MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 1691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020833	ATTTC	2	10	826117	826126	20 %	60 %	0 %	20 %	472333339
502	NC_020833	AACAG	2	10	827644	827653	60 %	0 %	20 %	20 %	472333340
503	NC_020833	ATACT	2	10	829469	829478	40 %	40 %	0 %	20 %	472333342
504	NC_020833	ACAAA	2	10	829859	829868	80 %	0 %	0 %	20 %	472333342
505	NC_020833	ATTTG	2	10	831772	831781	20 %	60 %	20 %	0 %	472333343
506	NC_020833	GGTGA	2	10	836380	836389	20 %	20 %	60 %	0 %	472333346
507	NC_020833	GTAAA	2	10	836621	836630	60 %	20 %	20 %	0 %	472333346
508	NC_020833	CGGTA	2	10	840453	840462	20 %	20 %	40 %	20 %	472333351
509	NC_020833	GAGCG	2	10	842506	842515	20 %	0 %	60 %	20 %	472333352
510	NC_020833	ATTGA	2	10	845234	845243	40 %	40 %	20 %	0 %	472333354
511	NC_020833	GGTTG	2	10	846306	846315	0 %	40 %	60 %	0 %	472333354
512	NC_020833	GATGC	2	10	849962	849971	20 %	20 %	40 %	20 %	472333357
513	NC_020833	GCAGA	2	10	851135	851144	40 %	0 %	40 %	20 %	472333358
514	NC_020833	ATCAA	2	10	853094	853103	60 %	20 %	0 %	20 %	472333361
515	NC_020833	CTGCT	2	10	856181	856190	0 %	40 %	20 %	40 %	472333363
516	NC_020833	CGGTG	2	10	857674	857683	0 %	20 %	60 %	20 %	472333364
517	NC_020833	GTGAA	2	10	858051	858060	40 %	20 %	40 %	0 %	472333364
518	NC_020833	GGCAA	2	10	860207	860216	40 %	0 %	40 %	20 %	472333367
519	NC_020833	CGAGC	2	10	866818	866827	20 %	0 %	40 %	40 %	472333373
520	NC_020833	ATTGC	2	10	868385	868394	20 %	40 %	20 %	20 %	472333376
521	NC_020833	TATTT	2	10	869334	869343	20 %	80 %	0 %	0 %	472333377
522	NC_020833	CCACC	2	10	870527	870536	20 %	0 %	0 %	80 %	472333377
523	NC_020833	AGTTT	2	10	870752	870761	20 %	60 %	20 %	0 %	472333378
524	NC_020833	TTAAA	2	10	871181	871190	60 %	40 %	0 %	0 %	472333378
525	NC_020833	TCCAT	2	10	871582	871591	20 %	40 %	0 %	40 %	472333378
526	NC_020833	CAACT	2	10	871674	871683	40 %	20 %	0 %	40 %	472333378
527	NC_020833	TCGGA	2	10	872858	872867	20 %	20 %	40 %	20 %	472333379
528	NC_020833	GTGAT	2	10	874965	874974	20 %	40 %	40 %	0 %	472333380
529	NC_020833	GTAAA	2	10	875975	875984	60 %	20 %	20 %	0 %	472333381
530	NC_020833	AAGAG	2	10	881184	881193	60 %	0 %	40 %	0 %	472333388
531	NC_020833	GTAAT	2	10	881750	881759	40 %	40 %	20 %	0 %	472333390
532	NC_020833	TTACC	2	10	882134	882143	20 %	40 %	0 %	40 %	472333390
533	NC_020833	TTGTA	2	10	882655	882664	20 %	60 %	20 %	0 %	472333391
534	NC_020833	AATTT	2	10	883623	883632	40 %	60 %	0 %	0 %	472333392
535	NC_020833	ATTTT	2	10	885235	885244	20 %	80 %	0 %	0 %	472333395
536	NC_020833	GATAG	2	10	889147	889156	40 %	20 %	40 %	0 %	472333404
537	NC_020833	CCAAT	2	10	892308	892317	40 %	20 %	0 %	40 %	472333409
538	NC_020833	TGCCG	2	10	893582	893591	0 %	20 %	40 %	40 %	472333411
539	NC_020833	TAGGT	2	10	895342	895351	20 %	40 %	40 %	0 %	472333414
540	NC_020833	ATTTC	2	10	895496	895505	20 %	60 %	0 %	20 %	472333414
541	NC_020833	AACCG	2	10	898486	898495	40 %	0 %	20 %	40 %	472333419
542	NC_020833	CAAGC	2	10	898598	898607	40 %	0 %	20 %	40 %	472333419
