MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 3896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009484	CGGGC	2	10	440969	440978	0 %	0 %	60 %	40 %	148259402
502	NC_009484	CTTGC	2	10	443125	443134	0 %	40 %	20 %	40 %	148259404
503	NC_009484	GGCGC	2	10	445599	445608	0 %	0 %	60 %	40 %	148259405
504	NC_009484	CGGGC	2	10	446179	446188	0 %	0 %	60 %	40 %	148259405
505	NC_009484	AAGGC	2	10	447378	447387	40 %	0 %	40 %	20 %	148259405
506	NC_009484	GCGCC	2	10	447451	447460	0 %	0 %	40 %	60 %	148259405
507	NC_009484	CATGC	2	10	447942	447951	20 %	20 %	20 %	40 %	148259406
508	NC_009484	CCGGC	2	10	448736	448745	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
509	NC_009484	TGCCT	2	10	451052	451061	0 %	40 %	20 %	40 %	148259410
510	NC_009484	CACAT	2	10	452836	452845	40 %	20 %	0 %	40 %	148259414
511	NC_009484	GCGCG	2	10	455094	455103	0 %	0 %	60 %	40 %	148259416
512	NC_009484	GCGCG	2	10	455325	455334	0 %	0 %	60 %	40 %	148259416
513	NC_009484	GCCGC	2	10	455817	455826	0 %	0 %	40 %	60 %	148259416
514	NC_009484	CTGTG	2	10	456019	456028	0 %	40 %	40 %	20 %	148259416
515	NC_009484	CGCGC	2	10	456204	456213	0 %	0 %	40 %	60 %	148259416
516	NC_009484	GGAAC	2	10	457023	457032	40 %	0 %	40 %	20 %	148259416
517	NC_009484	CAGCG	2	10	457172	457181	20 %	0 %	40 %	40 %	148259416
518	NC_009484	CTGCC	2	10	458742	458751	0 %	20 %	20 %	60 %	148259419
519	NC_009484	CGGCG	2	10	460754	460763	0 %	0 %	60 %	40 %	148259420
520	NC_009484	CGGGC	2	10	462469	462478	0 %	0 %	60 %	40 %	148259422
521	NC_009484	GAGCG	2	10	462791	462800	20 %	0 %	60 %	20 %	148259422
522	NC_009484	ATCAG	2	10	463359	463368	40 %	20 %	20 %	20 %	148259423
523	NC_009484	TCGCC	2	10	463816	463825	0 %	20 %	20 %	60 %	148259423
524	NC_009484	ACCGG	2	10	466630	466639	20 %	0 %	40 %	40 %	148259428
525	NC_009484	ACCGC	2	10	467129	467138	20 %	0 %	20 %	60 %	148259428
526	NC_009484	GCGCC	2	10	467438	467447	0 %	0 %	40 %	60 %	148259429
527	NC_009484	GACTG	2	10	467871	467880	20 %	20 %	40 %	20 %	148259430
528	NC_009484	GTGCC	2	10	469127	469136	0 %	20 %	40 %	40 %	148259431
529	NC_009484	AGATC	2	10	469378	469387	40 %	20 %	20 %	20 %	148259432
530	NC_009484	GAAGG	2	10	469755	469764	40 %	0 %	60 %	0 %	148259432
531	NC_009484	ACGTG	2	10	470255	470264	20 %	20 %	40 %	20 %	148259433
532	NC_009484	TCTCC	2	10	471880	471889	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
533	NC_009484	ATCGG	2	10	475591	475600	20 %	20 %	40 %	20 %	148259437
534	NC_009484	TTCGG	2	10	475627	475636	0 %	40 %	40 %	20 %	148259437
535	NC_009484	CGGCG	2	10	476280	476289	0 %	0 %	60 %	40 %	148259438
536	NC_009484	CCGGC	2	10	476462	476471	0 %	0 %	40 %	60 %	148259438
537	NC_009484	TTGCT	2	10	478482	478491	0 %	60 %	20 %	20 %	148259439
538	NC_009484	GCGCA	2	10	479805	479814	20 %	0 %	40 %	40 %	148259441
539	NC_009484	CGGCC	3	15	480472	480486	0 %	0 %	40 %	60 %	148259441
540	NC_009484	CGGAA	2	10	481008	481017	40 %	0 %	40 %	20 %	148259442
541	NC_009484	ATGCC	2	10	481134	481143	20 %	20 %	20 %	40 %	148259442
542	NC_009484	CAGGA	2	10	481311	481320	40 %	0 %	40 %	20 %	148259442
543	NC_009484	GCAGA	2	10	481682	481691	40 %	0 %	40 %	20 %	148259443
