MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 2609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008340	CCAGC	2	10	2494414	2494423	20 %	0 %	20 %	60 %	114321338
2002	NC_008340	CCCGC	2	10	2494710	2494719	0 %	0 %	20 %	80 %	114321338
2003	NC_008340	CCCAG	2	10	2495115	2495124	20 %	0 %	20 %	60 %	114321338
2004	NC_008340	CGGCC	2	10	2496038	2496047	0 %	0 %	40 %	60 %	114321339
2005	NC_008340	CCGCG	2	10	2496335	2496344	0 %	0 %	40 %	60 %	114321340
2006	NC_008340	GCTCG	2	10	2496380	2496389	0 %	20 %	40 %	40 %	114321340
2007	NC_008340	TGGGT	2	10	2496394	2496403	0 %	40 %	60 %	0 %	114321340
2008	NC_008340	TCGCC	2	10	2497626	2497635	0 %	20 %	20 %	60 %	114321341
2009	NC_008340	CGGCA	2	10	2498750	2498759	20 %	0 %	40 %	40 %	114321342
2010	NC_008340	CCAGG	2	10	2499755	2499764	20 %	0 %	40 %	40 %	114321343
2011	NC_008340	GCCAG	2	10	2499820	2499829	20 %	0 %	40 %	40 %	114321343
2012	NC_008340	CGGTG	2	10	2501138	2501147	0 %	20 %	60 %	20 %	114321344
2013	NC_008340	CCGGC	2	10	2501797	2501806	0 %	0 %	40 %	60 %	114321344
2014	NC_008340	AGCCC	2	10	2502406	2502415	20 %	0 %	20 %	60 %	114321345
2015	NC_008340	GCCGG	2	10	2503959	2503968	0 %	0 %	60 %	40 %	114321346
2016	NC_008340	TCCGG	2	10	2504736	2504745	0 %	20 %	40 %	40 %	114321347
2017	NC_008340	GCCGA	2	10	2507981	2507990	20 %	0 %	40 %	40 %	114321349
2018	NC_008340	CCCTG	2	10	2510030	2510039	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2019	NC_008340	GGGCC	2	10	2512242	2512251	0 %	0 %	60 %	40 %	114321353
2020	NC_008340	GCAGC	2	10	2512530	2512539	20 %	0 %	40 %	40 %	114321353
2021	NC_008340	GCCGG	2	10	2513161	2513170	0 %	0 %	60 %	40 %	114321354
2022	NC_008340	GGCCG	2	10	2515244	2515253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2023	NC_008340	AGCCC	2	10	2516198	2516207	20 %	0 %	20 %	60 %	114321359
2024	NC_008340	GTGGA	2	10	2516953	2516962	20 %	20 %	60 %	0 %	114321359
2025	NC_008340	CGTGG	2	10	2518206	2518215	0 %	20 %	60 %	20 %	114321361
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2027	NC_008340	CGGCG	2	10	2527785	2527794	0 %	0 %	60 %	40 %	114321372
2028	NC_008340	GGGCC	2	10	2529115	2529124	0 %	0 %	60 %	40 %	114321373
2029	NC_008340	CTGCC	2	10	2532114	2532123	0 %	20 %	20 %	60 %	114321378
2030	NC_008340	TGCCC	2	10	2534910	2534919	0 %	20 %	20 %	60 %	114321381
2031	NC_008340	GGCAG	2	10	2535167	2535176	20 %	0 %	60 %	20 %	114321381
2032	NC_008340	CAACC	2	10	2536128	2536137	40 %	0 %	0 %	60 %	114321383
2033	NC_008340	CCCGG	2	10	2537997	2538006	0 %	0 %	40 %	60 %	114321385
2034	NC_008340	GTGCG	2	10	2538478	2538487	0 %	20 %	60 %	20 %	114321386
2035	NC_008340	AGCGC	2	10	2538783	2538792	20 %	0 %	40 %	40 %	114321387
2036	NC_008340	CGAAC	2	10	2538987	2538996	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2037	NC_008340	TCGCT	2	10	2539035	2539044	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2038	NC_008340	GCGGG	2	10	2539505	2539514	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2039	NC_008340	GCGGT	2	10	2540942	2540951	0 %	20 %	60 %	20 %	114321388
2040	NC_008340	AGCGC	2	10	2541117	2541126	20 %	0 %	40 %	40 %	114321388
2041	NC_008340	GCCCG	2	10	2541690	2541699	0 %	0 %	40 %	60 %	114321389
2042	NC_008340	GCCAG	2	10	2541743	2541752	20 %	0 %	40 %	40 %	114321389
2043	NC_008340	TAAAA	2	10	2543687	2543696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_008340	GGCGC	2	10	2543879	2543888	0 %	0 %	60 %	40 %	114321390
2045	NC_008340	CGGCC	2	10	2548172	2548181	0 %	0 %	40 %	60 %	114321396
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2048	NC_008340	CGGCG	2	10	2550855	2550864	0 %	0 %	60 %	40 %	114321399
2049	NC_008340	GGCCG	2	10	2552604	2552613	0 %	0 %	60 %	40 %	114321401
2050	NC_008340	GCCCA	2	10	2554113	2554122	20 %	0 %	20 %	60 %	114321402
2051	NC_008340	GCCCG	2	10	2554798	2554807	0 %	0 %	40 %	60 %	114321403
2052	NC_008340	CGGCG	2	10	2555036	2555045	0 %	0 %	60 %	40 %	114321403
2053	NC_008340	TCCGG	2	10	2555814	2555823	0 %	20 %	40 %	40 %	114321403
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2055	NC_008340	GGCCC	2	10	2557011	2557020	0 %	0 %	40 %	60 %	114321405
2056	NC_008340	CGGCC	2	10	2557055	2557064	0 %	0 %	40 %	60 %	114321405
2057	NC_008340	GCTGG	2	10	2557655	2557664	0 %	20 %	60 %	20 %	114321405
2058	NC_008340	GCCGG	2	10	2558161	2558170	0 %	0 %	60 %	40 %	114321405
2059	NC_008340	CGCCC	2	10	2561599	2561608	0 %	0 %	20 %	80 %	114321409
