MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 4316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009633	TCATC	2	10	1149617	1149626	20 %	40 %	0 %	40 %	150388919
1002	NC_009633	CTCAT	2	10	1151998	1152007	20 %	40 %	0 %	40 %	150388920
1003	NC_009633	AATGA	2	10	1152626	1152635	60 %	20 %	20 %	0 %	150388921
1004	NC_009633	ATTAG	2	10	1154750	1154759	40 %	40 %	20 %	0 %	150388922
1005	NC_009633	GTTTT	2	10	1155142	1155151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009633	TAAAT	2	10	1155424	1155433	60 %	40 %	0 %	0 %	150388923
1007	NC_009633	TAATG	2	10	1156371	1156380	40 %	40 %	20 %	0 %	150388924
1008	NC_009633	CAATT	2	10	1156516	1156525	40 %	40 %	0 %	20 %	150388925
1009	NC_009633	TAATT	2	10	1157491	1157500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009633	CAATA	2	10	1159745	1159754	60 %	20 %	0 %	20 %	150388928
1011	NC_009633	GGTAA	2	10	1159893	1159902	40 %	20 %	40 %	0 %	150388928
1012	NC_009633	AAAAT	2	10	1160896	1160905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009633	AAGGA	2	10	1160958	1160967	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009633	CTTTT	2	10	1162040	1162049	0 %	80 %	0 %	20 %	150388930
1015	NC_009633	TGAAT	2	10	1162107	1162116	40 %	40 %	20 %	0 %	150388930
1016	NC_009633	GCACT	2	10	1162139	1162148	20 %	20 %	20 %	40 %	150388930
1017	NC_009633	AGAAA	2	10	1162902	1162911	80 %	0 %	20 %	0 %	150388930
1018	NC_009633	TAACA	2	10	1163847	1163856	60 %	20 %	0 %	20 %	150388931
1019	NC_009633	AATGA	2	10	1164095	1164104	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009633	TTCCA	2	10	1164299	1164308	20 %	40 %	0 %	40 %	150388932
1021	NC_009633	AATTA	2	10	1164479	1164488	60 %	40 %	0 %	0 %	150388932
1022	NC_009633	ATTAT	2	10	1164657	1164666	40 %	60 %	0 %	0 %	150388932
1023	NC_009633	ATTGG	2	10	1164963	1164972	20 %	40 %	40 %	0 %	150388932
1024	NC_009633	TGCAA	2	10	1164980	1164989	40 %	20 %	20 %	20 %	150388932
1025	NC_009633	GGGAT	2	10	1167345	1167354	20 %	20 %	60 %	0 %	150388936
1026	NC_009633	AATCA	2	10	1168067	1168076	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_009633	GGTAT	2	10	1170730	1170739	20 %	40 %	40 %	0 %	150388940
1028	NC_009633	TAAAT	2	10	1170755	1170764	60 %	40 %	0 %	0 %	150388940
1029	NC_009633	TGTAT	2	10	1171759	1171768	20 %	60 %	20 %	0 %	150388940
1030	NC_009633	ATAAA	2	10	1173444	1173453	80 %	20 %	0 %	0 %	150388942
1031	NC_009633	TAACA	2	10	1174430	1174439	60 %	20 %	0 %	20 %	150388943
1032	NC_009633	TATAG	2	10	1178219	1178228	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009633	TTCAA	2	10	1178946	1178955	40 %	40 %	0 %	20 %	150388948
1034	NC_009633	AGAAA	2	10	1180113	1180122	80 %	0 %	20 %	0 %	150388948
1035	NC_009633	AACCA	2	10	1180528	1180537	60 %	0 %	0 %	40 %	150388948
1036	NC_009633	TTCAG	2	10	1180650	1180659	20 %	40 %	20 %	20 %	150388948
1037	NC_009633	GAAAG	2	10	1181052	1181061	60 %	0 %	40 %	0 %	150388948
1038	NC_009633	CCTTT	2	10	1181400	1181409	0 %	60 %	0 %	40 %	150388948
1039	NC_009633	AGACC	2	10	1181782	1181791	40 %	0 %	20 %	40 %	150388948
1040	NC_009633	CTGTA	2	10	1182952	1182961	20 %	40 %	20 %	20 %	150388949
1041	NC_009633	TCAAA	2	10	1183055	1183064	60 %	20 %	0 %	20 %	150388949
1042	NC_009633	TAAAT	2	10	1183859	1183868	60 %	40 %	0 %	0 %	150388950
