MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 4316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009633	AAAGA	2	10	2280124	2280133	80 %	0 %	20 %	0 %	150389966
2002	NC_009633	ATTTT	2	10	2281489	2281498	20 %	80 %	0 %	0 %	150389968
2003	NC_009633	TACTA	2	10	2282046	2282055	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2004	NC_009633	AAAAG	2	10	2282173	2282182	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_009633	AAAGC	2	10	2282541	2282550	60 %	0 %	20 %	20 %	150389969
2006	NC_009633	GGAAT	2	10	2283330	2283339	40 %	20 %	40 %	0 %	150389969
2007	NC_009633	ATACA	2	10	2283522	2283531	60 %	20 %	0 %	20 %	150389969
2008	NC_009633	TGATA	2	10	2283804	2283813	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_009633	CATTC	2	10	2284186	2284195	20 %	40 %	0 %	40 %	150389970
2010	NC_009633	GATTT	2	10	2284335	2284344	20 %	60 %	20 %	0 %	150389970
2011	NC_009633	TAATT	2	10	2288054	2288063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_009633	GCAGT	2	10	2288687	2288696	20 %	20 %	40 %	20 %	150389973
2013	NC_009633	AAATC	2	10	2289596	2289605	60 %	20 %	0 %	20 %	150389974
2014	NC_009633	ATTAG	2	10	2290943	2290952	40 %	40 %	20 %	0 %	150389975
2015	NC_009633	TGTAG	2	10	2291078	2291087	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_009633	ATAAA	2	10	2291666	2291675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_009633	AATTT	2	10	2292568	2292577	40 %	60 %	0 %	0 %	150389978
2018	NC_009633	TGTTT	2	10	2293468	2293477	0 %	80 %	20 %	0 %	150389979
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2021	NC_009633	GATAA	2	10	2304729	2304738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2028	NC_009633	TAAAA	2	10	2314628	2314637	80 %	20 %	0 %	0 %	150390005
2029	NC_009633	TCTTT	2	10	2315154	2315163	0 %	80 %	0 %	20 %	150390006
2030	NC_009633	TAATA	2	10	2317529	2317538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_009633	ATTAA	2	10	2318572	2318581	60 %	40 %	0 %	0 %	150390010
2032	NC_009633	ATTTT	2	10	2318621	2318630	20 %	80 %	0 %	0 %	150390010
2033	NC_009633	AAACA	2	10	2318760	2318769	80 %	0 %	0 %	20 %	150390010
2034	NC_009633	TTATT	2	10	2319970	2319979	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_009633	TTGAA	2	10	2321325	2321334	40 %	40 %	20 %	0 %	150390013
2036	NC_009633	AGAAA	2	10	2321480	2321489	80 %	0 %	20 %	0 %	150390013
2037	NC_009633	GGAGA	2	10	2322323	2322332	40 %	0 %	60 %	0 %	150390014
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2039	NC_009633	ATTTA	2	10	2323056	2323065	40 %	60 %	0 %	0 %	150390016
2040	NC_009633	TGTTA	2	10	2325038	2325047	20 %	60 %	20 %	0 %	150390018
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2046	NC_009633	TTGTC	2	10	2332266	2332275	0 %	60 %	20 %	20 %	150390025
2047	NC_009633	AATGT	2	10	2332692	2332701	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_009633	AAAGG	2	10	2333249	2333258	60 %	0 %	40 %	0 %	150390026
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2053	NC_009633	TAGGG	2	10	2340127	2340136	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_009633	AATCA	2	10	2340573	2340582	60 %	20 %	0 %	20 %	150390033
2055	NC_009633	TGGAT	2	10	2340773	2340782	20 %	40 %	40 %	0 %	150390033
2056	NC_009633	ATTGA	2	10	2341275	2341284	40 %	40 %	20 %	0 %	150390034
2057	NC_009633	TGGGT	2	10	2341627	2341636	0 %	40 %	60 %	0 %	150390034
2058	NC_009633	TTCTT	2	10	2343627	2343636	0 %	80 %	0 %	20 %	150390036
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2089	NC_009633	ATCGA	3	15	2371544	2371558	40 %	20 %	20 %	20 %	150390069
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2095	NC_009633	TAAAA	2	10	2378371	2378380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_009633	CAACA	2	10	2378665	2378674	60 %	0 %	0 %	40 %	150390079
2097	NC_009633	ATGGG	2	10	2380438	2380447	20 %	20 %	60 %	0 %	150390081
2098	NC_009633	ATTGG	2	10	2380874	2380883	20 %	40 %	40 %	0 %	150390081
2099	NC_009633	GGTAA	2	10	2382529	2382538	40 %	20 %	40 %	0 %	150390081
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2109	NC_009633	TATTT	2	10	2395346	2395355	20 %	80 %	0 %	0 %	150390093
2110	NC_009633	ATTGA	2	10	2396353	2396362	40 %	40 %	20 %	0 %	150390094
2111	NC_009633	GCTAT	2	10	2399916	2399925	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2112	NC_009633	TCTGC	2	10	2400145	2400154	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2113	NC_009633	ATAAC	2	10	2402951	2402960	60 %	20 %	0 %	20 %	150390099
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2118	NC_009633	CACAG	2	10	2407575	2407584	40 %	0 %	20 %	40 %	150390104
2119	NC_009633	AATTA	2	10	2408682	2408691	60 %	40 %	0 %	0 %	150390104
2120	NC_009633	TTGTC	2	10	2408912	2408921	0 %	60 %	20 %	20 %	150390105
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2122	NC_009633	TTTTA	2	10	2411421	2411430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_009633	TGTTA	2	10	2412960	2412969	20 %	60 %	20 %	0 %	150390110
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2125	NC_009633	CAGCT	2	10	2414549	2414558	20 %	20 %	20 %	40 %	150390112
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2490	NC_009633	TTTCT	2	10	2814662	2814671	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2491	NC_009633	TTTGC	2	10	2814799	2814808	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2498	NC_009633	ACAAA	2	10	2820268	2820277	80 %	0 %	0 %	20 %	150390566
2499	NC_009633	AACAA	2	10	2821653	2821662	80 %	0 %	0 %	20 %	150390568
2500	NC_009633	ATGGC	2	10	2822943	2822952	20 %	20 %	40 %	20 %	150390569

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