MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 22105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014002	ATC	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494691
2	NC_014002	TTA	3	9	600	608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494691
3	NC_014002	TGA	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
4	NC_014002	GAT	2	6	647	652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
5	NC_014002	GAG	2	6	776	781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494691
6	NC_014002	ATG	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
7	NC_014002	GAT	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
8	NC_014002	TGA	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
9	NC_014002	AGA	2	6	978	983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494691
10	NC_014002	GAA	2	6	995	1000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494691
11	NC_014002	TGC	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494691
12	NC_014002	TAA	2	6	1108	1113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494691
13	NC_014002	ACA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494692
14	NC_014002	GAT	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494692
15	NC_014002	TTC	2	6	1523	1528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494692
16	NC_014002	CTG	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494692
17	NC_014002	TAG	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494692
18	NC_014002	CTT	2	6	1654	1659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494692
19	NC_014002	CAA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494692
20	NC_014002	ATT	2	6	1992	1997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494692
21	NC_014002	CAA	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494693
22	NC_014002	GAT	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
23	NC_014002	TGA	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
24	NC_014002	GAA	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494693
25	NC_014002	TGA	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
26	NC_014002	AGT	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
27	NC_014002	GAT	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
28	NC_014002	GCA	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494693
29	NC_014002	GGT	2	6	3566	3571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494693
30	NC_014002	TGC	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494693
31	NC_014002	TTA	2	6	3663	3668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494694
32	NC_014002	CTG	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494694
33	NC_014002	AAT	2	6	3923	3928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494694
34	NC_014002	AGA	2	6	4079	4084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494694
35	NC_014002	ATT	2	6	4377	4382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494694
36	NC_014002	GAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494694
37	NC_014002	ACC	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494695
38	NC_014002	GGT	2	6	5218	5223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494695
39	NC_014002	CAG	2	6	5242	5247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494695
40	NC_014002	GAA	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494695
41	NC_014002	CAT	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494695
42	NC_014002	TGC	2	6	5478	5483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494695
43	NC_014002	TGA	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494695
44	NC_014002	CTG	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494695
45	NC_014002	ACA	2	6	5696	5701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494695
46	NC_014002	GGC	2	6	5896	5901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494695
47	NC_014002	TTG	2	6	5903	5908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494695
48	NC_014002	GTA	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494696
49	NC_014002	ATA	2	6	6352	6357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494696
50	NC_014002	GAG	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494696
51	NC_014002	TGA	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494696
52	NC_014002	CAT	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494696
53	NC_014002	GAT	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494696
54	NC_014002	TGG	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494696
55	NC_014002	TAC	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494696
56	NC_014002	ATT	2	6	6919	6924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494696
57	NC_014002	TGA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494696
58	NC_014002	CGC	2	6	7129	7134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494696
59	NC_014002	AGC	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494696
60	NC_014002	GAA	2	6	7549	7554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494696
61	NC_014002	AAC	2	6	7669	7674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494697
62	NC_014002	CGC	2	6	7851	7856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494697
63	NC_014002	TCC	2	6	8068	8073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494698
64	NC_014002	AAC	2	6	8259	8264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494698
65	NC_014002	ATG	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494698
66	NC_014002	ATC	2	6	8358	8363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494698
67	NC_014002	ACC	2	6	8590	8595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494698
68	NC_014002	GGT	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494698
69	NC_014002	TGC	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494698
70	NC_014002	CTC	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494698
71	NC_014002	GAT	2	6	9044	9049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494699
72	NC_014002	GGA	2	6	9071	9076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494699
73	NC_014002	TCA	2	6	9135	9140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494699
74	NC_014002	TTG	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494699
75	NC_014002	AGA	2	6	9319	9324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494699
76	NC_014002	ATG	2	6	9417	9422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494699
77	NC_014002	TGA	2	6	9514	9519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494699
78	NC_014002	TGA	4	12	9553	9564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494699
79	NC_014002	TAC	2	6	9647	9652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494699
80	NC_014002	CAG	2	6	9699	9704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494699
81	NC_014002	CAG	2	6	10134	10139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494700
82	NC_014002	TCT	2	6	10207	10212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494700
83	NC_014002	TAT	2	6	10241	10246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494700
84	NC_014002	GCT	3	9	10492	10500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494700
85	NC_014002	CTG	2	6	10555	10560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494700
86	NC_014002	CAG	2	6	10631	10636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494700
87	NC_014002	TGA	2	6	10705	10710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494700
88	NC_014002	GGT	2	6	10872	10877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494700
89	NC_014002	TGA	2	6	11173	11178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494701
90	NC_014002	TGA	2	6	11204	11209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494701
91	NC_014002	AGG	3	9	11216	11224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494701
92	NC_014002	TGA	2	6	11407	11412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494701
93	NC_014002	CTT	2	6	11709	11714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494701
94	NC_014002	GAT	2	6	11718	11723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494701
95	NC_014002	GAT	2	6	11799	11804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494701
96	NC_014002	AGA	2	6	11904	11909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494701
97	NC_014002	CTG	2	6	11982	11987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494702
98	NC_014002	TCT	2	6	12077	12082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494702
99	NC_014002	GAG	2	6	12143	12148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494702
100	NC_014002	AGG	2	6	12155	12160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494702
101	NC_014002	AAT	2	6	12210	12215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494702
102	NC_014002	TTC	2	6	12468	12473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494702
103	NC_014002	CAC	2	6	12660	12665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494702
104	NC_014002	TTG	2	6	12821	12826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494702
105	NC_014002	TCA	2	6	12827	12832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494702
106	NC_014002	TGC	2	6	12897	12902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494702
107	NC_014002	CAC	2	6	13002	13007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494703
108	NC_014002	GGT	2	6	13040	13045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494703
109	NC_014002	TCC	2	6	13082	13087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494703
110	NC_014002	GTC	2	6	13126	13131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494703
111	NC_014002	TCA	2	6	13188	13193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494703
112	NC_014002	TGA	2	6	13453	13458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494703
113	NC_014002	ATG	2	6	13494	13499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494703
114	NC_014002	CAG	2	6	13513	13518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494703
115	NC_014002	TCT	2	6	13583	13588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494703
116	NC_014002	AGG	2	6	13744	13749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494703
117	NC_014002	TTC	2	6	13865	13870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494703
118	NC_014002	AGC	2	6	13920	13925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494703
119	NC_014002	AGG	2	6	13986	13991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494703
120	NC_014002	AGT	2	6	14082	14087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494703
121	NC_014002	CAA	2	6	14194	14199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494704
122	NC_014002	CTC	3	9	14228	14236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494704
123	NC_014002	CAT	2	6	14276	14281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494704
124	NC_014002	ACC	2	6	14286	14291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494704
125	NC_014002	CTG	2	6	14375	14380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494704
126	NC_014002	TAT	2	6	14498	14503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494704
127	NC_014002	GAC	2	6	14537	14542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494704
128	NC_014002	ATC	2	6	14556	14561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494704
129	NC_014002	TCA	2	6	14671	14676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494704
130	NC_014002	CAT	2	6	14686	14691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494704
131	NC_014002	CAG	2	6	14734	14739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494704
132	NC_014002	CTT	2	6	14774	14779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494704
133	NC_014002	CAG	2	6	14849	14854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494704
134	NC_014002	CTT	2	6	14856	14861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494704
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143	NC_014002	TCA	2	6	15590	15595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494705
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153	NC_014002	CTC	2	6	16264	16269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494706
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252	NC_014002	CAA	2	6	26976	26981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494716
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