MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 22105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014002	TTA	2	6	97237	97242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494779
1003	NC_014002	CTG	2	6	97249	97254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494779
1004	NC_014002	TAA	2	6	97304	97309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494779
1005	NC_014002	CAC	2	6	97334	97339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494779
1006	NC_014002	ATT	2	6	97427	97432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494779
1007	NC_014002	TGG	2	6	97538	97543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494779
1008	NC_014002	AAT	2	6	97719	97724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494779
1009	NC_014002	TAA	2	6	97777	97782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494779
1010	NC_014002	TCA	2	6	98002	98007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494780
1011	NC_014002	TTG	2	6	98108	98113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494780
1012	NC_014002	AGA	2	6	98146	98151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494780
1013	NC_014002	ATG	2	6	98192	98197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494780
1014	NC_014002	ATA	2	6	98536	98541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494781
1015	NC_014002	TCT	2	6	98550	98555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494781
1016	NC_014002	AGA	2	6	98678	98683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494781
1017	NC_014002	TGA	2	6	98748	98753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494781
1018	NC_014002	TAG	2	6	98768	98773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494781
1019	NC_014002	ATT	2	6	98774	98779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494781
1020	NC_014002	AAT	2	6	98936	98941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494781
1021	NC_014002	CAT	2	6	98977	98982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494781
1022	NC_014002	CAT	2	6	98989	98994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494781
1023	NC_014002	GCC	2	6	99065	99070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494781
1024	NC_014002	AAT	2	6	99074	99079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494781
1025	NC_014002	GTT	2	6	99291	99296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494782
1026	NC_014002	TTC	2	6	99315	99320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494782
1027	NC_014002	CTG	2	6	99379	99384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494782
1028	NC_014002	TTA	2	6	99467	99472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494782
1029	NC_014002	CTA	2	6	99524	99529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494782
1030	NC_014002	GTA	2	6	99664	99669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494782
1031	NC_014002	TAC	3	9	99687	99695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494782
1032	NC_014002	TTA	2	6	99715	99720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494782
1033	NC_014002	GTA	2	6	99765	99770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494782
1034	NC_014002	ATA	2	6	99881	99886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494782
1035	NC_014002	ACG	2	6	99930	99935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494782
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1037	NC_014002	TTG	2	6	100157	100162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494782
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1039	NC_014002	AAT	2	6	100345	100350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494782
1040	NC_014002	TTA	2	6	100406	100411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494782
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1053	NC_014002	TTA	2	6	101180	101185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494782
1054	NC_014002	CAA	2	6	101210	101215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494782
1055	NC_014002	ATT	2	6	101272	101277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494782
1056	NC_014002	CTT	2	6	101387	101392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494783
1057	NC_014002	TCT	2	6	101491	101496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494783
1058	NC_014002	TCA	2	6	101500	101505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494783
1059	NC_014002	ATA	2	6	101604	101609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494783
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1061	NC_014002	ATG	2	6	101748	101753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494783
1062	NC_014002	CAT	2	6	101759	101764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494783
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1069	NC_014002	TTG	2	6	102223	102228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494783
1070	NC_014002	TTC	2	6	102258	102263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494783
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1089	NC_014002	AAT	2	6	105120	105125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494787
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1092	NC_014002	TAG	2	6	105695	105700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494787
1093	NC_014002	CTT	2	6	105705	105710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494787
1094	NC_014002	TGG	3	9	105859	105867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494788
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1101	NC_014002	ATA	2	6	106256	106261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494788
1102	NC_014002	AAC	2	6	106283	106288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494788
1103	NC_014002	TTC	2	6	106343	106348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494788
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1108	NC_014002	AGA	2	6	106935	106940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494789
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1110	NC_014002	CAG	2	6	107317	107322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494789
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1113	NC_014002	GAT	2	6	107584	107589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494789
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1117	NC_014002	TTA	2	6	107967	107972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494790
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1121	NC_014002	CAA	2	6	108105	108110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494790
1122	NC_014002	ATA	2	6	108270	108275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494790
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1241	NC_014002	CAT	2	6	119959	119964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494793
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1478	NC_014002	AAT	2	6	141558	141563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494800
1479	NC_014002	ACC	2	6	141627	141632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494800
1480	NC_014002	TAT	2	6	141705	141710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494800
1481	NC_014002	CCT	2	6	141802	141807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494800
1482	NC_014002	CAG	2	6	141819	141824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494800
1483	NC_014002	ATT	2	6	142024	142029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494800
1484	NC_014002	CAA	2	6	142087	142092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494800
1485	NC_014002	CCG	2	6	142159	142164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494800
1486	NC_014002	ACA	2	6	142182	142187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494800
1487	NC_014002	TAA	2	6	142255	142260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494800
1488	NC_014002	TCA	2	6	142541	142546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494801
1489	NC_014002	CGG	2	6	142548	142553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494801
1490	NC_014002	ACA	2	6	142619	142624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494801
1491	NC_014002	AGC	2	6	142769	142774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494801
1492	NC_014002	AAT	2	6	142792	142797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494801
1493	NC_014002	TGC	2	6	143012	143017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494801
1494	NC_014002	CTG	2	6	143185	143190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494801
1495	NC_014002	TGC	2	6	143358	143363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494801
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1498	NC_014002	TTG	2	6	143769	143774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494802
1499	NC_014002	AGC	2	6	143890	143895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494802
1500	NC_014002	ATG	2	6	143910	143915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494802

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