MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 1691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020833	AAGGT	2	10	964	973	40 %	20 %	40 %	0 %	472332509
2	NC_020833	CCTTG	2	10	1675	1684	0 %	40 %	20 %	40 %	472332509
3	NC_020833	CTCCG	2	10	1745	1754	0 %	20 %	20 %	60 %	472332509
4	NC_020833	ACGGA	2	10	1932	1941	40 %	0 %	40 %	20 %	472332509
5	NC_020833	TAATT	2	10	3921	3930	40 %	60 %	0 %	0 %	472332511
6	NC_020833	CTTTT	2	10	5406	5415	0 %	80 %	0 %	20 %	472332514
7	NC_020833	TGGGC	2	10	7263	7272	0 %	20 %	60 %	20 %	472332516
8	NC_020833	CGTGC	2	10	7952	7961	0 %	20 %	40 %	40 %	472332517
9	NC_020833	TCAAC	2	10	9007	9016	40 %	20 %	0 %	40 %	472332519
10	NC_020833	GAGCC	2	10	9912	9921	20 %	0 %	40 %	40 %	472332522
11	NC_020833	CAAAT	2	10	13081	13090	60 %	20 %	0 %	20 %	472332524
12	NC_020833	TTTTA	2	10	16933	16942	20 %	80 %	0 %	0 %	472332530
13	NC_020833	AAAAC	2	10	18003	18012	80 %	0 %	0 %	20 %	472332531
14	NC_020833	TACCA	2	10	20275	20284	40 %	20 %	0 %	40 %	472332534
15	NC_020833	AGTTT	2	10	21159	21168	20 %	60 %	20 %	0 %	472332535
16	NC_020833	TAAAA	2	10	24124	24133	80 %	20 %	0 %	0 %	472332539
17	NC_020833	CTAAA	2	10	30091	30100	60 %	20 %	0 %	20 %	472332543
18	NC_020833	CAACC	2	10	31556	31565	40 %	0 %	0 %	60 %	472332544
19	NC_020833	CATTT	2	10	33609	33618	20 %	60 %	0 %	20 %	472332547
20	NC_020833	AAATT	2	10	34535	34544	60 %	40 %	0 %	0 %	472332548
21	NC_020833	TTTAA	2	10	35429	35438	40 %	60 %	0 %	0 %	472332549
22	NC_020833	GCAGG	2	10	37383	37392	20 %	0 %	60 %	20 %	472332550
23	NC_020833	ATCAA	2	10	38228	38237	60 %	20 %	0 %	20 %	472332551
24	NC_020833	TTGTG	2	10	38490	38499	0 %	60 %	40 %	0 %	472332551
25	NC_020833	ACTTA	2	10	40189	40198	40 %	40 %	0 %	20 %	472332552
26	NC_020833	GGACA	2	10	41848	41857	40 %	0 %	40 %	20 %	472332554
27	NC_020833	CATTA	2	10	43556	43565	40 %	40 %	0 %	20 %	472332556
28	NC_020833	CTTGG	2	10	45140	45149	0 %	40 %	40 %	20 %	472332558
29	NC_020833	GGCCT	2	10	46458	46467	0 %	20 %	40 %	40 %	472332559
30	NC_020833	CATTT	2	10	50479	50488	20 %	60 %	0 %	20 %	472332562
31	NC_020833	ATATT	2	10	53705	53714	40 %	60 %	0 %	0 %	472332565
32	NC_020833	GAAAG	2	10	54209	54218	60 %	0 %	40 %	0 %	472332565
33	NC_020833	ATCAT	2	10	55019	55028	40 %	40 %	0 %	20 %	472332566
34	NC_020833	ACGCA	2	10	55129	55138	40 %	0 %	20 %	40 %	472332566
35	NC_020833	CGAGG	2	10	57067	57076	20 %	0 %	60 %	20 %	472332568
36	NC_020833	CATCG	2	10	57485	57494	20 %	20 %	20 %	40 %	472332568
37	NC_020833	ACGCT	2	10	58172	58181	20 %	20 %	20 %	40 %	472332569
38	NC_020833	ACGAA	2	10	59759	59768	60 %	0 %	20 %	20 %	472332571
39	NC_020833	ATTTT	2	10	61302	61311	20 %	80 %	0 %	0 %	472332573
40	NC_020833	TCTTG	2	10	61398	61407	0 %	60 %	20 %	20 %	472332573
41	NC_020833	CTGAA	2	10	61697	61706	40 %	20 %	20 %	20 %	472332573
42	NC_020833	GTAAT	2	10	62445	62454	40 %	40 %	20 %	0 %	472332574
43	NC_020833	AAATA	2	10	66167	66176	80 %	20 %	0 %	0 %	472332577
