MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 3896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009484	GATCG	2	10	1313762	1313771	20 %	20 %	40 %	20 %	148260182
1502	NC_009484	TGCCC	2	10	1314059	1314068	0 %	20 %	20 %	60 %	148260183
1503	NC_009484	GGCGC	2	10	1314246	1314255	0 %	0 %	60 %	40 %	148260183
1504	NC_009484	GCCCT	2	10	1314694	1314703	0 %	20 %	20 %	60 %	148260183
1505	NC_009484	CTGGC	2	10	1314933	1314942	0 %	20 %	40 %	40 %	148260183
1506	NC_009484	TGGCG	2	10	1315584	1315593	0 %	20 %	60 %	20 %	148260183
1507	NC_009484	CCGGG	2	10	1315874	1315883	0 %	0 %	60 %	40 %	148260183
1508	NC_009484	GCGTC	2	10	1315937	1315946	0 %	20 %	40 %	40 %	148260183
1509	NC_009484	ACCGA	2	10	1316185	1316194	40 %	0 %	20 %	40 %	148260183
1510	NC_009484	CGGCG	2	10	1317254	1317263	0 %	0 %	60 %	40 %	148260184
1511	NC_009484	GCATG	2	10	1317461	1317470	20 %	20 %	40 %	20 %	148260185
1512	NC_009484	GCCGG	2	10	1317698	1317707	0 %	0 %	60 %	40 %	148260185
1513	NC_009484	TCGGC	2	10	1318097	1318106	0 %	20 %	40 %	40 %	148260186
1514	NC_009484	CTGAT	2	10	1318456	1318465	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_009484	CGGCG	2	10	1319410	1319419	0 %	0 %	60 %	40 %	148260187
1516	NC_009484	TCTGG	2	10	1322109	1322118	0 %	40 %	40 %	20 %	148260190
1517	NC_009484	CGGCT	2	10	1322140	1322149	0 %	20 %	40 %	40 %	148260190
1518	NC_009484	CGGCG	2	10	1322523	1322532	0 %	0 %	60 %	40 %	148260190
1519	NC_009484	GCCGG	2	10	1324091	1324100	0 %	0 %	60 %	40 %	148260192
1520	NC_009484	GCCGC	2	10	1324434	1324443	0 %	0 %	40 %	60 %	148260192
1521	NC_009484	CGGAA	2	10	1324692	1324701	40 %	0 %	40 %	20 %	148260192
1522	NC_009484	GCAAC	2	10	1326855	1326864	40 %	0 %	20 %	40 %	148260195
1523	NC_009484	ACGCC	2	10	1327365	1327374	20 %	0 %	20 %	60 %	148260195
1524	NC_009484	CGGCG	2	10	1328513	1328522	0 %	0 %	60 %	40 %	148260197
1525	NC_009484	CGCGG	2	10	1328548	1328557	0 %	0 %	60 %	40 %	148260197
1526	NC_009484	CGGCG	2	10	1330130	1330139	0 %	0 %	60 %	40 %	148260198
1527	NC_009484	GCGCG	2	10	1331620	1331629	0 %	0 %	60 %	40 %	148260199
1528	NC_009484	GGCGA	2	10	1332093	1332102	20 %	0 %	60 %	20 %	148260199
1529	NC_009484	GCAGC	2	10	1334345	1334354	20 %	0 %	40 %	40 %	148260201
1530	NC_009484	GCCGT	2	10	1335723	1335732	0 %	20 %	40 %	40 %	148260202
1531	NC_009484	TCGGC	2	10	1336759	1336768	0 %	20 %	40 %	40 %	148260204
1532	NC_009484	AGCGC	2	10	1336858	1336867	20 %	0 %	40 %	40 %	148260204
1533	NC_009484	ATCGA	2	10	1336947	1336956	40 %	20 %	20 %	20 %	148260204
1534	NC_009484	CCGGC	2	10	1338098	1338107	0 %	0 %	40 %	60 %	148260206
1535	NC_009484	CGGGC	2	10	1338126	1338135	0 %	0 %	60 %	40 %	148260206
1536	NC_009484	GCCGA	2	10	1338653	1338662	20 %	0 %	40 %	40 %	148260207
1537	NC_009484	ACGGC	2	10	1339040	1339049	20 %	0 %	40 %	40 %	148260207
1538	NC_009484	AAACG	2	10	1339279	1339288	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1539	NC_009484	CCCTG	2	10	1339643	1339652	0 %	20 %	20 %	60 %	148260208
1540	NC_009484	GCCGG	2	10	1341049	1341058	0 %	0 %	60 %	40 %	148260209
1541	NC_009484	ATGGC	2	10	1341066	1341075	20 %	20 %	40 %	20 %	148260209
1542	NC_009484	GCCGG	2	10	1341751	1341760	0 %	0 %	60 %	40 %	148260209
1543	NC_009484	GGTGC	2	10	1342862	1342871	0 %	20 %	60 %	20 %	148260211
1544	NC_009484	CGCGC	3	15	1342885	1342899	0 %	0 %	40 %	60 %	148260211
