MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 2221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008340	CCGCC	2	10	285	294	0 %	0 %	20 %	80 %	114319167
2	NC_008340	ACCAC	2	10	1324	1333	40 %	0 %	0 %	60 %	114319167
3	NC_008340	CTGCC	2	10	1819	1828	0 %	20 %	20 %	60 %	114319168
4	NC_008340	CGGGC	2	10	1945	1954	0 %	0 %	60 %	40 %	114319168
5	NC_008340	TCGCA	2	10	2525	2534	20 %	20 %	20 %	40 %	114319168
6	NC_008340	CGGCG	2	10	3717	3726	0 %	0 %	60 %	40 %	114319169
7	NC_008340	GACCC	2	10	5758	5767	20 %	0 %	20 %	60 %	114319170
8	NC_008340	CGACC	2	10	7560	7569	20 %	0 %	20 %	60 %	114319172
9	NC_008340	TTTTC	2	10	8665	8674	0 %	80 %	0 %	20 %	114319172
10	NC_008340	TGCCC	2	10	9034	9043	0 %	20 %	20 %	60 %	114319173
11	NC_008340	AGCGG	2	10	10276	10285	20 %	0 %	60 %	20 %	114319173
12	NC_008340	TGCCC	2	10	10829	10838	0 %	20 %	20 %	60 %	114319174
13	NC_008340	AAGGG	2	10	12014	12023	40 %	0 %	60 %	0 %	114319175
14	NC_008340	TGGCC	2	10	14274	14283	0 %	20 %	40 %	40 %	114319177
15	NC_008340	TGGCG	2	10	14878	14887	0 %	20 %	60 %	20 %	114319178
16	NC_008340	CCCAG	2	10	15262	15271	20 %	0 %	20 %	60 %	114319178
17	NC_008340	CCCAG	2	10	19681	19690	20 %	0 %	20 %	60 %	114319182
18	NC_008340	TCCAG	2	10	21147	21156	20 %	20 %	20 %	40 %	114319183
19	NC_008340	CCGGC	2	10	22351	22360	0 %	0 %	40 %	60 %	114319184
20	NC_008340	CGCGG	2	10	23254	23263	0 %	0 %	60 %	40 %	114319185
21	NC_008340	CCGGC	2	10	26417	26426	0 %	0 %	40 %	60 %	114319188
22	NC_008340	TCAGC	2	10	26820	26829	20 %	20 %	20 %	40 %	114319188
23	NC_008340	GGACC	2	10	26994	27003	20 %	0 %	40 %	40 %	114319188
24	NC_008340	CCCTG	2	10	27646	27655	0 %	20 %	20 %	60 %	114319189
25	NC_008340	GCGGT	2	10	30932	30941	0 %	20 %	60 %	20 %	114319194
26	NC_008340	CCAGG	2	10	33787	33796	20 %	0 %	40 %	40 %	114319196
27	NC_008340	CGGTC	2	10	35291	35300	0 %	20 %	40 %	40 %	114319197
28	NC_008340	CGCGG	2	10	35349	35358	0 %	0 %	60 %	40 %	114319197
29	NC_008340	CCAGG	2	10	35668	35677	20 %	0 %	40 %	40 %	114319198
30	NC_008340	GGCCC	2	10	36276	36285	0 %	0 %	40 %	60 %	114319198
31	NC_008340	GCCGG	2	10	37015	37024	0 %	0 %	60 %	40 %	114319199
32	NC_008340	TGGGC	2	10	41207	41216	0 %	20 %	60 %	20 %	114319203
33	NC_008340	GCCCC	2	10	44223	44232	0 %	0 %	20 %	80 %	114319206
34	NC_008340	ATCGC	2	10	46267	46276	20 %	20 %	20 %	40 %	114319206
35	NC_008340	GGCCC	2	10	48272	48281	0 %	0 %	40 %	60 %	114319208
36	NC_008340	TCGCC	2	10	50810	50819	0 %	20 %	20 %	60 %	114319210
37	NC_008340	ATCGA	2	10	51210	51219	40 %	20 %	20 %	20 %	114319211
38	NC_008340	TGCGT	2	10	51837	51846	0 %	40 %	40 %	20 %	114319212
39	NC_008340	TGACC	2	10	52461	52470	20 %	20 %	20 %	40 %	114319212
40	NC_008340	GGCCG	2	10	54364	54373	0 %	0 %	60 %	40 %	114319214
41	NC_008340	CGCGC	2	10	56764	56773	0 %	0 %	40 %	60 %	114319216
42	NC_008340	CCGCC	2	10	59628	59637	0 %	0 %	20 %	80 %	114319219
43	NC_008340	CCCGG	2	10	60756	60765	0 %	0 %	40 %	60 %	114319220
44	NC_008340	CAAGG	2	10	61433	61442	40 %	0 %	40 %	20 %	114319221
45	NC_008340	GCTGC	2	10	61979	61988	0 %	20 %	40 %	40 %	114319221
