MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 2096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009922	TCAAT	2	10	2973273	2973282	40 %	40 %	0 %	20 %	158321749
2002	NC_009922	ATTTT	2	10	2974937	2974946	20 %	80 %	0 %	0 %	158321751
2003	NC_009922	TTAGC	2	10	2977137	2977146	20 %	40 %	20 %	20 %	158321753
2004	NC_009922	TACTG	2	10	2977309	2977318	20 %	40 %	20 %	20 %	158321753
2005	NC_009922	GTAAA	2	10	2977779	2977788	60 %	20 %	20 %	0 %	158321754
2006	NC_009922	TTATT	2	10	2978376	2978385	20 %	80 %	0 %	0 %	158321755
2007	NC_009922	AATGC	2	10	2978528	2978537	40 %	20 %	20 %	20 %	158321756
2008	NC_009922	CCTAT	2	10	2984867	2984876	20 %	40 %	0 %	40 %	158321761
2009	NC_009922	CCAAT	2	10	2987233	2987242	40 %	20 %	0 %	40 %	158321763
2010	NC_009922	ATTTG	2	10	2987824	2987833	20 %	60 %	20 %	0 %	158321763
2011	NC_009922	GTTTC	2	10	2989035	2989044	0 %	60 %	20 %	20 %	158321765
2012	NC_009922	ACACC	2	10	2992880	2992889	40 %	0 %	0 %	60 %	158321769
2013	NC_009922	CTTTT	2	10	2994330	2994339	0 %	80 %	0 %	20 %	158321771
2014	NC_009922	ATCCA	2	10	2994573	2994582	40 %	20 %	0 %	40 %	158321771
2015	NC_009922	ATTTT	2	10	2996547	2996556	20 %	80 %	0 %	0 %	158321773
2016	NC_009922	TTTTG	2	10	2996816	2996825	0 %	80 %	20 %	0 %	158321774
2017	NC_009922	TAATT	2	10	3000141	3000150	40 %	60 %	0 %	0 %	158321776
2018	NC_009922	TTTAT	2	10	3000860	3000869	20 %	80 %	0 %	0 %	158321778
2019	NC_009922	TTTGT	2	10	3001300	3001309	0 %	80 %	20 %	0 %	158321778
2020	NC_009922	TCATC	2	10	3007484	3007493	20 %	40 %	0 %	40 %	158321783
2021	NC_009922	AAAAG	2	10	3010191	3010200	80 %	0 %	20 %	0 %	158321786
2022	NC_009922	AAAAC	2	10	3010475	3010484	80 %	0 %	0 %	20 %	158321786
2023	NC_009922	AAAAG	2	10	3010618	3010627	80 %	0 %	20 %	0 %	158321787
2024	NC_009922	ATTTA	2	10	3010783	3010792	40 %	60 %	0 %	0 %	158321787
2025	NC_009922	TGTAT	2	10	3010993	3011002	20 %	60 %	20 %	0 %	158321788
2026	NC_009922	TATTT	2	10	3011101	3011110	20 %	80 %	0 %	0 %	158321788
2027	NC_009922	CGATG	2	10	3011989	3011998	20 %	20 %	40 %	20 %	158321789
2028	NC_009922	GAAAA	2	10	3012206	3012215	80 %	0 %	20 %	0 %	158321790
2029	NC_009922	TTGCA	2	10	3012471	3012480	20 %	40 %	20 %	20 %	158321790
2030	NC_009922	ACTTG	2	10	3016557	3016566	20 %	40 %	20 %	20 %	158321794
2031	NC_009922	TCCAT	2	10	3017219	3017228	20 %	40 %	0 %	40 %	158321794
2032	NC_009922	CTCTT	2	10	3020453	3020462	0 %	60 %	0 %	40 %	158321798
2033	NC_009922	GATTC	2	10	3020507	3020516	20 %	40 %	20 %	20 %	158321798
2034	NC_009922	CTACC	2	10	3021273	3021282	20 %	20 %	0 %	60 %	158321799
2035	NC_009922	CTTCA	2	10	3024569	3024578	20 %	40 %	0 %	40 %	158321801
2036	NC_009922	TAGAG	2	10	3025139	3025148	40 %	20 %	40 %	0 %	158321802
2037	NC_009922	CCCAT	2	10	3025291	3025300	20 %	20 %	0 %	60 %	158321802
2038	NC_009922	TCGGA	2	10	3026853	3026862	20 %	20 %	40 %	20 %	158321803
2039	NC_009922	ATACC	2	10	3030387	3030396	40 %	20 %	0 %	40 %	158321806
2040	NC_009922	TCCCA	2	10	3030607	3030616	20 %	20 %	0 %	60 %	158321806
