MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 22105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014002	GGA	2	6	47218	47223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494732
502	NC_014002	CTG	2	6	47276	47281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494732
503	NC_014002	GCT	2	6	47293	47298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494732
504	NC_014002	ATT	2	6	47429	47434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494732
505	NC_014002	TAC	2	6	47526	47531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494732
506	NC_014002	TAC	2	6	47557	47562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494732
507	NC_014002	TAT	2	6	47614	47619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494732
508	NC_014002	CAG	2	6	47735	47740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494733
509	NC_014002	AGA	2	6	47743	47748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494733
510	NC_014002	GAA	3	9	47801	47809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494733
511	NC_014002	TCT	2	6	48073	48078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494733
512	NC_014002	ATT	2	6	48146	48151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494733
513	NC_014002	ACA	2	6	48245	48250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494733
514	NC_014002	TAT	2	6	48281	48286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494733
515	NC_014002	ACT	2	6	48430	48435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494733
516	NC_014002	TTC	2	6	48458	48463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494733
517	NC_014002	TGA	2	6	48515	48520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494734
518	NC_014002	AAT	2	6	48561	48566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494734
519	NC_014002	CGG	2	6	48602	48607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494734
520	NC_014002	ATT	2	6	48609	48614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494734
521	NC_014002	AGA	2	6	48654	48659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494734
522	NC_014002	TGA	2	6	48959	48964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494734
523	NC_014002	GCA	2	6	49072	49077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494734
524	NC_014002	ATG	2	6	49219	49224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494734
525	NC_014002	TCA	2	6	49379	49384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494734
526	NC_014002	AGT	2	6	49489	49494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494735
527	NC_014002	CTC	2	6	49524	49529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494735
528	NC_014002	CTT	2	6	49572	49577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494735
529	NC_014002	ATC	2	6	49599	49604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494735
530	NC_014002	TGC	2	6	49636	49641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494735
531	NC_014002	TGA	2	6	49749	49754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494735
532	NC_014002	ATG	2	6	49940	49945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494735
533	NC_014002	TCA	2	6	49972	49977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494735
534	NC_014002	ATC	2	6	50080	50085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494735
535	NC_014002	ATG	2	6	50102	50107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494735
536	NC_014002	GCC	2	6	50118	50123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494735
537	NC_014002	TAA	2	6	50175	50180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494735
538	NC_014002	GTT	2	6	50257	50262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494735
539	NC_014002	TCA	2	6	50305	50310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494736
540	NC_014002	GAA	2	6	50474	50479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494736
541	NC_014002	CTG	2	6	50936	50941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494736
542	NC_014002	ATA	2	6	51259	51264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494737
543	NC_014002	TAA	2	6	51278	51283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494737
544	NC_014002	AAC	2	6	51326	51331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494737
545	NC_014002	GAT	2	6	51449	51454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494737
546	NC_014002	AGA	2	6	51593	51598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494737
547	NC_014002	TTG	2	6	51859	51864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494737
548	NC_014002	CAT	2	6	52029	52034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494738
549	NC_014002	TGA	2	6	52197	52202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494738
550	NC_014002	CAA	2	6	52261	52266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494738
551	NC_014002	CTT	2	6	52393	52398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494738
552	NC_014002	GTA	2	6	52499	52504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494738
553	NC_014002	ATC	2	6	52637	52642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494738
554	NC_014002	TAT	2	6	52659	52664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494738
555	NC_014002	AAT	2	6	53042	53047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494739
556	NC_014002	GTA	2	6	53143	53148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494739
557	NC_014002	ATT	2	6	53155	53160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494739
558	NC_014002	ATG	3	9	53317	53325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494739
559	NC_014002	AAG	2	6	53416	53421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494739
560	NC_014002	GAT	2	6	53502	53507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494739
561	NC_014002	GTG	2	6	53559	53564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494739
562	NC_014002	AAC	2	6	53596	53601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494739
563	NC_014002	TTA	2	6	53735	53740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494739
564	NC_014002	CAA	2	6	53947	53952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494739
565	NC_014002	GAT	2	6	53970	53975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494739
566	NC_014002	ACA	2	6	53983	53988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494739
567	NC_014002	TGA	2	6	54053	54058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494739
568	NC_014002	TGC	2	6	54064	54069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494739
569	NC_014002	TAC	2	6	54096	54101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494739
570	NC_014002	CTG	2	6	54144	54149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494739
571	NC_014002	AAC	2	6	54248	54253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494739
572	NC_014002	GAT	2	6	54441	54446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494739
573	NC_014002	CCA	2	6	54564	54569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494739
574	NC_014002	TAA	2	6	54661	54666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494739
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576	NC_014002	TTG	2	6	55135	55140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494740
577	NC_014002	TGA	2	6	55441	55446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494740
578	NC_014002	GCC	2	6	55547	55552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494740
579	NC_014002	GCA	2	6	55764	55769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494740
580	NC_014002	AGG	2	6	55826	55831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494740
581	NC_014002	CTT	2	6	55863	55868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494740
582	NC_014002	TTC	2	6	55884	55889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494740
583	NC_014002	GAT	2	6	55955	55960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494740
584	NC_014002	TGA	2	6	56029	56034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494740
585	NC_014002	AGT	2	6	56112	56117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494740
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587	NC_014002	CAT	2	6	56715	56720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494741
588	NC_014002	TGC	2	6	56823	56828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494741
589	NC_014002	ATT	2	6	56914	56919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494741
590	NC_014002	GTT	2	6	57121	57126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494741
591	NC_014002	GAT	2	6	57166	57171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494741
592	NC_014002	TCA	2	6	57176	57181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494741
593	NC_014002	TAT	2	6	57366	57371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494741
594	NC_014002	GCC	2	6	57751	57756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494742
595	NC_014002	ATG	2	6	57851	57856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494742
596	NC_014002	AAT	2	6	58096	58101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494742
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598	NC_014002	AGA	2	6	58397	58402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494742
599	NC_014002	AAT	2	6	58497	58502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494742
600	NC_014002	CTG	2	6	58546	58551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494742
601	NC_014002	GCC	2	6	58585	58590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494742
602	NC_014002	TGT	2	6	58731	58736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494742
603	NC_014002	TCT	2	6	58845	58850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494742
604	NC_014002	TCA	2	6	58907	58912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494742
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606	NC_014002	TAT	2	6	59008	59013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494742
607	NC_014002	CGG	2	6	59039	59044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494742
608	NC_014002	TGC	2	6	59100	59105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494742
609	NC_014002	AGG	2	6	59210	59215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494742
610	NC_014002	CCA	2	6	59306	59311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494742
611	NC_014002	GCT	2	6	59352	59357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494742
612	NC_014002	TAT	2	6	59362	59367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494742
613	NC_014002	ATC	2	6	59464	59469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494743
614	NC_014002	GCA	2	6	59785	59790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494743
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616	NC_014002	ATG	2	6	60132	60137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494743
617	NC_014002	GCA	2	6	60217	60222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494743
618	NC_014002	GCA	2	6	60422	60427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494743
619	NC_014002	GTT	2	6	60473	60478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494743
620	NC_014002	ACC	2	6	60494	60499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494743
621	NC_014002	ATG	2	6	60572	60577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494743
622	NC_014002	TAC	2	6	60586	60591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494743
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624	NC_014002	GGA	2	6	60685	60690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494743
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998	NC_014002	GAT	2	6	96980	96985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494779
999	NC_014002	AAT	2	6	97013	97018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494779
1000	NC_014002	CTA	2	6	97060	97065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494779

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