MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 2096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009922	TTAAT	2	10	2226381	2226390	40 %	60 %	0 %	0 %	158321116
1502	NC_009922	ATTCT	2	10	2228599	2228608	20 %	60 %	0 %	20 %	158321119
1503	NC_009922	ATGCC	2	10	2228885	2228894	20 %	20 %	20 %	40 %	158321119
1504	NC_009922	CCATC	2	10	2229648	2229657	20 %	20 %	0 %	60 %	158321120
1505	NC_009922	GATTT	2	10	2231230	2231239	20 %	60 %	20 %	0 %	158321121
1506	NC_009922	CATTT	2	10	2233693	2233702	20 %	60 %	0 %	20 %	158321123
1507	NC_009922	GAATT	2	10	2233771	2233780	40 %	40 %	20 %	0 %	158321123
1508	NC_009922	ATTTA	2	10	2234384	2234393	40 %	60 %	0 %	0 %	158321124
1509	NC_009922	ATAAA	2	10	2235540	2235549	80 %	20 %	0 %	0 %	158321124
1510	NC_009922	TTTTC	2	10	2236750	2236759	0 %	80 %	0 %	20 %	158321125
1511	NC_009922	GCTTG	2	10	2239404	2239413	0 %	40 %	40 %	20 %	158321128
1512	NC_009922	TCTTT	2	10	2241746	2241755	0 %	80 %	0 %	20 %	158321130
1513	NC_009922	ATATT	2	10	2241911	2241920	40 %	60 %	0 %	0 %	158321130
1514	NC_009922	TTTTC	2	10	2243283	2243292	0 %	80 %	0 %	20 %	158321131
1515	NC_009922	GGTAT	2	10	2244134	2244143	20 %	40 %	40 %	0 %	158321131
1516	NC_009922	CCTTG	2	10	2244462	2244471	0 %	40 %	20 %	40 %	158321131
1517	NC_009922	ATTTT	2	10	2246972	2246981	20 %	80 %	0 %	0 %	158321133
1518	NC_009922	TTCTC	2	10	2247134	2247143	0 %	60 %	0 %	40 %	158321133
1519	NC_009922	AAATA	2	10	2248452	2248461	80 %	20 %	0 %	0 %	158321134
1520	NC_009922	AAATA	2	10	2248671	2248680	80 %	20 %	0 %	0 %	158321134
1521	NC_009922	CAATT	2	10	2250266	2250275	40 %	40 %	0 %	20 %	158321137
1522	NC_009922	ATATT	2	10	2251071	2251080	40 %	60 %	0 %	0 %	158321138
1523	NC_009922	TTCCC	2	10	2252065	2252074	0 %	40 %	0 %	60 %	158321139
1524	NC_009922	ATATA	2	10	2254092	2254101	60 %	40 %	0 %	0 %	158321143
1525	NC_009922	CTTCT	2	10	2259357	2259366	0 %	60 %	0 %	40 %	158321149
1526	NC_009922	AATAA	2	10	2260986	2260995	80 %	20 %	0 %	0 %	158321150
1527	NC_009922	CGAAG	2	10	2265209	2265218	40 %	0 %	40 %	20 %	158321153
1528	NC_009922	CATGG	2	10	2265570	2265579	20 %	20 %	40 %	20 %	158321153
1529	NC_009922	ATGCA	2	10	2267664	2267673	40 %	20 %	20 %	20 %	158321157
1530	NC_009922	ATAAA	2	10	2269079	2269088	80 %	20 %	0 %	0 %	158321159
1531	NC_009922	TTAAA	2	10	2273998	2274007	60 %	40 %	0 %	0 %	158321164
1532	NC_009922	AAATA	2	10	2274035	2274044	80 %	20 %	0 %	0 %	158321164
1533	NC_009922	CATCC	2	10	2274743	2274752	20 %	20 %	0 %	60 %	158321165
1534	NC_009922	TGTCC	2	10	2275975	2275984	0 %	40 %	20 %	40 %	158321165
1535	NC_009922	CCATC	2	10	2276416	2276425	20 %	20 %	0 %	60 %	158321165
1536	NC_009922	TGCTT	2	10	2277126	2277135	0 %	60 %	20 %	20 %	158321166
1537	NC_009922	AACAT	2	10	2279782	2279791	60 %	20 %	0 %	20 %	158321168
1538	NC_009922	CCCAG	2	10	2281227	2281236	20 %	0 %	20 %	60 %	158321168
1539	NC_009922	ACAGG	2	10	2281590	2281599	40 %	0 %	40 %	20 %	158321169
