MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 83600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009525	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659758
2	NC_009525	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659758
3	NC_009525	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
4	NC_009525	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
5	NC_009525	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659758
6	NC_009525	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
7	NC_009525	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
8	NC_009525	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
9	NC_009525	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
10	NC_009525	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
11	NC_009525	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
12	NC_009525	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659758
13	NC_009525	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
14	NC_009525	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659758
15	NC_009525	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
16	NC_009525	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659758
17	NC_009525	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659758
18	NC_009525	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
19	NC_009525	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659758
20	NC_009525	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
21	NC_009525	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659758
22	NC_009525	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659758
23	NC_009525	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659758
24	NC_009525	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659758
25	NC_009525	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009525	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009525	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009525	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009525	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009525	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009525	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009525	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009525	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009525	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009525	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659759
36	NC_009525	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659759
37	NC_009525	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659759
38	NC_009525	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659759
39	NC_009525	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659759
40	NC_009525	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148659759
41	NC_009525	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659759
42	NC_009525	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659759
43	NC_009525	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659759
44	NC_009525	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659759
45	NC_009525	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659759
46	NC_009525	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659759
47	NC_009525	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659759
48	NC_009525	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659759
49	NC_009525	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659759
50	NC_009525	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659759
51	NC_009525	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659759
52	NC_009525	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659759
53	NC_009525	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659760
54	NC_009525	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
55	NC_009525	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659760
56	NC_009525	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
57	NC_009525	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659760
58	NC_009525	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659760
59	NC_009525	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659760
60	NC_009525	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
61	NC_009525	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659760
62	NC_009525	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659760
63	NC_009525	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659760
64	NC_009525	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
65	NC_009525	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
66	NC_009525	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
67	NC_009525	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
68	NC_009525	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
69	NC_009525	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659760
70	NC_009525	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659760
71	NC_009525	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659760
72	NC_009525	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659760
73	NC_009525	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659760
74	NC_009525	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659760
75	NC_009525	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659760
76	NC_009525	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659761
77	NC_009525	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659761
78	NC_009525	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659761
79	NC_009525	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659761
80	NC_009525	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659761
81	NC_009525	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659761
82	NC_009525	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659761
83	NC_009525	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009525	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659762
85	NC_009525	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
86	NC_009525	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659762
87	NC_009525	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659762
88	NC_009525	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659762
89	NC_009525	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
90	NC_009525	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
91	NC_009525	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659762
92	NC_009525	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
93	NC_009525	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
94	NC_009525	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659762
95	NC_009525	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
96	NC_009525	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
97	NC_009525	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659762
98	NC_009525	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659762
99	NC_009525	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
100	NC_009525	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659762
101	NC_009525	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
102	NC_009525	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
103	NC_009525	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659762
104	NC_009525	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659762
105	NC_009525	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659762
106	NC_009525	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659762
107	NC_009525	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659762
108	NC_009525	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
109	NC_009525	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659762
110	NC_009525	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659762
111	NC_009525	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659762
112	NC_009525	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659762
113	NC_009525	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659762
114	NC_009525	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659762
115	NC_009525	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659762
116	NC_009525	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659762
117	NC_009525	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659762
118	NC_009525	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659762
119	NC_009525	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659763
120	NC_009525	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659763
121	NC_009525	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659763
122	NC_009525	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659763
123	NC_009525	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659763
124	NC_009525	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659763
125	NC_009525	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659763
126	NC_009525	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659763
127	NC_009525	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659763
128	NC_009525	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659763
129	NC_009525	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659763
130	NC_009525	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659763
131	NC_009525	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659763
132	NC_009525	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659763
133	NC_009525	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659763
134	NC_009525	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659763
135	NC_009525	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659763
136	NC_009525	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659763
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145	NC_009525	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659763
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147	NC_009525	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659763
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150	NC_009525	CGA	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659763
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152	NC_009525	CGG	2	6	8918	8923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659763
153	NC_009525	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659763
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161	NC_009525	CTG	3	9	9312	9320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659763
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174	NC_009525	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_009525	CGG	2	6	15060	15065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_009525	CAA	2	6	15093	15098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659770
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