MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 2847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003552	AGTAA	2	10	5086364	5086373	60 %	20 %	20 %	0 %	20092959
2502	NC_003552	TTAAT	2	10	5090408	5090417	40 %	60 %	0 %	0 %	20092961
2503	NC_003552	TTGAG	2	10	5097621	5097630	20 %	40 %	40 %	0 %	20092967
2504	NC_003552	TCCTG	2	10	5098055	5098064	0 %	40 %	20 %	40 %	20092967
2505	NC_003552	ACTCC	2	10	5098835	5098844	20 %	20 %	0 %	60 %	20092968
2506	NC_003552	CTCTC	2	10	5101344	5101353	0 %	40 %	0 %	60 %	20092970
2507	NC_003552	GACAG	2	10	5101977	5101986	40 %	0 %	40 %	20 %	20092971
2508	NC_003552	TTGCT	2	10	5103673	5103682	0 %	60 %	20 %	20 %	20092973
2509	NC_003552	ACAGT	2	10	5106008	5106017	40 %	20 %	20 %	20 %	20092975
2510	NC_003552	ATCTG	2	10	5107705	5107714	20 %	40 %	20 %	20 %	20092976
2511	NC_003552	CTGTC	2	10	5114581	5114590	0 %	40 %	20 %	40 %	20092980
2512	NC_003552	CATAA	2	10	5119153	5119162	60 %	20 %	0 %	20 %	20092986
2513	NC_003552	CCAGT	2	10	5122609	5122618	20 %	20 %	20 %	40 %	20092990
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2516	NC_003552	TCCTT	2	10	5127438	5127447	0 %	60 %	0 %	40 %	20092995
2517	NC_003552	CCTGC	2	10	5127589	5127598	0 %	20 %	20 %	60 %	20092995
2518	NC_003552	GAAAA	2	10	5128545	5128554	80 %	0 %	20 %	0 %	20092996
2519	NC_003552	AGGTA	2	10	5128853	5128862	40 %	20 %	40 %	0 %	20092996
2520	NC_003552	TATCT	2	10	5129204	5129213	20 %	60 %	0 %	20 %	20092997
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2522	NC_003552	GGAGC	2	10	5131487	5131496	20 %	0 %	60 %	20 %	20092998
2523	NC_003552	CCCTT	2	10	5131869	5131878	0 %	40 %	0 %	60 %	20092998
2524	NC_003552	CAAAA	2	10	5132812	5132821	80 %	0 %	0 %	20 %	20093000
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2530	NC_003552	AGAAA	2	10	5144181	5144190	80 %	0 %	20 %	0 %	20093010
2531	NC_003552	ATTTT	2	10	5146935	5146944	20 %	80 %	0 %	0 %	20093012
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2534	NC_003552	TATCT	2	10	5151147	5151156	20 %	60 %	0 %	20 %	20093017
2535	NC_003552	TTTGT	2	10	5151647	5151656	0 %	80 %	20 %	0 %	20093018
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2537	NC_003552	GAGAG	2	10	5156010	5156019	40 %	0 %	60 %	0 %	20093022
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2541	NC_003552	AACCG	2	10	5158145	5158154	40 %	0 %	20 %	40 %	20093024
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2547	NC_003552	GGAAA	2	10	5176088	5176097	60 %	0 %	40 %	0 %	20093042
2548	NC_003552	AGGTG	2	10	5176740	5176749	20 %	20 %	60 %	0 %	20093042
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2554	NC_003552	ACTTG	2	10	5203725	5203734	20 %	40 %	20 %	20 %	20093072
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2559	NC_003552	GTTCA	2	10	5214936	5214945	20 %	40 %	20 %	20 %	20093074
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2561	NC_003552	CCGGG	2	10	5216848	5216857	0 %	0 %	60 %	40 %	20093074
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2596	NC_003552	GTGTG	2	10	5275739	5275748	0 %	40 %	60 %	0 %	20093090
2597	NC_003552	CCAAT	2	10	5276544	5276553	40 %	20 %	0 %	40 %	20093090
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.