MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 22105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014002	GCA	2	6	361423	361428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495026
4002	NC_014002	GAT	2	6	361489	361494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495026
4003	NC_014002	TAT	2	6	361521	361526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495026
4004	NC_014002	GAT	2	6	361614	361619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495026
4005	NC_014002	ATC	2	6	361873	361878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495027
4006	NC_014002	TAT	2	6	361933	361938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495027
4007	NC_014002	TCT	2	6	362084	362089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495027
4008	NC_014002	CAT	2	6	362116	362121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495027
4009	NC_014002	TCT	2	6	362238	362243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495027
4010	NC_014002	ATT	2	6	362294	362299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495027
4011	NC_014002	CTT	2	6	362408	362413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495027
4012	NC_014002	CAG	2	6	362442	362447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495027
4013	NC_014002	TGT	3	9	362451	362459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495027
4014	NC_014002	GAT	2	6	362565	362570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495027
4015	NC_014002	AGG	2	6	362599	362604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495027
4016	NC_014002	TTC	2	6	362635	362640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495027
4017	NC_014002	ATT	3	9	362702	362710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495027
4018	NC_014002	ACC	2	6	363239	363244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495028
4019	NC_014002	ATA	2	6	363258	363263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495028
4020	NC_014002	AGG	2	6	363284	363289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495028
4021	NC_014002	TGA	2	6	363314	363319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495028
4022	NC_014002	AAT	2	6	363424	363429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495028
4023	NC_014002	CTT	2	6	363466	363471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495029
4024	NC_014002	CAA	2	6	363496	363501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495029
4025	NC_014002	TTC	2	6	363974	363979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495029
4026	NC_014002	TAT	2	6	364001	364006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495029
4027	NC_014002	CAG	2	6	364206	364211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495030
4028	NC_014002	GAT	2	6	364218	364223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495030
4029	NC_014002	GAT	2	6	364311	364316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495030
4030	NC_014002	AAC	2	6	364412	364417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495031
4031	NC_014002	CAT	2	6	364419	364424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495031
4032	NC_014002	ATT	2	6	364529	364534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495031
4033	NC_014002	TCA	2	6	364556	364561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495031
4034	NC_014002	TAT	2	6	364630	364635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495031
4035	NC_014002	CAG	2	6	364647	364652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495031
4036	NC_014002	CTT	2	6	364710	364715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495031
4037	NC_014002	TAT	2	6	364755	364760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495031
4038	NC_014002	ACT	2	6	364814	364819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495031
4039	NC_014002	TGT	2	6	364951	364956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495031
4040	NC_014002	TGT	2	6	364967	364972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495031
4041	NC_014002	CAG	2	6	364989	364994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495031
4042	NC_014002	CTT	2	6	365170	365175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495032
4043	NC_014002	TAT	2	6	365198	365203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495032
4044	NC_014002	TCC	2	6	365216	365221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495032
4045	NC_014002	TTC	3	9	365255	365263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495032
4046	NC_014002	TTC	2	6	365381	365386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495032
4047	NC_014002	CAG	2	6	365393	365398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495032
4048	NC_014002	GTG	2	6	365399	365404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495032
4049	NC_014002	ATC	2	6	365450	365455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495032
4050	NC_014002	ATC	2	6	365706	365711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495033
4051	NC_014002	GCT	2	6	365757	365762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495033
4052	NC_014002	CAA	2	6	365843	365848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495033
4053	NC_014002	CTT	2	6	365906	365911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495033
4054	NC_014002	TAT	2	6	366081	366086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495033
4055	NC_014002	CCT	2	6	366193	366198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495034
4056	NC_014002	AGC	2	6	366403	366408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495034
4057	NC_014002	TAT	2	6	366439	366444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495034
4058	NC_014002	TGC	2	6	366781	366786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495034
4059	NC_014002	CTG	2	6	366903	366908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495034
4060	NC_014002	GGA	2	6	366934	366939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495034
4061	NC_014002	CTG	2	6	366950	366955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495034
4062	NC_014002	GCA	2	6	366989	366994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495034
4063	NC_014002	TAT	2	6	367075	367080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495034
4064	NC_014002	GCC	2	6	367359	367364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495035
4065	NC_014002	ACT	2	6	367367	367372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495035
4066	NC_014002	AGT	2	6	367547	367552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495035
4067	NC_014002	GAT	2	6	367575	367580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495035
4068	NC_014002	CAA	2	6	367660	367665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495035
4069	NC_014002	GGA	2	6	367844	367849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495035
4070	NC_014002	AAT	2	6	367852	367857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495035
4071	NC_014002	GGA	2	6	367871	367876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495036
4072	NC_014002	TAC	2	6	367891	367896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495036
4073	NC_014002	GGA	2	6	367920	367925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495036
