MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 83600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009525	TTG	2	6	220885	220890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659952
4002	NC_009525	CGC	2	6	220914	220919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659952
4003	NC_009525	CGA	2	6	220925	220930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659952
4004	NC_009525	CTG	2	6	220957	220962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659952
4005	NC_009525	TCG	2	6	220994	220999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659952
4006	NC_009525	CCA	2	6	221009	221014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659952
4007	NC_009525	ATG	2	6	221185	221190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659952
4008	NC_009525	CAT	2	6	221199	221204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659952
4009	NC_009525	GGT	2	6	221214	221219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659952
4010	NC_009525	AGT	2	6	221419	221424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659953
4011	NC_009525	GCG	2	6	221430	221435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659953
4012	NC_009525	GGA	2	6	221438	221443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659953
4013	NC_009525	TGT	2	6	221453	221458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659953
4014	NC_009525	CCG	2	6	221555	221560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659953
4015	NC_009525	GGT	2	6	221599	221604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659953
4016	NC_009525	CAG	2	6	221629	221634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4017	NC_009525	GCC	2	6	221704	221709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659953
4018	NC_009525	CGG	2	6	221838	221843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659953
4019	NC_009525	ACC	2	6	221849	221854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659953
4020	NC_009525	CGG	2	6	221950	221955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659953
4021	NC_009525	CAG	2	6	222031	222036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4022	NC_009525	ACC	2	6	222047	222052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659953
4023	NC_009525	CCG	2	6	222059	222064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659953
4024	NC_009525	GGC	2	6	222090	222095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659953
4025	NC_009525	CAG	2	6	222190	222195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4026	NC_009525	GCA	2	6	222198	222203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4027	NC_009525	GCC	2	6	222217	222222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659953
4028	NC_009525	CCT	2	6	222258	222263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659953
4029	NC_009525	GCA	2	6	222297	222302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4030	NC_009525	CGA	2	6	222306	222311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4031	NC_009525	CGG	2	6	222347	222352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659953
4032	NC_009525	CGG	2	6	222361	222366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659953
4033	NC_009525	CGG	2	6	222402	222407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659953
4034	NC_009525	GCC	2	6	222436	222441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659953
4035	NC_009525	TCA	2	6	222498	222503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659953
4036	NC_009525	ATG	2	6	222542	222547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659953
4037	NC_009525	CCG	2	6	222618	222623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659953
4038	NC_009525	GCG	2	6	222638	222643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659953
4039	NC_009525	CAG	2	6	222682	222687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4040	NC_009525	GCC	2	6	222832	222837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659953
4041	NC_009525	CCT	2	6	222852	222857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659953
4042	NC_009525	ACG	3	9	222912	222920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4043	NC_009525	TCG	2	6	222950	222955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4044	NC_009525	TCG	2	6	223064	223069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659953
4045	NC_009525	CGC	2	6	223113	223118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_009525	ATG	2	6	223167	223172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_009525	CAG	2	6	223235	223240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659954
4048	NC_009525	GCA	2	6	223254	223259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659954
4049	NC_009525	CTG	2	6	223405	223410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659954
4050	NC_009525	GCA	2	6	223492	223497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659954
4051	NC_009525	CGC	2	6	223523	223528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_009525	CAC	2	6	223550	223555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_009525	ACG	2	6	223679	223684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4054	NC_009525	CCG	2	6	223752	223757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659955
4055	NC_009525	TGG	2	6	223914	223919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659955
4056	NC_009525	GCC	2	6	223985	223990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659955
4057	NC_009525	CTG	2	6	224021	224026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4058	NC_009525	GCC	2	6	224062	224067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659955
4059	NC_009525	ACG	2	6	224087	224092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4060	NC_009525	GTC	2	6	224123	224128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4061	NC_009525	GGC	2	6	224169	224174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659955
4062	NC_009525	GGC	2	6	224176	224181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659955
4063	NC_009525	GCC	2	6	224219	224224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659955
4064	NC_009525	TGC	2	6	224247	224252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4065	NC_009525	CAC	2	6	224291	224296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659955
4066	NC_009525	GAT	2	6	224332	224337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659955
4067	NC_009525	GTG	2	6	224375	224380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659955
4068	NC_009525	ATC	2	6	224381	224386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659955
4069	NC_009525	CGT	2	6	224392	224397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4070	NC_009525	CGC	2	6	224431	224436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659955