1043	NC_009633	AATCA	2	10	1185977	1185986	60 %	20 %	0 %	20 %	150388952
1044	NC_009633	ATTGG	2	10	1187400	1187409	20 %	40 %	40 %	0 %	150388953
1045	NC_009633	CATTG	2	10	1187497	1187506	20 %	40 %	20 %	20 %	150388953
1046	NC_009633	ATTAT	2	10	1187941	1187950	40 %	60 %	0 %	0 %	150388954
1047	NC_009633	GGAAA	2	10	1188977	1188986	60 %	0 %	40 %	0 %	150388955
1048	NC_009633	TAGGA	2	10	1189518	1189527	40 %	20 %	40 %	0 %	150388955
1049	NC_009633	GTAAA	2	10	1191780	1191789	60 %	20 %	20 %	0 %	150388958
1050	NC_009633	TGTAT	2	10	1196366	1196375	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009633	TGAAC	2	10	1196451	1196460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1052	NC_009633	AAGTG	2	10	1196638	1196647	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009633	AGATG	2	10	1197006	1197015	40 %	20 %	40 %	0 %	150388962
1054	NC_009633	GAAGT	2	10	1197454	1197463	40 %	20 %	40 %	0 %	150388962
1055	NC_009633	ACCAC	2	10	1198207	1198216	40 %	0 %	0 %	60 %	150388962
1056	NC_009633	CTATT	2	10	1199682	1199691	20 %	60 %	0 %	20 %	150388963
1057	NC_009633	CCATT	2	10	1200531	1200540	20 %	40 %	0 %	40 %	150388965
1058	NC_009633	AAAGG	2	10	1201455	1201464	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009633	ACCAA	2	10	1202051	1202060	60 %	0 %	0 %	40 %	150388969
1060	NC_009633	AGTTA	2	10	1204068	1204077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009633	TCATA	2	10	1204200	1204209	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_009633	TGCAG	2	10	1205444	1205453	20 %	20 %	40 %	20 %	150388972
1063	NC_009633	ATGAC	2	10	1205959	1205968	40 %	20 %	20 %	20 %	150388973
1064	NC_009633	AAAAG	2	10	1209297	1209306	80 %	0 %	20 %	0 %	150388977
1065	NC_009633	ATCGA	2	10	1209947	1209956	40 %	20 %	20 %	20 %	150388978
1066	NC_009633	GATAA	2	10	1212760	1212769	60 %	20 %	20 %	0 %	150388980
1067	NC_009633	ATTGA	2	10	1214853	1214862	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009633	GTTTT	2	10	1216704	1216713	0 %	80 %	20 %	0 %	150388984
1069	NC_009633	ACGAT	2	10	1218603	1218612	40 %	20 %	20 %	20 %	150388985
1070	NC_009633	GAAAT	2	10	1219134	1219143	60 %	20 %	20 %	0 %	150388985
1071	NC_009633	TAATA	2	10	1219969	1219978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009633	AAAAG	2	10	1220215	1220224	80 %	0 %	20 %	0 %	150388986
1073	NC_009633	TGGAA	2	10	1220752	1220761	40 %	20 %	40 %	0 %	150388986
1074	NC_009633	GATGC	2	10	1220952	1220961	20 %	20 %	40 %	20 %	150388986
1075	NC_009633	AAAAG	2	10	1221608	1221617	80 %	0 %	20 %	0 %	150388986
1076	NC_009633	CATTA	2	10	1221821	1221830	40 %	40 %	0 %	20 %	150388987
1077	NC_009633	AAGCA	2	10	1222261	1222270	60 %	0 %	20 %	20 %	150388987
1078	NC_009633	CCAAT	2	10	1222743	1222752	40 %	20 %	0 %	40 %	150388987
1079	NC_009633	AGATG	2	10	1225341	1225350	40 %	20 %	40 %	0 %	150388989
1080	NC_009633	GGGAA	2	10	1226042	1226051	40 %	0 %	60 %	0 %	150388990
1081	NC_009633	ATATA	2	10	1226471	1226480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009633	GAGCC	2	10	1227439	1227448	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1083	NC_009633	GGATT	2	10	1228739	1228748	20 %	40 %	40 %	0 %	150388992
1084	NC_009633	GTGAT	2	10	1229549	1229558	20 %	40 %	40 %	0 %	150388993
1085	NC_009633	AATTC	2	10	1229748	1229757	40 %	40 %	0 %	20 %	150388993
