MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 3127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008570	CCTGC	2	10	1541795	1541804	0 %	20 %	20 %	60 %	117619668
1002	NC_008570	GGGCT	2	10	1541957	1541966	0 %	20 %	60 %	20 %	117619668
1003	NC_008570	CGGCT	2	10	1542653	1542662	0 %	20 %	40 %	40 %	117619668
1004	NC_008570	CCAGA	2	10	1542800	1542809	40 %	0 %	20 %	40 %	117619668
1005	NC_008570	CTGCA	2	10	1543402	1543411	20 %	20 %	20 %	40 %	117619839
1006	NC_008570	TCAGC	2	10	1543597	1543606	20 %	20 %	20 %	40 %	117618540
1007	NC_008570	CAGGG	2	10	1546092	1546101	20 %	0 %	60 %	20 %	117620236
1008	NC_008570	CTGTT	2	10	1547023	1547032	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1009	NC_008570	GGGTG	2	10	1549528	1549537	0 %	20 %	80 %	0 %	117617574
1010	NC_008570	CGGGG	2	10	1549991	1550000	0 %	0 %	80 %	20 %	117617574
1011	NC_008570	GCGGG	2	10	1550566	1550575	0 %	0 %	80 %	20 %	117617641
1012	NC_008570	AGCAG	2	10	1552202	1552211	40 %	0 %	40 %	20 %	117620565
1013	NC_008570	CGGGT	2	10	1553156	1553165	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1014	NC_008570	CTCTT	2	10	1554495	1554504	0 %	60 %	0 %	40 %	117618017
1015	NC_008570	CTTCA	2	10	1554734	1554743	20 %	40 %	0 %	40 %	117618017
1016	NC_008570	GGGCA	2	10	1555124	1555133	20 %	0 %	60 %	20 %	117618017
1017	NC_008570	CCTTG	2	10	1555210	1555219	0 %	40 %	20 %	40 %	117618017
1018	NC_008570	TGAAT	2	10	1555523	1555532	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008570	TTTTC	2	10	1556598	1556607	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_008570	AGCCG	2	10	1559788	1559797	20 %	0 %	40 %	40 %	117619894
1021	NC_008570	CGCTG	2	10	1560261	1560270	0 %	20 %	40 %	40 %	117618042
1022	NC_008570	GCCGA	2	10	1560518	1560527	20 %	0 %	40 %	40 %	117618042
1023	NC_008570	CTCAC	2	10	1561213	1561222	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1024	NC_008570	CAGGC	2	10	1564982	1564991	20 %	0 %	40 %	40 %	117618255
1025	NC_008570	TGGCC	2	10	1567667	1567676	0 %	20 %	40 %	40 %	117618968
1026	NC_008570	GTCCG	2	10	1571817	1571826	0 %	20 %	40 %	40 %	117620013
1027	NC_008570	TCGGC	2	10	1573694	1573703	0 %	20 %	40 %	40 %	117620696
1028	NC_008570	GCAGA	2	10	1574190	1574199	40 %	0 %	40 %	20 %	117620696
1029	NC_008570	ACGGC	2	10	1575483	1575492	20 %	0 %	40 %	40 %	117621175
1030	NC_008570	TGCGC	2	10	1575764	1575773	0 %	20 %	40 %	40 %	117621175
1031	NC_008570	TGATC	2	10	1576269	1576278	20 %	40 %	20 %	20 %	117619587
1032	NC_008570	AGCAG	2	10	1576821	1576830	40 %	0 %	40 %	20 %	117620128
1033	NC_008570	TCGGG	2	10	1578408	1578417	0 %	20 %	60 %	20 %	117618958
1034	NC_008570	TCAAC	2	10	1579273	1579282	40 %	20 %	0 %	40 %	117617820
1035	NC_008570	AAAAC	2	10	1580462	1580471	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_008570	CCTTG	2	10	1582696	1582705	0 %	40 %	20 %	40 %	117620552
1037	NC_008570	TCGGA	2	10	1585104	1585113	20 %	20 %	40 %	20 %	117618808
1038	NC_008570	TCTGG	2	10	1585815	1585824	0 %	40 %	40 %	20 %	117619605
1039	NC_008570	CCGGC	2	10	1586061	1586070	0 %	0 %	40 %	60 %	117619605
1040	NC_008570	GATCA	2	10	1587092	1587101	40 %	20 %	20 %	20 %	117618977
1041	NC_008570	CGGCA	2	10	1589943	1589952	20 %	0 %	40 %	40 %	117620753
1042	NC_008570	CCGGA	2	10	1590468	1590477	20 %	0 %	40 %	40 %	117620753
1043	NC_008570	CGATG	2	10	1590998	1591007	20 %	20 %	40 %	20 %	117620900
1044	NC_008570	GCCTG	2	10	1592362	1592371	0 %	20 %	40 %	40 %	117617658
1045	NC_008570	ATGGC	2	10	1592815	1592824	20 %	20 %	40 %	20 %	117619996
1046	NC_008570	CAAGA	2	10	1592949	1592958	60 %	0 %	20 %	20 %	117619996
1047	NC_008570	GGGCA	2	10	1594312	1594321	20 %	0 %	60 %	20 %	117619985
