MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 3127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008570	GGCGA	2	10	3858751	3858760	20 %	0 %	60 %	20 %	117620824
2502	NC_008570	ATTTT	2	10	3858865	3858874	20 %	80 %	0 %	0 %	117620824
2503	NC_008570	TCGCC	2	10	3859005	3859014	0 %	20 %	20 %	60 %	117619387
2504	NC_008570	GCATG	2	10	3860252	3860261	20 %	20 %	40 %	20 %	117619945
2505	NC_008570	TCGCG	2	10	3864829	3864838	0 %	20 %	40 %	40 %	117619078
2506	NC_008570	GCAGT	2	10	3865101	3865110	20 %	20 %	40 %	20 %	117619078
2507	NC_008570	TGACC	2	10	3865659	3865668	20 %	20 %	20 %	40 %	117617540
2508	NC_008570	GATCA	2	10	3866122	3866131	40 %	20 %	20 %	20 %	117617540
2509	NC_008570	AGAGC	2	10	3866499	3866508	40 %	0 %	40 %	20 %	117617540
2510	NC_008570	AGTCG	2	10	3866599	3866608	20 %	20 %	40 %	20 %	117617985
2511	NC_008570	GGCGA	2	10	3871415	3871424	20 %	0 %	60 %	20 %	117620304
2512	NC_008570	GGCAG	2	10	3872099	3872108	20 %	0 %	60 %	20 %	117620304
2513	NC_008570	CTGGC	2	10	3875553	3875562	0 %	20 %	40 %	40 %	117619849
2514	NC_008570	CAAAA	2	10	3875660	3875669	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2515	NC_008570	CATGC	2	10	3875752	3875761	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2516	NC_008570	CATGC	2	10	3875862	3875871	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2517	NC_008570	CATGC	2	10	3875986	3875995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2518	NC_008570	CATGC	2	10	3876125	3876134	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2519	NC_008570	CATGC	2	10	3876229	3876238	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2520	NC_008570	GGGCC	2	10	3876903	3876912	0 %	0 %	60 %	40 %	117620491
2521	NC_008570	GCCAG	2	10	3876945	3876954	20 %	0 %	40 %	40 %	117620491
2522	NC_008570	GATCA	2	10	3877408	3877417	40 %	20 %	20 %	20 %	117620491
2523	NC_008570	CAAAA	2	10	3878083	3878092	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2524	NC_008570	GCCGC	2	10	3878311	3878320	0 %	0 %	40 %	60 %	117617676
2525	NC_008570	ATCGC	2	10	3879496	3879505	20 %	20 %	20 %	40 %	117617676
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2527	NC_008570	GATGT	2	10	3881755	3881764	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_008570	TGCCC	2	10	3887821	3887830	0 %	20 %	20 %	60 %	117619845
2529	NC_008570	GGCTG	2	10	3888159	3888168	0 %	20 %	60 %	20 %	117619845
2530	NC_008570	GATCC	2	10	3889523	3889532	20 %	20 %	20 %	40 %	117620272
2531	NC_008570	GCCCC	2	10	3890009	3890018	0 %	0 %	20 %	80 %	117620272
2532	NC_008570	CCTGG	2	10	3895855	3895864	0 %	20 %	40 %	40 %	117618537
2533	NC_008570	CGCCC	2	10	3896262	3896271	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2534	NC_008570	GACCA	2	10	3900436	3900445	40 %	0 %	20 %	40 %	117621064
2535	NC_008570	CAGCA	2	10	3901305	3901314	40 %	0 %	20 %	40 %	117621064
2536	NC_008570	AGTGT	2	10	3901459	3901468	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_008570	GGCGC	2	10	3903383	3903392	0 %	0 %	60 %	40 %	117618467
2538	NC_008570	CCAGG	2	10	3904048	3904057	20 %	0 %	40 %	40 %	117618679
2539	NC_008570	CCGGG	2	10	3906309	3906318	0 %	0 %	60 %	40 %	117619828
2540	NC_008570	ACCCG	2	10	3907517	3907526	20 %	0 %	20 %	60 %	117620769
2541	NC_008570	TAGAG	2	10	3909613	3909622	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_008570	ACGGC	2	10	3910311	3910320	20 %	0 %	40 %	40 %	117621434
2543	NC_008570	TGCCC	2	10	3910714	3910723	0 %	20 %	20 %	60 %	117618473
2544	NC_008570	AGCGC	2	10	3912904	3912913	20 %	0 %	40 %	40 %	117618473
2545	NC_008570	TGCGC	2	10	3914302	3914311	0 %	20 %	40 %	40 %	117619110
2546	NC_008570	CCACC	2	10	3914338	3914347	20 %	0 %	0 %	80 %	117619110
2547	NC_008570	CGTCA	2	10	3920171	3920180	20 %	20 %	20 %	40 %	117618784
2548	NC_008570	GTCGT	2	10	3930297	3930306	0 %	40 %	40 %	20 %	117618784
