MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 3127

< Previous1234567Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008570	CGGCG	2	10	4580876	4580885	0 %	0 %	60 %	40 %	117619602
3002	NC_008570	AGGTT	2	10	4583806	4583815	20 %	40 %	40 %	0 %	117621460
3003	NC_008570	CAGCC	2	10	4586338	4586347	20 %	0 %	20 %	60 %	117619456
3004	NC_008570	GCGCG	2	10	4588712	4588721	0 %	0 %	60 %	40 %	117620680
3005	NC_008570	ACGAA	2	10	4588794	4588803	60 %	0 %	20 %	20 %	117620680
3006	NC_008570	CTTTG	2	10	4589351	4589360	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3007	NC_008570	TGGGC	2	10	4590476	4590485	0 %	20 %	60 %	20 %	117617945
3008	NC_008570	GGCCG	2	10	4591107	4591116	0 %	0 %	60 %	40 %	117619467
3009	NC_008570	CCGGC	2	10	4591505	4591514	0 %	0 %	40 %	60 %	117620117
3010	NC_008570	CTGCG	2	10	4592223	4592232	0 %	20 %	40 %	40 %	117619573
3011	NC_008570	GCCGC	2	10	4594748	4594757	0 %	0 %	40 %	60 %	117621206
3012	NC_008570	CCTGC	2	10	4599420	4599429	0 %	20 %	20 %	60 %	117618895
3013	NC_008570	GGCTC	2	10	4599786	4599795	0 %	20 %	40 %	40 %	117618895
3014	NC_008570	CAACC	2	10	4600364	4600373	40 %	0 %	0 %	60 %	117618315
3015	NC_008570	CACAA	2	10	4601237	4601246	60 %	0 %	0 %	40 %	117620144
3016	NC_008570	ACCAG	2	10	4601832	4601841	40 %	0 %	20 %	40 %	117620556
3017	NC_008570	AGTAA	2	10	4603964	4603973	60 %	20 %	20 %	0 %	117620556
3018	NC_008570	AACTC	2	10	4604804	4604813	40 %	20 %	0 %	40 %	117621125
3019	NC_008570	AGCCA	2	10	4604842	4604851	40 %	0 %	20 %	40 %	117621125
3020	NC_008570	ACAGA	2	10	4605752	4605761	60 %	0 %	20 %	20 %	117620151
3021	NC_008570	TAAAG	2	10	4606331	4606340	60 %	20 %	20 %	0 %	117620557
3022	NC_008570	ATTAA	2	10	4606436	4606445	60 %	40 %	0 %	0 %	117620557
3023	NC_008570	AACCA	2	10	4606464	4606473	60 %	0 %	0 %	40 %	117620557
3024	NC_008570	CCATC	2	10	4606542	4606551	20 %	20 %	0 %	60 %	117620557
3025	NC_008570	AATGC	2	10	4606850	4606859	40 %	20 %	20 %	20 %	117620557
3026	NC_008570	GTTAT	2	10	4607737	4607746	20 %	60 %	20 %	0 %	117619932
3027	NC_008570	AATTA	2	10	4607913	4607922	60 %	40 %	0 %	0 %	117619932
3028	NC_008570	AACTG	2	10	4608543	4608552	40 %	20 %	20 %	20 %	117619932
3029	NC_008570	TCTGT	2	10	4608845	4608854	0 %	60 %	20 %	20 %	117619932
3030	NC_008570	ACACA	2	10	4610375	4610384	60 %	0 %	0 %	40 %	117619944
3031	NC_008570	TGTCT	2	10	4610954	4610963	0 %	60 %	20 %	20 %	117619944
3032	NC_008570	TATCA	2	10	4616680	4616689	40 %	40 %	0 %	20 %	117618739
3033	NC_008570	ATTTC	2	10	4617903	4617912	20 %	60 %	0 %	20 %	117618739
3034	NC_008570	TAACA	2	10	4619074	4619083	60 %	20 %	0 %	20 %	117618046
3035	NC_008570	GTAGA	2	10	4619770	4619779	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008570	ATGAG	2	10	4620053	4620062	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008570	TGGGC	2	10	4620754	4620763	0 %	20 %	60 %	20 %	117617842
3038	NC_008570	GCAAG	2	10	4621678	4621687	40 %	0 %	40 %	20 %	117620068
3039	NC_008570	CCGCG	2	10	4624358	4624367	0 %	0 %	40 %	60 %	117621278
3040	NC_008570	TGACC	2	10	4626189	4626198	20 %	20 %	20 %	40 %	117621307
3041	NC_008570	CGCTG	2	10	4626507	4626516	0 %	20 %	40 %	40 %	117621307
3042	NC_008570	CTTGC	2	10	4626886	4626895	0 %	40 %	20 %	40 %	117621307
