MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 2847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	TTCCT	2	10	1265	1274	0 %	60 %	0 %	40 %	20088900
2	NC_003552	GTAAA	2	10	7728	7737	60 %	20 %	20 %	0 %	20088903
3	NC_003552	TTCCT	2	10	10220	10229	0 %	60 %	0 %	40 %	20088905
4	NC_003552	TTTAT	2	10	11351	11360	20 %	80 %	0 %	0 %	20088906
5	NC_003552	CTTTT	2	10	11417	11426	0 %	80 %	0 %	20 %	20088906
6	NC_003552	ATATC	2	10	12296	12305	40 %	40 %	0 %	20 %	20088906
7	NC_003552	TCAGA	2	10	12440	12449	40 %	20 %	20 %	20 %	20088906
8	NC_003552	TGAAG	2	10	13249	13258	40 %	20 %	40 %	0 %	20088907
9	NC_003552	AGGGA	2	10	15744	15753	40 %	0 %	60 %	0 %	20088909
10	NC_003552	TTTTC	2	10	17773	17782	0 %	80 %	0 %	20 %	20088911
11	NC_003552	CATAT	2	10	17870	17879	40 %	40 %	0 %	20 %	20088911
12	NC_003552	TCTTT	2	10	20851	20860	0 %	80 %	0 %	20 %	20088913
13	NC_003552	CTTTT	2	10	20953	20962	0 %	80 %	0 %	20 %	20088913
14	NC_003552	TCTTT	2	10	21001	21010	0 %	80 %	0 %	20 %	20088913
15	NC_003552	AAATC	2	10	26804	26813	60 %	20 %	0 %	20 %	20088918
16	NC_003552	ATGCA	2	10	27187	27196	40 %	20 %	20 %	20 %	20088918
17	NC_003552	CAGAC	2	10	27424	27433	40 %	0 %	20 %	40 %	20088918
18	NC_003552	GTGAA	2	10	29452	29461	40 %	20 %	40 %	0 %	20088920
19	NC_003552	ATTGA	2	10	31458	31467	40 %	40 %	20 %	0 %	20088922
20	NC_003552	TTTCC	2	10	41934	41943	0 %	60 %	0 %	40 %	20088930
21	NC_003552	GATAG	2	10	43297	43306	40 %	20 %	40 %	0 %	20088931
22	NC_003552	AGCCG	2	10	45387	45396	20 %	0 %	40 %	40 %	20088934
23	NC_003552	CTCTG	2	10	47644	47653	0 %	40 %	20 %	40 %	20088936
24	NC_003552	CAGGA	2	10	48457	48466	40 %	0 %	40 %	20 %	20088936
25	NC_003552	AAAAC	2	10	58369	58378	80 %	0 %	0 %	20 %	20088946
26	NC_003552	CCTGT	2	10	60179	60188	0 %	40 %	20 %	40 %	20088949
27	NC_003552	GCAGG	2	10	60850	60859	20 %	0 %	60 %	20 %	20088949
28	NC_003552	AATTT	2	10	63812	63821	40 %	60 %	0 %	0 %	20088951
29	NC_003552	AGGAA	2	10	71126	71135	60 %	0 %	40 %	0 %	20088960
30	NC_003552	TGGAC	2	10	78460	78469	20 %	20 %	40 %	20 %	20088967
31	NC_003552	CTTTC	2	10	80509	80518	0 %	60 %	0 %	40 %	20088968
32	NC_003552	CAACC	2	10	81558	81567	40 %	0 %	0 %	60 %	20088970
33	NC_003552	CTTTT	2	10	83867	83876	0 %	80 %	0 %	20 %	20088971
34	NC_003552	TTCTT	2	10	86954	86963	0 %	80 %	0 %	20 %	20088974
35	NC_003552	GCAGT	2	10	87278	87287	20 %	20 %	40 %	20 %	20088974
36	NC_003552	AGACC	2	10	88230	88239	40 %	0 %	20 %	40 %	20088975
37	NC_003552	CTGGG	2	10	88465	88474	0 %	20 %	60 %	20 %	20088975
38	NC_003552	CAGGG	2	10	90154	90163	20 %	0 %	60 %	20 %	20088976
39	NC_003552	TAAAA	2	10	91116	91125	80 %	20 %	0 %	0 %	20088977
40	NC_003552	AAAGG	2	10	95138	95147	60 %	0 %	40 %	0 %	20088979
41	NC_003552	CGAAG	2	10	96471	96480	40 %	0 %	40 %	20 %	20088979
42	NC_003552	TCTTT	2	10	99855	99864	0 %	80 %	0 %	20 %	20088981
43	NC_003552	TCTTT	2	10	99911	99920	0 %	80 %	0 %	20 %	20088981
44	NC_003552	TTTCC	2	10	99962	99971	0 %	60 %	0 %	40 %	20088981
45	NC_003552	TTCTT	2	10	102885	102894	0 %	80 %	0 %	20 %	20088983
46	NC_003552	AAAAT	2	10	103638	103647	80 %	20 %	0 %	0 %	20088983
