MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 2609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008340	GGGTT	2	10	1225837	1225846	0 %	40 %	60 %	0 %	114320212
1002	NC_008340	GGCGG	2	10	1225947	1225956	0 %	0 %	80 %	20 %	114320212
1003	NC_008340	TAGCC	2	10	1227797	1227806	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1004	NC_008340	TTCCG	2	10	1228347	1228356	0 %	40 %	20 %	40 %	114320214
1005	NC_008340	CCGCT	2	10	1228478	1228487	0 %	20 %	20 %	60 %	114320214
1006	NC_008340	TCTAC	2	10	1229151	1229160	20 %	40 %	0 %	40 %	114320215
1007	NC_008340	GGCCA	2	10	1229489	1229498	20 %	0 %	40 %	40 %	114320216
1008	NC_008340	CTGGC	2	10	1229622	1229631	0 %	20 %	40 %	40 %	114320216
1009	NC_008340	CGGTG	2	10	1232101	1232110	0 %	20 %	60 %	20 %	114320216
1010	NC_008340	ACCCG	2	10	1233611	1233620	20 %	0 %	20 %	60 %	114320217
1011	NC_008340	CGGAC	2	10	1233826	1233835	20 %	0 %	40 %	40 %	114320217
1012	NC_008340	CGGGG	2	10	1234962	1234971	0 %	0 %	80 %	20 %	114320219
1013	NC_008340	GTGTT	2	10	1242645	1242654	0 %	60 %	40 %	0 %	114320222
1014	NC_008340	GGCCG	2	10	1243279	1243288	0 %	0 %	60 %	40 %	114320222
1015	NC_008340	GCCAC	2	10	1244871	1244880	20 %	0 %	20 %	60 %	114320224
1016	NC_008340	GCGAT	2	10	1245029	1245038	20 %	20 %	40 %	20 %	114320224
1017	NC_008340	TGCCG	2	10	1247006	1247015	0 %	20 %	40 %	40 %	114320227
1018	NC_008340	GTTTT	2	10	1247552	1247561	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008340	TGCGT	2	10	1248229	1248238	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_008340	CTTTG	2	10	1248744	1248753	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_008340	GTGCG	2	10	1250100	1250109	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_008340	TACTG	2	10	1251874	1251883	20 %	40 %	20 %	20 %	114320232
1023	NC_008340	TGCCA	2	10	1254626	1254635	20 %	20 %	20 %	40 %	114320233
1024	NC_008340	GCACC	2	10	1254701	1254710	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1025	NC_008340	GGTAT	2	10	1255360	1255369	20 %	40 %	40 %	0 %	114320234
1026	NC_008340	GAACC	2	10	1255406	1255415	40 %	0 %	20 %	40 %	114320234
1027	NC_008340	TGATC	2	10	1258766	1258775	20 %	40 %	20 %	20 %	114320238
1028	NC_008340	GGCCC	2	10	1261137	1261146	0 %	0 %	40 %	60 %	114320242
1029	NC_008340	GGCGT	2	10	1261906	1261915	0 %	20 %	60 %	20 %	114320242
1030	NC_008340	GCGCG	2	10	1261925	1261934	0 %	0 %	60 %	40 %	114320242
1031	NC_008340	CGGCC	2	10	1262549	1262558	0 %	0 %	40 %	60 %	114320242
1032	NC_008340	GCCGC	2	10	1263226	1263235	0 %	0 %	40 %	60 %	114320243
1033	NC_008340	CGGCG	2	10	1265350	1265359	0 %	0 %	60 %	40 %	114320245
1034	NC_008340	AGCGA	2	10	1267995	1268004	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1035	NC_008340	CGACG	2	10	1269472	1269481	20 %	0 %	40 %	40 %	114320247
1036	NC_008340	CCGAC	2	10	1270149	1270158	20 %	0 %	20 %	60 %	114320247
1037	NC_008340	GTCCG	2	10	1272346	1272355	0 %	20 %	40 %	40 %	114320250
1038	NC_008340	TTGGT	2	10	1272627	1272636	0 %	60 %	40 %	0 %	114320250
1039	NC_008340	CGGCG	2	10	1272886	1272895	0 %	0 %	60 %	40 %	114320250
1040	NC_008340	GGGCG	2	10	1273472	1273481	0 %	0 %	80 %	20 %	114320250
1041	NC_008340	TCCCG	2	10	1273692	1273701	0 %	20 %	20 %	60 %	114320250
1042	NC_008340	GCGTA	2	10	1273952	1273961	20 %	20 %	40 %	20 %	114320250