544	NC_009484	CGGGC	2	10	481865	481874	0 %	0 %	60 %	40 %	148259443
545	NC_009484	CCAGA	2	10	482215	482224	40 %	0 %	20 %	40 %	148259443
546	NC_009484	TCGAT	2	10	483721	483730	20 %	40 %	20 %	20 %	148259446
547	NC_009484	TGCGT	2	10	486260	486269	0 %	40 %	40 %	20 %	148259449
548	NC_009484	GCGTG	2	10	487031	487040	0 %	20 %	60 %	20 %	148259450
549	NC_009484	GCGAG	2	10	488155	488164	20 %	0 %	60 %	20 %	148259452
550	NC_009484	GGGCG	2	10	488269	488278	0 %	0 %	80 %	20 %	148259452
551	NC_009484	GAGGG	2	10	491205	491214	20 %	0 %	80 %	0 %	148259455
552	NC_009484	CTGGG	2	10	492220	492229	0 %	20 %	60 %	20 %	148259456
553	NC_009484	CCGAC	2	10	493317	493326	20 %	0 %	20 %	60 %	148259457
554	NC_009484	CCAGC	2	10	498419	498428	20 %	0 %	20 %	60 %	148259466
555	NC_009484	ATCGC	2	10	500340	500349	20 %	20 %	20 %	40 %	148259468
556	NC_009484	CTGAC	2	10	503130	503139	20 %	20 %	20 %	40 %	148259470
557	NC_009484	GCCGA	2	10	504084	504093	20 %	0 %	40 %	40 %	148259470
558	NC_009484	GCCGA	2	10	504345	504354	20 %	0 %	40 %	40 %	148259470
559	NC_009484	GCCGC	2	10	507144	507153	0 %	0 %	40 %	60 %	148259471
560	NC_009484	CCCGG	2	10	507543	507552	0 %	0 %	40 %	60 %	148259472
561	NC_009484	GCCGC	2	10	508586	508595	0 %	0 %	40 %	60 %	148259472
562	NC_009484	GCGCA	2	10	508879	508888	20 %	0 %	40 %	40 %	148259472
563	NC_009484	CGTCC	2	10	508989	508998	0 %	20 %	20 %	60 %	148259472
564	NC_009484	GGTCG	2	10	509280	509289	0 %	20 %	60 %	20 %	148259473
565	NC_009484	GCGCT	2	10	509707	509716	0 %	20 %	40 %	40 %	148259473
566	NC_009484	CCAGC	2	10	510377	510386	20 %	0 %	20 %	60 %	148259474
567	NC_009484	CGAAA	2	10	510961	510970	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
568	NC_009484	TCATG	2	10	510980	510989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
569	NC_009484	CGGAC	2	10	515507	515516	20 %	0 %	40 %	40 %	148259478
570	NC_009484	AAGGC	2	10	515737	515746	40 %	0 %	40 %	20 %	148259479
571	NC_009484	TCACC	2	10	516101	516110	20 %	20 %	0 %	60 %	148259479
572	NC_009484	TGAAC	2	10	517139	517148	40 %	20 %	20 %	20 %	148259480
573	NC_009484	GTTGA	2	10	517166	517175	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009484	CGCGG	2	10	520460	520469	0 %	0 %	60 %	40 %	148259482
575	NC_009484	GCGCG	2	10	521649	521658	0 %	0 %	60 %	40 %	148259484
576	NC_009484	CGGTC	2	10	522336	522345	0 %	20 %	40 %	40 %	148259484
577	NC_009484	CGCGC	2	10	523486	523495	0 %	0 %	40 %	60 %	148259485
578	NC_009484	GCGCC	2	10	523813	523822	0 %	0 %	40 %	60 %	148259485
579	NC_009484	GGCAG	2	10	523925	523934	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
580	NC_009484	AGGGC	2	10	524246	524255	20 %	0 %	60 %	20 %	148259486
581	NC_009484	CCCCG	2	10	525910	525919	0 %	0 %	20 %	80 %	148259488
582	NC_009484	TCGCC	2	10	527752	527761	0 %	20 %	20 %	60 %	148259490
583	NC_009484	GGTGC	2	10	527857	527866	0 %	20 %	60 %	20 %	148259491
584	NC_009484	CCGCG	2	10	528414	528423	0 %	0 %	40 %	60 %	148259491
585	NC_009484	CTGCT	2	10	528571	528580	0 %	40 %	20 %	40 %	148259491
586	NC_009484	TGATG	2	10	530447	530456	20 %	40 %	40 %	0 %	148259493
587	NC_009484	AGCCG	2	10	531176	531185	20 %	0 %	40 %	40 %	148259493
