MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 3896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009484	CGGCT	2	10	1158	1167	0 %	20 %	40 %	40 %	148259022
2	NC_009484	CGCGC	2	10	5558	5567	0 %	0 %	40 %	60 %	148259027
3	NC_009484	CCGGC	2	10	5841	5850	0 %	0 %	40 %	60 %	148259027
4	NC_009484	CGGGC	2	10	6925	6934	0 %	0 %	60 %	40 %	148259027
5	NC_009484	TGACG	2	10	7537	7546	20 %	20 %	40 %	20 %	148259027
6	NC_009484	GGGCA	2	10	8046	8055	20 %	0 %	60 %	20 %	148259028
7	NC_009484	CCGCG	2	10	9774	9783	0 %	0 %	40 %	60 %	148259029
8	NC_009484	CGCGG	2	10	11063	11072	0 %	0 %	60 %	40 %	148259031
9	NC_009484	CGCCC	2	10	11599	11608	0 %	0 %	20 %	80 %	148259031
10	NC_009484	CGCGG	2	10	11714	11723	0 %	0 %	60 %	40 %	148259031
11	NC_009484	CGACC	2	10	13158	13167	20 %	0 %	20 %	60 %	148259034
12	NC_009484	CTGAT	2	10	13536	13545	20 %	40 %	20 %	20 %	148259034
13	NC_009484	CGTTT	2	10	13573	13582	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009484	GGGCA	2	10	14699	14708	20 %	0 %	60 %	20 %	148259036
15	NC_009484	GATTC	2	10	14731	14740	20 %	40 %	20 %	20 %	148259037
16	NC_009484	GATGA	2	10	15633	15642	40 %	20 %	40 %	0 %	148259038
17	NC_009484	CGCGG	2	10	15701	15710	0 %	0 %	60 %	40 %	148259039
18	NC_009484	GATCT	2	10	16029	16038	20 %	40 %	20 %	20 %	148259039
19	NC_009484	GCGCC	2	10	17084	17093	0 %	0 %	40 %	60 %	148259041
20	NC_009484	TGCCG	2	10	17264	17273	0 %	20 %	40 %	40 %	148259041
21	NC_009484	GGTCG	2	10	18261	18270	0 %	20 %	60 %	20 %	148259041
22	NC_009484	CGCCT	2	10	19487	19496	0 %	20 %	20 %	60 %	148259043
23	NC_009484	ATCAC	2	10	19563	19572	40 %	20 %	0 %	40 %	148259043
24	NC_009484	GGCCG	2	10	19585	19594	0 %	0 %	60 %	40 %	148259043
25	NC_009484	CCGGC	2	10	20141	20150	0 %	0 %	40 %	60 %	148259044
26	NC_009484	GCCGC	2	10	21467	21476	0 %	0 %	40 %	60 %	148259044
27	NC_009484	CCGGC	2	10	22428	22437	0 %	0 %	40 %	60 %	148259045
28	NC_009484	GCCGC	2	10	22680	22689	0 %	0 %	40 %	60 %	148259046
29	NC_009484	TGCGC	2	10	22693	22702	0 %	20 %	40 %	40 %	148259046
30	NC_009484	AGCGC	2	10	26774	26783	20 %	0 %	40 %	40 %	148259050
31	NC_009484	CGGCG	2	10	27534	27543	0 %	0 %	60 %	40 %	148259050
32	NC_009484	CCGCG	2	10	29573	29582	0 %	0 %	40 %	60 %	148259052
33	NC_009484	GGCGC	2	10	30285	30294	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009484	TTTCC	2	10	30748	30757	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009484	CGACC	2	10	31927	31936	20 %	0 %	20 %	60 %	148259055
36	NC_009484	CGCGC	2	10	32333	32342	0 %	0 %	40 %	60 %	148259055
37	NC_009484	GCCGG	2	10	35105	35114	0 %	0 %	60 %	40 %	148259058
38	NC_009484	GCATC	2	10	35116	35125	20 %	20 %	20 %	40 %	148259058
39	NC_009484	GGACG	2	10	35437	35446	20 %	0 %	60 %	20 %	148259058
40	NC_009484	GCGCC	2	10	35570	35579	0 %	0 %	40 %	60 %	148259058
41	NC_009484	CGCCC	2	10	35686	35695	0 %	0 %	20 %	80 %	148259058
42	NC_009484	GCGCC	2	10	36064	36073	0 %	0 %	40 %	60 %	148259058
43	NC_009484	TCGAC	2	10	36638	36647	20 %	20 %	20 %	40 %	148259059
44	NC_009484	CGCGC	2	10	37002	37011	0 %	0 %	40 %	60 %	148259059
45	NC_009484	CCGGG	2	10	37125	37134	0 %	0 %	60 %	40 %	148259059
46	NC_009484	CACGG	2	10	37369	37378	20 %	0 %	40 %	40 %	148259059
47	NC_009484	CCGGG	2	10	38079	38088	0 %	0 %	60 %	40 %	148259059
48	NC_009484	CGCTT	2	10	38342	38351	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009484	GACCG	2	10	39784	39793	20 %	0 %	40 %	40 %	148259062
50	NC_009484	CGGCG	2	10	40309	40318	0 %	0 %	60 %	40 %	148259062
51	NC_009484	GGCCG	2	10	41590	41599	0 %	0 %	60 %	40 %	148259064
