	10	1519017	1519026	60 %	20 %	20 %	0 %	158320439
1022	NC_009922	ACAAA	2	10	1519435	1519444	80 %	0 %	0 %	20 %	158320439
1023	NC_009922	TTTTA	2	10	1520935	1520944	20 %	80 %	0 %	0 %	158320441
1024	NC_009922	CGAAG	2	10	1521959	1521968	40 %	0 %	40 %	20 %	158320443
1025	NC_009922	TGAAT	2	10	1522953	1522962	40 %	40 %	20 %	0 %	158320445
1026	NC_009922	AATAA	2	10	1523510	1523519	80 %	20 %	0 %	0 %	158320446
1027	NC_009922	GGTAA	2	10	1524582	1524591	40 %	20 %	40 %	0 %	158320447
1028	NC_009922	GCATA	2	10	1528663	1528672	40 %	20 %	20 %	20 %	158320452
1029	NC_009922	ATCGA	2	10	1530010	1530019	40 %	20 %	20 %	20 %	158320453
1030	NC_009922	ATTTT	2	10	1532900	1532909	20 %	80 %	0 %	0 %	158320458
1031	NC_009922	TCATC	2	10	1533480	1533489	20 %	40 %	0 %	40 %	158320458
1032	NC_009922	ATTTT	2	10	1535199	1535208	20 %	80 %	0 %	0 %	158320459
1033	NC_009922	AATTG	2	10	1536372	1536381	40 %	40 %	20 %	0 %	158320460
1034	NC_009922	GAAAT	2	10	1536509	1536518	60 %	20 %	20 %	0 %	158320460
1035	NC_009922	AGAAA	2	10	1536603	1536612	80 %	0 %	20 %	0 %	158320460
1036	NC_009922	ATTCA	2	10	1537472	1537481	40 %	40 %	0 %	20 %	158320461
1037	NC_009922	ATGTA	2	10	1538057	1538066	40 %	40 %	20 %	0 %	158320462
1038	NC_009922	ATTGA	2	10	1538533	1538542	40 %	40 %	20 %	0 %	158320463
1039	NC_009922	AAATC	2	10	1539250	1539259	60 %	20 %	0 %	20 %	158320464
1040	NC_009922	AAATA	2	10	1540122	1540131	80 %	20 %	0 %	0 %	158320464
1041	NC_009922	TAATA	2	10	1540718	1540727	60 %	40 %	0 %	0 %	158320465
1042	NC_009922	AGATG	2	10	1549160	1549169	40 %	20 %	40 %	0 %	158320473
1043	NC_009922	GGAAA	2	10	1551878	1551887	60 %	0 %	40 %	0 %	158320475
1044	NC_009922	ATGGT	2	10	1552541	1552550	20 %	40 %	40 %	0 %	158320476
1045	NC_009922	CAATA	2	10	1553601	1553610	60 %	20 %	0 %	20 %	158320478
1046	NC_009922	TAAAA	2	10	1554684	1554693	80 %	20 %	0 %	0 %	158320479
1047	NC_009922	AACCT	2	10	1555410	1555419	40 %	20 %	0 %	40 %	158320479
1048	NC_009922	TAAAA	2	10	1560637	1560646	80 %	20 %	0 %	0 %	158320485
1049	NC_009922	AGTTC	2	10	1562893	1562902	20 %	40 %	20 %	20 %	158320488
1050	NC_009922	GGGAT	2	10	1563841	1563850	20 %	20 %	60 %	0 %	158320490
1051	NC_009922	ATAGA	2	10	1566938	1566947	60 %	20 %	20 %	0 %	158320492
1052	NC_009922	AATTT	2	10	1567067	1567076	40 %	60 %	0 %	0 %	158320492
1053	NC_009922	AAAAG	2	10	1568346	1568355	80 %	0 %	20 %	0 %	158320493
1054	NC_009922	AGCAA	2	10	1568517	1568526	60 %	0 %	20 %	20 %	158320493
1055	NC_009922	ACGAT	2	10	1570233	1570242	40 %	20 %	20 %	20 %	158320493
1056	NC_009922	AGAAA	2	10	1571387	1571396	80 %	0 %	20 %	0 %	158320494