46	NC_008340	CGGAC	2	10	64951	64960	20 %	0 %	40 %	40 %	114319221
47	NC_008340	AGCCC	2	10	67092	67101	20 %	0 %	20 %	60 %	114319225
48	NC_008340	CGGCG	2	10	67170	67179	0 %	0 %	60 %	40 %	114319225
49	NC_008340	CGGTC	2	10	67360	67369	0 %	20 %	40 %	40 %	114319225
50	NC_008340	CCGGC	2	10	67809	67818	0 %	0 %	40 %	60 %	114319225
51	NC_008340	CGGTG	2	10	68203	68212	0 %	20 %	60 %	20 %	114319226
52	NC_008340	GCCGC	2	10	69613	69622	0 %	0 %	40 %	60 %	114319228
53	NC_008340	CCTGC	2	10	73471	73480	0 %	20 %	20 %	60 %	114319232
54	NC_008340	CGTGG	2	10	75947	75956	0 %	20 %	60 %	20 %	114319235
55	NC_008340	CAGGT	2	10	77257	77266	20 %	20 %	40 %	20 %	114319236
56	NC_008340	CTGGT	2	10	82712	82721	0 %	40 %	40 %	20 %	114319239
57	NC_008340	GCGCC	2	10	82954	82963	0 %	0 %	40 %	60 %	114319239
58	NC_008340	GCCCC	2	10	82994	83003	0 %	0 %	20 %	80 %	114319240
59	NC_008340	GCCGC	2	10	84732	84741	0 %	0 %	40 %	60 %	114319242
60	NC_008340	GGGCG	2	10	84843	84852	0 %	0 %	80 %	20 %	114319242
61	NC_008340	CCCGG	2	10	85316	85325	0 %	0 %	40 %	60 %	114319242
62	NC_008340	GCGCC	2	10	85977	85986	0 %	0 %	40 %	60 %	114319242
63	NC_008340	CCAGC	2	10	88092	88101	20 %	0 %	20 %	60 %	114319243
64	NC_008340	CCCGG	2	10	90786	90795	0 %	0 %	40 %	60 %	114319246
65	NC_008340	GTGGC	2	10	91534	91543	0 %	20 %	60 %	20 %	114319247
66	NC_008340	AGGGC	2	10	92888	92897	20 %	0 %	60 %	20 %	114319248
67	NC_008340	GACCC	2	10	95312	95321	20 %	0 %	20 %	60 %	114319251
68	NC_008340	GCTGC	2	10	96704	96713	0 %	20 %	40 %	40 %	114319253
69	NC_008340	GGGCT	2	10	99128	99137	0 %	20 %	60 %	20 %	114319254
70	NC_008340	TGGGG	2	10	99160	99169	0 %	20 %	80 %	0 %	114319254
71	NC_008340	GCCCG	2	10	101360	101369	0 %	0 %	40 %	60 %	114319255
72	NC_008340	CAGGT	2	10	101709	101718	20 %	20 %	40 %	20 %	114319256
73	NC_008340	GGCCA	2	10	105850	105859	20 %	0 %	40 %	40 %	114319260
74	NC_008340	GTGCC	2	10	106297	106306	0 %	20 %	40 %	40 %	114319261
75	NC_008340	GCCGT	2	10	107045	107054	0 %	20 %	40 %	40 %	114319261
76	NC_008340	AGCGG	2	10	107943	107952	20 %	0 %	60 %	20 %	114319262
77	NC_008340	CCAGC	2	10	109764	109773	20 %	0 %	20 %	60 %	114319264
78	NC_008340	GTCGT	2	10	112049	112058	0 %	40 %	40 %	20 %	114319266
79	NC_008340	CGGGC	2	10	113661	113670	0 %	0 %	60 %	40 %	114319268
80	NC_008340	CGGCG	2	10	115234	115243	0 %	0 %	60 %	40 %	114319270
81	NC_008340	CGGGC	2	10	116517	116526	0 %	0 %	60 %	40 %	114319270
82	NC_008340	GGGCC	2	10	116544	116553	0 %	0 %	60 %	40 %	114319270
83	NC_008340	CGGGG	2	10	117233	117242	0 %	0 %	80 %	20 %	114319271
84	NC_008340	CGTGG	2	10	118455	118464	0 %	20 %	60 %	20 %	114319271
85	NC_008340	CGGGC	2	10	118599	118608	0 %	0 %	60 %	40 %	114319271
86	NC_008340	CGGGA	2	10	120345	120354	20 %	0 %	60 %	20 %	114319272
87	NC_008340	GCCGT	2	10	121675	121684	0 %	20 %	40 %	40 %	114319273
88	NC_008340	GGCCG	2	10	122194	122203	0 %	0 %	60 %	40 %	114319273
89	NC_008340	GGCGG	2	10	122970	122979	0 %	0 %	80 %	20 %	114319274
90	NC_008340	GGGCA	2	10	123619	123628	20 %	0 %	60 %	20 %	114319275
91	NC_008340	GGGCC	2	10	123738	123747	0 %	0 %	60 %	40 %	114319275
