MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 2609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008340	CCATT	2	10	658903	658912	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
502	NC_008340	CCACC	2	10	659730	659739	20 %	0 %	0 %	80 %	114319769
503	NC_008340	TGCCG	2	10	660579	660588	0 %	20 %	40 %	40 %	114319770
504	NC_008340	AGGTC	2	10	664484	664493	20 %	20 %	40 %	20 %	114319774
505	NC_008340	GCCGG	2	10	665094	665103	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
506	NC_008340	GGGCA	2	10	671605	671614	20 %	0 %	60 %	20 %	114319781
507	NC_008340	TGGGC	2	10	671661	671670	0 %	20 %	60 %	20 %	114319781
508	NC_008340	GGTTG	2	10	672648	672657	0 %	40 %	60 %	0 %	114319783
509	NC_008340	CCCGG	2	10	673195	673204	0 %	0 %	40 %	60 %	114319784
510	NC_008340	CGCAG	2	10	673429	673438	20 %	0 %	40 %	40 %	114319784
511	NC_008340	CGGCG	2	10	673519	673528	0 %	0 %	60 %	40 %	114319784
512	NC_008340	CGGCG	2	10	674163	674172	0 %	0 %	60 %	40 %	114319785
513	NC_008340	GGGGC	2	10	676882	676891	0 %	0 %	80 %	20 %	114319788
514	NC_008340	CGCGG	2	10	680454	680463	0 %	0 %	60 %	40 %	114319791
515	NC_008340	AGGGC	2	10	680832	680841	20 %	0 %	60 %	20 %	114319791
516	NC_008340	GCCTG	2	10	681375	681384	0 %	20 %	40 %	40 %	114319792
517	NC_008340	TGTGG	2	10	682386	682395	0 %	40 %	60 %	0 %	114319793
518	NC_008340	GCCGT	2	10	682683	682692	0 %	20 %	40 %	40 %	114319794
519	NC_008340	GGGCC	2	10	683677	683686	0 %	0 %	60 %	40 %	114319794
520	NC_008340	GGGCG	2	10	685164	685173	0 %	0 %	80 %	20 %	114319795
521	NC_008340	CGGCC	2	10	686604	686613	0 %	0 %	40 %	60 %	114319797
522	NC_008340	CCGCG	2	10	688444	688453	0 %	0 %	40 %	60 %	114319798
523	NC_008340	AGCCG	2	10	690270	690279	20 %	0 %	40 %	40 %	114319800
524	NC_008340	CCGCC	2	10	690700	690709	0 %	0 %	20 %	80 %	114319800
525	NC_008340	GGCTC	2	10	690818	690827	0 %	20 %	40 %	40 %	114319800
526	NC_008340	GGGCA	2	10	692361	692370	20 %	0 %	60 %	20 %	114319801
527	NC_008340	GCCAC	2	10	692799	692808	20 %	0 %	20 %	60 %	114319802
528	NC_008340	GCGAT	2	10	693331	693340	20 %	20 %	40 %	20 %	114319803
529	NC_008340	CTGTC	2	10	693421	693430	0 %	40 %	20 %	40 %	114319804
530	NC_008340	GCCCG	2	10	697684	697693	0 %	0 %	40 %	60 %	114319807
531	NC_008340	CCCGG	2	10	698335	698344	0 %	0 %	40 %	60 %	114319807
532	NC_008340	GCCCG	2	10	698856	698865	0 %	0 %	40 %	60 %	114319808
533	NC_008340	CCCGG	2	10	699507	699516	0 %	0 %	40 %	60 %	114319808
534	NC_008340	GAGCC	2	10	701799	701808	20 %	0 %	40 %	40 %	114319809
535	NC_008340	GGTCG	2	10	702572	702581	0 %	20 %	60 %	20 %	114319809
536	NC_008340	GGCCC	2	10	704905	704914	0 %	0 %	40 %	60 %	114319811
537	NC_008340	GGGCG	2	10	705926	705935	0 %	0 %	80 %	20 %	114319811
538	NC_008340	GCCGC	2	10	706401	706410	0 %	0 %	40 %	60 %	114319812
539	NC_008340	TGGCC	2	10	706535	706544	0 %	20 %	40 %	40 %	114319812
540	NC_008340	CCGGC	2	10	706744	706753	0 %	0 %	40 %	60 %	114319812
541	NC_008340	CCCAG	2	10	708085	708094	20 %	0 %	20 %	60 %	114319813
542	NC_008340	GCCCG	2	10	708784	708793	0 %	0 %	40 %	60 %	114319813
543	NC_008340	CCAGG	2	10	709649	709658	20 %	0 %	40 %	40 %	114319813
544	NC_008340	GCGCG	2	10	711858	711867	0 %	0 %	60 %	40 %	114319814
545	NC_008340	CCCGA	2	10	713855	713864	20 %	0 %	20 %	60 %	114319815
546	NC_008340	TCTGC	2	10	716799	716808	0 %	40 %	20 %	40 %	114319817
547	NC_008340	GGCGC	2	10	718984	718993	0 %	0 %	60 %	40 %	114319818
548	NC_008340	GGCCT	2	10	720608	720617	0 %	20 %	40 %	40 %	114319819
549	NC_008340	GGCCT	2	10	721266	721275	0 %	20 %	40 %	40 %	114319820
550	NC_008340	GGGTG	2	10	723451	723460	0 %	20 %	80 %	0 %	114319823
551	NC_008340	GTGCT	2	10	728607	728616	0 %	40 %	40 %	20 %	114319826
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553	NC_008340	GCCCG	2	10	733382	733391	0 %	0 %	40 %	60 %	114319829
554	NC_008340	GCCTT	2	10	734617	734626	0 %	40 %	20 %	40 %	114319829
555	NC_008340	CGGGC	2	10	734952	734961	0 %	0 %	60 %	40 %	114319829
556	NC_008340	GCCGT	2	10	736648	736657	0 %	20 %	40 %	40 %	114319831
