MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 22105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014002	TCT	2	6	319276	319281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494984
3502	NC_014002	GCT	2	6	319315	319320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494984
3503	NC_014002	TGC	2	6	319332	319337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494984
3504	NC_014002	TGG	2	6	319391	319396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494984
3505	NC_014002	GTA	2	6	319463	319468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494984
3506	NC_014002	GAT	3	9	319500	319508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494984
3507	NC_014002	TAT	2	6	319680	319685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494984
3508	NC_014002	CAT	2	6	319710	319715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494984
3509	NC_014002	AGT	2	6	319755	319760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494985
3510	NC_014002	TCT	2	6	319792	319797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494985
3511	NC_014002	TTC	2	6	319926	319931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494985
3512	NC_014002	TTC	2	6	319947	319952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494985
3513	NC_014002	TTC	2	6	319992	319997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494985
3514	NC_014002	CAC	2	6	320183	320188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494985
3515	NC_014002	TGA	2	6	320304	320309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494986
3516	NC_014002	GAT	2	6	320665	320670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494986
3517	NC_014002	CAG	2	6	320707	320712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494986
3518	NC_014002	TTC	2	6	320732	320737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494986
3519	NC_014002	AGA	2	6	320745	320750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494986
3520	NC_014002	TGC	3	9	320912	320920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494986
3521	NC_014002	CCG	2	6	320926	320931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494986
3522	NC_014002	GAT	2	6	320946	320951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494986
3523	NC_014002	ATT	2	6	321088	321093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494986
3524	NC_014002	GCA	2	6	321118	321123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494986
3525	NC_014002	CTT	2	6	321181	321186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494986
3526	NC_014002	GTG	2	6	321419	321424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494986
3527	NC_014002	TAA	2	6	321763	321768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494987
3528	NC_014002	GAT	2	6	321770	321775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494987
3529	NC_014002	GGT	2	6	321834	321839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494987
3530	NC_014002	ATC	2	6	321943	321948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494987
3531	NC_014002	ATA	2	6	321975	321980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494987
3532	NC_014002	GGT	2	6	322004	322009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494987
3533	NC_014002	CCA	2	6	322069	322074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494987
3534	NC_014002	TAT	2	6	322148	322153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494987
3535	NC_014002	TGA	2	6	322179	322184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494987
3536	NC_014002	GGT	2	6	322346	322351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494988
3537	NC_014002	TCC	2	6	322562	322567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494988
3538	NC_014002	CAT	2	6	322601	322606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494988
3539	NC_014002	CTT	2	6	322660	322665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494988
3540	NC_014002	CAT	2	6	322745	322750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494988
3541	NC_014002	TCA	2	6	322767	322772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494988
3542	NC_014002	TCA	2	6	322788	322793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494988
3543	NC_014002	AAG	2	6	322794	322799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494988
3544	NC_014002	CAC	2	6	322996	323001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494988
3545	NC_014002	ATT	2	6	323064	323069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494988
3546	NC_014002	GTA	2	6	323078	323083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494988
3547	NC_014002	CGC	2	6	323146	323151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494988
3548	NC_014002	GTA	2	6	323153	323158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494988
3549	NC_014002	TAA	2	6	323257	323262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494988
3550	NC_014002	ATA	2	6	323291	323296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494988
3551	NC_014002	GCT	2	6	323370	323375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494988
3552	NC_014002	TCT	2	6	323427	323432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494988
3553	NC_014002	TGG	2	6	323834	323839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494989
3554	NC_014002	CAT	2	6	323854	323859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494989
3555	NC_014002	ATA	2	6	324074	324079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494990
3556	NC_014002	GTT	2	6	324110	324115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494990
3557	NC_014002	TGG	2	6	324233	324238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494991
3558	NC_014002	TCA	2	6	324360	324365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494991
3559	NC_014002	TTC	2	6	324374	324379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494991
3560	NC_014002	TGC	2	6	324428	324433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494991
3561	NC_014002	TTG	2	6	324492	324497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494991
3562	NC_014002	TCT	2	6	324507	324512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494991
3563	NC_014002	TCA	2	6	324769	324774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494991
3564	NC_014002	CAG	2	6	324791	324796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494991
3565	NC_014002	TTG	2	6	324822	324827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494991
3566	NC_014002	GAT	2	6	324971	324976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494991
3567	NC_014002	AGG	2	6	325002	325007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494991
3568	NC_014002	CTG	2	6	325026	325031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494991
3569	NC_014002	CTG	3	9	325063	325071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494991
3570	NC_014002	ATC	2	6	325179	325184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494991
3571	NC_014002	ATT	2	6	325224	325229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494991
3572	NC_014002	CTC	2	6	325363	325368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494992
3573	NC_014002	TTG	2	6	325432	325437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494992
3574	NC_014002	ATG	2	6	325573	325578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494992
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3576	NC_014002	ATA	2	6	325935	325940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494992
3577	NC_014002	ATG	2	6	325999	326004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494992
3578	NC_014002	TCA	2	6	326051	326056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494992
3579	NC_014002	CAT	2	6	326073	326078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494992
3580	NC_014002	TTA	2	6	326106	326111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494992
3581	NC_014002	AAG	2	6	326148	326153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494992
3582	NC_014002	ATG	2	6	326203	326208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494992
3583	NC_014002	AGA	2	6	326377	326382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494992
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3585	NC_014002	GTT	2	6	326466	326471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494992
3586	NC_014002	GTT	2	6	326556	326561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494992
3587	NC_014002	TGT	2	6	326612	326617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494992
3588	NC_014002	TTG	2	6	326700	326705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494992
3589	NC_014002	TCT	2	6	326725	326730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494992
3590	NC_014002	AAC	2	6	327013	327018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494992
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3592	NC_014002	CAA	2	6	327123	327128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494992
3593	NC_014002	TTG	2	6	327247	327252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494993
3594	NC_014002	CGG	2	6	327281	327286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494993
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3598	NC_014002	TGA	2	6	327607	327612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494993
3599	NC_014002	TTG	2	6	327712	327717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494993
3600	NC_014002	AGA	2	6	328076	328081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494994
3601	NC_014002	TGC	2	6	328271	328276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494994
3602	NC_014002	CTG	2	6	328300	328305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494994
3603	NC_014002	GTG	2	6	328435	328440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494994
3604	NC_014002	GAG	2	6	328461	328466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494994
3605	NC_014002	ATC	2	6	328481	328486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494994
3606	NC_014002	AAT	2	6	328508	328513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494994
3607	NC_014002	CTG	2	6	328605	328610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494994
3608	NC_014002	TGA	2	6	328661	328666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494994
3609	NC_014002	TCT	2	6	328685	328690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494994
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3611	NC_014002	TTG	2	6	328836	328841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494994
3612	NC_014002	TTG	2	6	328978	328983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494994
3613	NC_014002	TCT	2	6	329042	329047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494994
3614	NC_014002	GAA	2	6	329208	329213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494994
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3616	NC_014002	TAT	2	6	329494	329499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494994
3617	NC_014002	GGT	2	6	329602	329607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494995
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3619	NC_014002	GAA	2	6	329834	329839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494995
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3856	NC_014002	TCC	2	6	350164	350169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495016
3857	NC_014002	TGG	2	6	350241	350246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495016
3858	NC_014002	GAT	2	6	350255	350260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495016
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3864	NC_014002	CAT	2	6	350467	350472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495016
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3884	NC_014002	TTC	2	6	352011	352016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495018
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3977	NC_014002	CTG	2	6	359497	359502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495025
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