1048	NC_008570	CTCAT	2	10	1595880	1595889	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1049	NC_008570	AACAT	2	10	1597101	1597110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1050	NC_008570	CTGAT	2	10	1598197	1598206	20 %	40 %	20 %	20 %	117621317
1051	NC_008570	GGGCG	2	10	1599019	1599028	0 %	0 %	80 %	20 %	117618171
1052	NC_008570	AGCCC	2	10	1601729	1601738	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1053	NC_008570	CGCTG	2	10	1602587	1602596	0 %	20 %	40 %	40 %	117619012
1054	NC_008570	CGGGA	2	10	1604368	1604377	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_008570	CGGCG	2	10	1604557	1604566	0 %	0 %	60 %	40 %	117619883
1056	NC_008570	CGTGA	2	10	1604930	1604939	20 %	20 %	40 %	20 %	117619883
1057	NC_008570	CTGGG	2	10	1605015	1605024	0 %	20 %	60 %	20 %	117619883
1058	NC_008570	AGCAG	2	10	1605911	1605920	40 %	0 %	40 %	20 %	117619707
1059	NC_008570	CCGCG	2	10	1608510	1608519	0 %	0 %	40 %	60 %	117620188
1060	NC_008570	GCCTT	2	10	1610007	1610016	0 %	40 %	20 %	40 %	117619900
1061	NC_008570	GGGGA	2	10	1612270	1612279	20 %	0 %	80 %	0 %	117619510
1062	NC_008570	TCCAG	2	10	1614466	1614475	20 %	20 %	20 %	40 %	117619217
1063	NC_008570	CTGTC	2	10	1616793	1616802	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1064	NC_008570	AAAGA	2	10	1617504	1617513	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008570	CTGTG	2	10	1618998	1619007	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_008570	GCGGG	2	10	1619207	1619216	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_008570	CGGCG	2	10	1621334	1621343	0 %	0 %	60 %	40 %	117620808
1068	NC_008570	GCAGG	2	10	1623458	1623467	20 %	0 %	60 %	20 %	117620622
1069	NC_008570	CGCCC	2	10	1624675	1624684	0 %	0 %	20 %	80 %	117618103
1070	NC_008570	CTGCG	2	10	1626971	1626980	0 %	20 %	40 %	40 %	117619952
1071	NC_008570	CGTAC	2	10	1628545	1628554	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1072	NC_008570	TCTGT	2	10	1630303	1630312	0 %	60 %	20 %	20 %	117620839
1073	NC_008570	GCCCA	2	10	1632449	1632458	20 %	0 %	20 %	60 %	117618335
1074	NC_008570	GGCGT	2	10	1632473	1632482	0 %	20 %	60 %	20 %	117618335
1075	NC_008570	CGCGC	2	10	1635557	1635566	0 %	0 %	40 %	60 %	117618882
1076	NC_008570	CTGGC	2	10	1635612	1635621	0 %	20 %	40 %	40 %	117618882
1077	NC_008570	GCGCT	2	10	1636758	1636767	0 %	20 %	40 %	40 %	117618882
1078	NC_008570	TCGGC	2	10	1637338	1637347	0 %	20 %	40 %	40 %	117618882
1079	NC_008570	GTGGC	2	10	1637889	1637898	0 %	20 %	60 %	20 %	117618882
1080	NC_008570	ATGGG	2	10	1640109	1640118	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008570	TTTTG	2	10	1640905	1640914	0 %	80 %	20 %	0 %	117621120
1082	NC_008570	CCGTC	2	10	1648440	1648449	0 %	20 %	20 %	60 %	117619058
1083	NC_008570	TGGCC	2	10	1648549	1648558	0 %	20 %	40 %	40 %	117619058
1084	NC_008570	CGGGC	2	10	1649425	1649434	0 %	0 %	60 %	40 %	117619641
1085	NC_008570	AGGGC	2	10	1649828	1649837	20 %	0 %	60 %	20 %	117619641
1086	NC_008570	CGCTG	2	10	1650203	1650212	0 %	20 %	40 %	40 %	117619641
1087	NC_008570	GCCAA	2	10	1651963	1651972	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1088	NC_008570	AGGGC	2	10	1652730	1652739	20 %	0 %	60 %	20 %	117618259
1089	NC_008570	CCGTG	2	10	1654824	1654833	0 %	20 %	40 %	40 %	117618869
1090	NC_008570	TGACA	2	10	1655019	1655028	40 %	20 %	20 %	20 %	117618869
1091	NC_008570	TTCAC	2	10	1655232	1655241	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1092	NC_008570	TTGCC	2	10	1656376	1656385	0 %	40 %	20 %	40 %	117619499
1093	NC_008570	AAGGT	2	10	1657095	1657104	40 %	20 %	40 %	0 %	117618222
1094	NC_008570	GCCGA	2	10	1660108	1660117	20 %	0 %	40 %	40 %	117621335