1540	NC_009922	CTGTC	2	10	2285929	2285938	0 %	40 %	20 %	40 %	158321173
1541	NC_009922	CAGTG	2	10	2286159	2286168	20 %	20 %	40 %	20 %	158321173
1542	NC_009922	CATTT	2	10	2287003	2287012	20 %	60 %	0 %	20 %	158321174
1543	NC_009922	AATGG	2	10	2290311	2290320	40 %	20 %	40 %	0 %	158321177
1544	NC_009922	GCTTT	2	10	2290711	2290720	0 %	60 %	20 %	20 %	158321178
1545	NC_009922	TTCTA	2	10	2293377	2293386	20 %	60 %	0 %	20 %	158321179
1546	NC_009922	TATCT	2	10	2293578	2293587	20 %	60 %	0 %	20 %	158321179
1547	NC_009922	AATCA	2	10	2294879	2294888	60 %	20 %	0 %	20 %	158321180
1548	NC_009922	TATAA	2	10	2295941	2295950	60 %	40 %	0 %	0 %	158321180
1549	NC_009922	AAAAT	2	10	2297197	2297206	80 %	20 %	0 %	0 %	158321181
1550	NC_009922	GGAAA	2	10	2299112	2299121	60 %	0 %	40 %	0 %	158321182
1551	NC_009922	AAAAT	2	10	2301497	2301506	80 %	20 %	0 %	0 %	158321185
1552	NC_009922	ATAGA	2	10	2301535	2301544	60 %	20 %	20 %	0 %	158321185
1553	NC_009922	ACTTT	2	10	2302497	2302506	20 %	60 %	0 %	20 %	158321186
1554	NC_009922	GTTAA	2	10	2303828	2303837	40 %	40 %	20 %	0 %	158321186
1555	NC_009922	ACAAT	2	10	2304429	2304438	60 %	20 %	0 %	20 %	158321186
1556	NC_009922	AAACA	2	10	2304664	2304673	80 %	0 %	0 %	20 %	158321186
1557	NC_009922	CTTTC	2	10	2305261	2305270	0 %	60 %	0 %	40 %	158321187
1558	NC_009922	CAATC	2	10	2308497	2308506	40 %	20 %	0 %	40 %	158321190
1559	NC_009922	TCATT	2	10	2309483	2309492	20 %	60 %	0 %	20 %	158321190
1560	NC_009922	ATATT	2	10	2314128	2314137	40 %	60 %	0 %	0 %	158321196
1561	NC_009922	GGTAT	2	10	2314197	2314206	20 %	40 %	40 %	0 %	158321196
1562	NC_009922	CAATA	2	10	2323838	2323847	60 %	20 %	0 %	20 %	158321204
1563	NC_009922	TACCC	2	10	2324260	2324269	20 %	20 %	0 %	60 %	158321204
1564	NC_009922	TCTCT	2	10	2328822	2328831	0 %	60 %	0 %	40 %	158321209
1565	NC_009922	TCACC	2	10	2330139	2330148	20 %	20 %	0 %	60 %	158321211
1566	NC_009922	GCAAT	2	10	2330847	2330856	40 %	20 %	20 %	20 %	158321211
1567	NC_009922	AAAGG	2	10	2332302	2332311	60 %	0 %	40 %	0 %	158321212
1568	NC_009922	TATTT	2	10	2333498	2333507	20 %	80 %	0 %	0 %	158321214
1569	NC_009922	ATATT	2	10	2334125	2334134	40 %	60 %	0 %	0 %	158321215
1570	NC_009922	TCGTA	2	10	2334711	2334720	20 %	40 %	20 %	20 %	158321215
1571	NC_009922	TTTCA	2	10	2335795	2335804	20 %	60 %	0 %	20 %	158321217
1572	NC_009922	TTGGA	2	10	2336175	2336184	20 %	40 %	40 %	0 %	158321217
1573	NC_009922	ATGGA	2	10	2336793	2336802	40 %	20 %	40 %	0 %	158321218
1574	NC_009922	TAAAG	2	10	2337213	2337222	60 %	20 %	20 %	0 %	158321218
1575	NC_009922	GCAAT	2	10	2339024	2339033	40 %	20 %	20 %	20 %	158321219
1576	NC_009922	CTGAG	2	10	2339973	2339982	20 %	20 %	40 %	20 %	158321220
1577	NC_009922	ATTTT	2	10	2340901	2340910	20 %	80 %	0 %	0 %	158321221
1578	NC_009922	GCTTT	2	10	2342794	2342803	0 %	60 %	20 %	20 %	158321221
1579	NC_009922	CTTTT	2	10	2343289	2343298	0 %	80 %	0 %	20 %	158321221