557	NC_008340	GGTCA	2	10	736683	736692	20 %	20 %	40 %	20 %	114319831
558	NC_008340	CAGTC	2	10	738902	738911	20 %	20 %	20 %	40 %	114319832
559	NC_008340	GGCCG	2	10	743351	743360	0 %	0 %	60 %	40 %	114319835
560	NC_008340	GCCCG	2	10	744730	744739	0 %	0 %	40 %	60 %	114319836
561	NC_008340	GGTGC	2	10	745312	745321	0 %	20 %	60 %	20 %	114319836
562	NC_008340	GTCCA	2	10	745796	745805	20 %	20 %	20 %	40 %	114319836
563	NC_008340	CGGTG	2	10	746068	746077	0 %	20 %	60 %	20 %	114319836
564	NC_008340	CGCAG	2	10	748238	748247	20 %	0 %	40 %	40 %	114319837
565	NC_008340	GCCGG	2	10	749005	749014	0 %	0 %	60 %	40 %	114319838
566	NC_008340	CGGGG	2	10	749306	749315	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
567	NC_008340	GGCCC	2	10	749821	749830	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
568	NC_008340	CTGGG	2	10	750302	750311	0 %	20 %	60 %	20 %	114319840
569	NC_008340	GGCCC	2	10	750363	750372	0 %	0 %	40 %	60 %	114319840
570	NC_008340	GCCAG	2	10	750608	750617	20 %	0 %	40 %	40 %	114319840
571	NC_008340	GCGCC	2	10	751128	751137	0 %	0 %	40 %	60 %	114319840
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574	NC_008340	GCTCC	2	10	757964	757973	0 %	20 %	20 %	60 %	114319843
575	NC_008340	GAGCA	2	10	758853	758862	40 %	0 %	40 %	20 %	114319843
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577	NC_008340	CGGTG	2	10	760689	760698	0 %	20 %	60 %	20 %	114319845
578	NC_008340	GGTTC	2	10	764471	764480	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
579	NC_008340	GGGGT	2	10	765881	765890	0 %	20 %	80 %	0 %	114319850
580	NC_008340	CCGCG	2	10	768749	768758	0 %	0 %	40 %	60 %	114319852
581	NC_008340	CCGGG	2	10	769790	769799	0 %	0 %	60 %	40 %	114319852
582	NC_008340	GCGCT	2	10	770100	770109	0 %	20 %	40 %	40 %	114319852
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587	NC_008340	GCGGA	2	10	777904	777913	20 %	0 %	60 %	20 %	114319859
588	NC_008340	ACGGC	2	10	782503	782512	20 %	0 %	40 %	40 %	114319861
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593	NC_008340	GCAGG	2	10	784727	784736	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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595	NC_008340	CCCGG	2	10	785508	785517	0 %	0 %	40 %	60 %	114319864
596	NC_008340	GAGGC	2	10	786071	786080	20 %	0 %	60 %	20 %	114319864
597	NC_008340	ACCAG	2	10	786126	786135	40 %	0 %	20 %	40 %	114319864
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599	NC_008340	TCGCT	2	10	786377	786386	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
600	NC_008340	TCGCT	2	10	786467	786476	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
601	NC_008340	TCGCT	2	10	786557	786566	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
602	NC_008340	CGGGG	2	10	788949	788958	0 %	0 %	80 %	20 %	114319867
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613	NC_008340	TCGGC	2	10	800813	800822	0 %	20 %	40 %	40 %	114319877
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615	NC_008340	TCGCT	2	10	805480	805489	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
616	NC_008340	CCCCA	2	10	806962	806971	20 %	0 %	0 %	80 %	114319886
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619	NC_008340	GCCGT	2	10	812255	812264	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
620	NC_008340	GGCCC	2	10	813108	813117	0 %	0 %	40 %	60 %	114319891
621	NC_008340	ACCAA	2	10	814024	814033	60 %	0 %	0 %	40 %	114319892
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624	NC_008340	GCCAC	2	10	821806	821815	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
625	NC_008340	CCGCG	2	10	824081	824090	0 %	0 %	40 %	60 %	114319902
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628	NC_008340	TGGCC	2	10	826258	826267	0 %	20 %	40 %	40 %	114319904
629	NC_008340	ACTGG	2	10	828156	828165	20 %	20 %	40 %	20 %	114319905
630	NC_008340	CCGGG	2	10	828412	828421	0 %	0 %	60 %	40 %	114319906
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