1095	NC_008570	CCGGG	2	10	1661127	1661136	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1096	NC_008570	GCTGG	2	10	1661313	1661322	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_008570	GCCTG	2	10	1663773	1663782	0 %	20 %	40 %	40 %	117618858
1098	NC_008570	GGCCT	2	10	1664315	1664324	0 %	20 %	40 %	40 %	117618858
1099	NC_008570	CGGCC	2	10	1664862	1664871	0 %	0 %	40 %	60 %	117618272
1100	NC_008570	CGCGG	2	10	1666475	1666484	0 %	0 %	60 %	40 %	117617939
1101	NC_008570	TGTGT	2	10	1668693	1668702	0 %	60 %	40 %	0 %	117621506
1102	NC_008570	GCCGA	2	10	1672963	1672972	20 %	0 %	40 %	40 %	117619698
1103	NC_008570	ACCAG	2	10	1673102	1673111	40 %	0 %	20 %	40 %	117619698
1104	NC_008570	GGCCT	2	10	1675856	1675865	0 %	20 %	40 %	40 %	117621117
1105	NC_008570	GCGCC	2	10	1678008	1678017	0 %	0 %	40 %	60 %	117620198
1106	NC_008570	GCTCG	2	10	1679145	1679154	0 %	20 %	40 %	40 %	117619330
1107	NC_008570	CCCAG	2	10	1679420	1679429	20 %	0 %	20 %	60 %	117618863
1108	NC_008570	GGCCA	2	10	1679538	1679547	20 %	0 %	40 %	40 %	117618863
1109	NC_008570	CGACC	2	10	1682094	1682103	20 %	0 %	20 %	60 %	117621363
1110	NC_008570	CAGGG	2	10	1683755	1683764	20 %	0 %	60 %	20 %	117620861
1111	NC_008570	GCCGG	2	10	1684205	1684214	0 %	0 %	60 %	40 %	117620679
1112	NC_008570	CTCGC	2	10	1686122	1686131	0 %	20 %	20 %	60 %	117618194
1113	NC_008570	CGGCG	2	10	1686165	1686174	0 %	0 %	60 %	40 %	117618194
1114	NC_008570	GCGCC	2	10	1688189	1688198	0 %	0 %	40 %	60 %	117619186
1115	NC_008570	GCGCC	2	10	1689380	1689389	0 %	0 %	40 %	60 %	117621036
1116	NC_008570	TGGGG	2	10	1690175	1690184	0 %	20 %	80 %	0 %	117621488
1117	NC_008570	AGCGC	2	10	1690202	1690211	20 %	0 %	40 %	40 %	117621488
1118	NC_008570	GGGCA	2	10	1690233	1690242	20 %	0 %	60 %	20 %	117621488
1119	NC_008570	AGGGC	2	10	1691261	1691270	20 %	0 %	60 %	20 %	117621488
1120	NC_008570	GGCGC	2	10	1692274	1692283	0 %	0 %	60 %	40 %	117619830
1121	NC_008570	CACTC	2	10	1692456	1692465	20 %	20 %	0 %	60 %	117619830
1122	NC_008570	TGGCT	2	10	1692556	1692565	0 %	40 %	40 %	20 %	117619830
1123	NC_008570	GGTCA	2	10	1698375	1698384	20 %	20 %	40 %	20 %	117620359
1124	NC_008570	CTGTG	2	10	1698534	1698543	0 %	40 %	40 %	20 %	117618749
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1126	NC_008570	GCGCT	2	10	1703096	1703105	0 %	20 %	40 %	40 %	117619127
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1128	NC_008570	GGCGA	2	10	1705327	1705336	20 %	0 %	60 %	20 %	117618131
1129	NC_008570	GCCAC	2	10	1705409	1705418	20 %	0 %	20 %	60 %	117618131
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1132	NC_008570	TCTGA	2	10	1711524	1711533	20 %	40 %	20 %	20 %	117619038
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1139	NC_008570	CCTGG	2	10	1719742	1719751	0 %	20 %	40 %	40 %	117619982
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1141	NC_008570	CGGCG	2	10	1720841	1720850	0 %	0 %	60 %	40 %	117618738
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1147	NC_008570	TTGCC	2	10	1733851	1733860	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1176	NC_008570	CGGCG	2	10	1778698	1778707	0 %	0 %	60 %	40 %	117619958
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1251	NC_008570	GGGGC	2	10	1892162	1892171	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1252	NC_008570	CTGCT	2	10	1893722	1893731	0 %	40 %	20 %	40 %	117619810
1253	NC_008570	CGGAT	2	10	1894747	1894756	20 %	20 %	40 %	20 %	117619810
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1255	NC_008570	AGCCC	2	10	1898229	1898238	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1256	NC_008570	ACTAG	2	10	1898374	1898383	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1259	NC_008570	CCTGG	2	10	1902899	1902908	0 %	20 %	40 %	40 %	117619109
