MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 83600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009525	TTC	2	6	86733	86738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659836
1502	NC_009525	CGG	3	9	86741	86749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659836
1503	NC_009525	CGG	2	6	86781	86786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659836
1504	NC_009525	GCC	2	6	86822	86827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659836
1505	NC_009525	GTC	2	6	86914	86919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659836
1506	NC_009525	CTT	2	6	86969	86974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_009525	CCA	2	6	87047	87052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659837
1508	NC_009525	GAA	2	6	87135	87140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659837
1509	NC_009525	CCG	2	6	87149	87154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659837
1510	NC_009525	GCG	2	6	87196	87201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659837
1511	NC_009525	GGT	2	6	87207	87212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659837
1512	NC_009525	TGT	2	6	87311	87316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659837
1513	NC_009525	CGG	3	9	87429	87437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659837
1514	NC_009525	CGA	2	6	87503	87508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659837
1515	NC_009525	GAC	2	6	87516	87521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659837
1516	NC_009525	CCG	2	6	87523	87528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659837
1517	NC_009525	CAC	2	6	87546	87551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659837
1518	NC_009525	CGA	2	6	87584	87589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659837
1519	NC_009525	CAT	2	6	87729	87734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659837
1520	NC_009525	TCG	2	6	87815	87820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659837
1521	NC_009525	AGG	2	6	87908	87913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659838
1522	NC_009525	ACC	2	6	88040	88045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659838
1523	NC_009525	AGC	2	6	88059	88064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659838
1524	NC_009525	TGG	2	6	88079	88084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659838
1525	NC_009525	CGC	2	6	88128	88133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659838
1526	NC_009525	GCG	2	6	88141	88146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659838
1527	NC_009525	CTG	2	6	88225	88230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659838
1528	NC_009525	CGT	2	6	88239	88244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659838
1529	NC_009525	CGA	2	6	88386	88391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659838
1530	NC_009525	GGC	2	6	88392	88397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659838
1531	NC_009525	CCG	2	6	88412	88417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659838
1532	NC_009525	TGC	2	6	88454	88459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659838
1533	NC_009525	CAC	2	6	88567	88572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659839
1534	NC_009525	GGC	2	6	88575	88580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659839
1535	NC_009525	GCG	2	6	88681	88686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659839
1536	NC_009525	ATC	3	9	88728	88736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659839
1537	NC_009525	AAG	2	6	88743	88748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659839
1538	NC_009525	AGG	2	6	88861	88866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659839
1539	NC_009525	CCA	2	6	88868	88873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659839
1540	NC_009525	CTG	2	6	88965	88970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659839
1541	NC_009525	AAG	2	6	88974	88979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659839
1542	NC_009525	TCG	2	6	89005	89010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659839
1543	NC_009525	ACA	2	6	89023	89028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659839
1544	NC_009525	ACC	2	6	89079	89084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659839
1545	NC_009525	CTC	2	6	89195	89200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659840
1546	NC_009525	TCC	2	6	89218	89223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659840
1547	NC_009525	GCT	2	6	89235	89240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659840
1548	NC_009525	CAA	2	6	89248	89253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659840
1549	NC_009525	GCC	2	6	89414	89419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_009525	GTG	2	6	89450	89455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_009525	TCG	2	6	89584	89589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659841
1552	NC_009525	CGG	2	6	89645	89650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659841
1553	NC_009525	GCC	2	6	89823	89828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659841
1554	NC_009525	GAT	2	6	89841	89846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659841
1555	NC_009525	GTG	2	6	89900	89905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659841
1556	NC_009525	CCG	2	6	89930	89935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659841
1557	NC_009525	CGC	2	6	89970	89975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659841
1558	NC_009525	ACG	2	6	90040	90045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659841
1559	NC_009525	GGA	2	6	90074	90079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659841
1560	NC_009525	CAC	2	6	90129	90134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659841
1561	NC_009525	GCC	2	6	90176	90181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659841
1562	NC_009525	GCC	2	6	90228	90233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659841
1563	NC_009525	GCT	2	6	90305	90310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659841
1564	NC_009525	ACG	2	6	90322	90327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659841
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1569	NC_009525	GCT	2	6	90736	90741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659842
1570	NC_009525	TTC	2	6	90885	90890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_009525	TTC	2	6	90969	90974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659843
1572	NC_009525	GCT	2	6	91013	91018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659843
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1574	NC_009525	CAG	2	6	91089	91094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659843
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1581	NC_009525	CGG	2	6	91343	91348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659844
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1601	NC_009525	CGC	2	6	92285	92290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659845
1602	NC_009525	TGA	2	6	92398	92403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659845
1603	NC_009525	GCG	2	6	92406	92411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659845
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1605	NC_009525	TGG	2	6	92478	92483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659845
1606	NC_009525	GCT	2	6	92492	92497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659845
1607	NC_009525	GGC	2	6	92505	92510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659845
1608	NC_009525	TGC	2	6	92530	92535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659845
1609	NC_009525	GCC	2	6	92547	92552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659845
1610	NC_009525	GCT	2	6	92564	92569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659845
1611	NC_009525	CGA	2	6	92578	92583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659845
1612	NC_009525	CGC	4	12	92666	92677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659845
1613	NC_009525	TGC	2	6	92683	92688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659845
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1621	NC_009525	GCG	2	6	93054	93059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659845
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1985	NC_009525	CAT	2	6	113086	113091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659864
1986	NC_009525	GAG	2	6	113243	113248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659864
1987	NC_009525	GGC	2	6	113314	113319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659864
1988	NC_009525	TCG	2	6	113334	113339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659864
1989	NC_009525	GAC	2	6	113347	113352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659864
1990	NC_009525	TCG	2	6	113355	113360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659864
1991	NC_009525	CCG	2	6	113370	113375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659864
1992	NC_009525	TGT	2	6	113385	113390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659864
1993	NC_009525	CGG	2	6	113449	113454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659864
1994	NC_009525	GCT	2	6	113498	113503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659864
1995	NC_009525	GCT	2	6	113518	113523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659864
1996	NC_009525	GTC	2	6	113552	113557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659864
1997	NC_009525	CTT	2	6	113563	113568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659864
1998	NC_009525	GTC	2	6	113663	113668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659864
1999	NC_009525	TCT	2	6	113808	113813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659864
2000	NC_009525	CGT	2	6	113830	113835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659864

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