92	NC_008340	TCCGA	2	10	125117	125126	20 %	20 %	20 %	40 %	114319277
93	NC_008340	TCTAT	2	10	128195	128204	20 %	60 %	0 %	20 %	114319279
94	NC_008340	CGGCG	2	10	129538	129547	0 %	0 %	60 %	40 %	114319280
95	NC_008340	CGAAG	2	10	132766	132775	40 %	0 %	40 %	20 %	114319281
96	NC_008340	TTGGC	2	10	132820	132829	0 %	40 %	40 %	20 %	114319281
97	NC_008340	CCGGT	2	10	133621	133630	0 %	20 %	40 %	40 %	114319282
98	NC_008340	GCTGG	2	10	133729	133738	0 %	20 %	60 %	20 %	114319282
99	NC_008340	ACGGT	2	10	134172	134181	20 %	20 %	40 %	20 %	114319282
100	NC_008340	CCATG	2	10	134830	134839	20 %	20 %	20 %	40 %	114319282
101	NC_008340	TCCGT	2	10	135204	135213	0 %	40 %	20 %	40 %	114319283
102	NC_008340	CCGGG	2	10	136760	136769	0 %	0 %	60 %	40 %	114319284
103	NC_008340	GGTTC	2	10	138753	138762	0 %	40 %	40 %	20 %	114319285
104	NC_008340	GCGGG	2	10	140873	140882	0 %	0 %	80 %	20 %	114319287
105	NC_008340	GATGA	2	10	142100	142109	40 %	20 %	40 %	0 %	114319287
106	NC_008340	GCCCG	2	10	143133	143142	0 %	0 %	40 %	60 %	114319288
107	NC_008340	TGAGT	2	10	144157	144166	20 %	40 %	40 %	0 %	114319289
108	NC_008340	CCGAG	2	10	147319	147328	20 %	0 %	40 %	40 %	114319291
109	NC_008340	CCCAG	2	10	148776	148785	20 %	0 %	20 %	60 %	114319292
110	NC_008340	CCGGT	2	10	149299	149308	0 %	20 %	40 %	40 %	114319293
111	NC_008340	GGGGT	2	10	152124	152133	0 %	20 %	80 %	0 %	114319294
112	NC_008340	GGCCC	2	10	154989	154998	0 %	0 %	40 %	60 %	114319297
113	NC_008340	GGCCC	2	10	155468	155477	0 %	0 %	40 %	60 %	114319297
114	NC_008340	CGCGG	2	10	157416	157425	0 %	0 %	60 %	40 %	114319299
115	NC_008340	CCCGG	2	10	157958	157967	0 %	0 %	40 %	60 %	114319299
116	NC_008340	CCCAG	2	10	158414	158423	20 %	0 %	20 %	60 %	114319299
117	NC_008340	TCCAC	2	10	158852	158861	20 %	20 %	0 %	60 %	114319300
118	NC_008340	TGGCG	2	10	161483	161492	0 %	20 %	60 %	20 %	114319301
119	NC_008340	GCTGT	2	10	161939	161948	0 %	40 %	40 %	20 %	114319302
120	NC_008340	TCGGG	2	10	163340	163349	0 %	20 %	60 %	20 %	114319303
121	NC_008340	CAGGG	2	10	164182	164191	20 %	0 %	60 %	20 %	114319303
122	NC_008340	CGGCA	2	10	164563	164572	20 %	0 %	40 %	40 %	114319304
123	NC_008340	GGGCC	2	10	166121	166130	0 %	0 %	60 %	40 %	114319305
124	NC_008340	CCACC	2	10	166861	166870	20 %	0 %	0 %	80 %	114319306
125	NC_008340	GCGCC	2	10	167867	167876	0 %	0 %	40 %	60 %	114319307
126	NC_008340	GGCCG	2	10	168394	168403	0 %	0 %	60 %	40 %	114319307
127	NC_008340	CGGCG	2	10	169883	169892	0 %	0 %	60 %	40 %	114319308
128	NC_008340	GAGCC	2	10	172203	172212	20 %	0 %	40 %	40 %	114319310
129	NC_008340	GTGCC	2	10	173077	173086	0 %	20 %	40 %	40 %	114319311
130	NC_008340	CCCGG	2	10	173285	173294	0 %	0 %	40 %	60 %	114319311
131	NC_008340	ACGGG	2	10	173647	173656	20 %	0 %	60 %	20 %	114319312
132	NC_008340	GGGCG	2	10	175346	175355	0 %	0 %	80 %	20 %	114319313
133	NC_008340	GCGCT	2	10	175434	175443	0 %	20 %	40 %	40 %	114319313
134	NC_008340	CGGGC	2	10	175866	175875	0 %	0 %	60 %	40 %	114319314
135	NC_008340	CCGAC	2	10	176556	176565	20 %	0 %	20 %	60 %	114319314
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