2060	NC_008340	CCGGC	2	10	2563229	2563238	0 %	0 %	40 %	60 %	114321410
2061	NC_008340	CAGCG	2	10	2567761	2567770	20 %	0 %	40 %	40 %	114321413
2062	NC_008340	GCCGC	2	10	2567779	2567788	0 %	0 %	40 %	60 %	114321413
2063	NC_008340	ACGGC	2	10	2569200	2569209	20 %	0 %	40 %	40 %	114321415
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2069	NC_008340	CGGCG	2	10	2575060	2575069	0 %	0 %	60 %	40 %	114321419
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2073	NC_008340	CCGCC	2	10	2578643	2578652	0 %	0 %	20 %	80 %	114321423
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2083	NC_008340	GCCCC	2	10	2589556	2589565	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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2091	NC_008340	TGACC	2	10	2596311	2596320	20 %	20 %	20 %	40 %	114321436
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2093	NC_008340	TCGTC	2	10	2597173	2597182	0 %	40 %	20 %	40 %	114321438
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2096	NC_008340	TCGCT	2	10	2601438	2601447	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2097	NC_008340	AGGCC	2	10	2602198	2602207	20 %	0 %	40 %	40 %	114321442
2098	NC_008340	CCGGG	2	10	2602512	2602521	0 %	0 %	60 %	40 %	114321442
2099	NC_008340	CCAGC	2	10	2604508	2604517	20 %	0 %	20 %	60 %	114321443
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2109	NC_008340	CAGGC	2	10	2615674	2615683	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2110	NC_008340	TCGCT	2	10	2616361	2616370	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2111	NC_008340	TACAA	2	10	2616562	2616571	60 %	20 %	0 %	20 %	114321452
2112	NC_008340	GCTGA	2	10	2617246	2617255	20 %	20 %	40 %	20 %	114321453
2113	NC_008340	TCGCT	2	10	2617405	2617414	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2118	NC_008340	GCACC	2	10	2624434	2624443	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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2124	NC_008340	CGGCG	2	10	2631429	2631438	0 %	0 %	60 %	40 %	114321468
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2126	NC_008340	CGGCG	2	10	2636414	2636423	0 %	0 %	60 %	40 %	114321472
2127	NC_008340	CCTGG	2	10	2636835	2636844	0 %	20 %	40 %	40 %	114321473
2128	NC_008340	GAAGC	2	10	2637357	2637366	40 %	0 %	40 %	20 %	114321474
2129	NC_008340	AAAAT	2	10	2638463	2638472	80 %	20 %	0 %	0 %	114321475
2130	NC_008340	GAAAG	2	10	2638761	2638770	60 %	0 %	40 %	0 %	114321475
2131	NC_008340	ATGAA	2	10	2639051	2639060	60 %	20 %	20 %	0 %	114321475
2132	NC_008340	AAGGT	2	10	2639342	2639351	40 %	20 %	40 %	0 %	114321475
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2134	NC_008340	GCCCT	2	10	2643552	2643561	0 %	20 %	20 %	60 %	114321479
2135	NC_008340	AAGAT	2	10	2643885	2643894	60 %	20 %	20 %	0 %	114321479
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2142	NC_008340	GCGGG	2	10	2655262	2655271	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2143	NC_008340	GAAGA	2	10	2657084	2657093	60 %	0 %	40 %	0 %	114321491
2144	NC_008340	GCCCT	2	10	2657941	2657950	0 %	20 %	20 %	60 %	114321492
2145	NC_008340	GCCGC	2	10	2663893	2663902	0 %	0 %	40 %	60 %	114321495
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2149	NC_008340	GCCCG	2	10	2673470	2673479	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2150	NC_008340	CCGGC	2	10	2674811	2674820	0 %	0 %	40 %	60 %	114321504
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2165	NC_008340	CCCGG	2	10	2691293	2691302	0 %	0 %	40 %	60 %	114321519
2166	NC_008340	GGTGG	2	10	2694555	2694564	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2167	NC_008340	GCCGA	2	10	2695368	2695377	20 %	0 %	40 %	40 %	114321520
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2169	NC_008340	CCCGG	2	10	2697252	2697261	0 %	0 %	40 %	60 %	114321523
2170	NC_008340	GCCCG	2	10	2702062	2702071	0 %	0 %	40 %	60 %	114321525
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2173	NC_008340	GCGGG	2	10	2706362	2706371	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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2234	NC_008340	AGCGA	2	10	2772284	2772293	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2500	NC_008340	GCCCC	2	10	3097404	3097413	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

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