MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 3127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008570	CAGCG	2	10	809590	809599	20 %	0 %	40 %	40 %	117621531
502	NC_008570	CTAGC	2	10	810083	810092	20 %	20 %	20 %	40 %	117619558
503	NC_008570	GCCCA	2	10	810185	810194	20 %	0 %	20 %	60 %	117619558
504	NC_008570	GCGAG	2	10	813466	813475	20 %	0 %	60 %	20 %	117619856
505	NC_008570	TGCCG	2	10	814653	814662	0 %	20 %	40 %	40 %	117619856
506	NC_008570	ACGGC	2	10	814852	814861	20 %	0 %	40 %	40 %	117619856
507	NC_008570	GGGCG	2	10	815113	815122	0 %	0 %	80 %	20 %	117619856
508	NC_008570	CGGCG	2	10	815262	815271	0 %	0 %	60 %	40 %	117619856
509	NC_008570	CAGCG	2	10	816707	816716	20 %	0 %	40 %	40 %	117619239
510	NC_008570	GTGCC	2	10	823500	823509	0 %	20 %	40 %	40 %	117621162
511	NC_008570	CATCC	2	10	824770	824779	20 %	20 %	0 %	60 %	117619692
512	NC_008570	GGTCG	2	10	825925	825934	0 %	20 %	60 %	20 %	117620215
513	NC_008570	CCCGA	2	10	826070	826079	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
514	NC_008570	CGGCG	2	10	826532	826541	0 %	0 %	60 %	40 %	117618634
515	NC_008570	GGGGT	2	10	827191	827200	0 %	20 %	80 %	0 %	117618634
516	NC_008570	CGGGG	2	10	831730	831739	0 %	0 %	80 %	20 %	117617903
517	NC_008570	GTCGC	2	10	831867	831876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
518	NC_008570	GAGCA	2	10	832370	832379	40 %	0 %	40 %	20 %	117618349
519	NC_008570	TTTCA	2	10	832775	832784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
520	NC_008570	GCGTG	2	10	834963	834972	0 %	20 %	60 %	20 %	117620021
521	NC_008570	CTGCC	2	10	836394	836403	0 %	20 %	20 %	60 %	117620428
522	NC_008570	CTGGA	2	10	837967	837976	20 %	20 %	40 %	20 %	117619073
523	NC_008570	GTCGG	2	10	838001	838010	0 %	20 %	60 %	20 %	117619073
524	NC_008570	ATCTC	2	10	839604	839613	20 %	40 %	0 %	40 %	117618136
525	NC_008570	CGTTT	2	10	841656	841665	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_008570	AACGC	2	10	843012	843021	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
527	NC_008570	GCGCT	2	10	844285	844294	0 %	20 %	40 %	40 %	117620290
528	NC_008570	GCCAG	2	10	845603	845612	20 %	0 %	40 %	40 %	117617871
529	NC_008570	CAGAC	2	10	845872	845881	40 %	0 %	20 %	40 %	117617871
530	NC_008570	TGGGC	2	10	846710	846719	0 %	20 %	60 %	20 %	117617871
531	NC_008570	ATGGC	2	10	848190	848199	20 %	20 %	40 %	20 %	117618118
532	NC_008570	GGCTC	2	10	848668	848677	0 %	20 %	40 %	40 %	117620373
533	NC_008570	AGGGG	2	10	849258	849267	20 %	0 %	80 %	0 %	117619784
534	NC_008570	CTGGC	2	10	850006	850015	0 %	20 %	40 %	40 %	117619784
535	NC_008570	TGACC	2	10	850038	850047	20 %	20 %	20 %	40 %	117619784
536	NC_008570	GAAAA	2	10	852900	852909	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008570	CCGCA	2	10	853786	853795	20 %	0 %	20 %	60 %	117619289
538	NC_008570	ACCTG	2	10	854828	854837	20 %	20 %	20 %	40 %	117618157
539	NC_008570	CCTAA	2	10	855781	855790	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
540	NC_008570	CGGGC	2	10	858816	858825	0 %	0 %	60 %	40 %	117620609
541	NC_008570	CGCAG	2	10	859170	859179	20 %	0 %	40 %	40 %	117620609
542	NC_008570	CCAGA	2	10	861164	861173	40 %	0 %	20 %	40 %	117620211
543	NC_008570	GCCGC	2	10	861628	861637	0 %	0 %	40 %	60 %	117620211
544	NC_008570	GACCG	2	10	862684	862693	20 %	0 %	40 %	40 %	117619755
