MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 2847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003552	AAAAT	2	10	3026899	3026908	80 %	20 %	0 %	0 %	20091269
1502	NC_003552	TCACG	2	10	3027304	3027313	20 %	20 %	20 %	40 %	20091270
1503	NC_003552	CCGAG	2	10	3029173	3029182	20 %	0 %	40 %	40 %	20091272
1504	NC_003552	CATTT	2	10	3031897	3031906	20 %	60 %	0 %	20 %	20091275
1505	NC_003552	CCCTG	2	10	3035153	3035162	0 %	20 %	20 %	60 %	20091278
1506	NC_003552	AGCTG	2	10	3038861	3038870	20 %	20 %	40 %	20 %	20091280
1507	NC_003552	AATAA	2	10	3044200	3044209	80 %	20 %	0 %	0 %	20091284
1508	NC_003552	GCAAT	2	10	3051166	3051175	40 %	20 %	20 %	20 %	20091289
1509	NC_003552	CTTTA	2	10	3051620	3051629	20 %	60 %	0 %	20 %	20091289
1510	NC_003552	CCGTA	2	10	3051695	3051704	20 %	20 %	20 %	40 %	20091289
1511	NC_003552	ATCCT	2	10	3052743	3052752	20 %	40 %	0 %	40 %	20091289
1512	NC_003552	GGAAG	2	10	3054666	3054675	40 %	0 %	60 %	0 %	20091290
1513	NC_003552	TTTTC	2	10	3055106	3055115	0 %	80 %	0 %	20 %	20091291
1514	NC_003552	GGGAT	2	10	3056631	3056640	20 %	20 %	60 %	0 %	20091293
1515	NC_003552	CTTCA	2	10	3057805	3057814	20 %	40 %	0 %	40 %	20091294
1516	NC_003552	TGAAT	2	10	3058836	3058845	40 %	40 %	20 %	0 %	20091295
1517	NC_003552	CAAAA	2	10	3062123	3062132	80 %	0 %	0 %	20 %	20091298
1518	NC_003552	TCTTT	2	10	3062163	3062172	0 %	80 %	0 %	20 %	20091298
1519	NC_003552	CTTTT	2	10	3066965	3066974	0 %	80 %	0 %	20 %	20091303
1520	NC_003552	CTACC	2	10	3069859	3069868	20 %	20 %	0 %	60 %	20091305
1521	NC_003552	TCGAG	2	10	3073849	3073858	20 %	20 %	40 %	20 %	20091308
1522	NC_003552	TCGAA	2	10	3074691	3074700	40 %	20 %	20 %	20 %	20091308
1523	NC_003552	GTCTC	2	10	3074805	3074814	0 %	40 %	20 %	40 %	20091308
1524	NC_003552	TCTCA	2	10	3080389	3080398	20 %	40 %	0 %	40 %	20091313
1525	NC_003552	ACCCG	2	10	3083298	3083307	20 %	0 %	20 %	60 %	20091317
1526	NC_003552	CTGGA	2	10	3085233	3085242	20 %	20 %	40 %	20 %	20091318
1527	NC_003552	TGTTT	2	10	3088608	3088617	0 %	80 %	20 %	0 %	20091322
1528	NC_003552	AAAGT	2	10	3093475	3093484	60 %	20 %	20 %	0 %	20091325
1529	NC_003552	AAAAG	2	10	3094596	3094605	80 %	0 %	20 %	0 %	20091326
1530	NC_003552	TGAAA	2	10	3096793	3096802	60 %	20 %	20 %	0 %	20091329
1531	NC_003552	TATTC	2	10	3099319	3099328	20 %	60 %	0 %	20 %	20091331
1532	NC_003552	GCCAT	2	10	3099999	3100008	20 %	20 %	20 %	40 %	20091332
1533	NC_003552	GCCTC	2	10	3100887	3100896	0 %	20 %	20 %	60 %	20091332
1534	NC_003552	ACCCC	2	10	3105156	3105165	20 %	0 %	0 %	80 %	20091334
1535	NC_003552	CCCCG	2	10	3110253	3110262	0 %	0 %	20 %	80 %	20091338
1536	NC_003552	ATCGG	2	10	3111520	3111529	20 %	20 %	40 %	20 %	20091338
1537	NC_003552	CCCAG	2	10	3111665	3111674	20 %	0 %	20 %	60 %	20091338
1538	NC_003552	GAATG	2	10	3112100	3112109	40 %	20 %	40 %	0 %	20091338
1539	NC_003552	AACTC	2	10	3113597	3113606	40 %	20 %	0 %	40 %	20091339
1540	NC_003552	AGGAA	2	10	3114296	3114305	60 %	0 %	40 %	0 %	20091340
1541	NC_003552	GGGCA	2	10	3116046	3116055	20 %	0 %	60 %	20 %	20091341