47	NC_003552	GCTTC	2	10	113591	113600	0 %	40 %	20 %	40 %	20088989
48	NC_003552	ATCTT	2	10	114791	114800	20 %	60 %	0 %	20 %	20088990
49	NC_003552	TCTGT	2	10	120606	120615	0 %	60 %	20 %	20 %	20088995
50	NC_003552	TTGAT	2	10	123119	123128	20 %	60 %	20 %	0 %	20088996
51	NC_003552	TTTGC	2	10	123179	123188	0 %	60 %	20 %	20 %	20088996
52	NC_003552	AAAAG	2	10	126190	126199	80 %	0 %	20 %	0 %	20088998
53	NC_003552	TGAGA	2	10	127027	127036	40 %	20 %	40 %	0 %	20089000
54	NC_003552	GTCCT	2	10	129414	129423	0 %	40 %	20 %	40 %	20089002
55	NC_003552	TCTGT	2	10	134634	134643	0 %	60 %	20 %	20 %	20089006
56	NC_003552	AGTAC	2	10	135213	135222	40 %	20 %	20 %	20 %	20089007
57	NC_003552	ATTTC	2	10	135646	135655	20 %	60 %	0 %	20 %	20089008
58	NC_003552	CCCTG	2	10	136275	136284	0 %	20 %	20 %	60 %	20089008
59	NC_003552	GTTTC	2	10	136429	136438	0 %	60 %	20 %	20 %	20089008
60	NC_003552	ATTCT	2	10	136764	136773	20 %	60 %	0 %	20 %	20089009
61	NC_003552	GGGTG	2	10	139578	139587	0 %	20 %	80 %	0 %	20089013
62	NC_003552	ACAGA	2	10	139739	139748	60 %	0 %	20 %	20 %	20089013
63	NC_003552	GCTTT	2	10	141088	141097	0 %	60 %	20 %	20 %	20089015
64	NC_003552	GAAAA	2	10	141712	141721	80 %	0 %	20 %	0 %	20089015
65	NC_003552	AAATA	2	10	142040	142049	80 %	20 %	0 %	0 %	20089016
66	NC_003552	TTCAG	2	10	142175	142184	20 %	40 %	20 %	20 %	20089016
67	NC_003552	TTCCT	2	10	144717	144726	0 %	60 %	0 %	40 %	20089018
68	NC_003552	AATAA	2	10	148673	148682	80 %	20 %	0 %	0 %	20089021
69	NC_003552	GGATG	2	10	150539	150548	20 %	20 %	60 %	0 %	20089023
70	NC_003552	TTACC	2	10	151029	151038	20 %	40 %	0 %	40 %	20089023
71	NC_003552	TTATT	2	10	152362	152371	20 %	80 %	0 %	0 %	20089025
72	NC_003552	AAATG	2	10	160446	160455	60 %	20 %	20 %	0 %	20089032
73	NC_003552	CAGGG	2	10	166703	166712	20 %	0 %	60 %	20 %	20089038
74	NC_003552	GGACC	2	10	171673	171682	20 %	0 %	40 %	40 %	20089042
75	NC_003552	ACTTT	2	10	177449	177458	20 %	60 %	0 %	20 %	20089047
76	NC_003552	TCCTC	2	10	184024	184033	0 %	40 %	0 %	60 %	20089051
77	NC_003552	CTGTG	2	10	187263	187272	0 %	40 %	40 %	20 %	161484944
78	NC_003552	CTTCT	2	10	193371	193380	0 %	60 %	0 %	40 %	20089061
79	NC_003552	TGGAA	2	10	198222	198231	40 %	20 %	40 %	0 %	20089064
80	NC_003552	GGAAT	2	10	198430	198439	40 %	20 %	40 %	0 %	20089064
81	NC_003552	AGTTC	2	10	199769	199778	20 %	40 %	20 %	20 %	20089064
82	NC_003552	AGGGC	2	10	202656	202665	20 %	0 %	60 %	20 %	20089067
83	NC_003552	TCGGT	2	10	204844	204853	0 %	40 %	40 %	20 %	20089069
84	NC_003552	GGGTC	2	10	204994	205003	0 %	20 %	60 %	20 %	20089069
85	NC_003552	TGCCT	2	10	205658	205667	0 %	40 %	20 %	40 %	20089069
86	NC_003552	CCCAT	2	10	211057	211066	20 %	20 %	0 %	60 %	20089074
87	NC_003552	TGTTT	2	10	211306	211315	0 %	80 %	20 %	0 %	20089075
88	NC_003552	AAAGA	2	10	214137	214146	80 %	0 %	20 %	0 %	20089078
89	NC_003552	CACAA	2	10	215242	215251	60 %	0 %	0 %	40 %	20089079
90	NC_003552	GTTCG	2	10	220843	220852	0 %	40 %	40 %	20 %	20089084
91	NC_003552	AAACG	2	10	221396	221405	60 %	0 %	20 %	20 %	20089084
92	NC_003552	AAAGG	2	10	222074	222083	60 %	0 %	40 %	0 %	20089085
