MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 3067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020833	TAA	2	6	1217276	1217281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020833	TAT	3	9	1218044	1218052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020833	CTA	2	6	1218060	1218065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_020833	ATC	2	6	1218084	1218089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_020833	CAA	2	6	1220065	1220070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_020833	CAA	2	6	1221206	1221211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_020833	GCT	2	6	1225805	1225810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_020833	TAT	2	6	1228157	1228162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020833	AAT	2	6	1229129	1229134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020833	TGA	2	6	1229155	1229160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020833	ATC	2	6	1229250	1229255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_020833	AGC	2	6	1229257	1229262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_020833	TTA	2	6	1229545	1229550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020833	AAT	2	6	1232289	1232294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020833	GTT	2	6	1232824	1232829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020833	ATT	2	6	1235405	1235410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020833	TGA	2	6	1237548	1237553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020833	CAC	2	6	1238509	1238514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_020833	TGG	2	6	1238522	1238527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020833	ATT	2	6	1238560	1238565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020833	CAT	2	6	1238675	1238680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_020833	TAA	2	6	1239861	1239866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020833	GAA	2	6	1239922	1239927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020833	TCT	2	6	1239963	1239968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_020833	CAA	2	6	1240037	1240042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_020833	TTA	2	6	1240312	1240317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020833	TTA	2	6	1240458	1240463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020833	CAA	2	6	1240485	1240490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_020833	CCG	2	6	1244768	1244773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_020833	CAC	2	6	1245202	1245207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_020833	GTA	2	6	1245433	1245438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020833	TCG	2	6	1245453	1245458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_020833	CAA	2	6	1246642	1246647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_020833	TTA	2	6	1246932	1246937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020833	TAA	2	6	1246971	1246976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020833	TCA	2	6	1247043	1247048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_020833	ATT	2	6	1248717	1248722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020833	GAA	2	6	1248749	1248754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_020833	TAC	2	6	1248762	1248767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_020833	AAC	2	6	1249930	1249935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_020833	GCC	2	6	1249972	1249977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_020833	GAA	2	6	1251982	1251987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020833	CCA	2	6	1251988	1251993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_020833	TCA	2	6	1252241	1252246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_020833	TCA	2	6	1252295	1252300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_020833	ATT	2	6	1252642	1252647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020833	CAC	2	6	1254659	1254664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_020833	AAC	2	6	1254668	1254673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020833	GCT	2	6	1254675	1254680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_020833	GTA	2	6	1263417	1263422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020833	TCA	2	6	1263762	1263767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_020833	GTC	2	6	1264925	1264930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_020833	TTA	2	6	1264932	1264937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020833	TGT	2	6	1264968	1264973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020833	GAT	2	6	1265002	1265007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020833	CGG	2	6	1269760	1269765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_020833	TAT	2	6	1272800	1272805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020833	ACA	2	6	1272812	1272817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_020833	CAC	2	6	1272866	1272871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_020833	ATT	2	6	1273116	1273121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020833	ATT	2	6	1273141	1273146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020833	AAT	2	6	1273198	1273203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020833	ATC	2	6	1273208	1273213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_020833	TAA	2	6	1273235	1273240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020833	CAT	2	6	1273244	1273249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_020833	TTA	2	6	1273271	1273276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020833	TAA	2	6	1273292	1273297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020833	GCA	2	6	1273415	1273420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_020833	TAC	2	6	1274527	1274532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_020833	TAA	2	6	1275105	1275110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020833	ATT	2	6	1275121	1275126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020833	AAT	2	6	1275153	1275158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020833	CTA	2	6	1282373	1282378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_020833	ATT	2	6	1282462	1282467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020833	TTA	2	6	1282472	1282477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020833	TCT	2	6	1282498	1282503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_020833	AAT	2	6	1285200	1285205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020833	TAA	2	6	1290459	1290464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020833	GTT	2	6	1290487	1290492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020833	AAT	2	6	1290493	1290498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020833	ATT	2	6	1290511	1290516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020833	CTT	2	6	1290531	1290536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_020833	ACA	2	6	1290544	1290549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_020833	TCT	2	6	1290555	1290560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_020833	AAT	2	6	1293840	1293845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1587	NC_020833	TAA	2	6	1293925	1293930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020833	TAA	2	6	1298159	1298164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020833	GAA	2	6	1301809	1301814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020833	TGT	2	6	1301834	1301839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020833	AAT	2	6	1301945	1301950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020833	TAA	2	6	1302036	1302041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020833	TAA	2	6	1302049	1302054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_020833	TTA	2	6	1302056	1302061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020833	CTG	2	6	1303887	1303892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_020833	ACC	2	6	1303902	1303907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_020833	CGG	2	6	1303954	1303959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_020833	TTA	2	6	1304172	1304177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020833	CAG	2	6	1304584	1304589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_020833	CAA	2	6	1309568	1309573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_020833	ATC	2	6	1309597	1309602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_020833	ACA	2	6	1309628	1309633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_020833	TTA	2	6	1312554	1312559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020833	CCT	2	6	1312747	1312752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_020833	TTG	2	6	1313117	1313122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_020833	ATA	2	6	1313183	1313188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020833	TTG	2	6	1314042	1314047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020833	AGT	2	6	1314050	1314055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020833	GTT	2	6	1316226	1316231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020833	ATA	2	6	1317128	1317133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020833	CAA	2	6	1317188	1317193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_020833	TGT	2	6	1317197	1317202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020833	CAA	2	6	1317208	1317213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_020833	TGT	2	6	1317217	1317222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020833	ATT	2	6	1317223	1317228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020833	AGG	2	6	1317246	1317251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1619	NC_020833	AAC	2	6	1318173	1318178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_020833	AAC	2	6	1318183	1318188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_020833	AGA	2	6	1318917	1318922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020833	TCT	2	6	1320076	1320081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_020833	AGT	2	6	1324345	1324350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_020833	ATA	2	6	1324375	1324380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020833	AGG	2	6	1324424	1324429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_020833	TCA	2	6	1324492	1324497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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