MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 3896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009484	GCGCC	2	10	2635908	2635917	0 %	0 %	40 %	60 %	148261379
3002	NC_009484	GCCGG	2	10	2637034	2637043	0 %	0 %	60 %	40 %	148261380
3003	NC_009484	CCGGC	2	10	2639387	2639396	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3004	NC_009484	GCTCG	2	10	2642655	2642664	0 %	20 %	40 %	40 %	148261382
3005	NC_009484	ACCCG	2	10	2644112	2644121	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3006	NC_009484	GCCGG	2	10	2644128	2644137	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3007	NC_009484	TCCCG	2	10	2644911	2644920	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3008	NC_009484	GCCGC	2	10	2645515	2645524	0 %	0 %	40 %	60 %	148261385
3009	NC_009484	ACCAC	2	10	2646324	2646333	40 %	0 %	0 %	60 %	148261386
3010	NC_009484	CGGCG	2	10	2647313	2647322	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3011	NC_009484	CCGCG	2	10	2648281	2648290	0 %	0 %	40 %	60 %	148261388
3012	NC_009484	CCGGC	2	10	2649108	2649117	0 %	0 %	40 %	60 %	148261389
3013	NC_009484	GCCCG	2	10	2649747	2649756	0 %	0 %	40 %	60 %	148261389
3014	NC_009484	CGGCG	2	10	2649784	2649793	0 %	0 %	60 %	40 %	148261389
3015	NC_009484	CGCGG	2	10	2650995	2651004	0 %	0 %	60 %	40 %	148261391
3016	NC_009484	CGGCC	2	10	2652745	2652754	0 %	0 %	40 %	60 %	148261392
3017	NC_009484	CCGGC	2	10	2653200	2653209	0 %	0 %	40 %	60 %	148261393
3018	NC_009484	CCGGA	2	10	2653504	2653513	20 %	0 %	40 %	40 %	148261393
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3020	NC_009484	CGCCC	2	10	2653852	2653861	0 %	0 %	20 %	80 %	148261393
3021	NC_009484	GGCCG	2	10	2654089	2654098	0 %	0 %	60 %	40 %	148261393
3022	NC_009484	CCCCG	2	10	2654218	2654227	0 %	0 %	20 %	80 %	148261393
3023	NC_009484	GACGC	2	10	2654847	2654856	20 %	0 %	40 %	40 %	148261395
3024	NC_009484	GCGCG	2	10	2655359	2655368	0 %	0 %	60 %	40 %	148261395
3025	NC_009484	GGACG	2	10	2655701	2655710	20 %	0 %	60 %	20 %	148261395
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3029	NC_009484	GCCGG	2	10	2657892	2657901	0 %	0 %	60 %	40 %	148261396
3030	NC_009484	GGCCG	2	10	2659077	2659086	0 %	0 %	60 %	40 %	148261398
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3032	NC_009484	CCGGG	2	10	2660317	2660326	0 %	0 %	60 %	40 %	148261399
3033	NC_009484	GCCCG	2	10	2660804	2660813	0 %	0 %	40 %	60 %	148261399
3034	NC_009484	GGTGG	2	10	2662740	2662749	0 %	20 %	80 %	0 %	148261401
3035	NC_009484	ATCGC	2	10	2663488	2663497	20 %	20 %	20 %	40 %	148261402
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3037	NC_009484	GCGCC	2	10	2665150	2665159	0 %	0 %	40 %	60 %	148261404
3038	NC_009484	CGGCG	2	10	2666851	2666860	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3039	NC_009484	AGGCA	2	10	2670246	2670255	40 %	0 %	40 %	20 %	148261407
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3041	NC_009484	TGCAT	2	10	2671472	2671481	20 %	40 %	20 %	20 %	148261407
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3044	NC_009484	GCCAT	2	10	2674392	2674401	20 %	20 %	20 %	40 %	148261410
3045	NC_009484	CATCC	2	10	2676289	2676298	20 %	20 %	0 %	60 %	148261410
3046	NC_009484	AGCCT	2	10	2676435	2676444	20 %	20 %	20 %	40 %	148261410
3047	NC_009484	GCCGG	2	10	2676917	2676926	0 %	0 %	60 %	40 %	148261410
3048	NC_009484	CAAGC	2	10	2677765	2677774	40 %	0 %	20 %	40 %	148261411
3049	NC_009484	CGGTA	2	10	2678739	2678748	20 %	20 %	40 %	20 %	148261411
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3055	NC_009484	GCCGC	2	10	2684727	2684736	0 %	0 %	40 %	60 %	148261416
3056	NC_009484	GCGGG	2	10	2685034	2685043	0 %	0 %	80 %	20 %	148261416
3057	NC_009484	GCCCT	2	10	2685475	2685484	0 %	20 %	20 %	60 %	148261416
3058	NC_009484	CGCGC	2	10	2685758	2685767	0 %	0 %	40 %	60 %	148261417
3059	NC_009484	TTCCC	2	10	2688299	2688308	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3060	NC_009484	CGCGC	2	10	2688568	2688577	0 %	0 %	40 %	60 %	148261420
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3063	NC_009484	CGCGC	2	10	2691173	2691182	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3064	NC_009484	GCCGC	2	10	2694114	2694123	0 %	0 %	40 %	60 %	148261423
3065	NC_009484	TCCCG	2	10	2694392	2694401	0 %	20 %	20 %	60 %	148261423
3066	NC_009484	CGGCG	2	10	2694651	2694660	0 %	0 %	60 %	40 %	148261423
3067	NC_009484	GCCGC	2	10	2694824	2694833	0 %	0 %	40 %	60 %	148261423
3068	NC_009484	CGCGC	2	10	2695736	2695745	0 %	0 %	40 %	60 %	148261424
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3070	NC_009484	GGCGG	2	10	2696509	2696518	0 %	0 %	80 %	20 %	148261425
3071	NC_009484	GCAAT	2	10	2698068	2698077	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3072	NC_009484	CCCCT	2	10	2698181	2698190	0 %	20 %	0 %	80 %	148261427
3073	NC_009484	GCGGA	2	10	2698738	2698747	20 %	0 %	60 %	20 %	148261428
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3076	NC_009484	CGGCT	2	10	2701296	2701305	0 %	20 %	40 %	40 %	148261429
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3099	NC_009484	GGGCC	2	10	2726347	2726356	0 %	0 %	60 %	40 %	148261454
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3106	NC_009484	CCGGC	2	10	2735258	2735267	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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3108	NC_009484	CGGCG	2	10	2736421	2736430	0 %	0 %	60 %	40 %	148261466
3109	NC_009484	AGGGC	2	10	2737365	2737374	20 %	0 %	60 %	20 %	148261466
3110	NC_009484	GAGGC	2	10	2737702	2737711	20 %	0 %	60 %	20 %	148261467
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3112	NC_009484	GCGCC	2	10	2739003	2739012	0 %	0 %	40 %	60 %	148261468
3113	NC_009484	CGGAT	2	10	2740670	2740679	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3122	NC_009484	GGTGG	2	10	2748394	2748403	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_009484	GCGCG	2	10	2748861	2748870	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3124	NC_009484	GGCGG	2	10	2748943	2748952	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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