588	NC_009484	TTCCG	2	10	531732	531741	0 %	40 %	20 %	40 %	148259494
589	NC_009484	GTGCC	2	10	531908	531917	0 %	20 %	40 %	40 %	148259494
590	NC_009484	CAGCG	2	10	532407	532416	20 %	0 %	40 %	40 %	148259495
591	NC_009484	GAGGG	2	10	534816	534825	20 %	0 %	80 %	0 %	148259497
592	NC_009484	TGCGA	2	10	535625	535634	20 %	20 %	40 %	20 %	148259498
593	NC_009484	CTCGG	2	10	537109	537118	0 %	20 %	40 %	40 %	148259499
594	NC_009484	CTCGG	2	10	537178	537187	0 %	20 %	40 %	40 %	148259499
595	NC_009484	GCAGG	2	10	537888	537897	20 %	0 %	60 %	20 %	148259500
596	NC_009484	CGGCG	2	10	538626	538635	0 %	0 %	60 %	40 %	148259501
597	NC_009484	TGGAA	2	10	540444	540453	40 %	20 %	40 %	0 %	148259502
598	NC_009484	CGTGC	2	10	542965	542974	0 %	20 %	40 %	40 %	148259505
599	NC_009484	CGGAG	2	10	543319	543328	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
600	NC_009484	CTCCC	2	10	543479	543488	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
601	NC_009484	CAAGC	2	10	546774	546783	40 %	0 %	20 %	40 %	148259507
602	NC_009484	GGCGC	2	10	548381	548390	0 %	0 %	60 %	40 %	148259509
603	NC_009484	GATCG	2	10	550718	550727	20 %	20 %	40 %	20 %	148259512
604	NC_009484	ACGAT	2	10	551988	551997	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
605	NC_009484	CGGAG	2	10	552764	552773	20 %	0 %	60 %	20 %	148259513
606	NC_009484	GGTCG	2	10	552996	553005	0 %	20 %	60 %	20 %	148259513
607	NC_009484	TGGCA	2	10	553966	553975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
608	NC_009484	ACGGC	2	10	554114	554123	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
609	NC_009484	CGTGC	2	10	556768	556777	0 %	20 %	40 %	40 %	148259516
610	NC_009484	CGGCG	2	10	557900	557909	0 %	0 %	60 %	40 %	148259517
611	NC_009484	ACGAT	2	10	558136	558145	40 %	20 %	20 %	20 %	148259517
612	NC_009484	CGGCA	2	10	560082	560091	20 %	0 %	40 %	40 %	148259518
613	NC_009484	GTCGA	2	10	561413	561422	20 %	20 %	40 %	20 %	148259519
614	NC_009484	GCCGA	2	10	562828	562837	20 %	0 %	40 %	40 %	148259520
615	NC_009484	CGGCA	2	10	562975	562984	20 %	0 %	40 %	40 %	148259520
616	NC_009484	GCGCC	2	10	564076	564085	0 %	0 %	40 %	60 %	148259521
617	NC_009484	CGCAC	2	10	564090	564099	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
618	NC_009484	GCCGC	2	10	567273	567282	0 %	0 %	40 %	60 %	148259525
619	NC_009484	GGCGC	2	10	567745	567754	0 %	0 %	60 %	40 %	148259525
620	NC_009484	GATGC	2	10	567942	567951	20 %	20 %	40 %	20 %	148259525
621	NC_009484	AGGTC	2	10	568474	568483	20 %	20 %	40 %	20 %	148259525
622	NC_009484	GCCGG	2	10	569509	569518	0 %	0 %	60 %	40 %	148259526
623	NC_009484	CGCAT	2	10	569634	569643	20 %	20 %	20 %	40 %	148259526
624	NC_009484	GGCGG	2	10	570021	570030	0 %	0 %	80 %	20 %	148259526
625	NC_009484	GCGCA	2	10	570736	570745	20 %	0 %	40 %	40 %	148259528
626	NC_009484	CCTGG	2	10	571494	571503	0 %	20 %	40 %	40 %	148259529
627	NC_009484	CGGCG	2	10	571899	571908	0 %	0 %	60 %	40 %	148259529
628	NC_009484	CGGCG	2	10	572235	572244	0 %	0 %	60 %	40 %	148259530
629	NC_009484	GGCCC	2	10	572838	572847	0 %	0 %	40 %	60 %	148259530
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