1580	NC_009922	TTCAC	2	10	2344393	2344402	20 %	40 %	0 %	40 %	158321222
1581	NC_009922	TCCTT	2	10	2351205	2351214	0 %	60 %	0 %	40 %	158321224
1582	NC_009922	ATATT	2	10	2351678	2351687	40 %	60 %	0 %	0 %	158321224
1583	NC_009922	TTTTC	2	10	2351711	2351720	0 %	80 %	0 %	20 %	158321224
1584	NC_009922	TTCTT	2	10	2352212	2352221	0 %	80 %	0 %	20 %	158321225
1585	NC_009922	AAATT	2	10	2355722	2355731	60 %	40 %	0 %	0 %	158321228
1586	NC_009922	GGATT	2	10	2357845	2357854	20 %	40 %	40 %	0 %	158321232
1587	NC_009922	TTCTC	2	10	2359695	2359704	0 %	60 %	0 %	40 %	158321235
1588	NC_009922	ATGAT	2	10	2360786	2360795	40 %	40 %	20 %	0 %	158321236
1589	NC_009922	ATAAA	2	10	2361187	2361196	80 %	20 %	0 %	0 %	158321236
1590	NC_009922	TACCG	2	10	2363046	2363055	20 %	20 %	20 %	40 %	158321237
1591	NC_009922	GAAAA	2	10	2363386	2363395	80 %	0 %	20 %	0 %	158321237
1592	NC_009922	AATAA	2	10	2365280	2365289	80 %	20 %	0 %	0 %	158321240
1593	NC_009922	ATCAG	2	10	2370932	2370941	40 %	20 %	20 %	20 %	158321246
1594	NC_009922	CTATT	2	10	2371289	2371298	20 %	60 %	0 %	20 %	158321247
1595	NC_009922	CGCAG	2	10	2372434	2372443	20 %	0 %	40 %	40 %	158321247
1596	NC_009922	GGATC	2	10	2372470	2372479	20 %	20 %	40 %	20 %	158321247
1597	NC_009922	TCCGT	2	10	2373416	2373425	0 %	40 %	20 %	40 %	158321247
1598	NC_009922	ATACC	2	10	2373822	2373831	40 %	20 %	0 %	40 %	158321247
1599	NC_009922	CCAAT	2	10	2373837	2373846	40 %	20 %	0 %	40 %	158321247
1600	NC_009922	GTTTC	2	10	2374417	2374426	0 %	60 %	20 %	20 %	158321247
1601	NC_009922	ACTTG	2	10	2376242	2376251	20 %	40 %	20 %	20 %	158321248
1602	NC_009922	AATTG	2	10	2377924	2377933	40 %	40 %	20 %	0 %	158321251
1603	NC_009922	AAAGC	2	10	2378801	2378810	60 %	0 %	20 %	20 %	158321251
1604	NC_009922	ACAAT	2	10	2379683	2379692	60 %	20 %	0 %	20 %	158321252
1605	NC_009922	TTAAA	2	10	2380318	2380327	60 %	40 %	0 %	0 %	158321253
1606	NC_009922	TTGTA	2	10	2382775	2382784	20 %	60 %	20 %	0 %	158321256
1607	NC_009922	ATATT	2	10	2384008	2384017	40 %	60 %	0 %	0 %	158321258
1608	NC_009922	ATTTT	2	10	2384478	2384487	20 %	80 %	0 %	0 %	158321258
1609	NC_009922	TAAAG	2	10	2384950	2384959	60 %	20 %	20 %	0 %	158321259
1610	NC_009922	GAAAA	2	10	2385103	2385112	80 %	0 %	20 %	0 %	158321259
1611	NC_009922	ATTTC	2	10	2385239	2385248	20 %	60 %	0 %	20 %	158321259
1612	NC_009922	AATTT	2	10	2386561	2386570	40 %	60 %	0 %	0 %	158321260
1613	NC_009922	AAAGT	2	10	2386645	2386654	60 %	20 %	20 %	0 %	158321260
1614	NC_009922	CTATA	2	10	2387438	2387447	40 %	40 %	0 %	20 %	158321261
1615	NC_009922	AACAC	2	10	2387926	2387935	60 %	0 %	0 %	40 %	158321261
1616	NC_009922	ATTTA	2	10	2390162	2390171	40 %	60 %	0 %	0 %	158321264
1617	NC_009922	GATTT	2	10	2394052	2394061	20 %	60 %	20 %	0 %	158321267
1618	NC_009922	ACTGC	2	10	2394075	2394084	20 %	20 %	20 %	40 %	158321267
1619	NC_009922	TTGTT	2	10	2394710	2394719	0 %	80 %	20 %	0 %	158321268
