MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 4316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009633	AATTT	2	10	1653229	1653238	40 %	60 %	0 %	0 %	150389366
1502	NC_009633	TAAAA	2	10	1655399	1655408	80 %	20 %	0 %	0 %	150389368
1503	NC_009633	GAATG	2	10	1655868	1655877	40 %	20 %	40 %	0 %	150389369
1504	NC_009633	GATTA	2	10	1656089	1656098	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009633	TCAAT	2	10	1658837	1658846	40 %	40 %	0 %	20 %	150389372
1506	NC_009633	CATAA	2	10	1659177	1659186	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1507	NC_009633	ATGGA	2	10	1660466	1660475	40 %	20 %	40 %	0 %	150389374
1508	NC_009633	GTTTT	2	10	1662063	1662072	0 %	80 %	20 %	0 %	150389375
1509	NC_009633	TGAGA	2	10	1662211	1662220	40 %	20 %	40 %	0 %	150389375
1510	NC_009633	TCATA	2	10	1663164	1663173	40 %	40 %	0 %	20 %	150389377
1511	NC_009633	ATTGG	2	10	1665062	1665071	20 %	40 %	40 %	0 %	150389379
1512	NC_009633	TTTAA	2	10	1665642	1665651	40 %	60 %	0 %	0 %	150389379
1513	NC_009633	ATTGA	2	10	1666796	1666805	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_009633	ATGTT	2	10	1666878	1666887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009633	TGAGA	2	10	1667161	1667170	40 %	20 %	40 %	0 %	150389382
1516	NC_009633	TATCA	2	10	1667898	1667907	40 %	40 %	0 %	20 %	150389382
1517	NC_009633	ACCAA	2	10	1669415	1669424	60 %	0 %	0 %	40 %	150389383
1518	NC_009633	AAGAA	2	10	1670266	1670275	80 %	0 %	20 %	0 %	150389384
1519	NC_009633	TTCTA	2	10	1671910	1671919	20 %	60 %	0 %	20 %	150389386
1520	NC_009633	TTAAA	2	10	1673902	1673911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_009633	GTATA	2	10	1674853	1674862	40 %	40 %	20 %	0 %	150389388
1522	NC_009633	TGATT	2	10	1680340	1680349	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009633	AAAAT	2	10	1683842	1683851	80 %	20 %	0 %	0 %	150389395
1524	NC_009633	ATGTA	2	10	1684108	1684117	40 %	40 %	20 %	0 %	150389395
1525	NC_009633	AGAAA	2	10	1685722	1685731	80 %	0 %	20 %	0 %	150389396
1526	NC_009633	AAGAA	2	10	1693028	1693037	80 %	0 %	20 %	0 %	150389397
1527	NC_009633	TGTAT	2	10	1693171	1693180	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_009633	AATGG	2	10	1694035	1694044	40 %	20 %	40 %	0 %	150389398
1529	NC_009633	AAACC	2	10	1696230	1696239	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1530	NC_009633	TAGTG	2	10	1697620	1697629	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_009633	TAAAA	2	10	1697697	1697706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_009633	TCTTT	2	10	1697889	1697898	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1533	NC_009633	AAATT	2	10	1700554	1700563	60 %	40 %	0 %	0 %	150389401
1534	NC_009633	TGGGA	2	10	1700816	1700825	20 %	20 %	60 %	0 %	150389401
1535	NC_009633	GCTTT	2	10	1702870	1702879	0 %	60 %	20 %	20 %	150389403
1536	NC_009633	TAGAA	2	10	1703531	1703540	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_009633	TACAA	2	10	1704075	1704084	60 %	20 %	0 %	20 %	150389404
1538	NC_009633	ATAAC	2	10	1704451	1704460	60 %	20 %	0 %	20 %	150389405
1539	NC_009633	ATTTC	2	10	1705280	1705289	20 %	60 %	0 %	20 %	150389405
1540	NC_009633	CAAAT	2	10	1706437	1706446	60 %	20 %	0 %	20 %	150389406
1541	NC_009633	ATTTT	2	10	1706849	1706858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_009633	TTTCT	2	10	1707452	1707461	0 %	80 %	0 %	20 %	150389407
1543	NC_009633	GTTTT	2	10	1708031	1708040	0 %	80 %	20 %	0 %	150389408
1544	NC_009633	TACCA	2	10	1708065	1708074	40 %	20 %	0 %	40 %	150389408
