MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 2221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008340	GCCCG	2	10	2151370	2151379	0 %	0 %	40 %	60 %	114321039
1502	NC_008340	GCCGG	2	10	2154663	2154672	0 %	0 %	60 %	40 %	114321041
1503	NC_008340	GCGCC	2	10	2157287	2157296	0 %	0 %	40 %	60 %	114321043
1504	NC_008340	CCAGC	2	10	2157704	2157713	20 %	0 %	20 %	60 %	114321043
1505	NC_008340	GGCCA	2	10	2157750	2157759	20 %	0 %	40 %	40 %	114321043
1506	NC_008340	CCGGC	3	15	2161134	2161148	0 %	0 %	40 %	60 %	114321046
1507	NC_008340	CGCAG	2	10	2165200	2165209	20 %	0 %	40 %	40 %	114321050
1508	NC_008340	CGGCG	2	10	2168119	2168128	0 %	0 %	60 %	40 %	114321051
1509	NC_008340	GCCTG	2	10	2172358	2172367	0 %	20 %	40 %	40 %	114321055
1510	NC_008340	GGACC	2	10	2173010	2173019	20 %	0 %	40 %	40 %	114321055
1511	NC_008340	CGCCC	2	10	2176411	2176420	0 %	0 %	20 %	80 %	114321061
1512	NC_008340	ACGCA	2	10	2178551	2178560	40 %	0 %	20 %	40 %	114321063
1513	NC_008340	TTCCG	2	10	2183146	2183155	0 %	40 %	20 %	40 %	114321066
1514	NC_008340	ACGAG	2	10	2184065	2184074	40 %	0 %	40 %	20 %	114321067
1515	NC_008340	GCCCA	2	10	2184213	2184222	20 %	0 %	20 %	60 %	114321067
1516	NC_008340	GCGGT	2	10	2184935	2184944	0 %	20 %	60 %	20 %	114321068
1517	NC_008340	CGGGG	2	10	2184980	2184989	0 %	0 %	80 %	20 %	114321068
1518	NC_008340	ACCGC	2	10	2188620	2188629	20 %	0 %	20 %	60 %	114321072
1519	NC_008340	GGCCA	2	10	2189460	2189469	20 %	0 %	40 %	40 %	114321073
1520	NC_008340	GCCCG	2	10	2189971	2189980	0 %	0 %	40 %	60 %	114321074
1521	NC_008340	CGCAG	2	10	2192032	2192041	20 %	0 %	40 %	40 %	114321076
1522	NC_008340	GGCGA	2	10	2192998	2193007	20 %	0 %	60 %	20 %	114321078
1523	NC_008340	GCTGC	2	10	2196101	2196110	0 %	20 %	40 %	40 %	114321079
1524	NC_008340	TCATT	2	10	2203708	2203717	20 %	60 %	0 %	20 %	114321086
1525	NC_008340	TGGTC	2	10	2205683	2205692	0 %	40 %	40 %	20 %	114321088
1526	NC_008340	GCTCA	2	10	2207950	2207959	20 %	20 %	20 %	40 %	114321090
1527	NC_008340	GCCAC	2	10	2210459	2210468	20 %	0 %	20 %	60 %	114321092
1528	NC_008340	GCCCC	2	10	2212933	2212942	0 %	0 %	20 %	80 %	114321093
1529	NC_008340	GCCTT	2	10	2218964	2218973	0 %	40 %	20 %	40 %	114321099
1530	NC_008340	TCGCT	2	10	2219934	2219943	0 %	40 %	20 %	40 %	114321100
1531	NC_008340	CCGGG	2	10	2220945	2220954	0 %	0 %	60 %	40 %	114321101
1532	NC_008340	TGCCC	2	10	2221780	2221789	0 %	20 %	20 %	60 %	114321101
1533	NC_008340	CGGGG	2	10	2225699	2225708	0 %	0 %	80 %	20 %	114321105
1534	NC_008340	GGTGC	2	10	2226504	2226513	0 %	20 %	60 %	20 %	114321106
1535	NC_008340	ACGGC	2	10	2226574	2226583	20 %	0 %	40 %	40 %	114321106
1536	NC_008340	GGCTC	2	10	2227382	2227391	0 %	20 %	40 %	40 %	114321107
1537	NC_008340	GCCCC	2	10	2228380	2228389	0 %	0 %	20 %	80 %	114321107
1538	NC_008340	CACCG	2	10	2229983	2229992	20 %	0 %	20 %	60 %	114321108
