MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 1691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020833	ATCTT	2	10	1602271	1602280	20 %	60 %	0 %	20 %	472334163
1002	NC_020833	CAAAA	2	10	1602806	1602815	80 %	0 %	0 %	20 %	472334163
1003	NC_020833	ATTGT	2	10	1608231	1608240	20 %	60 %	20 %	0 %	472334169
1004	NC_020833	ACCAT	2	10	1610241	1610250	40 %	20 %	0 %	40 %	472334172
1005	NC_020833	CAATC	2	10	1610682	1610691	40 %	20 %	0 %	40 %	472334173
1006	NC_020833	CAGTA	2	10	1612181	1612190	40 %	20 %	20 %	20 %	472334175
1007	NC_020833	AATTG	2	10	1612595	1612604	40 %	40 %	20 %	0 %	472334176
1008	NC_020833	TTGAT	2	10	1614353	1614362	20 %	60 %	20 %	0 %	472334178
1009	NC_020833	ATCTG	2	10	1615957	1615966	20 %	40 %	20 %	20 %	472334179
1010	NC_020833	TGTTT	2	10	1616873	1616882	0 %	80 %	20 %	0 %	472334180
1011	NC_020833	TCAAG	2	10	1617262	1617271	40 %	20 %	20 %	20 %	472334180
1012	NC_020833	AGTTG	2	10	1619459	1619468	20 %	40 %	40 %	0 %	472334181
1013	NC_020833	ATTAA	2	10	1621026	1621035	60 %	40 %	0 %	0 %	472334182
1014	NC_020833	ATTTA	2	10	1621990	1621999	40 %	60 %	0 %	0 %	472334184
1015	NC_020833	AAAAT	2	10	1623200	1623209	80 %	20 %	0 %	0 %	472334185
1016	NC_020833	TTTGT	2	10	1626031	1626040	0 %	80 %	20 %	0 %	472334188
1017	NC_020833	TCTTA	2	10	1629264	1629273	20 %	60 %	0 %	20 %	472334193
1018	NC_020833	CTTTT	2	10	1632636	1632645	0 %	80 %	0 %	20 %	472334196
1019	NC_020833	AGCCA	2	10	1632959	1632968	40 %	0 %	20 %	40 %	472334196
1020	NC_020833	CAAAA	2	10	1634464	1634473	80 %	0 %	0 %	20 %	472334198
1021	NC_020833	CCACA	2	10	1636241	1636250	40 %	0 %	0 %	60 %	472334200
1022	NC_020833	CAAGC	2	10	1636294	1636303	40 %	0 %	20 %	40 %	472334200
1023	NC_020833	AAATA	2	10	1636307	1636316	80 %	20 %	0 %	0 %	472334200
1024	NC_020833	TAAAA	2	10	1640468	1640477	80 %	20 %	0 %	0 %	472334204
1025	NC_020833	GCAAT	2	10	1641079	1641088	40 %	20 %	20 %	20 %	472334205
1026	NC_020833	TAAAA	2	10	1641943	1641952	80 %	20 %	0 %	0 %	472334206
1027	NC_020833	TTCGT	2	10	1642081	1642090	0 %	60 %	20 %	20 %	472334207
1028	NC_020833	GGAGT	2	10	1646718	1646727	20 %	20 %	60 %	0 %	472334213
1029	NC_020833	CCAAC	2	10	1648368	1648377	40 %	0 %	0 %	60 %	472334215
1030	NC_020833	ATAAC	2	10	1651642	1651651	60 %	20 %	0 %	20 %	472334215
1031	NC_020833	AAAAG	2	10	1651655	1651664	80 %	0 %	20 %	0 %	472334215
1032	NC_020833	GAGAT	2	10	1652475	1652484	40 %	20 %	40 %	0 %	472334216
1033	NC_020833	GCTCG	2	10	1652961	1652970	0 %	20 %	40 %	40 %	472334217
1034	NC_020833	GAGCC	2	10	1654099	1654108	20 %	0 %	40 %	40 %	472334218
1035	NC_020833	AAAAT	2	10	1654515	1654524	80 %	20 %	0 %	0 %	472334218
1036	NC_020833	CCGCC	2	10	1655135	1655144	0 %	0 %	20 %	80 %	472334218
1037	NC_020833	AATCA	2	10	1655411	1655420	60 %	20 %	0 %	20 %	472334218
1038	NC_020833	TTAGT	2	10	1655898	1655907	20 %	60 %	20 %	0 %	472334219
1039	NC_020833	GCAAC	2	10	1657305	1657314	40 %	0 %	20 %	40 %	472334220
1040	NC_020833	TCGGT	2	10	1661461	1661470	0 %	40 %	40 %	20 %	472334224
1041	NC_020833	CCATA	2	10	1664082	1664091	40 %	20 %	0 %	40 %	472334226
1042	NC_020833	AGCCA	2	10	1666104	1666113	40 %	0 %	20 %	40 %	472334227