1620	NC_009922	TGGTA	2	10	2397662	2397671	20 %	40 %	40 %	0 %	158321271
1621	NC_009922	CATAG	2	10	2398518	2398527	40 %	20 %	20 %	20 %	158321271
1622	NC_009922	GATAT	2	10	2403199	2403208	40 %	40 %	20 %	0 %	158321274
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1624	NC_009922	AATCC	2	10	2409254	2409263	40 %	20 %	0 %	40 %	158321279
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1873	NC_009922	TTGTA	2	10	2764027	2764036	20 %	60 %	20 %	0 %	158321581
1874	NC_009922	CCGAA	2	10	2765179	2765188	40 %	0 %	20 %	40 %	158321582
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1885	NC_009922	TAGAA	2	10	2786696	2786705	60 %	20 %	20 %	0 %	158321606
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1889	NC_009922	CTTCC	2	10	2794098	2794107	0 %	40 %	0 %	60 %	158321612
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1896	NC_009922	TCTTA	2	10	2808658	2808667	20 %	60 %	0 %	20 %	158321623
1897	NC_009922	TCATT	2	10	2814451	2814460	20 %	60 %	0 %	20 %	158321624
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1909	NC_009922	ATAAA	2	10	2823456	2823465	80 %	20 %	0 %	0 %	158321629
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1978	NC_009922	AAGAT	2	10	2925051	2925060	60 %	20 %	20 %	0 %	158321711
1979	NC_009922	ATTTT	2	10	2927252	2927261	20 %	80 %	0 %	0 %	158321713
1980	NC_009922	TCCCT	2	10	2927504	2927513	0 %	40 %	0 %	60 %	158321713
1981	NC_009922	TTTCC	2	10	2927920	2927929	0 %	60 %	0 %	40 %	158321714
1982	NC_009922	CAATA	2	10	2933194	2933203	60 %	20 %	0 %	20 %	158321719
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1984	NC_009922	GCTAC	2	10	2934629	2934638	20 %	20 %	20 %	40 %	158321719
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1986	NC_009922	TTTGT	2	10	2936989	2936998	0 %	80 %	20 %	0 %	158321720
1987	NC_009922	CATAG	2	10	2937070	2937079	40 %	20 %	20 %	20 %	158321720
1988	NC_009922	CCTTT	2	10	2940528	2940537	0 %	60 %	0 %	40 %	158321723
1989	NC_009922	CCCTG	2	10	2941562	2941571	0 %	20 %	20 %	60 %	158321724
1990	NC_009922	TAAAT	2	10	2941700	2941709	60 %	40 %	0 %	0 %	158321724
1991	NC_009922	GTATT	2	10	2946045	2946054	20 %	60 %	20 %	0 %	158321727
1992	NC_009922	GAAAT	2	10	2951020	2951029	60 %	20 %	20 %	0 %	158321731
1993	NC_009922	ATTCA	2	10	2955034	2955043	40 %	40 %	0 %	20 %	158321732
1994	NC_009922	AAAGC	2	10	2957067	2957076	60 %	0 %	20 %	20 %	158321733
1995	NC_009922	CTAAA	2	10	2959573	2959582	60 %	20 %	0 %	20 %	158321735
1996	NC_009922	TTTCC	2	10	2960152	2960161	0 %	60 %	0 %	40 %	158321736
1997	NC_009922	TTCTT	2	10	2961716	2961725	0 %	80 %	0 %	20 %	158321738
1998	NC_009922	ATTAC	2	10	2962612	2962621	40 %	40 %	0 %	20 %	158321738
1999	NC_009922	GCATT	2	10	2965790	2965799	20 %	40 %	20 %	20 %	158321741
2000	NC_009922	TCACT	2	10	2967584	2967593	20 %	40 %	0 %	40 %	158321742

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