543	NC_020833	CATAT	2	10	901176	901185	40 %	40 %	0 %	20 %	472333421
544	NC_020833	TAGGG	2	10	902260	902269	20 %	20 %	60 %	0 %	472333422
545	NC_020833	ACCAC	2	10	903669	903678	40 %	0 %	0 %	60 %	472333423
546	NC_020833	TAGCT	2	10	903854	903863	20 %	40 %	20 %	20 %	472333424
547	NC_020833	AAGCG	2	10	908061	908070	40 %	0 %	40 %	20 %	472333428
548	NC_020833	ATTCT	2	10	910187	910196	20 %	60 %	0 %	20 %	472333430
549	NC_020833	CATTT	2	10	910776	910785	20 %	60 %	0 %	20 %	472333431
550	NC_020833	TTTAT	2	10	911006	911015	20 %	80 %	0 %	0 %	472333431
551	NC_020833	TTTCT	2	10	911855	911864	0 %	80 %	0 %	20 %	472333432
552	NC_020833	TTAAT	2	10	913340	913349	40 %	60 %	0 %	0 %	472333434
553	NC_020833	TTTGG	2	10	914401	914410	0 %	60 %	40 %	0 %	472333435
554	NC_020833	TTGAT	2	10	915254	915263	20 %	60 %	20 %	0 %	472333435
555	NC_020833	ATTTC	2	10	918046	918055	20 %	60 %	0 %	20 %	472333439
556	NC_020833	TTCCT	2	10	918915	918924	0 %	60 %	0 %	40 %	472333441
557	NC_020833	AAATT	2	10	920899	920908	60 %	40 %	0 %	0 %	472333446
558	NC_020833	TTAAT	2	10	921322	921331	40 %	60 %	0 %	0 %	472333447
559	NC_020833	AAGCG	2	10	922995	923004	40 %	0 %	40 %	20 %	472333448
560	NC_020833	TAAAT	2	10	923514	923523	60 %	40 %	0 %	0 %	472333448
561	NC_020833	AAATA	2	10	926118	926127	80 %	20 %	0 %	0 %	472333451
562	NC_020833	GAGCA	2	10	926680	926689	40 %	0 %	40 %	20 %	472333451
563	NC_020833	AGGCG	2	10	928062	928071	20 %	0 %	60 %	20 %	472333454
564	NC_020833	TCAAA	2	10	928317	928326	60 %	20 %	0 %	20 %	472333454
565	NC_020833	CTTGC	2	10	928624	928633	0 %	40 %	20 %	40 %	472333454
566	NC_020833	TATGG	2	10	932770	932779	20 %	40 %	40 %	0 %	472333458
567	NC_020833	AAAAG	2	10	935464	935473	80 %	0 %	20 %	0 %	472333462
568	NC_020833	GTAAC	2	10	937583	937592	40 %	20 %	20 %	20 %	472333464
569	NC_020833	CATTA	2	10	939905	939914	40 %	40 %	0 %	20 %	472333469
570	NC_020833	TGGCG	2	10	941435	941444	0 %	20 %	60 %	20 %	472333471
571	NC_020833	ATGGA	2	10	941953	941962	40 %	20 %	40 %	0 %	472333471
572	NC_020833	ATTTT	2	10	943447	943456	20 %	80 %	0 %	0 %	472333473
573	NC_020833	AGATA	2	10	944202	944211	60 %	20 %	20 %	0 %	472333474
574	NC_020833	TTTTA	2	10	952002	952011	20 %	80 %	0 %	0 %	472333482
575	NC_020833	ATTTT	2	10	952462	952471	20 %	80 %	0 %	0 %	472333482
576	NC_020833	AATAA	2	10	953001	953010	80 %	20 %	0 %	0 %	472333483
577	NC_020833	CAATC	2	10	954978	954987	40 %	20 %	0 %	40 %	472333486
578	NC_020833	TGAAA	2	10	954994	955003	60 %	20 %	20 %	0 %	472333486
579	NC_020833	AAGCC	2	10	956524	956533	40 %	0 %	20 %	40 %	472333486
580	NC_020833	CGCAC	2	10	957282	957291	20 %	0 %	20 %	60 %	472333487
581	NC_020833	CAAAT	2	10	957632	957641	60 %	20 %	0 %	20 %	472333487
582	NC_020833	CGGCA	2	10	959971	959980	20 %	0 %	40 %	40 %	472333487
583	NC_020833	GGGCA	2	10	961949	961958	20 %	0 %	60 %	20 %	472333489
584	NC_020833	GCTTG	2	10	962989	962998	0 %	40 %	40 %	20 %	472333489
585	NC_020833	GCTGT	33	165	963163	963327	0 %	40 %	40 %	20 %	472333489