1043	NC_020833	AAATC	2	10	1668909	1668918	60 %	20 %	0 %	20 %	472334229
1044	NC_020833	TGTTT	2	10	1669350	1669359	0 %	80 %	20 %	0 %	472334229
1045	NC_020833	CAATA	2	10	1670671	1670680	60 %	20 %	0 %	20 %	472334231
1046	NC_020833	TCTTG	2	10	1673050	1673059	0 %	60 %	20 %	20 %	472334232
1047	NC_020833	AAAGC	2	10	1673403	1673412	60 %	0 %	20 %	20 %	472334233
1048	NC_020833	TGTTT	4	20	1675122	1675141	0 %	80 %	20 %	0 %	472334234
1049	NC_020833	ACCCA	2	10	1675522	1675531	40 %	0 %	0 %	60 %	472334234
1050	NC_020833	TCGGA	2	10	1676246	1676255	20 %	20 %	40 %	20 %	472334234
1051	NC_020833	ACTCA	2	10	1679708	1679717	40 %	20 %	0 %	40 %	472334236
1052	NC_020833	AACCC	2	10	1682979	1682988	40 %	0 %	0 %	60 %	472334240
1053	NC_020833	CCAAA	2	10	1687123	1687132	60 %	0 %	0 %	40 %	472334246
1054	NC_020833	GCATC	2	10	1687839	1687848	20 %	20 %	20 %	40 %	472334247
1055	NC_020833	TGCCG	2	10	1688481	1688490	0 %	20 %	40 %	40 %	472334247
1056	NC_020833	CCGTT	2	10	1692887	1692896	0 %	40 %	20 %	40 %	472334251
1057	NC_020833	ATTTT	2	10	1693235	1693244	20 %	80 %	0 %	0 %	472334252
1058	NC_020833	TTCAA	2	10	1695077	1695086	40 %	40 %	0 %	20 %	472334253
1059	NC_020833	TTACT	2	10	1695774	1695783	20 %	60 %	0 %	20 %	472334253
1060	NC_020833	TAAGT	2	10	1698919	1698928	40 %	40 %	20 %	0 %	472334256
1061	NC_020833	GGTAC	2	10	1699460	1699469	20 %	20 %	40 %	20 %	472334257
1062	NC_020833	TAAAC	2	10	1700400	1700409	60 %	20 %	0 %	20 %	472334258
1063	NC_020833	CAATG	2	10	1700444	1700453	40 %	20 %	20 %	20 %	472334258
1064	NC_020833	GGCGA	2	10	1702723	1702732	20 %	0 %	60 %	20 %	472334259
1065	NC_020833	TTGGT	2	10	1703609	1703618	0 %	60 %	40 %	0 %	472334259
1066	NC_020833	CCCAA	2	10	1703866	1703875	40 %	0 %	0 %	60 %	472334260
1067	NC_020833	TGCAA	2	10	1704304	1704313	40 %	20 %	20 %	20 %	472334261
1068	NC_020833	CATCC	2	10	1705895	1705904	20 %	20 %	0 %	60 %	472334264
1069	NC_020833	GAAAT	2	10	1707440	1707449	60 %	20 %	20 %	0 %	472334265
1070	NC_020833	AAACT	2	10	1708447	1708456	60 %	20 %	0 %	20 %	472334267
1071	NC_020833	TTCTA	2	10	1708520	1708529	20 %	60 %	0 %	20 %	472334267
1072	NC_020833	CGACC	2	10	1708996	1709005	20 %	0 %	20 %	60 %	472334268
1073	NC_020833	ATTTT	2	10	1709506	1709515	20 %	80 %	0 %	0 %	472334269
1074	NC_020833	GCAAC	2	10	1712179	1712188	40 %	0 %	20 %	40 %	472334272
1075	NC_020833	CAACC	2	10	1715621	1715630	40 %	0 %	0 %	60 %	472334274
1076	NC_020833	GAGCA	2	10	1717142	1717151	40 %	0 %	40 %	20 %	472334277
1077	NC_020833	CTGCT	2	10	1718948	1718957	0 %	40 %	20 %	40 %	472334279
1078	NC_020833	AAACC	2	10	1725760	1725769	60 %	0 %	0 %	40 %	472334288
1079	NC_020833	TAAAA	2	10	1726322	1726331	80 %	20 %	0 %	0 %	472334290
1080	NC_020833	CAAAA	2	10	1726843	1726852	80 %	0 %	0 %	20 %	472334290
1081	NC_020833	TCATA	2	10	1727319	1727328	40 %	40 %	0 %	20 %	472334291
1082	NC_020833	TTTGA	2	10	1728462	1728471	20 %	60 %	20 %	0 %	472334294
1083	NC_020833	CGGTA	2	10	1729485	1729494	20 %	20 %	40 %	20 %	472334294
1084	NC_020833	CGATA	2	10	1733365	1733374	40 %	20 %	20 %	20 %	472334301
1085	NC_020833	GCTAA	2	10	1734561	1734570	40 %	20 %	20 %	20 %	472334302