1057	NC_009922	AAAAT	2	10	1573544	1573553	80 %	20 %	0 %	0 %	158320496
1058	NC_009922	GAAAA	2	10	1575100	1575109	80 %	0 %	20 %	0 %	158320499
1059	NC_009922	GATCA	2	10	1576558	1576567	40 %	20 %	20 %	20 %	158320502
1060	NC_009922	AAAGA	2	10	1577077	1577086	80 %	0 %	20 %	0 %	158320502
1061	NC_009922	ATATT	2	10	1577207	1577216	40 %	60 %	0 %	0 %	158320502
1062	NC_009922	GTATC	2	10	1577997	1578006	20 %	40 %	20 %	20 %	158320504
1063	NC_009922	GAATT	2	10	1581469	1581478	40 %	40 %	20 %	0 %	158320507
1064	NC_009922	CTTTG	2	10	1581604	1581613	0 %	60 %	20 %	20 %	158320507
1065	NC_009922	AAAGG	2	10	1583554	1583563	60 %	0 %	40 %	0 %	158320508
1066	NC_009922	TGGAA	2	10	1583868	1583877	40 %	20 %	40 %	0 %	158320508
1067	NC_009922	AAATT	2	10	1585533	1585542	60 %	40 %	0 %	0 %	158320511
1068	NC_009922	ACGAT	2	10	1585570	1585579	40 %	20 %	20 %	20 %	158320511
1069	NC_009922	CATTG	2	10	1587780	1587789	20 %	40 %	20 %	20 %	158320513
1070	NC_009922	GAAGA	2	10	1588746	1588755	60 %	0 %	40 %	0 %	158320514
1071	NC_009922	AAAAT	2	10	1589025	1589034	80 %	20 %	0 %	0 %	158320514
1072	NC_009922	AAAAG	2	10	1590822	1590831	80 %	0 %	20 %	0 %	158320516
1073	NC_009922	GAAAA	2	10	1591652	1591661	80 %	0 %	20 %	0 %	158320517
1074	NC_009922	AAATG	2	10	1593333	1593342	60 %	20 %	20 %	0 %	158320518
1075	NC_009922	AAAAG	2	10	1596215	1596224	80 %	0 %	20 %	0 %	158320522
1076	NC_009922	AAGAA	2	10	1596937	1596946	80 %	0 %	20 %	0 %	158320523
1077	NC_009922	TTACT	2	10	1597939	1597948	20 %	60 %	0 %	20 %	158320525
1078	NC_009922	CAAAA	2	10	1597949	1597958	80 %	0 %	0 %	20 %	158320525
1079	NC_009922	TAAAA	2	10	1603943	1603952	80 %	20 %	0 %	0 %	158320532
1080	NC_009922	AACAG	2	10	1606230	1606239	60 %	0 %	20 %	20 %	158320533
1081	NC_009922	GAATC	2	10	1606611	1606620	40 %	20 %	20 %	20 %	158320534
1082	NC_009922	AAATG	2	10	1606818	1606827	60 %	20 %	20 %	0 %	158320534
1083	NC_009922	CTATG	2	10	1608103	1608112	20 %	40 %	20 %	20 %	158320535
1084	NC_009922	ATTAA	2	10	1608884	1608893	60 %	40 %	0 %	0 %	158320536
1085	NC_009922	AGGTA	2	10	1608973	1608982	40 %	20 %	40 %	0 %	158320536
1086	NC_009922	AACAA	2	10	1611232	1611241	80 %	0 %	0 %	20 %	158320538
1087	NC_009922	GAATT	2	10	1611513	1611522	40 %	40 %	20 %	0 %	158320538
1088	NC_009922	ACACT	2	10	1611822	1611831	40 %	20 %	0 %	40 %	158320538
1089	NC_009922	TAAAT	2	10	1612353	1612362	60 %	40 %	0 %	0 %	158320539
1090	NC_009922	AATTC	2	10	1613813	1613822	40 %	40 %	0 %	20 %	158320541
1091	NC_009922	ATTTG	2	10	1614113	1614122	20 %	60 %	20 %	0 %	158320542