1539	NC_008340	CCGGC	2	10	2230788	2230797	0 %	0 %	40 %	60 %	114321108
1540	NC_008340	GGCCA	2	10	2230951	2230960	20 %	0 %	40 %	40 %	114321109
1541	NC_008340	GCCGG	2	10	2233935	2233944	0 %	0 %	60 %	40 %	114321113
1542	NC_008340	GTGCG	2	10	2235165	2235174	0 %	20 %	60 %	20 %	114321113
1543	NC_008340	GCCGA	2	10	2236212	2236221	20 %	0 %	40 %	40 %	114321114
1544	NC_008340	CCGGG	2	10	2237976	2237985	0 %	0 %	60 %	40 %	114321116
1545	NC_008340	GCACC	2	10	2239235	2239244	20 %	0 %	20 %	60 %	114321117
1546	NC_008340	CTTGC	2	10	2241084	2241093	0 %	40 %	20 %	40 %	114321120
1547	NC_008340	GCCGC	2	10	2241212	2241221	0 %	0 %	40 %	60 %	114321121
1548	NC_008340	TGCTC	2	10	2245747	2245756	0 %	40 %	20 %	40 %	114321124
1549	NC_008340	GGTGC	2	10	2247593	2247602	0 %	20 %	60 %	20 %	114321128
1550	NC_008340	CCGCG	2	10	2248439	2248448	0 %	0 %	40 %	60 %	114321129
1551	NC_008340	CCAGC	2	10	2251052	2251061	20 %	0 %	20 %	60 %	114321130
1552	NC_008340	CCTGG	2	10	2254073	2254082	0 %	20 %	40 %	40 %	114321133
1553	NC_008340	GGGGC	2	10	2254382	2254391	0 %	0 %	80 %	20 %	114321133
1554	NC_008340	TGGCT	2	10	2255021	2255030	0 %	40 %	40 %	20 %	114321134
1555	NC_008340	CGGAC	2	10	2257891	2257900	20 %	0 %	40 %	40 %	114321136
1556	NC_008340	CGGCC	2	10	2258657	2258666	0 %	0 %	40 %	60 %	114321137
1557	NC_008340	CGGCT	2	10	2260542	2260551	0 %	20 %	40 %	40 %	114321139
1558	NC_008340	ACTCC	2	10	2261697	2261706	20 %	20 %	0 %	60 %	114321140
1559	NC_008340	CGCTG	2	10	2262827	2262836	0 %	20 %	40 %	40 %	114321142
1560	NC_008340	GTCCG	2	10	2262949	2262958	0 %	20 %	40 %	40 %	114321142
1561	NC_008340	GCCCC	2	10	2262969	2262978	0 %	0 %	20 %	80 %	114321142
1562	NC_008340	ACCGG	2	10	2264729	2264738	20 %	0 %	40 %	40 %	114321144
1563	NC_008340	CGCTG	2	10	2264948	2264957	0 %	20 %	40 %	40 %	114321144
1564	NC_008340	GCGCC	2	10	2265173	2265182	0 %	0 %	40 %	60 %	114321144
1565	NC_008340	CGGGC	2	10	2265389	2265398	0 %	0 %	60 %	40 %	114321144
1566	NC_008340	GCGCT	2	10	2265847	2265856	0 %	20 %	40 %	40 %	114321145
1567	NC_008340	TCCCC	2	10	2266997	2267006	0 %	20 %	0 %	80 %	114321147
1568	NC_008340	GTTCA	2	10	2267978	2267987	20 %	40 %	20 %	20 %	114321148
1569	NC_008340	CCCCT	2	10	2268233	2268242	0 %	20 %	0 %	80 %	114321148
1570	NC_008340	CGCGG	2	10	2268455	2268464	0 %	0 %	60 %	40 %	114321148
1571	NC_008340	CACCG	2	10	2271340	2271349	20 %	0 %	20 %	60 %	114321152
1572	NC_008340	GAAAT	2	10	2272172	2272181	60 %	20 %	20 %	0 %	114321152
1573	NC_008340	GAGCC	2	10	2273820	2273829	20 %	0 %	40 %	40 %	114321153
1574	NC_008340	CGACA	2	10	2273989	2273998	40 %	0 %	20 %	40 %	114321153
1575	NC_008340	GGGTC	2	10	2274215	2274224	0 %	20 %	60 %	20 %	114321153
1576	NC_008340	ACGCC	2	10	2275782	2275791	20 %	0 %	20 %	60 %	114321155
1577	NC_008340	GGGAC	2	10	2276944	2276953	20 %	0 %	60 %	20 %	114321155
1578	NC_008340	GCCTG	2	10	2277129	2277138	0 %	20 %	40 %	40 %	114321155