545	NC_008570	GCTCA	2	10	862714	862723	20 %	20 %	20 %	40 %	117619755
546	NC_008570	GGAAG	2	10	863301	863310	40 %	0 %	60 %	0 %	117619755
547	NC_008570	TTGTG	2	10	870926	870935	0 %	60 %	40 %	0 %	117618004
548	NC_008570	ATTTC	2	10	870954	870963	20 %	60 %	0 %	20 %	117618004
549	NC_008570	TGCTT	2	10	870989	870998	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
550	NC_008570	CGAAA	2	10	871033	871042	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
551	NC_008570	TCAAT	2	10	871130	871139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
552	NC_008570	ATCGC	2	10	876664	876673	20 %	20 %	20 %	40 %	117618818
553	NC_008570	GCGGA	2	10	878477	878486	20 %	0 %	60 %	20 %	117621333
554	NC_008570	GTGAA	2	10	881814	881823	40 %	20 %	40 %	0 %	117618946
555	NC_008570	CTGAC	2	10	883826	883835	20 %	20 %	20 %	40 %	117617509
556	NC_008570	TCCGT	2	10	884253	884262	0 %	40 %	20 %	40 %	117617509
557	NC_008570	GGTTG	2	10	888178	888187	0 %	40 %	60 %	0 %	117620836
558	NC_008570	GTCTC	2	10	889105	889114	0 %	40 %	20 %	40 %	117620387
559	NC_008570	CTGAA	2	10	890217	890226	40 %	20 %	20 %	20 %	117617733
560	NC_008570	AATCC	2	10	891637	891646	40 %	20 %	0 %	40 %	117621272
561	NC_008570	GGGGA	2	10	893776	893785	20 %	0 %	80 %	0 %	117619022
562	NC_008570	GAACC	2	10	896560	896569	40 %	0 %	20 %	40 %	117618585
563	NC_008570	CCGCT	2	10	898621	898630	0 %	20 %	20 %	60 %	117620706
564	NC_008570	TGGCG	2	10	902668	902677	0 %	20 %	60 %	20 %	117617677
565	NC_008570	CCAGG	2	10	902966	902975	20 %	0 %	40 %	40 %	117617677
566	NC_008570	GCCAC	2	10	904622	904631	20 %	0 %	20 %	60 %	117617984
567	NC_008570	GAGGC	2	10	904759	904768	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
568	NC_008570	GACGC	2	10	904873	904882	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
569	NC_008570	ATCGG	2	10	905135	905144	20 %	20 %	40 %	20 %	117618435
570	NC_008570	CTGGC	2	10	905642	905651	0 %	20 %	40 %	40 %	117621221
571	NC_008570	CTGGC	2	10	908018	908027	0 %	20 %	40 %	40 %	117620363
572	NC_008570	AGCCG	2	10	911727	911736	20 %	0 %	40 %	40 %	117619553
573	NC_008570	TGGCG	2	10	912569	912578	0 %	20 %	60 %	20 %	117621167
574	NC_008570	CCTCC	2	10	912746	912755	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
575	NC_008570	AGCGC	2	10	913134	913143	20 %	0 %	40 %	40 %	117618830
576	NC_008570	CGAGC	2	10	913565	913574	20 %	0 %	40 %	40 %	117618830
577	NC_008570	CGCTG	2	10	915141	915150	0 %	20 %	40 %	40 %	117620417
578	NC_008570	GCGCC	2	10	915643	915652	0 %	0 %	40 %	60 %	117620417
579	NC_008570	CATAA	2	10	915810	915819	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
580	NC_008570	GGACG	2	10	919466	919475	20 %	0 %	60 %	20 %	117620698
581	NC_008570	CTCCC	2	10	922500	922509	0 %	20 %	0 %	80 %	117618868
582	NC_008570	GGGTC	2	10	923733	923742	0 %	20 %	60 %	20 %	117618868
583	NC_008570	CTGGC	2	10	926385	926394	0 %	20 %	40 %	40 %	117617693
584	NC_008570	ATTTA	2	10	928482	928491	40 %	60 %	0 %	0 %	117618065
585	NC_008570	GGCAT	2	10	929534	929543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
586	NC_008570	TGGCC	2	10	929806	929815	0 %	20 %	40 %	40 %	117617895
587	NC_008570	GAGCA	2	10	930795	930804	40 %	0 %	40 %	20 %	117617895
588	NC_008570	TGCGC	2	10	931380	931389	0 %	20 %	40 %	40 %	117617895
589	NC_008570	CTCCA	2	10	931587	931596	20 %	20 %	0 %	60 %	117617895
