MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 2221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008340	GGACC	2	10	1454004	1454013	20 %	0 %	40 %	40 %	114320405
1002	NC_008340	GCACA	2	10	1454673	1454682	40 %	0 %	20 %	40 %	114320406
1003	NC_008340	GCATC	2	10	1457172	1457181	20 %	20 %	20 %	40 %	114320409
1004	NC_008340	CCGCG	2	10	1457489	1457498	0 %	0 %	40 %	60 %	114320409
1005	NC_008340	CCGCG	2	10	1457711	1457720	0 %	0 %	40 %	60 %	114320409
1006	NC_008340	GACGG	2	10	1458345	1458354	20 %	0 %	60 %	20 %	114320410
1007	NC_008340	GGACA	2	10	1458442	1458451	40 %	0 %	40 %	20 %	114320410
1008	NC_008340	GGTGA	2	10	1458484	1458493	20 %	20 %	60 %	0 %	114320410
1009	NC_008340	ATTCC	2	10	1459076	1459085	20 %	40 %	0 %	40 %	114320411
1010	NC_008340	GCCTG	2	10	1459609	1459618	0 %	20 %	40 %	40 %	114320411
1011	NC_008340	GCCGG	2	10	1462726	1462735	0 %	0 %	60 %	40 %	114320416
1012	NC_008340	GGTCC	2	10	1462871	1462880	0 %	20 %	40 %	40 %	114320416
1013	NC_008340	CCCGT	2	10	1464412	1464421	0 %	20 %	20 %	60 %	114320417
1014	NC_008340	CAGTT	2	10	1465219	1465228	20 %	40 %	20 %	20 %	114320418
1015	NC_008340	GGCCA	2	10	1466216	1466225	20 %	0 %	40 %	40 %	114320419
1016	NC_008340	GGCGC	2	10	1467135	1467144	0 %	0 %	60 %	40 %	114320420
1017	NC_008340	TCAGC	2	10	1468888	1468897	20 %	20 %	20 %	40 %	114320421
1018	NC_008340	TGCAG	2	10	1469366	1469375	20 %	20 %	40 %	20 %	114320422
1019	NC_008340	GCCCG	2	10	1470257	1470266	0 %	0 %	40 %	60 %	114320423
1020	NC_008340	GTTCG	2	10	1473174	1473183	0 %	40 %	40 %	20 %	114320426
1021	NC_008340	GATAA	2	10	1474275	1474284	60 %	20 %	20 %	0 %	114320427
1022	NC_008340	GTGGC	2	10	1474410	1474419	0 %	20 %	60 %	20 %	114320427
1023	NC_008340	TTGCG	2	10	1476249	1476258	0 %	40 %	40 %	20 %	114320429
1024	NC_008340	GCCTG	2	10	1478321	1478330	0 %	20 %	40 %	40 %	114320430
1025	NC_008340	TTGCC	2	10	1478379	1478388	0 %	40 %	20 %	40 %	114320430
1026	NC_008340	CTGGC	2	10	1478668	1478677	0 %	20 %	40 %	40 %	114320431
1027	NC_008340	CGGGC	2	10	1480197	1480206	0 %	0 %	60 %	40 %	114320432
1028	NC_008340	GGCCG	2	10	1481444	1481453	0 %	0 %	60 %	40 %	114320434
1029	NC_008340	GGGCG	2	10	1481528	1481537	0 %	0 %	80 %	20 %	114320434
1030	NC_008340	CCGGC	2	10	1482055	1482064	0 %	0 %	40 %	60 %	114320434
1031	NC_008340	GGCAC	2	10	1484737	1484746	20 %	0 %	40 %	40 %	114320438
1032	NC_008340	GCAGC	2	10	1485241	1485250	20 %	0 %	40 %	40 %	114320438
1033	NC_008340	CCCGG	2	10	1485656	1485665	0 %	0 %	40 %	60 %	114320439
1034	NC_008340	CGGAC	2	10	1487282	1487291	20 %	0 %	40 %	40 %	114320440
1035	NC_008340	GCTGC	2	10	1493394	1493403	0 %	20 %	40 %	40 %	114320446
1036	NC_008340	GGCCT	2	10	1494449	1494458	0 %	20 %	40 %	40 %	114320448
1037	NC_008340	GCGCT	2	10	1494509	1494518	0 %	20 %	40 %	40 %	114320448
1038	NC_008340	CCCCG	2	10	1495368	1495377	0 %	0 %	20 %	80 %	114320450
1039	NC_008340	CCGGT	2	10	1495486	1495495	0 %	20 %	40 %	40 %	114320450
1040	NC_008340	GGCCC	2	10	1497323	1497332	0 %	0 %	40 %	60 %	114320453
1041	NC_008340	GGCCT	2	10	1502979	1502988	0 %	20 %	40 %	40 %	114320458
1042	NC_008340	GGCCG	2	10	1504585	1504594	0 %	0 %	60 %	40 %	114320459