1579	NC_008340	CACGG	2	10	2277784	2277793	20 %	0 %	40 %	40 %	114321155
1580	NC_008340	TTCCC	2	10	2280594	2280603	0 %	40 %	0 %	60 %	114321158
1581	NC_008340	CTGCC	2	10	2281783	2281792	0 %	20 %	20 %	60 %	114321158
1582	NC_008340	CCCGG	2	10	2282436	2282445	0 %	0 %	40 %	60 %	114321159
1583	NC_008340	CCCGC	2	10	2284551	2284560	0 %	0 %	20 %	80 %	114321161
1584	NC_008340	CCGGC	2	10	2287183	2287192	0 %	0 %	40 %	60 %	114321162
1585	NC_008340	GATCA	2	10	2287367	2287376	40 %	20 %	20 %	20 %	114321162
1586	NC_008340	ATCCA	2	10	2287572	2287581	40 %	20 %	0 %	40 %	114321163
1587	NC_008340	ATCGG	2	10	2291033	2291042	20 %	20 %	40 %	20 %	114321166
1588	NC_008340	GCCAG	2	10	2291158	2291167	20 %	0 %	40 %	40 %	114321166
1589	NC_008340	CACCG	2	10	2291964	2291973	20 %	0 %	20 %	60 %	114321166
1590	NC_008340	CAACC	2	10	2292399	2292408	40 %	0 %	0 %	60 %	114321167
1591	NC_008340	TGACC	2	10	2293819	2293828	20 %	20 %	20 %	40 %	114321169
1592	NC_008340	CAGCG	2	10	2294178	2294187	20 %	0 %	40 %	40 %	114321169
1593	NC_008340	CCGTG	2	10	2296889	2296898	0 %	20 %	40 %	40 %	114321174
1594	NC_008340	GCGCG	2	10	2297170	2297179	0 %	0 %	60 %	40 %	114321175
1595	NC_008340	CCCGG	2	10	2298851	2298860	0 %	0 %	40 %	60 %	114321177
1596	NC_008340	GGCCA	2	10	2299397	2299406	20 %	0 %	40 %	40 %	114321177
1597	NC_008340	GGCAC	2	10	2299567	2299576	20 %	0 %	40 %	40 %	114321177
1598	NC_008340	TGGGT	2	10	2300871	2300880	0 %	40 %	60 %	0 %	114321178
1599	NC_008340	GCCGC	2	10	2300884	2300893	0 %	0 %	40 %	60 %	114321178
1600	NC_008340	CGATG	2	10	2302315	2302324	20 %	20 %	40 %	20 %	114321179
1601	NC_008340	TACCG	2	10	2303318	2303327	20 %	20 %	20 %	40 %	114321179
1602	NC_008340	CCGGG	2	10	2305863	2305872	0 %	0 %	60 %	40 %	114321183
1603	NC_008340	ACCGG	2	10	2306202	2306211	20 %	0 %	40 %	40 %	114321183
1604	NC_008340	TGGCC	2	10	2306221	2306230	0 %	20 %	40 %	40 %	114321183
1605	NC_008340	CCGAC	2	10	2306323	2306332	20 %	0 %	20 %	60 %	114321184
1606	NC_008340	GCCTG	2	10	2306785	2306794	0 %	20 %	40 %	40 %	114321184
1607	NC_008340	ATGTG	2	10	2307270	2307279	20 %	40 %	40 %	0 %	114321185
1608	NC_008340	GGGCC	2	10	2310846	2310855	0 %	0 %	60 %	40 %	114321189
1609	NC_008340	GCCCG	2	10	2313690	2313699	0 %	0 %	40 %	60 %	114321191
1610	NC_008340	GCACG	2	10	2314525	2314534	20 %	0 %	40 %	40 %	114321192
1611	NC_008340	CCAGA	2	10	2316187	2316196	40 %	0 %	20 %	40 %	114321193
1612	NC_008340	GCCAC	2	10	2316596	2316605	20 %	0 %	20 %	60 %	114321194
1613	NC_008340	AGCGC	2	10	2318314	2318323	20 %	0 %	40 %	40 %	114321195
1614	NC_008340	CGGAT	2	10	2318872	2318881	20 %	20 %	40 %	20 %	114321196
1615	NC_008340	GGCCA	2	10	2319428	2319437	20 %	0 %	40 %	40 %	114321196
1616	NC_008340	CGGGA	2	10	2319901	2319910	20 %	0 %	60 %	20 %	114321196
1617	NC_008340	GGCCG	2	10	2320856	2320865	0 %	0 %	60 %	40 %	114321197
1618	NC_008340	CCCGC	2	10	2322476	2322485	0 %	0 %	20 %	80 %	114321198