1542	NC_003552	GCTTT	2	10	3122162	3122171	0 %	60 %	20 %	20 %	20091344
1543	NC_003552	ATATT	2	10	3127748	3127757	40 %	60 %	0 %	0 %	20091346
1544	NC_003552	GTTTT	2	10	3127977	3127986	0 %	80 %	20 %	0 %	20091346
1545	NC_003552	TTTTC	2	10	3128317	3128326	0 %	80 %	0 %	20 %	20091346
1546	NC_003552	TTTAT	2	10	3129879	3129888	20 %	80 %	0 %	0 %	20091347
1547	NC_003552	TGCCC	2	10	3130953	3130962	0 %	20 %	20 %	60 %	20091348
1548	NC_003552	TTTCT	2	10	3137615	3137624	0 %	80 %	0 %	20 %	20091353
1549	NC_003552	TTCTG	2	10	3138096	3138105	0 %	60 %	20 %	20 %	20091353
1550	NC_003552	AATTG	2	10	3140457	3140466	40 %	40 %	20 %	0 %	20091354
1551	NC_003552	TAAAA	2	10	3142758	3142767	80 %	20 %	0 %	0 %	20091355
1552	NC_003552	TCATA	2	10	3144507	3144516	40 %	40 %	0 %	20 %	20091356
1553	NC_003552	GATCA	2	10	3146953	3146962	40 %	20 %	20 %	20 %	20091358
1554	NC_003552	CATTT	2	10	3147190	3147199	20 %	60 %	0 %	20 %	20091359
1555	NC_003552	CGCTT	2	10	3150129	3150138	0 %	40 %	20 %	40 %	20091361
1556	NC_003552	TCGGT	2	10	3151157	3151166	0 %	40 %	40 %	20 %	20091363
1557	NC_003552	TATCA	2	10	3151642	3151651	40 %	40 %	0 %	20 %	20091363
1558	NC_003552	ACCTG	2	10	3151899	3151908	20 %	20 %	20 %	40 %	20091363
1559	NC_003552	CGGTT	2	10	3154108	3154117	0 %	40 %	40 %	20 %	20091364
1560	NC_003552	TTGTT	2	10	3154791	3154800	0 %	80 %	20 %	0 %	20091365
1561	NC_003552	TTTCA	2	10	3162185	3162194	20 %	60 %	0 %	20 %	20091370
1562	NC_003552	CAAAG	2	10	3162956	3162965	60 %	0 %	20 %	20 %	20091370
1563	NC_003552	GAAAG	2	10	3172000	3172009	60 %	0 %	40 %	0 %	20091376
1564	NC_003552	CCTGA	2	10	3173268	3173277	20 %	20 %	20 %	40 %	20091377
1565	NC_003552	AGAAA	2	10	3173540	3173549	80 %	0 %	20 %	0 %	20091378
1566	NC_003552	TGAAT	2	10	3174873	3174882	40 %	40 %	20 %	0 %	20091379
1567	NC_003552	CCTTT	2	10	3179786	3179795	0 %	60 %	0 %	40 %	20091382
1568	NC_003552	GCTCA	2	10	3179989	3179998	20 %	20 %	20 %	40 %	20091382
1569	NC_003552	ACCTT	2	10	3180744	3180753	20 %	40 %	0 %	40 %	20091382
1570	NC_003552	CAAAA	2	10	3181222	3181231	80 %	0 %	0 %	20 %	20091382
1571	NC_003552	GGTAA	2	10	3182174	3182183	40 %	20 %	40 %	0 %	20091383
1572	NC_003552	AAGGA	2	10	3182525	3182534	60 %	0 %	40 %	0 %	20091383
1573	NC_003552	CCTGA	2	10	3183723	3183732	20 %	20 %	20 %	40 %	20091385
1574	NC_003552	GTACA	2	10	3189184	3189193	40 %	20 %	20 %	20 %	20091390
1575	NC_003552	AATTC	2	10	3189204	3189213	40 %	40 %	0 %	20 %	20091390
1576	NC_003552	TAAAA	2	10	3189507	3189516	80 %	20 %	0 %	0 %	20091391
1577	NC_003552	TATCT	2	10	3190915	3190924	20 %	60 %	0 %	20 %	20091392
1578	NC_003552	ACTTT	2	10	3191899	3191908	20 %	60 %	0 %	20 %	20091393
1579	NC_003552	AGTGG	2	10	3193571	3193580	20 %	20 %	60 %	0 %	20091394
1580	NC_003552	AAGAT	2	10	3193666	3193675	60 %	20 %	20 %	0 %	20091394
1581	NC_003552	CGTTG	2	10	3194000	3194009	0 %	40 %	40 %	20 %	20091394
1582	NC_003552	ATGAA	2	10	3197278	3197287	60 %	20 %	20 %	0 %	20091396
1583	NC_003552	CTCCA	2	10	3199042	3199051	20 %	20 %	0 %	60 %	20091397
1584	NC_003552	GGCAA	2	10	3200094	3200103	40 %	0 %	40 %	20 %	20091398