52	NC_009484	AGCCG	2	10	42243	42252	20 %	0 %	40 %	40 %	148259064
53	NC_009484	CAATG	2	10	42748	42757	40 %	20 %	20 %	20 %	148259064
54	NC_009484	ACCGA	2	10	42921	42930	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009484	CGCGC	2	10	43665	43674	0 %	0 %	40 %	60 %	148259065
56	NC_009484	GGGGA	2	10	45246	45255	20 %	0 %	80 %	0 %	148259066
57	NC_009484	CGGTC	2	10	45628	45637	0 %	20 %	40 %	40 %	148259066
58	NC_009484	CCGGT	2	10	45844	45853	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009484	GCCGG	2	10	47636	47645	0 %	0 %	60 %	40 %	148259069
60	NC_009484	CGCGG	2	10	47671	47680	0 %	0 %	60 %	40 %	148259069
61	NC_009484	CGGCG	3	15	47887	47901	0 %	0 %	60 %	40 %	148259069
62	NC_009484	GCCGC	2	10	48309	48318	0 %	0 %	40 %	60 %	148259069
63	NC_009484	GCCGC	2	10	51559	51568	0 %	0 %	40 %	60 %	148259072
64	NC_009484	TCGGC	2	10	51794	51803	0 %	20 %	40 %	40 %	148259072
65	NC_009484	CGGCG	2	10	52110	52119	0 %	0 %	60 %	40 %	148259072
66	NC_009484	TCGGC	2	10	53228	53237	0 %	20 %	40 %	40 %	148259072
67	NC_009484	TGCGA	2	10	53572	53581	20 %	20 %	40 %	20 %	148259072
68	NC_009484	GCTGG	2	10	54368	54377	0 %	20 %	60 %	20 %	148259073
69	NC_009484	GCCGC	2	10	54620	54629	0 %	0 %	40 %	60 %	148259074
70	NC_009484	GGCCG	2	10	57493	57502	0 %	0 %	60 %	40 %	148259076
71	NC_009484	GCGCG	2	10	58997	59006	0 %	0 %	60 %	40 %	148259078
72	NC_009484	TCCCG	2	10	59162	59171	0 %	20 %	20 %	60 %	148259078
73	NC_009484	GCCGG	2	10	62661	62670	0 %	0 %	60 %	40 %	148259080
74	NC_009484	TCGGC	2	10	62992	63001	0 %	20 %	40 %	40 %	148259080
75	NC_009484	TCGGT	2	10	64635	64644	0 %	40 %	40 %	20 %	148259081
76	NC_009484	GCCGA	2	10	64805	64814	20 %	0 %	40 %	40 %	148259081
77	NC_009484	CGGCG	2	10	65029	65038	0 %	0 %	60 %	40 %	148259082
78	NC_009484	ACCGG	2	10	68383	68392	20 %	0 %	40 %	40 %	148259084
79	NC_009484	GGGGC	2	10	68926	68935	0 %	0 %	80 %	20 %	148259085
80	NC_009484	CCGCC	2	10	70097	70106	0 %	0 %	20 %	80 %	148259086
81	NC_009484	CGGGA	2	10	70449	70458	20 %	0 %	60 %	20 %	148259086
82	NC_009484	CGCGG	2	10	70577	70586	0 %	0 %	60 %	40 %	148259086
83	NC_009484	GGCGA	2	10	70770	70779	20 %	0 %	60 %	20 %	148259086
84	NC_009484	TGCCG	2	10	70876	70885	0 %	20 %	40 %	40 %	148259086
85	NC_009484	GCCTC	2	10	70947	70956	0 %	20 %	20 %	60 %	148259087
86	NC_009484	GCCGC	2	10	73931	73940	0 %	0 %	40 %	60 %	148259089
87	NC_009484	CCGCG	2	10	74780	74789	0 %	0 %	40 %	60 %	148259090
88	NC_009484	GGGTG	2	10	75835	75844	0 %	20 %	80 %	0 %	148259091
89	NC_009484	CATCG	2	10	76120	76129	20 %	20 %	20 %	40 %	148259091
90	NC_009484	GAAAT	2	10	76161	76170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009484	GGGTG	2	10	77145	77154	0 %	20 %	80 %	0 %	148259092
92	NC_009484	TGGGG	2	10	77636	77645	0 %	20 %	80 %	0 %	148259092
93	NC_009484	GCGCG	2	10	78117	78126	0 %	0 %	60 %	40 %	148259092
94	NC_009484	AGGCG	2	10	79928	79937	20 %	0 %	60 %	20 %	148259094
95	NC_009484	CGGCG	2	10	82151	82160	0 %	0 %	60 %	40 %	148259097
96	NC_009484	CCGCG	2	10	85934	85943	0 %	0 %	40 %	60 %	148259099
97	NC_009484	AATGA	2	10	86228	86237	60 %	20 %	20 %	0 %	148259099
98	NC_009484	TCGCG	2	10	88737	88746	0 %	20 %	40 %	40 %	148259103
99	NC_009484	TGATC	2	10	88986	88995	20 %	40 %	20 %	20 %	148259103
100	NC_009484	GTCGA	2	10	89107	89116	20 %	20 %	40 %	20 %	148259103
101	NC_009484	TGAAC	2	10	89560	89569	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009484	GAGCG	2	10	89884	89893	20 %	0 %	60 %	20 %	148259104
103	NC_009484	CGTGC	2	10	91203	91212	0 %	20 %	40 %	40 %	148259105
104	NC_009484	GGCGG	2	10	91313	91322	0 %	0 %	80 %	20 %	148259105