3043	NC_008570	CCGGC	2	10	4627798	4627807	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3044	NC_008570	GCGCC	2	10	4628887	4628896	0 %	0 %	40 %	60 %	117618544
3045	NC_008570	GGCTC	2	10	4630942	4630951	0 %	20 %	40 %	40 %	117618321
3046	NC_008570	GCCCT	2	10	4635513	4635522	0 %	20 %	20 %	60 %	117621329
3047	NC_008570	TGCCC	2	10	4636162	4636171	0 %	20 %	20 %	60 %	117621329
3048	NC_008570	GGGCC	2	10	4636546	4636555	0 %	0 %	60 %	40 %	117621329
3049	NC_008570	TTGGG	2	10	4638736	4638745	0 %	40 %	60 %	0 %	117620418
3050	NC_008570	GCTGG	2	10	4639564	4639573	0 %	20 %	60 %	20 %	117621352
3051	NC_008570	CGGGC	2	10	4640743	4640752	0 %	0 %	60 %	40 %	117617624
3052	NC_008570	ACCCG	2	10	4640958	4640967	20 %	0 %	20 %	60 %	117617624
3053	NC_008570	TGCAG	2	10	4641965	4641974	20 %	20 %	40 %	20 %	117618142
3054	NC_008570	GCCCT	2	10	4642069	4642078	0 %	20 %	20 %	60 %	117618142
3055	NC_008570	CACGG	2	10	4642844	4642853	20 %	0 %	40 %	40 %	117617965
3056	NC_008570	GGCGA	2	10	4644655	4644664	20 %	0 %	60 %	20 %	117621228
3057	NC_008570	GCGGT	2	10	4644685	4644694	0 %	20 %	60 %	20 %	117621228
3058	NC_008570	GCGCC	2	10	4645548	4645557	0 %	0 %	40 %	60 %	117621228
3059	NC_008570	GAGCC	2	10	4646729	4646738	20 %	0 %	40 %	40 %	117621138
3060	NC_008570	ACTGG	2	10	4648297	4648306	20 %	20 %	40 %	20 %	117621138
3061	NC_008570	CTTGC	2	10	4648503	4648512	0 %	40 %	20 %	40 %	117617874
3062	NC_008570	GCCGG	2	10	4651358	4651367	0 %	0 %	60 %	40 %	117619375
3063	NC_008570	TGCCC	2	10	4652144	4652153	0 %	20 %	20 %	60 %	117619375
3064	NC_008570	CGCAC	2	10	4652647	4652656	20 %	0 %	20 %	60 %	117617937
3065	NC_008570	CGGGC	2	10	4653106	4653115	0 %	0 %	60 %	40 %	117617937
3066	NC_008570	GGCCG	2	10	4653315	4653324	0 %	0 %	60 %	40 %	117617937
3067	NC_008570	TTGGC	2	10	4655552	4655561	0 %	40 %	40 %	20 %	117618429
3068	NC_008570	CTGGG	2	10	4655776	4655785	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3069	NC_008570	GGCCA	2	10	4657340	4657349	20 %	0 %	40 %	40 %	117618813
3070	NC_008570	TCCTG	2	10	4657468	4657477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3071	NC_008570	GACCC	2	10	4659468	4659477	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3072	NC_008570	GGCCT	2	10	4659865	4659874	0 %	20 %	40 %	40 %	117620224
3073	NC_008570	AGACC	2	10	4660335	4660344	40 %	0 %	20 %	40 %	117620224
3074	NC_008570	GCGAA	2	10	4661478	4661487	40 %	0 %	40 %	20 %	117618409
3075	NC_008570	GCGCC	2	10	4663082	4663091	0 %	0 %	40 %	60 %	117620042
3076	NC_008570	TCGGC	2	10	4665787	4665796	0 %	20 %	40 %	40 %	117620050
3077	NC_008570	CTCGC	2	10	4667459	4667468	0 %	20 %	20 %	60 %	117618474
3078	NC_008570	GCTGG	2	10	4669727	4669736	0 %	20 %	60 %	20 %	117619471
3079	NC_008570	CGCCA	2	10	4674825	4674834	20 %	0 %	20 %	60 %	117620940
3080	NC_008570	TGACC	2	10	4677922	4677931	20 %	20 %	20 %	40 %	117619264
3081	NC_008570	CAAAC	2	10	4678569	4678578	60 %	0 %	0 %	40 %	117618394
3082	NC_008570	AATGG	2	10	4681629	4681638	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_008570	TGCCA	2	10	4682806	4682815	20 %	20 %	20 %	40 %	117621311
3084	NC_008570	ATCCC	2	10	4683245	4683254	20 %	20 %	0 %	60 %	117621311
3085	NC_008570	GGGAA	2	10	4685636	4685645	40 %	0 %	60 %	0 %	117617563
3086	NC_008570	GGTCA	2	10	4686358	4686367	20 %	20 %	40 %	20 %	117617563