590	NC_008570	TCGTG	2	10	934090	934099	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
591	NC_008570	CTTCT	2	10	934843	934852	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
592	NC_008570	TAGCG	2	10	935246	935255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
593	NC_008570	AGTCG	2	10	936173	936182	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
594	NC_008570	TCAAT	2	10	938358	938367	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
595	NC_008570	CATGG	2	10	940331	940340	20 %	20 %	40 %	20 %	117620070
596	NC_008570	CGAGC	2	10	940756	940765	20 %	0 %	40 %	40 %	117620070
597	NC_008570	GGCGA	2	10	942439	942448	20 %	0 %	60 %	20 %	117620966
598	NC_008570	CCGGC	2	10	943007	943016	0 %	0 %	40 %	60 %	117620966
599	NC_008570	TTCTC	2	10	944513	944522	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
600	NC_008570	AGCGC	2	10	945488	945497	20 %	0 %	40 %	40 %	117618673
601	NC_008570	GCGCC	2	10	945942	945951	0 %	0 %	40 %	60 %	117618673
602	NC_008570	GGGCC	2	10	947889	947898	0 %	0 %	60 %	40 %	117617981
603	NC_008570	GCCTG	2	10	948775	948784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
604	NC_008570	GAGCA	2	10	951240	951249	40 %	0 %	40 %	20 %	117617964
605	NC_008570	CCATG	2	10	952116	952125	20 %	20 %	20 %	40 %	117619203
606	NC_008570	CGCTG	2	10	955782	955791	0 %	20 %	40 %	40 %	117620279
607	NC_008570	GATCT	2	10	957714	957723	20 %	40 %	20 %	20 %	117621555
608	NC_008570	GATCT	2	10	959383	959392	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
609	NC_008570	CCCAG	2	10	963682	963691	20 %	0 %	20 %	60 %	117619308
610	NC_008570	GCGGG	2	10	964408	964417	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
611	NC_008570	GCTGG	2	10	967787	967796	0 %	20 %	60 %	20 %	117621482
612	NC_008570	TGCCG	2	10	969318	969327	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
613	NC_008570	CGTCA	2	10	970140	970149	20 %	20 %	20 %	40 %	117619846
614	NC_008570	GGCGG	2	10	970217	970226	0 %	0 %	80 %	20 %	117619846
615	NC_008570	CGGGT	2	10	973022	973031	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
616	NC_008570	CAAAT	2	10	974244	974253	60 %	20 %	0 %	20 %	117618265
617	NC_008570	TGATC	2	10	975941	975950	20 %	40 %	20 %	20 %	117618265
618	NC_008570	TCTCT	2	10	978214	978223	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
619	NC_008570	CTGCT	2	10	978354	978363	0 %	40 %	20 %	40 %	117621129
620	NC_008570	CTCGC	2	10	978727	978736	0 %	20 %	20 %	60 %	117620646
621	NC_008570	TGGCC	2	10	978767	978776	0 %	20 %	40 %	40 %	117620646
622	NC_008570	TGCGG	2	10	981429	981438	0 %	20 %	60 %	20 %	117620646
623	NC_008570	GCATC	2	10	982698	982707	20 %	20 %	20 %	40 %	117620646
624	NC_008570	GGCGC	2	10	985826	985835	0 %	0 %	60 %	40 %	117618703
625	NC_008570	GGTCG	2	10	987836	987845	0 %	20 %	60 %	20 %	117618373
626	NC_008570	TCACG	2	10	989348	989357	20 %	20 %	20 %	40 %	117618849
627	NC_008570	GGCCG	2	10	991469	991478	0 %	0 %	60 %	40 %	117621367
628	NC_008570	CCAGC	2	10	992027	992036	20 %	0 %	20 %	60 %	117621367
629	NC_008570	CGTGC	2	10	995154	995163	0 %	20 %	40 %	40 %	117621060
630	NC_008570	CGGCG	2	10	995169	995178	0 %	0 %	60 %	40 %	117621060
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632	NC_008570	CGGCG	2	10	996842	996851	0 %	0 %	60 %	40 %	117617892
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