MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 3067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020833	TGG	2	6	298188	298193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020833	TCC	2	6	298214	298219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_020833	GGA	2	6	298231	298236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020833	GGT	2	6	298351	298356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020833	CGG	2	6	298438	298443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_020833	TCA	2	6	298466	298471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_020833	CGT	2	6	298546	298551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020833	GCT	2	6	298600	298605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_020833	GTT	2	6	298764	298769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020833	ACG	2	6	298777	298782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_020833	GAA	3	9	298894	298902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020833	AGA	2	6	298912	298917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020833	CGA	2	6	299019	299024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020833	GTG	2	6	299095	299100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020833	TCG	2	6	299124	299129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_020833	GCC	2	6	299238	299243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_020833	GTT	2	6	299267	299272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020833	GTT	2	6	299351	299356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020833	ATT	2	6	302810	302815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020833	TGA	2	6	305565	305570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020833	CTA	2	6	305603	305608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_020833	GTT	2	6	305616	305621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020833	TGG	2	6	305657	305662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020833	GCT	2	6	305705	305710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020833	TGG	2	6	305754	305759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020833	GCT	2	6	305802	305807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_020833	TGG	2	6	305852	305857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020833	GCT	2	6	305900	305905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_020833	TAT	2	6	306124	306129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020833	TCT	2	6	308582	308587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020833	ACC	2	6	312361	312366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_020833	GTT	2	6	312586	312591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020833	CCA	2	6	312676	312681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_020833	AAT	2	6	312800	312805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020833	TAG	2	6	312897	312902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020833	GGT	2	6	314464	314469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020833	ATA	3	9	314485	314493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020833	TTA	2	6	314672	314677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020833	CCA	2	6	314779	314784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_020833	AGC	2	6	314800	314805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020833	TGA	2	6	314877	314882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020833	TTA	2	6	314995	315000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020833	TGT	2	6	315013	315018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020833	AAC	2	6	315044	315049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_020833	GAT	2	6	317162	317167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020833	TTA	2	6	317168	317173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020833	ATT	2	6	317246	317251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020833	TCA	2	6	317282	317287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_020833	TCA	2	6	319961	319966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_020833	AAT	2	6	320998	321003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020833	ACA	2	6	321038	321043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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553	NC_020833	ACC	2	6	321128	321133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_020833	GGT	2	6	321151	321156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020833	TGC	2	6	322124	322129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_020833	GTG	2	6	322143	322148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020833	TAA	2	6	322996	323001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020833	TGA	2	6	323035	323040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020833	TAT	2	6	324201	324206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020833	ATT	2	6	324219	324224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020833	ATG	2	6	325842	325847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020833	AAT	2	6	325871	325876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020833	ATT	2	6	327891	327896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020833	AAC	2	6	331367	331372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_020833	ATT	2	6	334017	334022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020833	TTG	2	6	334066	334071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020833	TAA	2	6	334615	334620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020833	ATA	2	6	336416	336421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020833	GAT	2	6	336573	336578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_020833	ATA	2	6	336660	336665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020833	GGT	2	6	338451	338456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020833	TAA	3	9	340424	340432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020833	TAT	2	6	341030	341035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020833	TTA	2	6	341123	341128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_020833	TAT	2	6	342446	342451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020833	ATA	2	6	342456	342461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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582	NC_020833	TAT	2	6	342516	342521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_020833	ATT	2	6	342590	342595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_020833	TGG	2	6	342896	342901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_020833	ATT	2	6	343046	343051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020833	TAC	2	6	343064	343069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020833	ATT	2	6	343162	343167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020833	TCT	2	6	346635	346640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_020833	GTT	2	6	346694	346699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020833	TGG	2	6	346708	346713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_020833	AAT	2	6	369362	369367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_020833	CTT	2	6	385178	385183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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