2041	NC_009922	TTTGT	2	10	3031554	3031563	0 %	80 %	20 %	0 %	158321807
2042	NC_009922	CAATC	2	10	3032374	3032383	40 %	20 %	0 %	40 %	158321808
2043	NC_009922	CCATA	2	10	3033927	3033936	40 %	20 %	0 %	40 %	158321809
2044	NC_009922	TAATG	2	10	3035292	3035301	40 %	40 %	20 %	0 %	158321810
2045	NC_009922	TATTT	2	10	3041115	3041124	20 %	80 %	0 %	0 %	158321812
2046	NC_009922	ACTTA	2	10	3041175	3041184	40 %	40 %	0 %	20 %	158321812
2047	NC_009922	AGAGA	2	10	3041443	3041452	60 %	0 %	40 %	0 %	158321813
2048	NC_009922	TACCA	2	10	3041847	3041856	40 %	20 %	0 %	40 %	158321813
2049	NC_009922	ATTCC	2	10	3041952	3041961	20 %	40 %	0 %	40 %	158321813
2050	NC_009922	TAAAT	2	10	3049707	3049716	60 %	40 %	0 %	0 %	158321819
2051	NC_009922	AAAAG	2	10	3050637	3050646	80 %	0 %	20 %	0 %	158321820
2052	NC_009922	TCTGC	2	10	3052884	3052893	0 %	40 %	20 %	40 %	158321824
2053	NC_009922	AATAA	2	10	3053009	3053018	80 %	20 %	0 %	0 %	158321824
2054	NC_009922	AAGAG	2	10	3056980	3056989	60 %	0 %	40 %	0 %	158321828
2055	NC_009922	AGGAT	2	10	3060435	3060444	40 %	20 %	40 %	0 %	158321832
2056	NC_009922	TATTT	2	10	3061664	3061673	20 %	80 %	0 %	0 %	158321833
2057	NC_009922	CTTTT	2	10	3064759	3064768	0 %	80 %	0 %	20 %	158321836
2058	NC_009922	AAAGG	2	10	3066702	3066711	60 %	0 %	40 %	0 %	158321838
2059	NC_009922	CTATG	2	10	3070549	3070558	20 %	40 %	20 %	20 %	158321842
2060	NC_009922	CTGCT	2	10	3071513	3071522	0 %	40 %	20 %	40 %	158321843
2061	NC_009922	ATAAG	2	10	3072155	3072164	60 %	20 %	20 %	0 %	158321843
2062	NC_009922	TTCTT	2	10	3072207	3072216	0 %	80 %	0 %	20 %	158321844
2063	NC_009922	TTCCT	2	10	3073421	3073430	0 %	60 %	0 %	40 %	158321845
2064	NC_009922	CCCAG	2	10	3074078	3074087	20 %	0 %	20 %	60 %	158321846
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2072	NC_009922	ATTGG	2	10	3082771	3082780	20 %	40 %	40 %	0 %	158321853
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2082	NC_009922	ATACT	2	10	3097664	3097673	40 %	40 %	0 %	20 %	158321868
2083	NC_009922	AATTT	2	10	3101026	3101035	40 %	60 %	0 %	0 %	158321871
2084	NC_009922	TTTTA	2	10	3101791	3101800	20 %	80 %	0 %	0 %	158321872
2085	NC_009922	TCTTT	2	10	3102760	3102769	0 %	80 %	0 %	20 %	158321874
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2088	NC_009922	ATTGG	2	10	3111081	3111090	20 %	40 %	40 %	0 %	158321882
2089	NC_009922	CCTAC	2	10	3111930	3111939	20 %	20 %	0 %	60 %	158321883
2090	NC_009922	AAAAC	2	10	3113342	3113351	80 %	0 %	0 %	20 %	158321884
2091	NC_009922	AGCCG	2	10	3116298	3116307	20 %	0 %	40 %	40 %	158321887
2092	NC_009922	CTCTG	2	10	3116973	3116982	0 %	40 %	20 %	40 %	158321888
2093	NC_009922	ATTCC	2	10	3117252	3117261	20 %	40 %	0 %	40 %	158321888
2094	NC_009922	CATTT	2	10	3117821	3117830	20 %	60 %	0 %	20 %	158321889
2095	NC_009922	GAATT	2	10	3121919	3121928	40 %	40 %	20 %	0 %	158321892
2096	NC_009922	AATAT	2	10	3122565	3122574	60 %	40 %	0 %	0 %	158321894

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.