586	NC_020833	GCAGA	2	10	964179	964188	40 %	0 %	40 %	20 %	472333491
587	NC_020833	TGCAC	2	10	964638	964647	20 %	20 %	20 %	40 %	472333492
588	NC_020833	GATTT	2	10	965664	965673	20 %	60 %	20 %	0 %	472333493
589	NC_020833	GTGAT	2	10	966151	966160	20 %	40 %	40 %	0 %	472333493
590	NC_020833	AATGA	2	10	967012	967021	60 %	20 %	20 %	0 %	472333494
591	NC_020833	ATATT	2	10	969887	969896	40 %	60 %	0 %	0 %	472333496
592	NC_020833	AAATG	2	10	972294	972303	60 %	20 %	20 %	0 %	472333497
593	NC_020833	TGTGC	2	10	973610	973619	0 %	40 %	40 %	20 %	472333498
594	NC_020833	TTGAG	2	10	973709	973718	20 %	40 %	40 %	0 %	472333498
595	NC_020833	CTTTT	2	10	974049	974058	0 %	80 %	0 %	20 %	472333499
596	NC_020833	TTTGC	2	10	975529	975538	0 %	60 %	20 %	20 %	472333501
597	NC_020833	GTTTA	2	10	979030	979039	20 %	60 %	20 %	0 %	472333510
598	NC_020833	TTTGA	2	10	979783	979792	20 %	60 %	20 %	0 %	472333512
599	NC_020833	CGTTG	2	10	981672	981681	0 %	40 %	40 %	20 %	472333515
600	NC_020833	CGGTT	2	10	982390	982399	0 %	40 %	40 %	20 %	472333517
601	NC_020833	GATAA	2	10	985431	985440	60 %	20 %	20 %	0 %	472333522
602	NC_020833	AGCTG	2	10	987702	987711	20 %	20 %	40 %	20 %	472333526
603	NC_020833	GCAAT	2	10	989729	989738	40 %	20 %	20 %	20 %	472333528
604	NC_020833	GCGGT	2	10	991713	991722	0 %	20 %	60 %	20 %	472333531
605	NC_020833	AGTTT	2	10	992218	992227	20 %	60 %	20 %	0 %	472333533
606	NC_020833	GGTAT	2	10	993959	993968	20 %	40 %	40 %	0 %	472333535
607	NC_020833	AAATG	2	10	994298	994307	60 %	20 %	20 %	0 %	472333536
608	NC_020833	CAAAC	2	10	994597	994606	60 %	0 %	0 %	40 %	472333537
609	NC_020833	CGGTG	2	10	999009	999018	0 %	20 %	60 %	20 %	472333542
610	NC_020833	ATCCA	2	10	1000170	1000179	40 %	20 %	0 %	40 %	472333543
611	NC_020833	CAATG	2	10	1000616	1000625	40 %	20 %	20 %	20 %	472333543
612	NC_020833	CGTGG	2	10	1000662	1000671	0 %	20 %	60 %	20 %	472333543
613	NC_020833	CACGG	2	10	1002131	1002140	20 %	0 %	40 %	40 %	472333545
614	NC_020833	ACCGC	2	10	1004466	1004475	20 %	0 %	20 %	60 %	472333550
615	NC_020833	TGAAT	2	10	1006418	1006427	40 %	40 %	20 %	0 %	472333552
616	NC_020833	AACAA	2	10	1008768	1008777	80 %	0 %	0 %	20 %	472333553
617	NC_020833	AATGC	2	10	1008916	1008925	40 %	20 %	20 %	20 %	472333554
618	NC_020833	CCCGA	2	10	1011913	1011922	20 %	0 %	20 %	60 %	472333558
619	NC_020833	TACAA	2	10	1015998	1016007	60 %	20 %	0 %	20 %	472333559
620	NC_020833	TGGTA	2	10	1017866	1017875	20 %	40 %	40 %	0 %	472333559
621	NC_020833	TTATC	2	10	1018784	1018793	20 %	60 %	0 %	20 %	472333561
622	NC_020833	ACTCA	2	10	1019153	1019162	40 %	20 %	0 %	40 %	472333562
623	NC_020833	TGTAG	2	10	1019385	1019394	20 %	40 %	40 %	0 %	472333562
624	NC_020833	CGATG	2	10	1022069	1022078	20 %	20 %	40 %	20 %	472333566
625	NC_020833	CGAGC	2	10	1022793	1022802	20 %	0 %	40 %	40 %	472333566
626	NC_020833	ACGAT	2	10	1023806	1023815	40 %	20 %	20 %	20 %	472333568
627	NC_020833	CGCTA	2	10	1024259	1024268	20 %	20 %	20 %	40 %	472333568
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