105	NC_009484	GGGCC	2	10	91493	91502	0 %	0 %	60 %	40 %	148259105
106	NC_009484	CCGGC	2	10	91800	91809	0 %	0 %	40 %	60 %	148259105
107	NC_009484	GAGCC	2	10	92667	92676	20 %	0 %	40 %	40 %	148259105
108	NC_009484	CGGGG	2	10	92905	92914	0 %	0 %	80 %	20 %	148259105
109	NC_009484	CAGGG	2	10	93143	93152	20 %	0 %	60 %	20 %	148259105
110	NC_009484	GTGCT	2	10	96757	96766	0 %	40 %	40 %	20 %	148259108
111	NC_009484	CCGCG	2	10	98184	98193	0 %	0 %	40 %	60 %	148259110
112	NC_009484	TCCGT	2	10	99452	99461	0 %	40 %	20 %	40 %	148259111
113	NC_009484	GTTTC	2	10	100052	100061	0 %	60 %	20 %	20 %	148259111
114	NC_009484	GCTGC	2	10	102722	102731	0 %	20 %	40 %	40 %	148259113
115	NC_009484	GGAGG	2	10	103112	103121	20 %	0 %	80 %	0 %	148259113
116	NC_009484	CTGAA	2	10	104048	104057	40 %	20 %	20 %	20 %	148259113
117	NC_009484	GCCGT	2	10	104628	104637	0 %	20 %	40 %	40 %	148259114
118	NC_009484	CCCGG	2	10	105369	105378	0 %	0 %	40 %	60 %	148259115
119	NC_009484	AACCG	2	10	105778	105787	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_009484	CCGGC	2	10	106777	106786	0 %	0 %	40 %	60 %	148259116
121	NC_009484	ATCAA	2	10	108486	108495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009484	ACCGG	2	10	108726	108735	20 %	0 %	40 %	40 %	148259119
123	NC_009484	TCAAT	2	10	109854	109863	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009484	CCCGG	2	10	110511	110520	0 %	0 %	40 %	60 %	148259121
125	NC_009484	GCGCA	3	15	111686	111700	20 %	0 %	40 %	40 %	148259122
126	NC_009484	ATCAG	2	10	116710	116719	40 %	20 %	20 %	20 %	148259128
127	NC_009484	ATTGT	2	10	118532	118541	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009484	AGGGA	2	10	119012	119021	40 %	0 %	60 %	0 %	148259129
129	NC_009484	GCGAT	2	10	119582	119591	20 %	20 %	40 %	20 %	148259129
130	NC_009484	CGTTC	2	10	120795	120804	0 %	40 %	20 %	40 %	148259130
131	NC_009484	GGGGA	2	10	122882	122891	20 %	0 %	80 %	0 %	148259132
132	NC_009484	TGGCC	2	10	124989	124998	0 %	20 %	40 %	40 %	148259134
133	NC_009484	CCGGG	2	10	125782	125791	0 %	0 %	60 %	40 %	148259134
134	NC_009484	GCCAC	2	10	125942	125951	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_009484	TGGAA	2	10	126112	126121	40 %	20 %	40 %	0 %	148259135
136	NC_009484	CGAGC	2	10	129085	129094	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009484	GATCG	2	10	129395	129404	20 %	20 %	40 %	20 %	148259137
138	NC_009484	CGGCG	2	10	130754	130763	0 %	0 %	60 %	40 %	148259138
139	NC_009484	GCATC	2	10	131680	131689	20 %	20 %	20 %	40 %	148259139
140	NC_009484	CCAGC	2	10	132558	132567	20 %	0 %	20 %	60 %	148259140
141	NC_009484	GCGCC	2	10	133056	133065	0 %	0 %	40 %	60 %	148259140
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151	NC_009484	GTCAT	2	10	147888	147897	20 %	40 %	20 %	20 %	148259153
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177	NC_009484	GCCCG	2	10	171954	171963	0 %	0 %	40 %	60 %	148259169
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214	NC_009484	CGGAT	2	10	201349	201358	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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243	NC_009484	ACGGG	2	10	231703	231712	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
244	NC_009484	ATTCC	2	10	233887	233896	20 %	40 %	0 %	40 %	148259222
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265	NC_009484	CCGGC	2	10	247618	247627	0 %	0 %	40 %	60 %	148259233
266	NC_009484	GCCGG	2	10	248193	248202	0 %	0 %	60 %	40 %	148259234
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