1545	NC_009633	TAGAA	2	10	1709304	1709313	60 %	20 %	20 %	0 %	150389409
1546	NC_009633	AGTTG	2	10	1709544	1709553	20 %	40 %	40 %	0 %	150389409
1547	NC_009633	GTTGT	2	10	1710900	1710909	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_009633	TAAAA	2	10	1713622	1713631	80 %	20 %	0 %	0 %	150389413
1549	NC_009633	AGGAG	2	10	1714311	1714320	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_009633	CAACA	2	10	1714387	1714396	60 %	0 %	0 %	40 %	150389415
1551	NC_009633	ACAAT	2	10	1719522	1719531	60 %	20 %	0 %	20 %	150389418
1552	NC_009633	AAGAG	2	10	1719908	1719917	60 %	0 %	40 %	0 %	150389418
1553	NC_009633	CTTTT	2	10	1720599	1720608	0 %	80 %	0 %	20 %	150389419
1554	NC_009633	ATATA	2	10	1721467	1721476	60 %	40 %	0 %	0 %	150389419
1555	NC_009633	TTTAT	2	10	1721887	1721896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009633	TATGA	2	10	1723152	1723161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009633	CAACA	2	10	1724648	1724657	60 %	0 %	0 %	40 %	150389423
1558	NC_009633	GTGTT	2	10	1725069	1725078	0 %	60 %	40 %	0 %	150389424
1559	NC_009633	TGAAA	2	10	1725693	1725702	60 %	20 %	20 %	0 %	150389425
1560	NC_009633	GAGAA	2	10	1731023	1731032	60 %	0 %	40 %	0 %	150389429
1561	NC_009633	AAAAT	2	10	1732020	1732029	80 %	20 %	0 %	0 %	150389429
1562	NC_009633	TGAGA	2	10	1732139	1732148	40 %	20 %	40 %	0 %	150389429
1563	NC_009633	ACAAA	2	10	1734081	1734090	80 %	0 %	0 %	20 %	150389430
1564	NC_009633	TAACC	2	10	1734350	1734359	40 %	20 %	0 %	40 %	150389431
1565	NC_009633	AAGCA	2	10	1734917	1734926	60 %	0 %	20 %	20 %	150389431
1566	NC_009633	TGGTG	2	10	1735516	1735525	0 %	40 %	60 %	0 %	150389432
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1568	NC_009633	ATATT	2	10	1738261	1738270	40 %	60 %	0 %	0 %	150389435
1569	NC_009633	AACAT	2	10	1738522	1738531	60 %	20 %	0 %	20 %	150389435
1570	NC_009633	GGAAT	2	10	1738916	1738925	40 %	20 %	40 %	0 %	150389435
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1572	NC_009633	TAAAA	2	10	1741370	1741379	80 %	20 %	0 %	0 %	150389437
1573	NC_009633	ACAGC	2	10	1754876	1754885	40 %	0 %	20 %	40 %	150389449
1574	NC_009633	CAAAA	2	10	1755225	1755234	80 %	0 %	0 %	20 %	150389449
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1576	NC_009633	TGCAA	2	10	1755806	1755815	40 %	20 %	20 %	20 %	150389449
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1579	NC_009633	TGATT	2	10	1758148	1758157	20 %	60 %	20 %	0 %	150389451
1580	NC_009633	AAGGT	2	10	1762472	1762481	40 %	20 %	40 %	0 %	150389455
1581	NC_009633	AATTA	2	10	1764270	1764279	60 %	40 %	0 %	0 %	150389456
1582	NC_009633	CTCTT	2	10	1764836	1764845	0 %	60 %	0 %	40 %	150389456
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1584	NC_009633	AGGTG	2	10	1766576	1766585	20 %	20 %	60 %	0 %	150389458
1585	NC_009633	AATTA	2	10	1767887	1767896	60 %	40 %	0 %	0 %	150389458
1586	NC_009633	ATCAT	2	10	1768002	1768011	40 %	40 %	0 %	20 %	150389458
1587	NC_009633	CTTCT	2	10	1768595	1768604	0 %	60 %	0 %	40 %	150389458
1588	NC_009633	AACCA	2	10	1768682	1768691	60 %	0 %	0 %	40 %	150389458
1589	NC_009633	AATAA	2	10	1769393	1769402	80 %	20 %	0 %	0 %	150389458
1590	NC_009633	AAAGT	2	10	1770441	1770450	60 %	20 %	20 %	0 %	150389458
1591	NC_009633	TGGTA	2	10	1772601	1772610	20 %	40 %	40 %	0 %	150389460
1592	NC_009633	ATAGA	2	10	1772849	1772858	60 %	20 %	20 %	0 %	150389460
1593	NC_009633	ATTTA	2	10	1774716	1774725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009633	GGTAT	2	10	1780605	1780614	20 %	40 %	40 %	0 %	150389465