1545	NC_009484	GCATC	2	10	1345367	1345376	20 %	20 %	20 %	40 %	148260212
1546	NC_009484	CGCCC	2	10	1345965	1345974	0 %	0 %	20 %	80 %	148260212
1547	NC_009484	CCCGC	2	10	1347359	1347368	0 %	0 %	20 %	80 %	148260213
1548	NC_009484	TCCAT	2	10	1347471	1347480	20 %	40 %	0 %	40 %	148260213
1549	NC_009484	CGACG	2	10	1347896	1347905	20 %	0 %	40 %	40 %	148260214
1550	NC_009484	CCAGG	2	10	1348517	1348526	20 %	0 %	40 %	40 %	148260214
1551	NC_009484	AGCGG	2	10	1348673	1348682	20 %	0 %	60 %	20 %	148260214
1552	NC_009484	GCCGG	2	10	1350332	1350341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1553	NC_009484	GCTCG	2	10	1350556	1350565	0 %	20 %	40 %	40 %	148260216
1554	NC_009484	GCGCT	2	10	1351046	1351055	0 %	20 %	40 %	40 %	148260217
1555	NC_009484	CCCCG	2	10	1352886	1352895	0 %	0 %	20 %	80 %	148260219
1556	NC_009484	GCCCT	2	10	1353302	1353311	0 %	20 %	20 %	60 %	148260219
1557	NC_009484	CACAC	2	10	1354124	1354133	40 %	0 %	0 %	60 %	148260220
1558	NC_009484	CGCAG	2	10	1354369	1354378	20 %	0 %	40 %	40 %	148260221
1559	NC_009484	CGCGC	2	10	1355116	1355125	0 %	0 %	40 %	60 %	148260221
1560	NC_009484	GCCCG	2	10	1355774	1355783	0 %	0 %	40 %	60 %	148260222
1561	NC_009484	TCCGG	2	10	1356947	1356956	0 %	20 %	40 %	40 %	148260222
1562	NC_009484	GCCGC	2	10	1357040	1357049	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1563	NC_009484	GCCAG	2	10	1358370	1358379	20 %	0 %	40 %	40 %	148260223
1564	NC_009484	CCTCG	2	10	1358734	1358743	0 %	20 %	20 %	60 %	148260223
1565	NC_009484	GCCGC	2	10	1358944	1358953	0 %	0 %	40 %	60 %	148260223
1566	NC_009484	ACGGC	2	10	1360045	1360054	20 %	0 %	40 %	40 %	148260224
1567	NC_009484	CCCTG	2	10	1360747	1360756	0 %	20 %	20 %	60 %	148260225
1568	NC_009484	CGCGC	2	10	1361545	1361554	0 %	0 %	40 %	60 %	148260225
1569	NC_009484	CGCCA	2	10	1361569	1361578	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1570	NC_009484	GGTCC	2	10	1361588	1361597	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1571	NC_009484	CTCGC	2	10	1361947	1361956	0 %	20 %	20 %	60 %	148260226
1572	NC_009484	GCCGC	2	10	1362752	1362761	0 %	0 %	40 %	60 %	148260226
1573	NC_009484	ACCAG	2	10	1364856	1364865	40 %	0 %	20 %	40 %	148260228
1574	NC_009484	CTCGA	2	10	1366294	1366303	20 %	20 %	20 %	40 %	148260229
1575	NC_009484	CGGCG	2	10	1366407	1366416	0 %	0 %	60 %	40 %	148260229
1576	NC_009484	CGGCC	2	10	1366829	1366838	0 %	0 %	40 %	60 %	148260230
1577	NC_009484	TCTGG	2	10	1367015	1367024	0 %	40 %	40 %	20 %	148260230
1578	NC_009484	CGCGG	2	10	1369801	1369810	0 %	0 %	60 %	40 %	148260233
1579	NC_009484	CCCGC	2	10	1370034	1370043	0 %	0 %	20 %	80 %	148260233
1580	NC_009484	GCCGC	2	10	1370103	1370112	0 %	0 %	40 %	60 %	148260233
1581	NC_009484	GCGCC	2	10	1370256	1370265	0 %	0 %	40 %	60 %	148260233
1582	NC_009484	CGCCA	2	10	1370287	1370296	20 %	0 %	20 %	60 %	148260233
1583	NC_009484	CCCGC	2	10	1370382	1370391	0 %	0 %	20 %	80 %	148260233
1584	NC_009484	CCGCC	2	10	1371485	1371494	0 %	0 %	20 %	80 %	148260235
1585	NC_009484	GCGCC	2	10	1371873	1371882	0 %	0 %	40 %	60 %	148260236
1586	NC_009484	CCGCG	2	10	1372309	1372318	0 %	0 %	40 %	60 %	148260236
1587	NC_009484	CGCCC	2	10	1372767	1372776	0 %	0 %	20 %	80 %	148260236
1588	NC_009484	CCGGC	2	10	1374251	1374260	0 %	0 %	40 %	60 %	148260237
1589	NC_009484	CCGCC	2	10	1374740	1374749	0 %	0 %	20 %	80 %	148260237
