MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 3067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020833	GGT	2	6	775414	775419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020833	CGG	2	6	775501	775506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_020833	TCA	2	6	775529	775534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_020833	CGT	2	6	775609	775614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020833	GCT	2	6	775663	775668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_020833	GTT	2	6	775827	775832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020833	ACG	2	6	775840	775845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_020833	GAA	3	9	775957	775965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020833	AGA	2	6	775975	775980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020833	CGA	2	6	776082	776087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_020833	GTG	2	6	776158	776163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020833	TCG	2	6	776187	776192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_020833	GCC	2	6	776301	776306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_020833	GTT	2	6	776330	776335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020833	AGA	2	6	780426	780431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020833	TCT	2	6	781629	781634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_020833	GAT	2	6	781638	781643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020833	GAG	2	6	782871	782876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020833	GTA	2	6	782916	782921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020833	GTA	2	6	783577	783582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020833	CTA	2	6	783599	783604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_020833	ACT	2	6	783636	783641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020833	TGG	2	6	783646	783651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020833	AAT	2	6	783653	783658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020833	TTG	2	6	783664	783669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020833	ATA	2	6	785199	785204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020833	ATT	2	6	786575	786580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020833	GTT	2	6	790389	790394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020833	AAG	2	6	790415	790420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020833	TGC	2	6	790439	790444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_020833	GTA	2	6	791214	791219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020833	TCA	2	6	791316	791321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_020833	CAT	2	6	793043	793048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_020833	TAA	2	6	797152	797157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020833	AAC	2	6	797178	797183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_020833	ATT	2	6	797225	797230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020833	TGA	2	6	802001	802006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020833	ATA	2	6	802007	802012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020833	ATG	2	6	802051	802056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020833	TAA	2	6	804320	804325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020833	TTC	2	6	805126	805131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_020833	GAC	2	6	806036	806041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020833	ATA	2	6	806058	806063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020833	AAT	2	6	809178	809183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020833	AAG	2	6	809246	809251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1047	NC_020833	TTA	2	6	812346	812351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_020833	TAT	2	6	812389	812394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020833	TAG	2	6	812396	812401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1053	NC_020833	GCT	2	6	817387	817392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1055	NC_020833	CTA	2	6	817426	817431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_020833	GCT	2	6	817442	817447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_020833	GCT	2	6	822876	822881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1059	NC_020833	TAA	2	6	825330	825335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020833	TAG	2	6	825380	825385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_020833	ATC	2	6	827035	827040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_020833	ATT	2	6	827079	827084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020833	AAT	2	6	827088	827093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020833	AAT	2	6	827205	827210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020833	TAT	2	6	828086	828091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1069	NC_020833	AAT	2	6	830502	830507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020833	ATT	2	6	830545	830550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_020833	TTG	2	6	874771	874776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020833	ATT	2	6	874871	874876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1104	NC_020833	ATA	2	6	875666	875671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020833	TAA	2	6	880144	880149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_020833	TTG	2	6	881519	881524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020833	AGT	2	6	881527	881532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020833	TGC	2	6	882294	882299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1122	NC_020833	ATT	2	6	889359	889364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020833	TCA	2	6	891159	891164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1125	NC_020833	TTG	2	6	891248	891253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_020833	CAA	2	6	891608	891613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_020833	AGC	2	6	891629	891634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_020833	GGT	2	6	894224	894229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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