MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 4316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009633	ATTCA	2	10	698	707	40 %	40 %	0 %	20 %	150387854
2	NC_009633	GTTTT	2	10	1516	1525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009633	TAAAG	2	10	3330	3339	60 %	20 %	20 %	0 %	150387857
4	NC_009633	TTGTT	2	10	3455	3464	0 %	80 %	20 %	0 %	150387857
5	NC_009633	TGAAA	2	10	6620	6629	60 %	20 %	20 %	0 %	150387860
6	NC_009633	AAATT	2	10	9713	9722	60 %	40 %	0 %	0 %	150387862
7	NC_009633	CAAGT	2	10	10603	10612	40 %	20 %	20 %	20 %	150387863
8	NC_009633	ACTTA	2	10	10633	10642	40 %	40 %	0 %	20 %	150387863
9	NC_009633	TCGTG	2	10	12377	12386	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009633	TATGG	2	10	13834	13843	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009633	AAGAT	2	10	16018	16027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009633	AGAAA	2	10	16814	16823	80 %	0 %	20 %	0 %	150387864
13	NC_009633	GTTAC	2	10	17390	17399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009633	TTTTA	2	10	17871	17880	20 %	80 %	0 %	0 %	150387866
15	NC_009633	ATGGG	2	10	17914	17923	20 %	20 %	60 %	0 %	150387866
16	NC_009633	ATGGA	2	10	18342	18351	40 %	20 %	40 %	0 %	150387867
17	NC_009633	AAATA	2	10	19033	19042	80 %	20 %	0 %	0 %	150387867
18	NC_009633	AAAAG	2	10	19773	19782	80 %	0 %	20 %	0 %	150387868
19	NC_009633	AAATA	2	10	20391	20400	80 %	20 %	0 %	0 %	150387868
20	NC_009633	GGCTA	2	10	20780	20789	20 %	20 %	40 %	20 %	150387869
21	NC_009633	CTACG	2	10	21441	21450	20 %	20 %	20 %	40 %	150387869
22	NC_009633	TCGTG	2	10	23432	23441	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009633	TATGG	2	10	24893	24902	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009633	AAGAT	2	10	27077	27086	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009633	AATGA	2	10	27693	27702	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009633	GATTA	2	10	27721	27730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009633	ATGAT	2	10	27770	27779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009633	ACAAT	2	10	28783	28792	60 %	20 %	0 %	20 %	150387871
29	NC_009633	ATTAT	2	10	29785	29794	40 %	60 %	0 %	0 %	150387871
30	NC_009633	TAGAA	2	10	30074	30083	60 %	20 %	20 %	0 %	150387871
31	NC_009633	TAGAG	2	10	30711	30720	40 %	20 %	40 %	0 %	150387872
32	NC_009633	ATGGC	2	10	31794	31803	20 %	20 %	40 %	20 %	150387874
33	NC_009633	CATTT	2	10	32693	32702	20 %	60 %	0 %	20 %	150387874
34	NC_009633	TTATT	2	10	32864	32873	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009633	ACTAA	2	10	33050	33059	60 %	20 %	0 %	20 %	150387875
36	NC_009633	CAAAT	2	10	33152	33161	60 %	20 %	0 %	20 %	150387875
37	NC_009633	GTATT	2	10	34521	34530	20 %	60 %	20 %	0 %	150387875
38	NC_009633	GAATC	2	10	35422	35431	40 %	20 %	20 %	20 %	150387875
39	NC_009633	AAGAG	2	10	35455	35464	60 %	0 %	40 %	0 %	150387875
40	NC_009633	TGTAA	2	10	36190	36199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009633	GATTT	2	10	36600	36609	20 %	60 %	20 %	0 %	150387877
42	NC_009633	TAAAA	2	10	37861	37870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009633	AGTGG	2	10	40725	40734	20 %	20 %	60 %	0 %	150387880
44	NC_009633	CAAAT	2	10	41178	41187	60 %	20 %	0 %	20 %	150387882
45	NC_009633	GTGAT	2	10	41397	41406	20 %	40 %	40 %	0 %	150387882
46	NC_009633	GATAT	2	10	41914	41923	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009633	AGAAA	2	10	43997	44006	80 %	0 %	20 %	0 %	150387885
48	NC_009633	CATTC	2	10	44684	44693	20 %	40 %	0 %	40 %	150387886
49	NC_009633	GGGTG	2	10	48131	48140	0 %	20 %	80 %	0 %	150387891
50	NC_009633	ATAAA	2	10	48627	48636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009633	TCGTG	2	10	49922	49931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009633	TATGG	2	10	51401	51410	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009633	AAGAT	2	10	53585	53594	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009633	TCGTG	2	10	55449	55458	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009633	TATGG	2	10	56950	56959	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009633	AAGAT	2	10	59134	59143	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009633	AAATC	2	10	61348	61357	60 %	20 %	0 %	20 %	150387893
