MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 3067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020833	TCT	2	6	2149001	2149006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_020833	TAA	2	6	2150971	2150976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_020833	GTT	2	6	2152357	2152362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_020833	TAA	2	6	2154505	2154510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020833	TAA	2	6	2154559	2154564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020833	ATC	2	6	2156145	2156150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_020833	TTC	2	6	2159855	2159860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_020833	AGA	2	6	2159865	2159870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_020833	AAT	2	6	2163878	2163883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_020833	TAA	2	6	2163916	2163921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_020833	AGT	2	6	2164031	2164036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_020833	ATA	2	6	2164167	2164172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_020833	ACA	2	6	2164187	2164192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_020833	TTC	2	6	2166163	2166168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_020833	GTT	2	6	2168719	2168724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_020833	ACG	2	6	2170890	2170895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_020833	ACC	2	6	2170905	2170910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_020833	GTA	2	6	2173937	2173942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_020833	AAT	2	6	2174054	2174059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_020833	GAA	2	6	2176251	2176256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020833	TAA	2	6	2176887	2176892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_020833	ACA	2	6	2179824	2179829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_020833	GAA	3	9	2179880	2179888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_020833	ATA	2	6	2179927	2179932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_020833	TTA	2	6	2181832	2181837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020833	CAT	2	6	2182006	2182011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2528	NC_020833	CAA	2	6	2183736	2183741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_020833	GTT	2	6	2185460	2185465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_020833	ATA	2	6	2185467	2185472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_020833	GTG	2	6	2186366	2186371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_020833	TTG	2	6	2186479	2186484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2534	NC_020833	TTG	2	6	2186686	2186691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_020833	GCA	2	6	2186787	2186792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2539	NC_020833	GCC	2	6	2187249	2187254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_020833	ATA	2	6	2189273	2189278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_020833	AGG	2	6	2189934	2189939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_020833	TTG	2	6	2193509	2193514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_020833	TTA	2	6	2197388	2197393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2547	NC_020833	TAA	2	6	2197960	2197965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_020833	TAT	2	6	2197970	2197975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_020833	AAT	2	6	2197998	2198003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_020833	AAT	2	6	2198620	2198625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020833	GCT	2	6	2201709	2201714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_020833	ATT	3	9	2203450	2203458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020833	GAA	2	6	2203533	2203538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020833	ATT	2	6	2203590	2203595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020833	AAT	2	6	2203599	2203604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020833	ATT	2	6	2203614	2203619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020833	GGA	2	6	2205225	2205230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020833	CCT	2	6	2206909	2206914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_020833	AGC	2	6	2207969	2207974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2561	NC_020833	AAC	2	6	2208044	2208049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_020833	ATT	2	6	2208118	2208123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020833	ATC	2	6	2208207	2208212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_020833	GGC	2	6	2211385	2211390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2567	NC_020833	TTA	2	6	2218316	2218321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2572	NC_020833	GTC	2	6	2218707	2218712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_020833	TCT	2	6	2218815	2218820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2593	NC_020833	TTA	2	6	2220363	2220368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2597	NC_020833	GGA	2	6	2221353	2221358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020833	TTG	2	6	2221403	2221408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_020833	CTA	2	6	2221531	2221536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2602	NC_020833	CTT	2	6	2221722	2221727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_020833	AGA	2	6	2221992	2221997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_020833	ATC	2	6	2222006	2222011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_020833	CCG	2	6	2222050	2222055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_020833	ACA	2	6	2222092	2222097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_020833	TCT	2	6	2222200	2222205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2609	NC_020833	CGC	2	6	2222543	2222548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_020833	ATG	2	6	2222598	2222603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_020833	TCC	2	6	2222624	2222629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2612	NC_020833	CAA	2	6	2222676	2222681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_020833	GAC	2	6	2222737	2222742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_020833	GCA	2	6	2222749	2222754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_020833	TTC	2	6	2222825	2222830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2618	NC_020833	GCT	2	6	2223276	2223281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2622	NC_020833	AGT	2	6	2223644	2223649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_020833	GCC	2	6	2223758	2223763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_020833	CTG	2	6	2223822	2223827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_020833	ACG	2	6	2224000	2224005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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