2549	NC_008570	GGTCG	2	10	3930563	3930572	0 %	20 %	60 %	20 %	117618784
2550	NC_008570	AAAAT	2	10	3931032	3931041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_008570	TCACC	2	10	3933960	3933969	20 %	20 %	0 %	60 %	117619706
2552	NC_008570	ATGAA	2	10	3935893	3935902	60 %	20 %	20 %	0 %	117620603
2553	NC_008570	CCCCT	2	10	3937582	3937591	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2554	NC_008570	CGTGC	2	10	3938891	3938900	0 %	20 %	40 %	40 %	117618661
2555	NC_008570	GGTCT	2	10	3938987	3938996	0 %	40 %	40 %	20 %	117618661
2556	NC_008570	CCCCA	2	10	3942290	3942299	20 %	0 %	0 %	80 %	117617501
2557	NC_008570	CCAGC	2	10	3945774	3945783	20 %	0 %	20 %	60 %	117620273
2558	NC_008570	TCCAG	2	10	3945854	3945863	20 %	20 %	20 %	40 %	117620273
2559	NC_008570	CCAGC	2	10	3947399	3947408	20 %	0 %	20 %	60 %	117618109
2560	NC_008570	GCCTT	2	10	3948275	3948284	0 %	40 %	20 %	40 %	117618828
2561	NC_008570	GCCGA	2	10	3950310	3950319	20 %	0 %	40 %	40 %	117617872
2562	NC_008570	GATCA	2	10	3951371	3951380	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2563	NC_008570	CGACT	2	10	3953593	3953602	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2564	NC_008570	CGCTA	2	10	3954520	3954529	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2565	NC_008570	TAAGG	2	10	3955207	3955216	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_008570	CACGA	2	10	3955676	3955685	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2567	NC_008570	TTTGC	2	10	3956946	3956955	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2568	NC_008570	CCAGA	2	10	3956959	3956968	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2569	NC_008570	AACGC	2	10	3957853	3957862	40 %	0 %	20 %	40 %	117620607
2570	NC_008570	GCCTT	2	10	3958236	3958245	0 %	40 %	20 %	40 %	117620607
2571	NC_008570	TCTTG	2	10	3959769	3959778	0 %	60 %	20 %	20 %	117619175
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2573	NC_008570	AGCAG	2	10	3963726	3963735	40 %	0 %	40 %	20 %	117621040
2574	NC_008570	CGTGA	2	10	3964379	3964388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2575	NC_008570	CCGGC	2	10	3965486	3965495	0 %	0 %	40 %	60 %	117617783
2576	NC_008570	ACCTT	2	10	3967717	3967726	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2577	NC_008570	CTTTC	2	10	3971491	3971500	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2578	NC_008570	GCGCA	2	10	3972247	3972256	20 %	0 %	40 %	40 %	117619450
2579	NC_008570	GCGAG	2	10	3972910	3972919	20 %	0 %	60 %	20 %	117619450
2580	NC_008570	GCCAT	2	10	3973690	3973699	20 %	20 %	20 %	40 %	117619450
2581	NC_008570	TGCCC	2	10	3974351	3974360	0 %	20 %	20 %	60 %	117619450
2582	NC_008570	CGCGC	2	10	3975983	3975992	0 %	0 %	40 %	60 %	117619241
2583	NC_008570	TGGCC	2	10	3976278	3976287	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2584	NC_008570	CGTGA	2	10	3977956	3977965	20 %	20 %	40 %	20 %	117620345
2585	NC_008570	TGGCC	2	10	3978387	3978396	0 %	20 %	40 %	40 %	117620345
2586	NC_008570	AATCC	2	10	3978890	3978899	40 %	20 %	0 %	40 %	117620345
2587	NC_008570	GATCA	2	10	3979380	3979389	40 %	20 %	20 %	20 %	117619770
2588	NC_008570	GTGGA	2	10	3982721	3982730	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_008570	TTGCA	2	10	3984920	3984929	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2590	NC_008570	CGCCA	2	10	3985356	3985365	20 %	0 %	20 %	60 %	117617932
2591	NC_008570	AATTA	2	10	3991238	3991247	60 %	40 %	0 %	0 %	117618375
2592	NC_008570	TAACA	2	10	3992458	3992467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2593	NC_008570	CTCAA	2	10	3993630	3993639	40 %	20 %	0 %	40 %	117617843
2594	NC_008570	CTGGG	2	10	3995276	3995285	0 %	20 %	60 %	20 %	117620022
2595	NC_008570	GCAGC	2	10	3995404	3995413	20 %	0 %	40 %	40 %	117620022
2596	NC_008570	CAAGG	2	10	3997993	3998002	40 %	0 %	40 %	20 %	117618231