44	NC_020833	TACAC	2	10	66828	66837	40 %	20 %	0 %	40 %	472332578
45	NC_020833	ATTGG	2	10	67357	67366	20 %	40 %	40 %	0 %	472332578
46	NC_020833	GTCAA	2	10	67786	67795	40 %	20 %	20 %	20 %	472332578
47	NC_020833	TTTGA	2	10	68610	68619	20 %	60 %	20 %	0 %	472332579
48	NC_020833	TCTGT	2	10	69191	69200	0 %	60 %	20 %	20 %	472332579
49	NC_020833	GAAAC	2	10	72926	72935	60 %	0 %	20 %	20 %	472332581
50	NC_020833	AAATT	2	10	77111	77120	60 %	40 %	0 %	0 %	472332584
51	NC_020833	TTGAT	2	10	77613	77622	20 %	60 %	20 %	0 %	472332585
52	NC_020833	GCCTT	2	10	79250	79259	0 %	40 %	20 %	40 %	472332587
53	NC_020833	GATTG	2	10	82990	82999	20 %	40 %	40 %	0 %	472332590
54	NC_020833	CCACA	2	10	83957	83966	40 %	0 %	0 %	60 %	472332592
55	NC_020833	TCAAA	2	10	84671	84680	60 %	20 %	0 %	20 %	472332592
56	NC_020833	GAACA	2	10	86265	86274	60 %	0 %	20 %	20 %	472332593
57	NC_020833	TTAAT	2	10	86760	86769	40 %	60 %	0 %	0 %	472332594
58	NC_020833	GGTTA	2	10	87447	87456	20 %	40 %	40 %	0 %	472332595
59	NC_020833	AAACA	2	10	91051	91060	80 %	0 %	0 %	20 %	472332599
60	NC_020833	GCTTG	2	10	98437	98446	0 %	40 %	40 %	20 %	472332601
61	NC_020833	CTTGA	2	10	98554	98563	20 %	40 %	20 %	20 %	472332601
62	NC_020833	CCACC	2	10	99167	99176	20 %	0 %	0 %	80 %	472332601
63	NC_020833	TTTGG	2	10	99534	99543	0 %	60 %	40 %	0 %	472332602
64	NC_020833	TTGGG	2	10	101835	101844	0 %	40 %	60 %	0 %	472332604
65	NC_020833	TTTCG	2	10	102107	102116	0 %	60 %	20 %	20 %	472332604
66	NC_020833	CGGAG	2	10	103034	103043	20 %	0 %	60 %	20 %	472332606
67	NC_020833	ACGCA	2	10	106235	106244	40 %	0 %	20 %	40 %	472332610
68	NC_020833	ACCAA	2	10	107901	107910	60 %	0 %	0 %	40 %	472332610
69	NC_020833	TGTTT	2	10	109278	109287	0 %	80 %	20 %	0 %	472332611
70	NC_020833	TAATT	2	10	110288	110297	40 %	60 %	0 %	0 %	472332612
71	NC_020833	TAAAT	2	10	111957	111966	60 %	40 %	0 %	0 %	472332614
72	NC_020833	CATAC	2	10	114742	114751	40 %	20 %	0 %	40 %	472332617
73	NC_020833	GGCAA	2	10	120034	120043	40 %	0 %	40 %	20 %	472332623
74	NC_020833	GGTGT	2	10	122830	122839	0 %	40 %	60 %	0 %	472332625
75	NC_020833	ATTTT	2	10	123056	123065	20 %	80 %	0 %	0 %	472332625
76	NC_020833	AATGA	2	10	124608	124617	60 %	20 %	20 %	0 %	472332627
77	NC_020833	GATTG	2	10	125307	125316	20 %	40 %	40 %	0 %	472332627
78	NC_020833	TTGCG	2	10	126441	126450	0 %	40 %	40 %	20 %	472332629
79	NC_020833	AAGTA	2	10	129597	129606	60 %	20 %	20 %	0 %	472332633
80	NC_020833	AAGTT	2	10	131203	131212	40 %	40 %	20 %	0 %	472332635
81	NC_020833	ACACC	2	10	132485	132494	40 %	0 %	0 %	60 %	472332636
82	NC_020833	CCATT	2	10	132966	132975	20 %	40 %	0 %	40 %	472332637
83	NC_020833	CCAAT	2	10	134430	134439	40 %	20 %	0 %	40 %	472332638
84	NC_020833	TTCAG	2	10	134845	134854	20 %	40 %	20 %	20 %	472332638
85	NC_020833	TCTCA	2	10	135642	135651	20 %	40 %	0 %	40 %	472332639
86	NC_020833	TGCAT	2	10	136565	136574	20 %	40 %	20 %	20 %	472332640
87	NC_020833	TGGAA	2	10	137093	137102	40 %	20 %	40 %	0 %	472332640