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1267	NC_008570	CTGCC	2	10	1927504	1927513	0 %	20 %	20 %	60 %	117620012
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1285	NC_008570	CAGGG	2	10	1946766	1946775	20 %	0 %	60 %	20 %	117620988
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1291	NC_008570	CGTTG	2	10	1955575	1955584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1292	NC_008570	GGGCA	2	10	1956705	1956714	20 %	0 %	60 %	20 %	117617609
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1325	NC_008570	CATGG	2	10	2019285	2019294	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1333	NC_008570	AATTT	2	10	2025808	2025817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1334	NC_008570	TATCG	2	10	2029826	2029835	20 %	40 %	20 %	20 %	117621540
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1350	NC_008570	ACCGA	2	10	2067924	2067933	40 %	0 %	20 %	40 %	117618483
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1355	NC_008570	CGGGG	2	10	2072563	2072572	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1356	NC_008570	TGCAG	2	10	2072738	2072747	20 %	20 %	40 %	20 %	117619062
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1358	NC_008570	TGGGC	2	10	2073425	2073434	0 %	20 %	60 %	20 %	117619062
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1361	NC_008570	TGGAC	2	10	2078221	2078230	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1362	NC_008570	AGGGC	2	10	2079254	2079263	20 %	0 %	60 %	20 %	117620455
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1365	NC_008570	GGCCC	2	10	2084830	2084839	0 %	0 %	40 %	60 %	117618116
1366	NC_008570	GACCT	2	10	2085413	2085422	20 %	20 %	20 %	40 %	117621340
1367	NC_008570	ATAAC	2	10	2085652	2085661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1368	NC_008570	AGCGA	2	10	2088153	2088162	40 %	0 %	40 %	20 %	117618185
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1370	NC_008570	CGGCG	2	10	2093949	2093958	0 %	0 %	60 %	40 %	117620480
1371	NC_008570	TGAAC	2	10	2097703	2097712	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1372	NC_008570	ACGGA	2	10	2098549	2098558	40 %	0 %	40 %	20 %	117618018
1373	NC_008570	TGGTA	2	10	2100252	2100261	20 %	40 %	40 %	0 %	117618735
1374	NC_008570	GCCGC	2	10	2101836	2101845	0 %	0 %	40 %	60 %	117619269
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1376	NC_008570	CGGCC	2	10	2102894	2102903	0 %	0 %	40 %	60 %	117617620
1377	NC_008570	GCTGC	2	10	2103187	2103196	0 %	20 %	40 %	40 %	117618342
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1480	NC_008570	CGGCG	2	10	2292796	2292805	0 %	0 %	60 %	40 %	117618133
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1486	NC_008570	CCAGG	2	10	2305206	2305215	20 %	0 %	40 %	40 %	117620444
1487	NC_008570	GGGGT	2	10	2305435	2305444	0 %	20 %	80 %	0 %	117620444
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1492	NC_008570	GGCGG	2	10	2311604	2311613	0 %	0 %	80 %	20 %	117620297
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1494	NC_008570	GGGGC	2	10	2319317	2319326	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1495	NC_008570	TGCGG	2	10	2319953	2319962	0 %	20 %	60 %	20 %	117619172
1496	NC_008570	CCATC	2	10	2320081	2320090	20 %	20 %	0 %	60 %	117619172
1497	NC_008570	GCCTC	2	10	2324713	2324722	0 %	20 %	20 %	60 %	117620009
1498	NC_008570	GAGAC	2	10	2325214	2325223	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1499	NC_008570	TCGCC	2	10	2325595	2325604	0 %	20 %	20 %	60 %	117621475
1500	NC_008570	TGGGT	2	10	2325735	2325744	0 %	40 %	60 %	0 %	117621475

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