2597	NC_008570	ACCAG	2	10	3999681	3999690	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2598	NC_008570	GAAAA	2	10	3999792	3999801	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_008570	TTATT	2	10	4001468	4001477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_008570	AATTC	2	10	4002439	4002448	40 %	40 %	0 %	20 %	117619734
2601	NC_008570	TCTGC	2	10	4003750	4003759	0 %	40 %	20 %	40 %	117620177
2602	NC_008570	CCCGG	2	10	4006057	4006066	0 %	0 %	40 %	60 %	117619351
2603	NC_008570	CTTCA	2	10	4007324	4007333	20 %	40 %	0 %	40 %	117619880
2604	NC_008570	CAGGC	2	10	4008153	4008162	20 %	0 %	40 %	40 %	117620289
2605	NC_008570	GGAAG	2	10	4009226	4009235	40 %	0 %	60 %	0 %	117620289
2606	NC_008570	AGTGG	2	10	4013757	4013766	20 %	20 %	60 %	0 %	117619435
2607	NC_008570	GCCAA	2	10	4015258	4015267	40 %	0 %	20 %	40 %	117618303
2608	NC_008570	GGTGA	2	10	4015884	4015893	20 %	20 %	60 %	0 %	117618303
2609	NC_008570	AACCC	2	10	4019388	4019397	40 %	0 %	0 %	60 %	117617686
2610	NC_008570	TTTGC	2	10	4021995	4022004	0 %	60 %	20 %	20 %	117621393
2611	NC_008570	AGGCC	2	10	4023422	4023431	20 %	0 %	40 %	40 %	117617666
2612	NC_008570	CGCTG	2	10	4024619	4024628	0 %	20 %	40 %	40 %	117619176
2613	NC_008570	GGCGC	2	10	4025458	4025467	0 %	0 %	60 %	40 %	117619176
2614	NC_008570	GGTGA	2	10	4025980	4025989	20 %	20 %	60 %	0 %	117618837
2615	NC_008570	CATCC	2	10	4026946	4026955	20 %	20 %	0 %	60 %	117618837
2616	NC_008570	GTGTC	2	10	4028319	4028328	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2617	NC_008570	GCGGG	2	10	4028875	4028884	0 %	0 %	80 %	20 %	117621530
2618	NC_008570	GCCCA	2	10	4030195	4030204	20 %	0 %	20 %	60 %	117620935
2619	NC_008570	GGCAG	2	10	4032053	4032062	20 %	0 %	60 %	20 %	117620586
2620	NC_008570	CAGGG	2	10	4032092	4032101	20 %	0 %	60 %	20 %	117620586
2621	NC_008570	GGGCG	2	10	4033156	4033165	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2622	NC_008570	GGCCG	2	10	4033547	4033556	0 %	0 %	60 %	40 %	117618326
2623	NC_008570	GCTGA	2	10	4034052	4034061	20 %	20 %	40 %	20 %	117618129
2624	NC_008570	AGCCC	2	10	4034219	4034228	20 %	0 %	20 %	60 %	117618129
2625	NC_008570	GGCAC	2	10	4034893	4034902	20 %	0 %	40 %	40 %	117618129
2626	NC_008570	GGCGC	2	10	4035425	4035434	0 %	0 %	60 %	40 %	117618129
2627	NC_008570	CGCGC	2	10	4036020	4036029	0 %	0 %	40 %	60 %	117618129
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2738	NC_008570	CTCGC	2	10	4199103	4199112	0 %	20 %	20 %	60 %	117619283
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2743	NC_008570	CTGGC	2	10	4210011	4210020	0 %	20 %	40 %	40 %	117618877
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2954	NC_008570	CGCTT	2	10	4515206	4515215	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2982	NC_008570	GCGCA	2	10	4555730	4555739	20 %	0 %	40 %	40 %	117619398
2983	NC_008570	CCACA	2	10	4558887	4558896	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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2986	NC_008570	AGCAG	2	10	4561802	4561811	40 %	0 %	40 %	20 %	117620140
2987	NC_008570	TAGCC	2	10	4563769	4563778	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2993	NC_008570	TGCTC	2	10	4572749	4572758	0 %	40 %	20 %	40 %	117621554
2994	NC_008570	GCGCC	2	10	4572891	4572900	0 %	0 %	40 %	60 %	117621554
2995	NC_008570	AGCAG	2	10	4573170	4573179	40 %	0 %	40 %	20 %	117621554
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2997	NC_008570	ATTTC	2	10	4576053	4576062	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2998	NC_008570	AAGGC	2	10	4576193	4576202	40 %	0 %	40 %	20 %	117619187
2999	NC_008570	CGGGA	2	10	4579942	4579951	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3000	NC_008570	GCACC	2	10	4580692	4580701	20 %	0 %	20 %	60 %	117619261

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