1043	NC_008340	TGCGC	2	10	1274215	1274224	0 %	20 %	40 %	40 %	114320250
1044	NC_008340	GGCGG	2	10	1276690	1276699	0 %	0 %	80 %	20 %	114320253
1045	NC_008340	CCGGC	2	10	1277456	1277465	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1046	NC_008340	CCCGT	2	10	1277640	1277649	0 %	20 %	20 %	60 %	114320254
1047	NC_008340	GGCCA	2	10	1277881	1277890	20 %	0 %	40 %	40 %	114320254
1048	NC_008340	CCGGT	2	10	1278109	1278118	0 %	20 %	40 %	40 %	114320254
1049	NC_008340	TGGCC	2	10	1279053	1279062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1050	NC_008340	GCCGC	2	10	1286681	1286690	0 %	0 %	40 %	60 %	114320259
1051	NC_008340	TGGTG	2	10	1289669	1289678	0 %	40 %	60 %	0 %	114320262
1052	NC_008340	CCCGT	2	10	1289871	1289880	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1053	NC_008340	CGGTG	2	10	1290384	1290393	0 %	20 %	60 %	20 %	114320263
1054	NC_008340	TCCTC	2	10	1292763	1292772	0 %	40 %	0 %	60 %	114320265
1055	NC_008340	GCCGG	2	10	1293591	1293600	0 %	0 %	60 %	40 %	114320265
1056	NC_008340	CGGCC	2	10	1293609	1293618	0 %	0 %	40 %	60 %	114320265
1057	NC_008340	TGCGG	2	10	1295103	1295112	0 %	20 %	60 %	20 %	114320267
1058	NC_008340	CCCTG	2	10	1296227	1296236	0 %	20 %	20 %	60 %	114320268
1059	NC_008340	CCGGG	2	10	1300010	1300019	0 %	0 %	60 %	40 %	114320269
1060	NC_008340	CTCCC	2	10	1300965	1300974	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1061	NC_008340	CTGCC	2	10	1303715	1303724	0 %	20 %	20 %	60 %	114320273
1062	NC_008340	GGTGT	2	10	1304196	1304205	0 %	40 %	60 %	0 %	114320273
1063	NC_008340	GACGC	2	10	1304983	1304992	20 %	0 %	40 %	40 %	114320274
1064	NC_008340	GCCCG	2	10	1304997	1305006	0 %	0 %	40 %	60 %	114320274
1065	NC_008340	GTTCG	2	10	1305508	1305517	0 %	40 %	40 %	20 %	114320274
1066	NC_008340	AGGAT	2	10	1305712	1305721	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008340	CCATG	2	10	1309745	1309754	20 %	20 %	20 %	40 %	114320277
1068	NC_008340	TGACC	2	10	1310375	1310384	20 %	20 %	20 %	40 %	114320277
1069	NC_008340	CGAAA	2	10	1310561	1310570	60 %	0 %	20 %	20 %	114320277
1070	NC_008340	GGCCT	2	10	1312291	1312300	0 %	20 %	40 %	40 %	114320279
1071	NC_008340	TGCGC	2	10	1313688	1313697	0 %	20 %	40 %	40 %	114320279
1072	NC_008340	GCGCG	2	10	1314884	1314893	0 %	0 %	60 %	40 %	114320281
1073	NC_008340	TTTCG	2	10	1317028	1317037	0 %	60 %	20 %	20 %	114320282
1074	NC_008340	GTCGG	2	10	1319588	1319597	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1075	NC_008340	GATGG	2	10	1323667	1323676	20 %	20 %	60 %	0 %	114320289
1076	NC_008340	AGGGC	2	10	1325513	1325522	20 %	0 %	60 %	20 %	114320290
1077	NC_008340	CCGAT	2	10	1325681	1325690	20 %	20 %	20 %	40 %	114320290
1078	NC_008340	GCCGG	2	10	1326070	1326079	0 %	0 %	60 %	40 %	114320290
1079	NC_008340	GCGCC	2	10	1327511	1327520	0 %	0 %	40 %	60 %	114320291
1080	NC_008340	GGTGG	2	10	1328062	1328071	0 %	20 %	80 %	0 %	114320291
1081	NC_008340	GCCGG	2	10	1328851	1328860	0 %	0 %	60 %	40 %	114320292
1082	NC_008340	GATCG	2	10	1335339	1335348	20 %	20 %	40 %	20 %	114320297
1083	NC_008340	GGCCC	2	10	1338447	1338456	0 %	0 %	40 %	60 %	114320299
1084	NC_008340	GCGCG	2	10	1339859	1339868	0 %	0 %	60 %	40 %	114320300
1085	NC_008340	CCAGC	2	10	1340006	1340015	20 %	0 %	20 %	60 %	114320300
1086	NC_008340	GGCCC	2	10	1341086	1341095	0 %	0 %	40 %	60 %	114320301