1086	NC_009633	CCTGT	2	10	1230773	1230782	0 %	40 %	20 %	40 %	150388995
1087	NC_009633	TGTAC	2	10	1231659	1231668	20 %	40 %	20 %	20 %	150388995
1088	NC_009633	TTAAA	2	10	1232529	1232538	60 %	40 %	0 %	0 %	150388995
1089	NC_009633	GAGAG	2	10	1233410	1233419	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009633	ATTTT	2	10	1233460	1233469	20 %	80 %	0 %	0 %	150388997
1091	NC_009633	TACCC	2	10	1234457	1234466	20 %	20 %	0 %	60 %	150388998
1092	NC_009633	GAATT	2	10	1236344	1236353	40 %	40 %	20 %	0 %	150389002
1093	NC_009633	TTGGC	2	10	1236735	1236744	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1094	NC_009633	AAGAA	2	10	1236987	1236996	80 %	0 %	20 %	0 %	150389003
1095	NC_009633	ATTTA	2	10	1237127	1237136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009633	ATTAA	2	10	1237158	1237167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009633	TGTAC	2	10	1237368	1237377	20 %	40 %	20 %	20 %	150389004
1098	NC_009633	AGGCG	2	10	1239487	1239496	20 %	0 %	60 %	20 %	150389005
1099	NC_009633	AAGAT	2	10	1240138	1240147	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009633	ATATA	2	10	1240278	1240287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009633	AATTA	2	10	1241200	1241209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009633	AAGGG	2	10	1241220	1241229	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009633	GCTAT	2	10	1244833	1244842	20 %	40 %	20 %	20 %	150389010
1104	NC_009633	GTGAT	2	10	1247133	1247142	20 %	40 %	40 %	0 %	150389012
1105	NC_009633	ATGTG	2	10	1247389	1247398	20 %	40 %	40 %	0 %	150389012
1106	NC_009633	CATGC	2	10	1250357	1250366	20 %	20 %	20 %	40 %	150389015
1107	NC_009633	AGAGG	2	10	1252989	1252998	40 %	0 %	60 %	0 %	150389017
1108	NC_009633	GTATT	2	10	1255113	1255122	20 %	60 %	20 %	0 %	150389020
1109	NC_009633	TCCAT	2	10	1256185	1256194	20 %	40 %	0 %	40 %	150389022
1110	NC_009633	TATAT	2	10	1258317	1258326	40 %	60 %	0 %	0 %	150389026
1111	NC_009633	AATTA	2	10	1258478	1258487	60 %	40 %	0 %	0 %	150389026
1112	NC_009633	TTCTA	2	10	1259112	1259121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1113	NC_009633	CAATG	2	10	1263211	1263220	40 %	20 %	20 %	20 %	150389031
1114	NC_009633	GTTCT	2	10	1263319	1263328	0 %	60 %	20 %	20 %	150389031
1115	NC_009633	CGAAT	2	10	1263624	1263633	40 %	20 %	20 %	20 %	150389031
1116	NC_009633	TAGCA	2	10	1263721	1263730	40 %	20 %	20 %	20 %	150389031
1117	NC_009633	CATTC	2	10	1264560	1264569	20 %	40 %	0 %	40 %	150389032
1118	NC_009633	AAATG	2	10	1265759	1265768	60 %	20 %	20 %	0 %	150389034
1119	NC_009633	TTATT	2	10	1266114	1266123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009633	TTTCT	2	10	1266907	1266916	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_009633	GTGAA	2	10	1267232	1267241	40 %	20 %	40 %	0 %	150389036
1122	NC_009633	AATCG	2	10	1267315	1267324	40 %	20 %	20 %	20 %	150389036
1123	NC_009633	AACAA	2	10	1267851	1267860	80 %	0 %	0 %	20 %	150389037
1124	NC_009633	GAAAA	2	10	1268707	1268716	80 %	0 %	20 %	0 %	150389038
1125	NC_009633	AGAAC	2	10	1268718	1268727	60 %	0 %	20 %	20 %	150389038
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1127	NC_009633	TAAAT	2	10	1273094	1273103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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