58	NC_009633	AAAAG	2	10	62117	62126	80 %	0 %	20 %	0 %	150387893
59	NC_009633	TCGTT	2	10	62294	62303	0 %	60 %	20 %	20 %	150387893
60	NC_009633	AAGAA	2	10	63601	63610	80 %	0 %	20 %	0 %	150387894
61	NC_009633	GAAAA	2	10	64145	64154	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009633	CATCA	2	10	66109	66118	40 %	20 %	0 %	40 %	150387896
63	NC_009633	TGAGG	2	10	66223	66232	20 %	20 %	60 %	0 %	150387896
64	NC_009633	GTATG	2	10	67111	67120	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009633	AATTT	2	10	67918	67927	40 %	60 %	0 %	0 %	150387899
66	NC_009633	TAGTC	2	10	69385	69394	20 %	40 %	20 %	20 %	150387900
67	NC_009633	GGATA	2	10	70536	70545	40 %	20 %	40 %	0 %	150387901
68	NC_009633	TAGCC	2	10	70716	70725	20 %	20 %	20 %	40 %	150387901
69	NC_009633	TTTGC	2	10	72362	72371	0 %	60 %	20 %	20 %	150387904
70	NC_009633	GCCTT	2	10	72931	72940	0 %	40 %	20 %	40 %	150387904
71	NC_009633	TAAAT	2	10	74461	74470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009633	TTTTC	2	10	75611	75620	0 %	80 %	0 %	20 %	150387906
73	NC_009633	CACTC	2	10	76007	76016	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_009633	ATATT	2	10	76111	76120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009633	AAAGA	2	10	77925	77934	80 %	0 %	20 %	0 %	150387910
76	NC_009633	ATTGC	2	10	80515	80524	20 %	40 %	20 %	20 %	150387911
77	NC_009633	GAAAA	2	10	83292	83301	80 %	0 %	20 %	0 %	150387914
78	NC_009633	GCCCA	2	10	83491	83500	20 %	0 %	20 %	60 %	150387914
79	NC_009633	ATTTA	2	10	84220	84229	40 %	60 %	0 %	0 %	150387915
80	NC_009633	AGGGA	2	10	86656	86665	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009633	GGTTC	2	10	86954	86963	0 %	40 %	40 %	20 %	150387917
82	NC_009633	AAAGG	2	10	87302	87311	60 %	0 %	40 %	0 %	150387918
83	NC_009633	ATCAA	2	10	89421	89430	60 %	20 %	0 %	20 %	150387920
84	NC_009633	GAAAT	2	10	89757	89766	60 %	20 %	20 %	0 %	150387920
85	NC_009633	CCAGG	2	10	91955	91964	20 %	0 %	40 %	40 %	150387923
86	NC_009633	CATTG	2	10	93175	93184	20 %	40 %	20 %	20 %	150387924
87	NC_009633	AAGGG	2	10	93882	93891	40 %	0 %	60 %	0 %	150387925
88	NC_009633	GCATT	2	10	94091	94100	20 %	40 %	20 %	20 %	150387926
89	NC_009633	GAAAG	2	10	94824	94833	60 %	0 %	40 %	0 %	150387927
90	NC_009633	AATTG	2	10	95873	95882	40 %	40 %	20 %	0 %	150387928
91	NC_009633	TAAAA	3	15	99767	99781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009633	AAAAG	2	10	101055	101064	80 %	0 %	20 %	0 %	150387934
93	NC_009633	AGGGT	2	10	101631	101640	20 %	20 %	60 %	0 %	150387935
94	NC_009633	AAAAG	2	10	103569	103578	80 %	0 %	20 %	0 %	150387938
95	NC_009633	GAAAT	2	10	103624	103633	60 %	20 %	20 %	0 %	150387938
96	NC_009633	GAAGA	3	15	104302	104316	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009633	AAAGG	2	10	107362	107371	60 %	0 %	40 %	0 %	150387942
98	NC_009633	TTTCT	2	10	107848	107857	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009633	CTATA	2	10	107883	107892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009633	GTTTT	2	10	108031	108040	0 %	80 %	20 %	0 %	150387943
101	NC_009633	ATATT	2	10	110036	110045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009633	AATAA	2	10	112141	112150	80 %	20 %	0 %	0 %	150387947
103	NC_009633	AAAGA	2	10	113436	113445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009633	TTCAA	2	10	113948	113957	40 %	40 %	0 %	20 %	150387948
105	NC_009633	GATAG	2	10	115660	115669	40 %	20 %	40 %	0 %	150387950
106	NC_009633	ACAAA	2	10	116260	116269	80 %	0 %	0 %	20 %	150387951
107	NC_009633	TATGC	2	10	116700	116709	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009633	GAAAG	2	10	117133	117142	60 %	0 %	40 %	0 %	150387952
109	NC_009633	GATAT	2	10	117514	117523	40 %	40 %	20 %	0 %	150387953
110	NC_009633	ATATT	2	10	118315	118324	40 %	60 %	0 %	0 %	150387953
111	NC_009633	ATTTT	2	10	120436	120445	20 %	80 %	0 %	0 %	150387955
112	NC_009633	TTGAA	2	10	122885	122894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009633	TATTT	2	10	122948	122957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009633	TTGCA	2	10	122968	122977	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009633	AATAT	2	10	123972	123981	60 %	40 %	0 %	0 %	150387957