1086	NC_020833	TCAGC	2	10	1735043	1735052	20 %	20 %	20 %	40 %	472334303
1087	NC_020833	AAACC	2	10	1735731	1735740	60 %	0 %	0 %	40 %	472334303
1088	NC_020833	TTTCC	2	10	1736667	1736676	0 %	60 %	0 %	40 %	472334304
1089	NC_020833	TGCGA	2	10	1736895	1736904	20 %	20 %	40 %	20 %	472334304
1090	NC_020833	ACTTC	2	10	1738400	1738409	20 %	40 %	0 %	40 %	472334305
1091	NC_020833	CAATT	2	10	1738497	1738506	40 %	40 %	0 %	20 %	472334305
1092	NC_020833	AACCA	2	10	1739510	1739519	60 %	0 %	0 %	40 %	472334306
1093	NC_020833	ATAAA	2	10	1741642	1741651	80 %	20 %	0 %	0 %	472334307
1094	NC_020833	TCATA	2	10	1741898	1741907	40 %	40 %	0 %	20 %	472334308
1095	NC_020833	CCCAT	2	10	1742135	1742144	20 %	20 %	0 %	60 %	472334308
1096	NC_020833	TTTAT	2	10	1742290	1742299	20 %	80 %	0 %	0 %	472334308
1097	NC_020833	TTTAT	2	10	1743576	1743585	20 %	80 %	0 %	0 %	472334309
1098	NC_020833	ATCAT	2	10	1747372	1747381	40 %	40 %	0 %	20 %	472334312
1099	NC_020833	TCTTT	2	10	1759099	1759108	0 %	80 %	0 %	20 %	472334329
1100	NC_020833	ATCTT	2	10	1765639	1765648	20 %	60 %	0 %	20 %	472334336
1101	NC_020833	CAAAA	2	10	1766174	1766183	80 %	0 %	0 %	20 %	472334336
1102	NC_020833	GCAAG	2	10	1771080	1771089	40 %	0 %	40 %	20 %	472334343
1103	NC_020833	GATGT	2	10	1774052	1774061	20 %	40 %	40 %	0 %	472334347
1104	NC_020833	TGATT	2	10	1776677	1776686	20 %	60 %	20 %	0 %	472334350
1105	NC_020833	CACAA	2	10	1777051	1777060	60 %	0 %	0 %	40 %	472334350
1106	NC_020833	GATTT	2	10	1777751	1777760	20 %	60 %	20 %	0 %	472334351
1107	NC_020833	AAGTG	2	10	1783327	1783336	40 %	20 %	40 %	0 %	472334357
1108	NC_020833	ATGGT	2	10	1784208	1784217	20 %	40 %	40 %	0 %	472334357
1109	NC_020833	TAACC	2	10	1785200	1785209	40 %	20 %	0 %	40 %	472334359
1110	NC_020833	AACAA	2	10	1785520	1785529	80 %	0 %	0 %	20 %	472334359
1111	NC_020833	ATTTG	2	10	1785947	1785956	20 %	60 %	20 %	0 %	472334359
1112	NC_020833	AGTTG	2	10	1792488	1792497	20 %	40 %	40 %	0 %	472334374
1113	NC_020833	GCAGA	2	10	1795412	1795421	40 %	0 %	40 %	20 %	472334377
1114	NC_020833	ATTTT	2	10	1795657	1795666	20 %	80 %	0 %	0 %	472334377
1115	NC_020833	TTTGC	2	10	1796440	1796449	0 %	60 %	20 %	20 %	472334377
1116	NC_020833	AATTG	2	10	1797887	1797896	40 %	40 %	20 %	0 %	472334377
1117	NC_020833	TCATA	2	10	1798049	1798058	40 %	40 %	0 %	20 %	472334377
1118	NC_020833	GGTTC	2	10	1799174	1799183	0 %	40 %	40 %	20 %	472334378
1119	NC_020833	ATTCA	2	10	1802180	1802189	40 %	40 %	0 %	20 %	472334380
1120	NC_020833	CTGTA	2	10	1802371	1802380	20 %	40 %	20 %	20 %	472334380
1121	NC_020833	CATTT	2	10	1804813	1804822	20 %	60 %	0 %	20 %	472334383
1122	NC_020833	ATTGC	2	10	1805371	1805380	20 %	40 %	20 %	20 %	472334385
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1496	NC_020833	CACTA	2	10	2342245	2342254	40 %	20 %	0 %	40 %	472334923
1497	NC_020833	CAAGC	2	10	2343024	2343033	40 %	0 %	20 %	40 %	472334924
1498	NC_020833	TAAAG	2	10	2343142	2343151	60 %	20 %	20 %	0 %	472334924
1499	NC_020833	AAACC	2	10	2343406	2343415	60 %	0 %	0 %	40 %	472334924
1500	NC_020833	AAACC	2	10	2344389	2344398	60 %	0 %	0 %	40 %	472334925

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