1043	NC_008340	GGTGC	2	10	1508002	1508011	0 %	20 %	60 %	20 %	114320463
1044	NC_008340	GCGCC	2	10	1510229	1510238	0 %	0 %	40 %	60 %	114320465
1045	NC_008340	CCGGG	2	10	1511914	1511923	0 %	0 %	60 %	40 %	114320467
1046	NC_008340	GTGCG	2	10	1517154	1517163	0 %	20 %	60 %	20 %	114320471
1047	NC_008340	CAGGT	2	10	1519316	1519325	20 %	20 %	40 %	20 %	114320472
1048	NC_008340	CTGGG	2	10	1520646	1520655	0 %	20 %	60 %	20 %	114320473
1049	NC_008340	GCCGG	2	10	1524281	1524290	0 %	0 %	60 %	40 %	114320475
1050	NC_008340	GCCGT	2	10	1526909	1526918	0 %	20 %	40 %	40 %	114320479
1051	NC_008340	GCATC	2	10	1528380	1528389	20 %	20 %	20 %	40 %	114320482
1052	NC_008340	GGGCC	2	10	1528473	1528482	0 %	0 %	60 %	40 %	114320482
1053	NC_008340	GGCCG	2	10	1529531	1529540	0 %	0 %	60 %	40 %	114320483
1054	NC_008340	GCGGA	2	10	1529840	1529849	20 %	0 %	60 %	20 %	114320484
1055	NC_008340	GCGCA	2	10	1533769	1533778	20 %	0 %	40 %	40 %	114320490
1056	NC_008340	GACCG	2	10	1533793	1533802	20 %	0 %	40 %	40 %	114320490
1057	NC_008340	CCACC	2	10	1534098	1534107	20 %	0 %	0 %	80 %	114320490
1058	NC_008340	GCCGC	2	10	1534607	1534616	0 %	0 %	40 %	60 %	114320490
1059	NC_008340	CCGCA	2	10	1537856	1537865	20 %	0 %	20 %	60 %	114320494
1060	NC_008340	CGGTG	2	10	1541030	1541039	0 %	20 %	60 %	20 %	114320498
1061	NC_008340	CCGGC	2	10	1541072	1541081	0 %	0 %	40 %	60 %	114320498
1062	NC_008340	GGGCG	2	10	1541165	1541174	0 %	0 %	80 %	20 %	114320498
1063	NC_008340	GCGTC	2	10	1541273	1541282	0 %	20 %	40 %	40 %	114320498
1064	NC_008340	GCTGC	2	10	1541442	1541451	0 %	20 %	40 %	40 %	114320499
1065	NC_008340	GTGAT	2	10	1542709	1542718	20 %	40 %	40 %	0 %	114320499
1066	NC_008340	GGCCT	2	10	1542777	1542786	0 %	20 %	40 %	40 %	114320499
1067	NC_008340	CGGTG	2	10	1547721	1547730	0 %	20 %	60 %	20 %	114320505
1068	NC_008340	GCGGG	2	10	1547733	1547742	0 %	0 %	80 %	20 %	114320505
1069	NC_008340	ACCGG	2	10	1548733	1548742	20 %	0 %	40 %	40 %	114320506
1070	NC_008340	TGCGG	2	10	1549084	1549093	0 %	20 %	60 %	20 %	114320506
1071	NC_008340	CCGGC	2	10	1549734	1549743	0 %	0 %	40 %	60 %	114320508
1072	NC_008340	CCGGC	2	10	1552029	1552038	0 %	0 %	40 %	60 %	114320510
1073	NC_008340	GTGGC	2	10	1553627	1553636	0 %	20 %	60 %	20 %	114320512
1074	NC_008340	CTCGT	2	10	1554457	1554466	0 %	40 %	20 %	40 %	114320513
1075	NC_008340	GCGCC	2	10	1554514	1554523	0 %	0 %	40 %	60 %	114320514
1076	NC_008340	CCGGT	2	10	1554624	1554633	0 %	20 %	40 %	40 %	114320514
1077	NC_008340	CACCG	2	10	1555243	1555252	20 %	0 %	20 %	60 %	114320514
1078	NC_008340	CGCCC	2	10	1556740	1556749	0 %	0 %	20 %	80 %	114320515
1079	NC_008340	CGGTC	2	10	1557654	1557663	0 %	20 %	40 %	40 %	114320516
1080	NC_008340	GCCCG	2	10	1557970	1557979	0 %	0 %	40 %	60 %	114320516
1081	NC_008340	TGCGG	2	10	1559439	1559448	0 %	20 %	60 %	20 %	114320518
1082	NC_008340	CCAGC	2	10	1563053	1563062	20 %	0 %	20 %	60 %	114320521
1083	NC_008340	GCCGG	2	10	1563829	1563838	0 %	0 %	60 %	40 %	114320522
1084	NC_008340	CCAAC	2	10	1565053	1565062	40 %	0 %	0 %	60 %	114320524
1085	NC_008340	CGCGG	2	10	1565602	1565611	0 %	0 %	60 %	40 %	114320524
1086	NC_008340	GGTGA	2	10	1566544	1566553	20 %	20 %	60 %	0 %	114320525