4074	NC_014002	TAC	2	6	368001	368006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495036
4075	NC_014002	GAC	2	6	368012	368017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495036
4076	NC_014002	ACT	2	6	368040	368045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495036
4077	NC_014002	GGA	2	6	368104	368109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495036
4078	NC_014002	ATT	2	6	368210	368215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495037
4079	NC_014002	CAC	2	6	368232	368237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495037
4080	NC_014002	GGA	2	6	368251	368256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495037
4081	NC_014002	GCA	3	9	368351	368359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495037
4082	NC_014002	CCA	2	6	368379	368384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495037
4083	NC_014002	ATC	2	6	368502	368507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495037
4084	NC_014002	AGA	2	6	368605	368610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495037
4085	NC_014002	ATG	2	6	368621	368626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495037
4086	NC_014002	GCA	2	6	368812	368817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495037
4087	NC_014002	AGA	2	6	368848	368853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495037
4088	NC_014002	TGG	2	6	368893	368898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495037
4089	NC_014002	AGA	2	6	368920	368925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495037
4090	NC_014002	CAT	2	6	368932	368937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495037
4091	NC_014002	GGT	2	6	369212	369217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495037
4092	NC_014002	AGG	2	6	369315	369320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495037
4093	NC_014002	TTG	2	6	369323	369328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495037
4094	NC_014002	TGG	2	6	369383	369388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495038
4095	NC_014002	GTG	2	6	369722	369727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495038
4096	NC_014002	CCA	2	6	369746	369751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495038
4097	NC_014002	CAA	2	6	369752	369757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495038
4098	NC_014002	AAG	2	6	369880	369885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495038
4099	NC_014002	CTT	2	6	370273	370278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495039
4100	NC_014002	GTT	2	6	370398	370403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495039
4101	NC_014002	CAA	2	6	370488	370493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495039
4102	NC_014002	TTA	2	6	370523	370528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495039
4103	NC_014002	TTG	2	6	370739	370744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495039
4104	NC_014002	TGT	2	6	370833	370838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495039
4105	NC_014002	TAT	2	6	370974	370979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495040
4106	NC_014002	TTG	2	6	370988	370993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495040
4107	NC_014002	ACT	2	6	371009	371014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495040
4108	NC_014002	TGC	2	6	371019	371024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495040
4109	NC_014002	GAG	2	6	371029	371034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495040
4110	NC_014002	TTC	2	6	371201	371206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495040
4111	NC_014002	TGA	2	6	371277	371282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495040
4112	NC_014002	GAT	2	6	371341	371346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495040
4113	NC_014002	CAA	2	6	371433	371438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495040
4114	NC_014002	ATG	2	6	371501	371506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495040
4115	NC_014002	CTT	2	6	371612	371617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495040
4116	NC_014002	GAT	2	6	371806	371811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495040
4117	NC_014002	AAC	2	6	371964	371969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495040
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4119	NC_014002	TTA	2	6	372122	372127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495041
4120	NC_014002	CAT	2	6	372227	372232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495041
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4239	NC_014002	TCG	2	6	381219	381224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495048
4240	NC_014002	CTA	2	6	381238	381243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495048
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4344	NC_014002	TTC	2	6	389141	389146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495054
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4358	NC_014002	ATA	2	6	390387	390392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495054
4359	NC_014002	AGA	2	6	390680	390685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495055
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4369	NC_014002	ACT	2	6	391754	391759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495056
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4371	NC_014002	TTG	2	6	392013	392018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495056
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4475	NC_014002	GAA	2	6	402192	402197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495068
4476	NC_014002	GGT	2	6	402230	402235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495068
4477	NC_014002	AGG	2	6	402350	402355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495068
4478	NC_014002	CAA	2	6	402386	402391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495068
4479	NC_014002	GGA	2	6	402437	402442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495068
4480	NC_014002	TGA	3	9	402460	402468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495068
4481	NC_014002	CCA	2	6	402673	402678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495068
4482	NC_014002	TGA	2	6	402680	402685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495068
4483	NC_014002	GAT	2	6	402764	402769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495068
4484	NC_014002	ATG	2	6	402804	402809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495068
4485	NC_014002	CAT	2	6	402811	402816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495068
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4487	NC_014002	ACA	2	6	402957	402962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495068
4488	NC_014002	TGA	2	6	403016	403021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495068
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4490	NC_014002	TGA	2	6	403296	403301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495069
4491	NC_014002	TGA	2	6	403361	403366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495069
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