4071	NC_009525	TGG	2	6	224469	224474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659955
4072	NC_009525	TCG	2	6	224511	224516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4073	NC_009525	CGG	2	6	224532	224537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659955
4074	NC_009525	CTG	2	6	224594	224599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4075	NC_009525	TGC	2	6	224652	224657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4076	NC_009525	CGG	2	6	224661	224666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659955
4077	NC_009525	GCG	3	9	224676	224684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659955
4078	NC_009525	CAT	2	6	224734	224739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659955
4079	NC_009525	CTG	2	6	224750	224755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4080	NC_009525	GCT	2	6	224761	224766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659955
4081	NC_009525	GAT	2	6	224785	224790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659955
4082	NC_009525	CGG	2	6	224802	224807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659955
4083	NC_009525	GTT	2	6	224824	224829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659955
4084	NC_009525	CAG	2	6	224893	224898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_009525	GAA	2	6	224939	224944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659956
4086	NC_009525	CGC	2	6	225008	225013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659956
4087	NC_009525	CCG	2	6	225140	225145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659956
4088	NC_009525	GCC	2	6	225163	225168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659956
4089	NC_009525	GCC	2	6	225187	225192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659956
4090	NC_009525	GCC	3	9	225211	225219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659956
4091	NC_009525	CGC	2	6	225234	225239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659956
4092	NC_009525	AGC	2	6	225268	225273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659956
4093	NC_009525	TTG	2	6	225306	225311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659956
4094	NC_009525	CGC	2	6	225315	225320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659956
4095	NC_009525	GCC	2	6	225328	225333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659956
4096	NC_009525	TCA	2	6	225384	225389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659956
4097	NC_009525	TGG	2	6	225588	225593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659956
4098	NC_009525	CCG	2	6	225597	225602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659956
4099	NC_009525	ACG	2	6	225603	225608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659956
4100	NC_009525	CGT	2	6	225640	225645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659956
4101	NC_009525	CGG	2	6	225682	225687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659956
4102	NC_009525	CCA	2	6	225688	225693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659956
4103	NC_009525	CTA	2	6	225709	225714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659956
4104	NC_009525	CTC	2	6	225748	225753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659956
4105	NC_009525	ACA	2	6	225822	225827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659956
4106	NC_009525	GTC	2	6	225959	225964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659956
4107	NC_009525	GAA	2	6	225967	225972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659956
4108	NC_009525	ACA	2	6	225987	225992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659956
4109	NC_009525	ACG	2	6	225996	226001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659956
4110	NC_009525	AGC	2	6	226124	226129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659957
4111	NC_009525	CGG	2	6	226130	226135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659957
4112	NC_009525	CAC	2	6	226147	226152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659957
4113	NC_009525	GGC	2	6	226180	226185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659957
4114	NC_009525	CGG	2	6	226335	226340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659957
4115	NC_009525	GCT	2	6	226434	226439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659957
4116	NC_009525	CTG	2	6	226482	226487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659957
4117	NC_009525	GAA	2	6	226603	226608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659957
4118	NC_009525	CTC	2	6	226609	226614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659957
4119	NC_009525	TGG	2	6	226683	226688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659957
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4238	NC_009525	GCC	2	6	232614	232619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659959
4239	NC_009525	CCG	2	6	232677	232682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659959
4240	NC_009525	GCC	2	6	232700	232705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659959
4241	NC_009525	TGC	2	6	232731	232736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659959
4242	NC_009525	GTG	2	6	232943	232948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_009525	GCG	2	6	233001	233006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4244	NC_009525	TGG	2	6	233029	233034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659960
4245	NC_009525	TGC	2	6	233092	233097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659960
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4252	NC_009525	GCG	2	6	233373	233378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659960
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4355	NC_009525	TGC	2	6	238441	238446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659963
4356	NC_009525	TGA	2	6	238540	238545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659963
4357	NC_009525	GGC	2	6	238581	238586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659964
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4430	NC_009525	CCG	3	9	243295	243303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4475	NC_009525	CGG	2	6	245245	245250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659969
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4479	NC_009525	GTG	2	6	245685	245690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659969
4480	NC_009525	GTC	2	6	245724	245729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659969
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