MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 22105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014002	GTC	2	6	495472	495477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495157
5502	NC_014002	AGC	2	6	495528	495533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495157
5503	NC_014002	TAA	2	6	495597	495602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495157
5504	NC_014002	TTC	2	6	495604	495609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495157
5505	NC_014002	CAT	2	6	495789	495794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495157
5506	NC_014002	GAT	2	6	496208	496213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495158
5507	NC_014002	GAG	2	6	496244	496249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495158
5508	NC_014002	GAA	2	6	496325	496330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495158
5509	NC_014002	ACA	2	6	496404	496409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495158
5510	NC_014002	ATG	2	6	496439	496444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495158
5511	NC_014002	TTG	2	6	496488	496493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495158
5512	NC_014002	ATC	2	6	496527	496532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495158
5513	NC_014002	ATC	2	6	496579	496584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495158
5514	NC_014002	ATT	2	6	496763	496768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495159
5515	NC_014002	CCA	2	6	496807	496812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495159
5516	NC_014002	AGT	2	6	496820	496825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495159
5517	NC_014002	CCG	2	6	496912	496917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495159
5518	NC_014002	TCA	2	6	496954	496959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495159
5519	NC_014002	GCC	2	6	497101	497106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495159
5520	NC_014002	ACC	2	6	497149	497154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495159
5521	NC_014002	GCA	2	6	497185	497190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495159
5522	NC_014002	TCT	2	6	497206	497211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495159
5523	NC_014002	CAT	2	6	497295	497300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495159
5524	NC_014002	CAG	2	6	497390	497395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495159
5525	NC_014002	GGT	2	6	497424	497429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495159
5526	NC_014002	GTT	2	6	497541	497546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495159
5527	NC_014002	CAC	2	6	497651	497656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495159
5528	NC_014002	CAA	2	6	497780	497785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495159
5529	NC_014002	TAC	2	6	497901	497906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495159
5530	NC_014002	GCT	2	6	498001	498006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495159
5531	NC_014002	CAA	2	6	498098	498103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495159
5532	NC_014002	ACC	2	6	498261	498266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495159
5533	NC_014002	TTC	2	6	498531	498536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495159
5534	NC_014002	TTG	2	6	498596	498601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495159
5535	NC_014002	ACA	2	6	498694	498699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495159
5536	NC_014002	ACC	2	6	498846	498851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495159
5537	NC_014002	TTG	2	6	498887	498892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495159
5538	NC_014002	TTC	2	6	498945	498950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495159
5539	NC_014002	TAC	2	6	498960	498965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495159
5540	NC_014002	TGG	2	6	498991	498996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495159
5541	NC_014002	TAC	2	6	499017	499022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495159
5542	NC_014002	GCA	2	6	499055	499060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495159
5543	NC_014002	TAA	2	6	499157	499162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495159
5544	NC_014002	CAA	2	6	499241	499246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495159
5545	NC_014002	CTT	2	6	499482	499487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495159
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5547	NC_014002	AAT	2	6	501020	501025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495160
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5549	NC_014002	TCT	2	6	501367	501372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495160
5550	NC_014002	TTC	2	6	501394	501399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495160
5551	NC_014002	TCC	2	6	501435	501440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495160
5552	NC_014002	TGG	2	6	501458	501463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495160
5553	NC_014002	ATG	2	6	501547	501552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495160
5554	NC_014002	TCT	2	6	501559	501564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495160
5555	NC_014002	CAT	2	6	501715	501720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495161
5556	NC_014002	ATC	2	6	501898	501903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495161
5557	NC_014002	CTT	2	6	501957	501962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495161
5558	NC_014002	TTA	3	9	502020	502028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495161
5559	NC_014002	GTT	2	6	502063	502068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495161
5560	NC_014002	GAA	2	6	502670	502675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495162
5561	NC_014002	TGT	2	6	502719	502724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495162
5562	NC_014002	GTC	2	6	502765	502770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495162
5563	NC_014002	AGA	2	6	502780	502785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495162
5564	NC_014002	GAA	2	6	503032	503037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495163
5565	NC_014002	GAA	2	6	503083	503088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495163
5566	NC_014002	TAC	2	6	503148	503153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495163
5567	NC_014002	GAT	2	6	503182	503187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495163
5568	NC_014002	GAA	2	6	503290	503295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495163
5569	NC_014002	TTG	2	6	503396	503401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495163
5570	NC_014002	GAT	2	6	503434	503439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495163
5571	NC_014002	TGG	2	6	503640	503645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495163
5572	NC_014002	ATG	2	6	503651	503656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495163
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5574	NC_014002	TTG	2	6	503770	503775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495163
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5578	NC_014002	ATT	2	6	504014	504019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495163
5579	NC_014002	ATC	2	6	504059	504064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495163
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5584	NC_014002	AAG	2	6	504729	504734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495164
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5589	NC_014002	GGT	2	6	505339	505344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495165
5590	NC_014002	GTC	2	6	505395	505400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495165
5591	NC_014002	CAA	2	6	505455	505460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495165
5592	NC_014002	ATG	2	6	505493	505498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495165
5593	NC_014002	ATG	2	6	505717	505722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495165
5594	NC_014002	AAT	2	6	505836	505841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495165
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5599	NC_014002	GAT	2	6	506515	506520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495165
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5601	NC_014002	ATA	2	6	506657	506662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495165
5602	NC_014002	TGG	2	6	506664	506669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495165
5603	NC_014002	TGC	2	6	506672	506677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495165
5604	NC_014002	CTC	2	6	506861	506866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495165
5605	NC_014002	ATG	2	6	507157	507162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495165
5606	NC_014002	GAG	2	6	507175	507180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495165
5607	NC_014002	AGC	2	6	507204	507209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495165
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5609	NC_014002	CAT	2	6	507324	507329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495165
5610	NC_014002	CCT	2	6	507379	507384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495165
5611	NC_014002	ATA	2	6	507440	507445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495165
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5613	NC_014002	TAC	2	6	507632	507637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495166
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5617	NC_014002	TAA	2	6	508115	508120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495166
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5974	NC_014002	CTT	2	6	542481	542486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495203
5975	NC_014002	ATG	2	6	542500	542505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495203
5976	NC_014002	GAT	2	6	542514	542519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495203
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5978	NC_014002	TGA	2	6	542585	542590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495203
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5980	NC_014002	GAT	2	6	542745	542750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495203
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5982	NC_014002	TAC	2	6	542853	542858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495204
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5986	NC_014002	GTG	2	6	543298	543303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495204
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