1595	NC_009633	GAAAA	2	10	1781333	1781342	80 %	0 %	20 %	0 %	150389465
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1597	NC_009633	TATAT	2	10	1784088	1784097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_009633	CAAAT	2	10	1784767	1784776	60 %	20 %	0 %	20 %	150389469
1599	NC_009633	ATGTC	2	10	1785544	1785553	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1600	NC_009633	ATTGC	2	10	1791026	1791035	20 %	40 %	20 %	20 %	150389475
1601	NC_009633	AATAT	2	10	1791465	1791474	60 %	40 %	0 %	0 %	150389475
1602	NC_009633	AGGGG	2	10	1792228	1792237	20 %	0 %	80 %	0 %	150389475
1603	NC_009633	GAATG	2	10	1792551	1792560	40 %	20 %	40 %	0 %	150389476
1604	NC_009633	GGGAA	2	10	1794632	1794641	40 %	0 %	60 %	0 %	150389478
1605	NC_009633	ACGGT	2	10	1798012	1798021	20 %	20 %	40 %	20 %	150389482
1606	NC_009633	AGCAA	2	10	1798070	1798079	60 %	0 %	20 %	20 %	150389482
1607	NC_009633	GAATA	2	10	1798169	1798178	60 %	20 %	20 %	0 %	150389482
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1609	NC_009633	GAATA	2	10	1799591	1799600	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_009633	AAATC	2	10	1799832	1799841	60 %	20 %	0 %	20 %	150389484
1611	NC_009633	AATGA	2	10	1803625	1803634	60 %	20 %	20 %	0 %	150389487
1612	NC_009633	TGACT	2	10	1803744	1803753	20 %	40 %	20 %	20 %	150389487
1613	NC_009633	ATGAC	2	10	1809658	1809667	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_009633	TCAAA	2	10	1809988	1809997	60 %	20 %	0 %	20 %	150389491
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1616	NC_009633	AAAAG	2	10	1811213	1811222	80 %	0 %	20 %	0 %	150389492
1617	NC_009633	AGGGG	2	10	1812983	1812992	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_009633	AGCTA	2	10	1813933	1813942	40 %	20 %	20 %	20 %	150389494
1619	NC_009633	GAGAA	2	10	1816286	1816295	60 %	0 %	40 %	0 %	150389496
1620	NC_009633	TAAAA	2	10	1819073	1819082	80 %	20 %	0 %	0 %	150389498
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1622	NC_009633	ACCTA	2	10	1821220	1821229	40 %	20 %	0 %	40 %	150389499
1623	NC_009633	TTGAT	2	10	1825189	1825198	20 %	60 %	20 %	0 %	150389501
1624	NC_009633	AAAAG	2	10	1826804	1826813	80 %	0 %	20 %	0 %	150389502
1625	NC_009633	AAAGC	2	10	1827168	1827177	60 %	0 %	20 %	20 %	150389502
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1882	NC_009633	GAGTG	2	10	2119627	2119636	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1883	NC_009633	TAAGC	2	10	2119806	2119815	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1884	NC_009633	GAAGC	2	10	2120039	2120048	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1885	NC_009633	CCATA	2	10	2121315	2121324	40 %	20 %	0 %	40 %	150389813
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1895	NC_009633	GGAGA	2	10	2137981	2137990	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1989	NC_009633	TCTTA	2	10	2272678	2272687	20 %	60 %	0 %	20 %	150389962
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1996	NC_009633	ATTGA	2	10	2276107	2276116	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1997	NC_009633	ATTAT	2	10	2276764	2276773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_009633	GTTAA	2	10	2278535	2278544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_009633	TAAAT	2	10	2278860	2278869	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_009633	GCAGA	2	10	2279093	2279102	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

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