88	NC_020833	CGGTG	2	10	139453	139462	0 %	20 %	60 %	20 %	472332644
89	NC_020833	TTGGC	2	10	140220	140229	0 %	40 %	40 %	20 %	472332644
90	NC_020833	AAGCC	2	10	141693	141702	40 %	0 %	20 %	40 %	472332646
91	NC_020833	CCCCA	2	10	144522	144531	20 %	0 %	0 %	80 %	472332651
92	NC_020833	GTGAA	2	10	147096	147105	40 %	20 %	40 %	0 %	472332653
93	NC_020833	GCTAC	2	10	148618	148627	20 %	20 %	20 %	40 %	472332654
94	NC_020833	TTATG	2	10	149042	149051	20 %	60 %	20 %	0 %	472332654
95	NC_020833	TAACA	2	10	156819	156828	60 %	20 %	0 %	20 %	472332657
96	NC_020833	ACCGT	2	10	157816	157825	20 %	20 %	20 %	40 %	472332658
97	NC_020833	GCAAA	2	10	160512	160521	60 %	0 %	20 %	20 %	472332660
98	NC_020833	TTGGG	2	10	161434	161443	0 %	40 %	60 %	0 %	472332661
99	NC_020833	TTTAC	2	10	161444	161453	20 %	60 %	0 %	20 %	472332661
100	NC_020833	GAATG	2	10	162779	162788	40 %	20 %	40 %	0 %	472332662
101	NC_020833	ATAAA	2	10	165548	165557	80 %	20 %	0 %	0 %	472332667
102	NC_020833	TAATT	2	10	166376	166385	40 %	60 %	0 %	0 %	472332667
103	NC_020833	ACGCA	2	10	167307	167316	40 %	0 %	20 %	40 %	472332670
104	NC_020833	GTACA	2	10	168385	168394	40 %	20 %	20 %	20 %	472332673
105	NC_020833	TTGCT	2	10	168815	168824	0 %	60 %	20 %	20 %	472332674
106	NC_020833	TAAAT	2	10	169624	169633	60 %	40 %	0 %	0 %	472332674
107	NC_020833	TGGAG	2	10	172254	172263	20 %	20 %	60 %	0 %	472332677
108	NC_020833	ACCGA	2	10	173315	173324	40 %	0 %	20 %	40 %	472332678
109	NC_020833	GCGGT	2	10	179458	179467	0 %	20 %	60 %	20 %	472332686
110	NC_020833	ATCGC	2	10	180020	180029	20 %	20 %	20 %	40 %	472332686
111	NC_020833	CGATG	2	10	185514	185523	20 %	20 %	40 %	20 %	472332691
112	NC_020833	GTTAA	2	10	186983	186992	40 %	40 %	20 %	0 %	472332692
113	NC_020833	GCCGA	2	10	190277	190286	20 %	0 %	40 %	40 %	472332694
114	NC_020833	CTTTT	2	10	191642	191651	0 %	80 %	0 %	20 %	472332695
115	NC_020833	AACCG	2	10	193102	193111	40 %	0 %	20 %	40 %	472332696
116	NC_020833	AAACC	2	10	193674	193683	60 %	0 %	0 %	40 %	472332697
117	NC_020833	ACCAA	2	10	193861	193870	60 %	0 %	0 %	40 %	472332697
118	NC_020833	CAATC	2	10	196810	196819	40 %	20 %	0 %	40 %	472332700
119	NC_020833	AATTT	2	10	197368	197377	40 %	60 %	0 %	0 %	472332701
120	NC_020833	GCTTG	2	10	197841	197850	0 %	40 %	40 %	20 %	472332701
121	NC_020833	AGGCA	2	10	198311	198320	40 %	0 %	40 %	20 %	472332701
122	NC_020833	TTGGA	2	10	198633	198642	20 %	40 %	40 %	0 %	472332701
123	NC_020833	GGAGC	2	10	199426	199435	20 %	0 %	60 %	20 %	472332701
124	NC_020833	GAAAA	2	10	199915	199924	80 %	0 %	20 %	0 %	472332701
125	NC_020833	GAACT	2	10	202285	202294	40 %	20 %	20 %	20 %	472332704
126	NC_020833	TGGGC	2	10	206853	206862	0 %	20 %	60 %	20 %	472332709
127	NC_020833	CGAAC	2	10	210971	210980	40 %	0 %	20 %	40 %	472332714
128	NC_020833	TTCTC	2	10	214032	214041	0 %	60 %	0 %	40 %	472332720
129	NC_020833	CCTCA	2	10	214395	214404	20 %	20 %	0 %	60 %	472332720