93	NC_003552	CTTTT	2	10	222489	222498	0 %	80 %	0 %	20 %	20089086
94	NC_003552	CTTTT	2	10	223119	223128	0 %	80 %	0 %	20 %	20089086
95	NC_003552	AATCC	2	10	225482	225491	40 %	20 %	0 %	40 %	20089087
96	NC_003552	GCAAA	2	10	225806	225815	60 %	0 %	20 %	20 %	20089087
97	NC_003552	GTCCG	2	10	225923	225932	0 %	20 %	40 %	40 %	20089087
98	NC_003552	TGGCG	2	10	229326	229335	0 %	20 %	60 %	20 %	20089088
99	NC_003552	GTTCT	2	10	230326	230335	0 %	60 %	20 %	20 %	20089089
100	NC_003552	TCAAG	2	10	230463	230472	40 %	20 %	20 %	20 %	20089089
101	NC_003552	TGGGG	2	10	235805	235814	0 %	20 %	80 %	0 %	20089093
102	NC_003552	TCCTG	2	10	236933	236942	0 %	40 %	20 %	40 %	20089094
103	NC_003552	TTTCA	2	10	237218	237227	20 %	60 %	0 %	20 %	20089095
104	NC_003552	CTGTT	2	10	239478	239487	0 %	60 %	20 %	20 %	20089097
105	NC_003552	GTTTT	2	10	240682	240691	0 %	80 %	20 %	0 %	20089098
106	NC_003552	TGTCT	2	10	241670	241679	0 %	60 %	20 %	20 %	20089099
107	NC_003552	TTCGA	2	10	243447	243456	20 %	40 %	20 %	20 %	20089101
108	NC_003552	AAGCT	2	10	245047	245056	40 %	20 %	20 %	20 %	20089101
109	NC_003552	TGAGG	2	10	247403	247412	20 %	20 %	60 %	0 %	20089102
110	NC_003552	GGTTG	2	10	249330	249339	0 %	40 %	60 %	0 %	20089103
111	NC_003552	TTAGA	2	10	251336	251345	40 %	40 %	20 %	0 %	20089104
112	NC_003552	TCAGG	2	10	255426	255435	20 %	20 %	40 %	20 %	20089109
113	NC_003552	TTTTC	2	10	257023	257032	0 %	80 %	0 %	20 %	20089110
114	NC_003552	GCCTC	2	10	257765	257774	0 %	20 %	20 %	60 %	20089111
115	NC_003552	TTGAA	2	10	264804	264813	40 %	40 %	20 %	0 %	20089117
116	NC_003552	CTTTT	2	10	265980	265989	0 %	80 %	0 %	20 %	20089118
117	NC_003552	GCCGT	2	10	266187	266196	0 %	20 %	40 %	40 %	20089118
118	NC_003552	CTGCA	2	10	266380	266389	20 %	20 %	20 %	40 %	20089119
119	NC_003552	TCCGT	2	10	267102	267111	0 %	40 %	20 %	40 %	20089119
120	NC_003552	TTTGA	2	10	268802	268811	20 %	60 %	20 %	0 %	20089120
121	NC_003552	CTGAT	2	10	269631	269640	20 %	40 %	20 %	20 %	20089121
122	NC_003552	TAAAT	2	10	270831	270840	60 %	40 %	0 %	0 %	20089122
123	NC_003552	AGGAA	2	10	274634	274643	60 %	0 %	40 %	0 %	20089126
124	NC_003552	CATTC	2	10	276587	276596	20 %	40 %	0 %	40 %	20089128
125	NC_003552	TTTTA	2	10	277230	277239	20 %	80 %	0 %	0 %	20089129
126	NC_003552	GATAA	2	10	278858	278867	60 %	20 %	20 %	0 %	20089131
127	NC_003552	CTTTT	2	10	281665	281674	0 %	80 %	0 %	20 %	20089132
128	NC_003552	AAGTG	2	10	282447	282456	40 %	20 %	40 %	0 %	20089133
129	NC_003552	GCAGC	2	10	284441	284450	20 %	0 %	40 %	40 %	20089135
130	NC_003552	TGGAG	2	10	285578	285587	20 %	20 %	60 %	0 %	20089137
131	NC_003552	CGGAA	2	10	285921	285930	40 %	0 %	40 %	20 %	20089138
132	NC_003552	GAAGG	2	10	286468	286477	40 %	0 %	60 %	0 %	20089138
133	NC_003552	TTCCT	2	10	287566	287575	0 %	60 %	0 %	40 %	20089139
134	NC_003552	TTCAA	2	10	288102	288111	40 %	40 %	0 %	20 %	20089139
135	NC_003552	TCGGT	2	10	291894	291903	0 %	40 %	40 %	20 %	20089142
136	NC_003552	TACAT	2	10	291953	291962	40 %	40 %	0 %	20 %	20089142
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