1087	NC_008340	CCGCG	2	10	1566876	1566885	0 %	0 %	40 %	60 %	114320525
1088	NC_008340	TGGGG	2	10	1566901	1566910	0 %	20 %	80 %	0 %	114320525
1089	NC_008340	GGGCA	2	10	1569599	1569608	20 %	0 %	60 %	20 %	114320527
1090	NC_008340	GGGAT	2	10	1572371	1572380	20 %	20 %	60 %	0 %	114320528
1091	NC_008340	AGATC	2	10	1573413	1573422	40 %	20 %	20 %	20 %	114320529
1092	NC_008340	GCCGA	2	10	1573451	1573460	20 %	0 %	40 %	40 %	114320529
1093	NC_008340	GCGGG	2	10	1574454	1574463	0 %	0 %	80 %	20 %	114320530
1094	NC_008340	ATGGC	2	10	1577096	1577105	20 %	20 %	40 %	20 %	114320533
1095	NC_008340	CGAGC	2	10	1580584	1580593	20 %	0 %	40 %	40 %	114320535
1096	NC_008340	CGCAG	2	10	1582202	1582211	20 %	0 %	40 %	40 %	114320537
1097	NC_008340	CAGGC	2	10	1582384	1582393	20 %	0 %	40 %	40 %	114320537
1098	NC_008340	CAGAC	2	10	1583302	1583311	40 %	0 %	20 %	40 %	114320537
1099	NC_008340	GCCCC	2	10	1583684	1583693	0 %	0 %	20 %	80 %	114320538
1100	NC_008340	ACCCC	2	10	1586654	1586663	20 %	0 %	0 %	80 %	114320540
1101	NC_008340	GCCAG	2	10	1587274	1587283	20 %	0 %	40 %	40 %	114320541
1102	NC_008340	CCGGC	2	10	1591206	1591215	0 %	0 %	40 %	60 %	114320545
1103	NC_008340	TGGGT	2	10	1592332	1592341	0 %	40 %	60 %	0 %	114320546
1104	NC_008340	CGGCC	2	10	1601731	1601740	0 %	0 %	40 %	60 %	114320552
1105	NC_008340	GATCA	2	10	1603421	1603430	40 %	20 %	20 %	20 %	114320554
1106	NC_008340	AATGG	2	10	1606319	1606328	40 %	20 %	40 %	0 %	114320557
1107	NC_008340	GCAGC	2	10	1607069	1607078	20 %	0 %	40 %	40 %	114320557
1108	NC_008340	GGGGC	2	10	1607136	1607145	0 %	0 %	80 %	20 %	114320558
1109	NC_008340	CTACG	2	10	1608691	1608700	20 %	20 %	20 %	40 %	114320560
1110	NC_008340	GCCTG	2	10	1608866	1608875	0 %	20 %	40 %	40 %	114320560
1111	NC_008340	GACGT	2	10	1609744	1609753	20 %	20 %	40 %	20 %	114320561
1112	NC_008340	GTTGC	2	10	1615823	1615832	0 %	40 %	40 %	20 %	114320565
1113	NC_008340	GGCGC	2	10	1619062	1619071	0 %	0 %	60 %	40 %	114320568
1114	NC_008340	GCTGA	2	10	1619815	1619824	20 %	20 %	40 %	20 %	114320569
1115	NC_008340	ATCGT	2	10	1619954	1619963	20 %	40 %	20 %	20 %	114320569
1116	NC_008340	GGGTT	2	10	1620271	1620280	0 %	40 %	60 %	0 %	114320569
1117	NC_008340	GGCGA	2	10	1621556	1621565	20 %	0 %	60 %	20 %	114320571
1118	NC_008340	GGCCC	2	10	1622021	1622030	0 %	0 %	40 %	60 %	114320571
1119	NC_008340	GCGCA	2	10	1622518	1622527	20 %	0 %	40 %	40 %	114320572
1120	NC_008340	CACGG	2	10	1622931	1622940	20 %	0 %	40 %	40 %	114320573
1121	NC_008340	GTCGG	2	10	1623172	1623181	0 %	20 %	60 %	20 %	114320573
1122	NC_008340	GGCCA	2	10	1623705	1623714	20 %	0 %	40 %	40 %	114320573
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1495	NC_008340	GCCGC	2	10	2148297	2148306	0 %	0 %	40 %	60 %	114321036
1496	NC_008340	TACGC	2	10	2148571	2148580	20 %	20 %	20 %	40 %	114321036
1497	NC_008340	AACCC	2	10	2149510	2149519	40 %	0 %	0 %	60 %	114321036
1498	NC_008340	TGATC	2	10	2150636	2150645	20 %	40 %	20 %	20 %	114321038
1499	NC_008340	GCCGC	2	10	2151089	2151098	0 %	0 %	40 %	60 %	114321039
1500	NC_008340	GCGCC	2	10	2151253	2151262	0 %	0 %	40 %	60 %	114321039

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