1619	NC_008340	CCTCG	2	10	2325332	2325341	0 %	20 %	20 %	60 %	114321201
1620	NC_008340	CCAGG	2	10	2333025	2333034	20 %	0 %	40 %	40 %	114321207
1621	NC_008340	CCTGG	2	10	2333079	2333088	0 %	20 %	40 %	40 %	114321207
1622	NC_008340	GCCAT	2	10	2334906	2334915	20 %	20 %	20 %	40 %	114321209
1623	NC_008340	GCTCT	2	10	2335814	2335823	0 %	40 %	20 %	40 %	114321210
1624	NC_008340	CCCGC	2	10	2339327	2339336	0 %	0 %	20 %	80 %	114321212
1625	NC_008340	CGGCT	2	10	2341667	2341676	0 %	20 %	40 %	40 %	114321214
1626	NC_008340	CGGCG	2	10	2344301	2344310	0 %	0 %	60 %	40 %	114321216
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1630	NC_008340	CGGGC	2	10	2350551	2350560	0 %	0 %	60 %	40 %	114321222
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1633	NC_008340	GGCGG	2	10	2352002	2352011	0 %	0 %	80 %	20 %	114321222
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1641	NC_008340	CCGCC	2	10	2363547	2363556	0 %	0 %	20 %	80 %	114321234
1642	NC_008340	GCCCG	2	10	2367192	2367201	0 %	0 %	40 %	60 %	114321236
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1724	NC_008340	CCCAG	2	10	2495115	2495124	20 %	0 %	20 %	60 %	114321338
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1746	NC_008340	CGGCG	2	10	2527785	2527794	0 %	0 %	60 %	40 %	114321372
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1873	NC_008340	TCCGG	2	10	2713898	2713907	0 %	20 %	40 %	40 %	114321537
1874	NC_008340	GGCGG	2	10	2714358	2714367	0 %	0 %	80 %	20 %	114321537
1875	NC_008340	GGGTC	2	10	2716888	2716897	0 %	20 %	60 %	20 %	114321541
1876	NC_008340	TCCGG	2	10	2716984	2716993	0 %	20 %	40 %	40 %	114321541
1877	NC_008340	TGCTC	2	10	2719405	2719414	0 %	40 %	20 %	40 %	114321541
1878	NC_008340	GGGTC	2	10	2720891	2720900	0 %	20 %	60 %	20 %	114321543
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1886	NC_008340	GCGCC	2	10	2730246	2730255	0 %	0 %	40 %	60 %	114321548
1887	NC_008340	GCGCC	2	10	2730832	2730841	0 %	0 %	40 %	60 %	114321549
1888	NC_008340	GGGCC	2	10	2731069	2731078	0 %	0 %	60 %	40 %	114321549
1889	NC_008340	ACGCC	2	10	2731578	2731587	20 %	0 %	20 %	60 %	114321550
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1897	NC_008340	GCATC	2	10	2737319	2737328	20 %	20 %	20 %	40 %	114321554
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1907	NC_008340	GCCAG	2	10	2752453	2752462	20 %	0 %	40 %	40 %	114321569
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1939	NC_008340	GCCGC	2	10	2813965	2813974	0 %	0 %	40 %	60 %	114321621
1940	NC_008340	GGTGG	2	10	2814271	2814280	0 %	20 %	80 %	0 %	114321621
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1950	NC_008340	GCCTA	2	10	2830711	2830720	20 %	20 %	20 %	40 %	114321637
1951	NC_008340	GGCCG	2	10	2831183	2831192	0 %	0 %	60 %	40 %	114321637
1952	NC_008340	TCCGC	2	10	2832612	2832621	0 %	20 %	20 %	60 %	114321638
1953	NC_008340	GAGCT	2	10	2832964	2832973	20 %	20 %	40 %	20 %	114321638