1590	NC_009484	GCCGT	2	10	1374778	1374787	0 %	20 %	40 %	40 %	148260237
1591	NC_009484	GCCAG	2	10	1374842	1374851	20 %	0 %	40 %	40 %	148260237
1592	NC_009484	CGCCC	2	10	1374854	1374863	0 %	0 %	20 %	80 %	148260237
1593	NC_009484	TCGGC	2	10	1375077	1375086	0 %	20 %	40 %	40 %	148260238
1594	NC_009484	GCCCG	2	10	1375432	1375441	0 %	0 %	40 %	60 %	148260238
1595	NC_009484	GCTCG	2	10	1376581	1376590	0 %	20 %	40 %	40 %	148260238
1596	NC_009484	GCGCC	2	10	1377201	1377210	0 %	0 %	40 %	60 %	148260239
1597	NC_009484	CCCCG	2	10	1377714	1377723	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1598	NC_009484	CAGCG	2	10	1377860	1377869	20 %	0 %	40 %	40 %	148260240
1599	NC_009484	CGATG	2	10	1378841	1378850	20 %	20 %	40 %	20 %	148260241
1600	NC_009484	GCGCC	2	10	1379621	1379630	0 %	0 %	40 %	60 %	148260241
1601	NC_009484	CGACC	2	10	1383539	1383548	20 %	0 %	20 %	60 %	148260246
1602	NC_009484	CAATC	2	10	1385719	1385728	40 %	20 %	0 %	40 %	148260247
1603	NC_009484	GCGCC	2	10	1387248	1387257	0 %	0 %	40 %	60 %	148260247
1604	NC_009484	GCGCC	2	10	1387827	1387836	0 %	0 %	40 %	60 %	148260248
1605	NC_009484	GCCCG	2	10	1389469	1389478	0 %	0 %	40 %	60 %	148260251
1606	NC_009484	GCCGC	2	10	1389493	1389502	0 %	0 %	40 %	60 %	148260251
1607	NC_009484	CCGCG	2	10	1390150	1390159	0 %	0 %	40 %	60 %	148260251
1608	NC_009484	CCGCG	2	10	1390635	1390644	0 %	0 %	40 %	60 %	148260251
1609	NC_009484	CCGCC	2	10	1391276	1391285	0 %	0 %	20 %	80 %	148260252
1610	NC_009484	GAGCC	2	10	1391929	1391938	20 %	0 %	40 %	40 %	148260252
1611	NC_009484	CCCGC	2	10	1394881	1394890	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1612	NC_009484	CGGTG	2	10	1395000	1395009	0 %	20 %	60 %	20 %	148260256
1613	NC_009484	GGCGC	2	10	1397453	1397462	0 %	0 %	60 %	40 %	148260257
1614	NC_009484	GGGCG	2	10	1397557	1397566	0 %	0 %	80 %	20 %	148260257
1615	NC_009484	CGGGC	2	10	1398021	1398030	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_009484	CGGCG	2	10	1399667	1399676	0 %	0 %	60 %	40 %	148260259
1617	NC_009484	CGGCA	2	10	1400633	1400642	20 %	0 %	40 %	40 %	148260260
1618	NC_009484	GGGAA	2	10	1402199	1402208	40 %	0 %	60 %	0 %	148260261
1619	NC_009484	CGGCG	2	10	1402338	1402347	0 %	0 %	60 %	40 %	148260261
1620	NC_009484	GCGCC	2	10	1403421	1403430	0 %	0 %	40 %	60 %	148260262
1621	NC_009484	CATCG	2	10	1405085	1405094	20 %	20 %	20 %	40 %	148260263
1622	NC_009484	GGCCG	2	10	1405856	1405865	0 %	0 %	60 %	40 %	148260263
1623	NC_009484	GCGCT	2	10	1406217	1406226	0 %	20 %	40 %	40 %	148260263
1624	NC_009484	TCGCG	2	10	1406868	1406877	0 %	20 %	40 %	40 %	148260264
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1626	NC_009484	GCCGC	2	10	1408167	1408176	0 %	0 %	40 %	60 %	148260265
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1750	NC_009484	CCGCG	3	15	1530213	1530227	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1996	NC_009484	CCGGC	2	10	1741309	1741318	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1997	NC_009484	GGGCA	2	10	1741546	1741555	20 %	0 %	60 %	20 %	148260577
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1999	NC_009484	GCCGC	2	10	1741847	1741856	0 %	0 %	40 %	60 %	148260577
2000	NC_009484	GCCGC	2	10	1741913	1741922	0 %	0 %	40 %	60 %	148260577

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