1092	NC_009922	CAAAT	2	10	1614866	1614875	60 %	20 %	0 %	20 %	158320543
1093	NC_009922	AAAAT	2	10	1616683	1616692	80 %	20 %	0 %	0 %	158320544
1094	NC_009922	AGAAA	2	10	1617634	1617643	80 %	0 %	20 %	0 %	158320545
1095	NC_009922	AGAAA	2	10	1619966	1619975	80 %	0 %	20 %	0 %	158320548
1096	NC_009922	AAGAA	2	10	1620524	1620533	80 %	0 %	20 %	0 %	158320549
1097	NC_009922	TATCC	2	10	1622646	1622655	20 %	40 %	0 %	40 %	158320551
1098	NC_009922	AATAG	2	10	1622971	1622980	60 %	20 %	20 %	0 %	158320551
1099	NC_009922	TATTC	2	10	1623152	1623161	20 %	60 %	0 %	20 %	158320552
1100	NC_009922	GCTCT	2	10	1625019	1625028	0 %	40 %	20 %	40 %	158320553
1101	NC_009922	ATGTG	2	10	1627995	1628004	20 %	40 %	40 %	0 %	158320555
1102	NC_009922	AGATG	2	10	1628106	1628115	40 %	20 %	40 %	0 %	158320555
1103	NC_009922	GAAAA	2	10	1628138	1628147	80 %	0 %	20 %	0 %	158320555
1104	NC_009922	CAACT	2	10	1628836	1628845	40 %	20 %	0 %	40 %	158320555
1105	NC_009922	CAGAA	2	10	1631282	1631291	60 %	0 %	20 %	20 %	158320557
1106	NC_009922	AATGA	2	10	1631912	1631921	60 %	20 %	20 %	0 %	158320558
1107	NC_009922	CGGTA	2	10	1633647	1633656	20 %	20 %	40 %	20 %	158320560
1108	NC_009922	AAATT	2	10	1637734	1637743	60 %	40 %	0 %	0 %	158320564
1109	NC_009922	ATTCC	2	10	1638740	1638749	20 %	40 %	0 %	40 %	158320566
1110	NC_009922	GAGAA	2	10	1641527	1641536	60 %	0 %	40 %	0 %	158320568
1111	NC_009922	CATAG	2	10	1643444	1643453	40 %	20 %	20 %	20 %	158320570
1112	NC_009922	AAAAG	2	10	1644658	1644667	80 %	0 %	20 %	0 %	158320571
1113	NC_009922	TCAGC	2	10	1644836	1644845	20 %	20 %	20 %	40 %	158320571
1114	NC_009922	AGGAT	2	10	1646194	1646203	40 %	20 %	40 %	0 %	158320571
1115	NC_009922	GAAAA	2	10	1648154	1648163	80 %	0 %	20 %	0 %	158320574
1116	NC_009922	AAAAT	2	10	1649100	1649109	80 %	20 %	0 %	0 %	158320574
1117	NC_009922	ATTCA	2	10	1650136	1650145	40 %	40 %	0 %	20 %	158320575
1118	NC_009922	CAAAG	2	10	1652710	1652719	60 %	0 %	20 %	20 %	158320578
1119	NC_009922	TCCAA	2	10	1653167	1653176	40 %	20 %	0 %	40 %	158320578
1120	NC_009922	GCCAT	2	10	1653402	1653411	20 %	20 %	20 %	40 %	158320578
1121	NC_009922	ACCTT	2	10	1653973	1653982	20 %	40 %	0 %	40 %	158320579
1122	NC_009922	ATCAT	2	10	1656376	1656385	40 %	40 %	0 %	20 %	158320580
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1124	NC_009922	TTTTC	2	10	1659816	1659825	0 %	80 %	0 %	20 %	158320583
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1493	NC_009922	ACCAA	2	10	2207940	2207949	60 %	0 %	0 %	40 %	158321099
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