3087	NC_008570	TGCGC	2	10	4688260	4688269	0 %	20 %	40 %	40 %	117621356
3088	NC_008570	TGCCG	2	10	4688917	4688926	0 %	20 %	40 %	40 %	117618178
3089	NC_008570	GTAGG	2	10	4690366	4690375	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_008570	CCATG	2	10	4691442	4691451	20 %	20 %	20 %	40 %	117617601
3091	NC_008570	CTGGT	2	10	4692948	4692957	0 %	40 %	40 %	20 %	117618529
3092	NC_008570	CGCGG	2	10	4693465	4693474	0 %	0 %	60 %	40 %	117618529
3093	NC_008570	GGGTC	2	10	4696899	4696908	0 %	20 %	60 %	20 %	117621498
3094	NC_008570	GCATG	2	10	4697154	4697163	20 %	20 %	40 %	20 %	117621498
3095	NC_008570	AGCGC	2	10	4697307	4697316	20 %	0 %	40 %	40 %	117621498
3096	NC_008570	GCGGA	2	10	4697522	4697531	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3097	NC_008570	CCGCT	2	10	4697590	4697599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3098	NC_008570	CGACT	2	10	4699713	4699722	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3099	NC_008570	CGCTA	2	10	4700640	4700649	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3100	NC_008570	TAAGG	2	10	4701325	4701334	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008570	CACGA	2	10	4701794	4701803	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3102	NC_008570	GCCGC	2	10	4703190	4703199	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3103	NC_008570	ATTTC	2	10	4705120	4705129	20 %	60 %	0 %	20 %	117619079
3104	NC_008570	CTTCT	2	10	4705533	4705542	0 %	60 %	0 %	40 %	117620189
3105	NC_008570	GACCC	2	10	4707544	4707553	20 %	0 %	20 %	60 %	117617716
3106	NC_008570	TACCG	2	10	4710352	4710361	20 %	20 %	20 %	40 %	117618062
3107	NC_008570	TTCGA	2	10	4711670	4711679	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3108	NC_008570	GGGCT	2	10	4712429	4712438	0 %	20 %	60 %	20 %	117617885
3109	NC_008570	TCGGC	2	10	4713165	4713174	0 %	20 %	40 %	40 %	117618476
3110	NC_008570	CAGGG	2	10	4713410	4713419	20 %	0 %	60 %	20 %	117618476
3111	NC_008570	CCCCA	2	10	4715581	4715590	20 %	0 %	0 %	80 %	117619394
3112	NC_008570	AAAAC	2	10	4716234	4716243	80 %	0 %	0 %	20 %	117619394
3113	NC_008570	TGCCA	2	10	4717275	4717284	20 %	20 %	20 %	40 %	117619655
3114	NC_008570	GCCGT	2	10	4720087	4720096	0 %	20 %	40 %	40 %	117620323
3115	NC_008570	TCAGC	2	10	4720615	4720624	20 %	20 %	20 %	40 %	117619857
3116	NC_008570	CACCG	2	10	4721840	4721849	20 %	0 %	20 %	60 %	117619857
3117	NC_008570	TCAGG	2	10	4723254	4723263	20 %	20 %	40 %	20 %	117619430
3118	NC_008570	GCCCA	2	10	4725722	4725731	20 %	0 %	20 %	60 %	117617774
3119	NC_008570	ACGGA	2	10	4728129	4728138	40 %	0 %	40 %	20 %	117619063
3120	NC_008570	ATGGA	2	10	4730069	4730078	40 %	20 %	40 %	0 %	117618578
3121	NC_008570	TCGAT	2	10	4730326	4730335	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3122	NC_008570	GCTCA	2	10	4732449	4732458	20 %	20 %	20 %	40 %	117620411
3123	NC_008570	CGATC	2	10	4735834	4735843	20 %	20 %	20 %	40 %	117620874
3124	NC_008570	CTGGC	2	10	4736434	4736443	0 %	20 %	40 %	40 %	117617612
3125	NC_008570	GATTC	2	10	4741914	4741923	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3126	NC_008570	GCAGC	2	10	4742780	4742789	20 %	0 %	40 %	40 %	117621102
3127	NC_008570	AGGGC	2	10	4743727	4743736	20 %	0 %	60 %	20 %	117618389

< Previous1234567Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.