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1957	NC_008340	GCCGG	2	10	2837767	2837776	0 %	0 %	60 %	40 %	114321643
1958	NC_008340	TGGGC	2	10	2837876	2837885	0 %	20 %	60 %	20 %	114321644
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1960	NC_008340	CTGGG	2	10	2839070	2839079	0 %	20 %	60 %	20 %	114321645
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1962	NC_008340	GCCTG	2	10	2839617	2839626	0 %	20 %	40 %	40 %	114321645
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1969	NC_008340	AGGCC	2	10	2845398	2845407	20 %	0 %	40 %	40 %	114321651
1970	NC_008340	GCCAC	2	10	2845433	2845442	20 %	0 %	20 %	60 %	114321651
1971	NC_008340	GGTCC	2	10	2845486	2845495	0 %	20 %	40 %	40 %	114321651
1972	NC_008340	CAACG	2	10	2848212	2848221	40 %	0 %	20 %	40 %	114321656
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1974	NC_008340	CCCGC	2	10	2851533	2851542	0 %	0 %	20 %	80 %	114321659
1975	NC_008340	CCACC	2	10	2852542	2852551	20 %	0 %	0 %	80 %	114321659
1976	NC_008340	TCGGC	2	10	2852877	2852886	0 %	20 %	40 %	40 %	114321659
1977	NC_008340	CGCTG	2	10	2853114	2853123	0 %	20 %	40 %	40 %	114321659
1978	NC_008340	CCAGC	2	10	2853378	2853387	20 %	0 %	20 %	60 %	114321660
1979	NC_008340	ACCGC	2	10	2853686	2853695	20 %	0 %	20 %	60 %	114321660
1980	NC_008340	TCGGC	2	10	2854166	2854175	0 %	20 %	40 %	40 %	114321660
1981	NC_008340	GCGCT	2	10	2857607	2857616	0 %	20 %	40 %	40 %	114321661
1982	NC_008340	GCCCG	2	10	2858267	2858276	0 %	0 %	40 %	60 %	114321662
1983	NC_008340	CGCAG	2	10	2858660	2858669	20 %	0 %	40 %	40 %	114321662
1984	NC_008340	CGGGT	2	10	2859251	2859260	0 %	20 %	60 %	20 %	114321663
1985	NC_008340	GGCTC	2	10	2859621	2859630	0 %	20 %	40 %	40 %	114321663
1986	NC_008340	CGGCC	2	10	2863059	2863068	0 %	0 %	40 %	60 %	114321665
1987	NC_008340	GACCC	2	10	2863096	2863105	20 %	0 %	20 %	60 %	114321665
1988	NC_008340	GGACA	2	10	2863623	2863632	40 %	0 %	40 %	20 %	114321666
1989	NC_008340	GCCTG	2	10	2864127	2864136	0 %	20 %	40 %	40 %	114321667
1990	NC_008340	ATCCG	2	10	2866798	2866807	20 %	20 %	20 %	40 %	114321671
1991	NC_008340	GCACC	2	10	2867139	2867148	20 %	0 %	20 %	60 %	114321671
1992	NC_008340	GCCCT	2	10	2867251	2867260	0 %	20 %	20 %	60 %	114321671
1993	NC_008340	GGGCA	2	10	2868842	2868851	20 %	0 %	60 %	20 %	114321673
1994	NC_008340	ACGCC	2	10	2870517	2870526	20 %	0 %	20 %	60 %	114321675
1995	NC_008340	CGGTG	2	10	2873807	2873816	0 %	20 %	60 %	20 %	114321678
1996	NC_008340	GCCCC	2	10	2874060	2874069	0 %	0 %	20 %	80 %	114321678
1997	NC_008340	CGGCG	2	10	2874444	2874453	0 %	0 %	60 %	40 %	114321678
1998	NC_008340	ACCCA	2	10	2883496	2883505	40 %	0 %	0 %	60 %	114321688
1999	NC_008340	GCCCC	2	10	2883884	2883893	0 %	0 %	20 %	80 %	114321688
2000	NC_008340	CGGGA	2	10	2884117	2884126	20 %	0 %	60 %	20 %	114321689

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