116	NC_009633	ATATT	2	10	128341	128350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009633	TATAA	2	10	128355	128364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009633	AAATG	2	10	129286	129295	60 %	20 %	20 %	0 %	150387962
119	NC_009633	GAATC	2	10	130587	130596	40 %	20 %	20 %	20 %	150387962
120	NC_009633	GATAA	2	10	131682	131691	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009633	AGATA	2	10	132889	132898	60 %	20 %	20 %	0 %	150387965
122	NC_009633	CTATT	2	10	135257	135266	20 %	60 %	0 %	20 %	150387968
123	NC_009633	TTTCT	2	10	136046	136055	0 %	80 %	0 %	20 %	150387969
124	NC_009633	GCAGT	2	10	136807	136816	20 %	20 %	40 %	20 %	150387969
125	NC_009633	AATTC	2	10	136840	136849	40 %	40 %	0 %	20 %	150387969
126	NC_009633	AAAAG	2	10	136908	136917	80 %	0 %	20 %	0 %	150387969
127	NC_009633	CAAAA	2	10	137586	137595	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009633	ATAAA	2	10	138124	138133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009633	TTCAT	2	10	138597	138606	20 %	60 %	0 %	20 %	150387971
130	NC_009633	CCGAT	2	10	140895	140904	20 %	20 %	20 %	40 %	150387973
131	NC_009633	AGATA	2	10	143384	143393	60 %	20 %	20 %	0 %	150387976
132	NC_009633	AAAAG	2	10	144951	144960	80 %	0 %	20 %	0 %	150387979
133	NC_009633	TATAT	2	10	145275	145284	40 %	60 %	0 %	0 %	150387979
134	NC_009633	TTGTA	2	10	145325	145334	20 %	60 %	20 %	0 %	150387979
135	NC_009633	TTGAT	2	10	150651	150660	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009633	ATAGA	2	10	152057	152066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009633	TATAA	2	10	153398	153407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009633	TATAG	2	10	156540	156549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009633	ACTGG	2	10	157251	157260	20 %	20 %	40 %	20 %	150387989
140	NC_009633	TGTTA	2	10	161471	161480	20 %	60 %	20 %	0 %	150387995
141	NC_009633	TTTAG	2	10	162784	162793	20 %	60 %	20 %	0 %	150387996
142	NC_009633	CGAAG	2	10	165156	165165	40 %	0 %	40 %	20 %	150387997
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145	NC_009633	TGCCA	2	10	172112	172121	20 %	20 %	20 %	40 %	150388002
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151	NC_009633	ACTGC	2	10	179643	179652	20 %	20 %	20 %	40 %	150388008
152	NC_009633	GCAGT	2	10	180286	180295	20 %	20 %	40 %	20 %	150388008
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154	NC_009633	TCTAT	2	10	181729	181738	20 %	60 %	0 %	20 %	150388010
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158	NC_009633	ATTTA	2	10	185705	185714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009633	GTCAA	2	10	188639	188648	40 %	20 %	20 %	20 %	150388019
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175	NC_009633	TGATA	2	10	212816	212825	40 %	40 %	20 %	0 %	150388031
176	NC_009633	AATTA	2	10	213660	213669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_009633	TCATT	2	10	214554	214563	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
180	NC_009633	AAAGT	2	10	214903	214912	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_009633	AGATT	2	10	215699	215708	40 %	40 %	20 %	0 %	150388033
182	NC_009633	TAGAG	2	10	216092	216101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_009633	AAGTT	2	10	239038	239047	40 %	40 %	20 %	0 %	150388049
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212	NC_009633	AGTTA	2	10	251214	251223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_009633	TAAAA	2	10	277226	277235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_009633	TGGAT	2	10	297457	297466	20 %	40 %	40 %	0 %	150388100
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269	NC_009633	TGGAA	2	10	313261	313270	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
270	NC_009633	TCCTG	2	10	313867	313876	0 %	40 %	20 %	40 %	150388120
271	NC_009633	TGAAA	2	10	313906	313915	60 %	20 %	20 %	0 %	150388120
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273	NC_009633	CTGTC	2	10	316463	316472	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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