1585	NC_003552	AAATC	2	10	3202977	3202986	60 %	20 %	0 %	20 %	20091401
1586	NC_003552	GAAAG	2	10	3202989	3202998	60 %	0 %	40 %	0 %	20091401
1587	NC_003552	AGACA	2	10	3208975	3208984	60 %	0 %	20 %	20 %	20091406
1588	NC_003552	GGGGT	2	10	3210141	3210150	0 %	20 %	80 %	0 %	20091406
1589	NC_003552	AGTTC	2	10	3210672	3210681	20 %	40 %	20 %	20 %	20091406
1590	NC_003552	AAACG	2	10	3210880	3210889	60 %	0 %	20 %	20 %	20091406
1591	NC_003552	ATCAT	2	10	3210949	3210958	40 %	40 %	0 %	20 %	20091406
1592	NC_003552	TTTTG	2	10	3214275	3214284	0 %	80 %	20 %	0 %	20091410
1593	NC_003552	AATAT	2	10	3221981	3221990	60 %	40 %	0 %	0 %	20091415
1594	NC_003552	GGGGA	2	10	3226619	3226628	20 %	0 %	80 %	0 %	20091424
1595	NC_003552	CTTTT	2	10	3227200	3227209	0 %	80 %	0 %	20 %	20091425
1596	NC_003552	GTAGA	2	10	3227924	3227933	40 %	20 %	40 %	0 %	20091426
1597	NC_003552	GGGCG	2	10	3228171	3228180	0 %	0 %	80 %	20 %	20091426
1598	NC_003552	GAATT	2	10	3230284	3230293	40 %	40 %	20 %	0 %	20091427
1599	NC_003552	AAGAT	2	10	3233243	3233252	60 %	20 %	20 %	0 %	20091428
1600	NC_003552	ATTTT	2	10	3233729	3233738	20 %	80 %	0 %	0 %	20091428
1601	NC_003552	CAGAC	2	10	3238524	3238533	40 %	0 %	20 %	40 %	20091432
1602	NC_003552	TTTCT	2	10	3239596	3239605	0 %	80 %	0 %	20 %	20091434
1603	NC_003552	AGAGC	2	10	3239728	3239737	40 %	0 %	40 %	20 %	20091434
1604	NC_003552	GATTT	2	10	3241590	3241599	20 %	60 %	20 %	0 %	20091436
1605	NC_003552	ATAAA	2	10	3245458	3245467	80 %	20 %	0 %	0 %	20091441
1606	NC_003552	CTTCT	2	10	3246134	3246143	0 %	60 %	0 %	40 %	20091442
1607	NC_003552	AATAG	2	10	3246249	3246258	60 %	20 %	20 %	0 %	20091442
1608	NC_003552	CTGGT	2	10	3248028	3248037	0 %	40 %	40 %	20 %	20091445
1609	NC_003552	TTTGT	2	10	3248199	3248208	0 %	80 %	20 %	0 %	20091445
1610	NC_003552	AAAGT	2	10	3253481	3253490	60 %	20 %	20 %	0 %	20091449
1611	NC_003552	AGATA	2	10	3256614	3256623	60 %	20 %	20 %	0 %	20091451
1612	NC_003552	TGCAA	2	10	3260408	3260417	40 %	20 %	20 %	20 %	20091453
1613	NC_003552	CAGGA	2	10	3261499	3261508	40 %	0 %	40 %	20 %	20091454
1614	NC_003552	GCTTT	2	10	3267243	3267252	0 %	60 %	20 %	20 %	20091459
1615	NC_003552	TATTT	2	10	3271341	3271350	20 %	80 %	0 %	0 %	20091464
1616	NC_003552	ACACC	2	10	3275254	3275263	40 %	0 %	0 %	60 %	20091468
1617	NC_003552	CGGCT	2	10	3276019	3276028	0 %	20 %	40 %	40 %	20091468
1618	NC_003552	GGGGA	2	10	3277933	3277942	20 %	0 %	80 %	0 %	20091470
1619	NC_003552	AGAAA	2	10	3278972	3278981	80 %	0 %	20 %	0 %	20091471
1620	NC_003552	GGCAG	2	10	3279138	3279147	20 %	0 %	60 %	20 %	20091471
1621	NC_003552	GACCT	2	10	3282639	3282648	20 %	20 %	20 %	40 %	20091473
1622	NC_003552	AAAAG	2	10	3283754	3283763	80 %	0 %	20 %	0 %	20091473
1623	NC_003552	TGTTT	2	10	3284663	3284672	0 %	80 %	20 %	0 %	20091474
1624	NC_003552	CGGTA	2	10	3284792	3284801	20 %	20 %	40 %	20 %	20091474
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1626	NC_003552	TTCCC	2	10	3288454	3288463	0 %	40 %	0 %	60 %	20091478
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