130	NC_020833	CGGTG	2	10	214611	214620	0 %	20 %	60 %	20 %	472332720
131	NC_020833	GCGTG	2	10	217790	217799	0 %	20 %	60 %	20 %	472332724
132	NC_020833	CACGC	2	10	218136	218145	20 %	0 %	20 %	60 %	472332724
133	NC_020833	ACGGC	2	10	218387	218396	20 %	0 %	40 %	40 %	472332724
134	NC_020833	GCAAA	2	10	224423	224432	60 %	0 %	20 %	20 %	472332734
135	NC_020833	TGATT	2	10	224792	224801	20 %	60 %	20 %	0 %	472332734
136	NC_020833	AGGGC	2	10	225025	225034	20 %	0 %	60 %	20 %	472332735
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139	NC_020833	ATTCA	2	10	228966	228975	40 %	40 %	0 %	20 %	472332738
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142	NC_020833	CGGTA	2	10	235880	235889	20 %	20 %	40 %	20 %	472332749
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144	NC_020833	TTGGT	2	10	236944	236953	0 %	60 %	40 %	0 %	472332749
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148	NC_020833	TACCG	2	10	241447	241456	20 %	20 %	20 %	40 %	472332750
149	NC_020833	ATTAA	2	10	242710	242719	60 %	40 %	0 %	0 %	472332750
150	NC_020833	GGTGC	2	10	242836	242845	0 %	20 %	60 %	20 %	472332750
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152	NC_020833	TCTTA	2	10	244635	244644	20 %	60 %	0 %	20 %	472332751
153	NC_020833	TAAAA	2	10	244660	244669	80 %	20 %	0 %	0 %	472332751
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156	NC_020833	AATTG	2	10	250145	250154	40 %	40 %	20 %	0 %	472332755
157	NC_020833	GCACG	2	10	250273	250282	20 %	0 %	40 %	40 %	472332755
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164	NC_020833	TTGGT	2	10	269761	269770	0 %	60 %	40 %	0 %	472332768
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248	NC_020833	ATTTT	2	10	426792	426801	20 %	80 %	0 %	0 %	472332930
249	NC_020833	TCTGG	2	10	428116	428125	0 %	40 %	40 %	20 %	472332932
250	NC_020833	TCGTA	2	10	428981	428990	20 %	40 %	20 %	20 %	472332932
251	NC_020833	ACTTC	2	10	433290	433299	20 %	40 %	0 %	40 %	472332935
252	NC_020833	TTTGG	2	10	434831	434840	0 %	60 %	40 %	0 %	472332937
253	NC_020833	AAGCA	2	10	437733	437742	60 %	0 %	20 %	20 %	472332940
254	NC_020833	ATAGC	2	10	438983	438992	40 %	20 %	20 %	20 %	472332944
255	NC_020833	GCCGA	2	10	442608	442617	20 %	0 %	40 %	40 %	472332950
256	NC_020833	GGCAG	2	10	445442	445451	20 %	0 %	60 %	20 %	472332956
257	NC_020833	TTCTG	2	10	446463	446472	0 %	60 %	20 %	20 %	472332957
258	NC_020833	TTTAC	2	10	447573	447582	20 %	60 %	0 %	20 %	472332957
259	NC_020833	TTTTG	2	10	448359	448368	0 %	80 %	20 %	0 %	472332958
260	NC_020833	GCTGA	2	10	451900	451909	20 %	20 %	40 %	20 %	472332963
261	NC_020833	CCTGC	2	10	452585	452594	0 %	20 %	20 %	60 %	472332964
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263	NC_020833	AACTG	2	10	452925	452934	40 %	20 %	20 %	20 %	472332964
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391	NC_020833	GATGC	2	10	646036	646045	20 %	20 %	40 %	20 %	472333164
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