1087	NC_008340	GGGCG	2	10	1342095	1342104	0 %	0 %	80 %	20 %	114320301
1088	NC_008340	GGACG	2	10	1346055	1346064	20 %	0 %	60 %	20 %	114320305
1089	NC_008340	GGGTC	2	10	1346313	1346322	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_008340	CCTGG	2	10	1346594	1346603	0 %	20 %	40 %	40 %	114320306
1091	NC_008340	CTGGC	2	10	1348180	1348189	0 %	20 %	40 %	40 %	114320307
1092	NC_008340	CCCGG	2	10	1352034	1352043	0 %	0 %	40 %	60 %	114320310
1093	NC_008340	ACCGG	2	10	1354022	1354031	20 %	0 %	40 %	40 %	114320310
1094	NC_008340	TGTGC	2	10	1354284	1354293	0 %	40 %	40 %	20 %	114320311
1095	NC_008340	TGGCC	2	10	1355743	1355752	0 %	20 %	40 %	40 %	114320312
1096	NC_008340	GGCGT	2	10	1357265	1357274	0 %	20 %	60 %	20 %	114320314
1097	NC_008340	CGGCC	2	10	1358087	1358096	0 %	0 %	40 %	60 %	114320314
1098	NC_008340	CCGGT	2	10	1358106	1358115	0 %	20 %	40 %	40 %	114320314
1099	NC_008340	GGTCA	2	10	1359769	1359778	20 %	20 %	40 %	20 %	114320316
1100	NC_008340	GGTTG	2	10	1361051	1361060	0 %	40 %	60 %	0 %	114320318
1101	NC_008340	CTCGC	2	10	1363056	1363065	0 %	20 %	20 %	60 %	114320321
1102	NC_008340	CGGCG	2	10	1363365	1363374	0 %	0 %	60 %	40 %	114320321
1103	NC_008340	GATCA	2	10	1365770	1365779	40 %	20 %	20 %	20 %	114320324
1104	NC_008340	GGCCA	2	10	1365945	1365954	20 %	0 %	40 %	40 %	114320324
1105	NC_008340	CAGGG	2	10	1366544	1366553	20 %	0 %	60 %	20 %	114320325
1106	NC_008340	TCGCT	2	10	1370125	1370134	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1107	NC_008340	TCGCT	2	10	1370217	1370226	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1108	NC_008340	TCGCT	2	10	1370585	1370594	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1109	NC_008340	CAGGG	2	10	1374644	1374653	20 %	0 %	60 %	20 %	114320332
1110	NC_008340	CGCCA	2	10	1374789	1374798	20 %	0 %	20 %	60 %	114320332
1111	NC_008340	CGGTT	2	10	1376711	1376720	0 %	40 %	40 %	20 %	114320334
1112	NC_008340	CTCCA	2	10	1378113	1378122	20 %	20 %	0 %	60 %	114320336
1113	NC_008340	GGGTG	2	10	1379390	1379399	0 %	20 %	80 %	0 %	114320337
1114	NC_008340	GCGCC	2	10	1380773	1380782	0 %	0 %	40 %	60 %	114320338
1115	NC_008340	CCAGC	2	10	1380953	1380962	20 %	0 %	20 %	60 %	114320338
1116	NC_008340	GGGCC	2	10	1382453	1382462	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1117	NC_008340	CGCGT	2	10	1382802	1382811	0 %	20 %	40 %	40 %	114320341
1118	NC_008340	TGCTC	2	10	1386569	1386578	0 %	40 %	20 %	40 %	114320343
1119	NC_008340	CACCC	2	10	1389065	1389074	20 %	0 %	0 %	80 %	114320344
1120	NC_008340	CCGCG	2	10	1389298	1389307	0 %	0 %	40 %	60 %	114320344
1121	NC_008340	GGCCC	2	10	1390237	1390246	0 %	0 %	40 %	60 %	114320345
1122	NC_008340	CGGGC	2	10	1393648	1393657	0 %	0 %	60 %	40 %	114320348
1123	NC_008340	GGCCT	2	10	1394047	1394056	0 %	20 %	40 %	40 %	114320349
1124	NC_008340	GCCGT	2	10	1394431	1394440	0 %	20 %	40 %	40 %	114320349
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1126	NC_008340	GCTGG	2	10	1394842	1394851	0 %	20 %	60 %	20 %	114320350
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1225	NC_008340	GTGCG	2	10	1499763	1499772	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1264	NC_008340	CCGGT	2	10	1554624	1554633	0 %	20 %	40 %	40 %	114320514
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