MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 2847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003552	AGACC	2	10	1005037	1005046	40 %	0 %	20 %	40 %	20089735
502	NC_003552	GTCAG	2	10	1006758	1006767	20 %	20 %	40 %	20 %	20089735
503	NC_003552	CCGCT	2	10	1011982	1011991	0 %	20 %	20 %	60 %	20089739
504	NC_003552	TTCTT	2	10	1012715	1012724	0 %	80 %	0 %	20 %	20089740
505	NC_003552	TTTTC	2	10	1014821	1014830	0 %	80 %	0 %	20 %	20089741
506	NC_003552	TCCTC	2	10	1015073	1015082	0 %	40 %	0 %	60 %	20089741
507	NC_003552	CCCTG	2	10	1015524	1015533	0 %	20 %	20 %	60 %	20089741
508	NC_003552	TACAT	2	10	1018277	1018286	40 %	40 %	0 %	20 %	20089742
509	NC_003552	TGCAT	2	10	1020306	1020315	20 %	40 %	20 %	20 %	20089743
510	NC_003552	TGAAG	2	10	1021528	1021537	40 %	20 %	40 %	0 %	20089744
511	NC_003552	GCTGT	2	10	1023966	1023975	0 %	40 %	40 %	20 %	20089746
512	NC_003552	TCTTT	2	10	1024473	1024482	0 %	80 %	0 %	20 %	20089746
513	NC_003552	AAAAG	2	10	1028476	1028485	80 %	0 %	20 %	0 %	20089750
514	NC_003552	TTCGG	2	10	1030988	1030997	0 %	40 %	40 %	20 %	20089752
515	NC_003552	TCTCT	2	10	1033772	1033781	0 %	60 %	0 %	40 %	20089754
516	NC_003552	GGAGG	2	10	1035393	1035402	20 %	0 %	80 %	0 %	20089755
517	NC_003552	TCAGG	2	10	1039669	1039678	20 %	20 %	40 %	20 %	20089757
518	NC_003552	TGCTC	2	10	1044348	1044357	0 %	40 %	20 %	40 %	20089760
519	NC_003552	AAAAG	2	10	1046711	1046720	80 %	0 %	20 %	0 %	20089761
520	NC_003552	AAGGG	2	10	1049219	1049228	40 %	0 %	60 %	0 %	20089763
521	NC_003552	CTTTT	2	10	1050079	1050088	0 %	80 %	0 %	20 %	20089764
522	NC_003552	TTCAT	2	10	1052803	1052812	20 %	60 %	0 %	20 %	20089766
523	NC_003552	AAAAC	2	10	1053058	1053067	80 %	0 %	0 %	20 %	20089766
524	NC_003552	CCCGT	2	10	1053699	1053708	0 %	20 %	20 %	60 %	20089766
525	NC_003552	CCATT	2	10	1055655	1055664	20 %	40 %	0 %	40 %	20089766
526	NC_003552	GAAAA	2	10	1058345	1058354	80 %	0 %	20 %	0 %	20089768
527	NC_003552	CAGGA	2	10	1062559	1062568	40 %	0 %	40 %	20 %	20089769
528	NC_003552	GCAAA	2	10	1063300	1063309	60 %	0 %	20 %	20 %	20089769
529	NC_003552	TAAAT	2	10	1063913	1063922	60 %	40 %	0 %	0 %	20089770
530	NC_003552	ATTTA	2	10	1064497	1064506	40 %	60 %	0 %	0 %	20089771
531	NC_003552	AAACT	2	10	1068766	1068775	60 %	20 %	0 %	20 %	20089775
532	NC_003552	GAAAA	2	10	1069794	1069803	80 %	0 %	20 %	0 %	20089776
533	NC_003552	CGGAT	2	10	1070452	1070461	20 %	20 %	40 %	20 %	20089776
534	NC_003552	TTCCT	2	10	1078775	1078784	0 %	60 %	0 %	40 %	20089780
535	NC_003552	CCAAT	2	10	1079434	1079443	40 %	20 %	0 %	40 %	20089780
536	NC_003552	AATCA	2	10	1081393	1081402	60 %	20 %	0 %	20 %	20089783
537	NC_003552	AAATC	2	10	1082450	1082459	60 %	20 %	0 %	20 %	20089784
538	NC_003552	CTCGT	2	10	1086765	1086774	0 %	40 %	20 %	40 %	20089787
539	NC_003552	TTCAG	2	10	1086932	1086941	20 %	40 %	20 %	20 %	20089787
540	NC_003552	CCAGG	2	10	1093102	1093111	20 %	0 %	40 %	40 %	20089792
541	NC_003552	AAAAG	2	10	1093738	1093747	80 %	0 %	20 %	0 %	20089792
542	NC_003552	CGGAA	2	10	1094547	1094556	40 %	0 %	40 %	20 %	20089793
543	NC_003552	GGCTG	2	10	1094749	1094758	0 %	20 %	60 %	20 %	20089793
544	NC_003552	CATTT	2	10	1095130	1095139	20 %	60 %	0 %	20 %	20089793
545	NC_003552	TTCCT	2	10	1097486	1097495	0 %	60 %	0 %	40 %	20089795
546	NC_003552	TTCCT	2	10	1099228	1099237	0 %	60 %	0 %	40 %	20089796
547	NC_003552	CTTCT	2	10	1100866	1100875	0 %	60 %	0 %	40 %	20089798
548	NC_003552	AGGAC	2	10	1104890	1104899	40 %	0 %	40 %	20 %	20089803
549	NC_003552	TGATA	2	10	1106807	1106816	40 %	40 %	20 %	0 %	20089805
550	NC_003552	ATGTA	2	10	1107059	1107068	40 %	40 %	20 %	0 %	20089805
551	NC_003552	CCTCT	2	10	1107293	1107302	0 %	40 %	0 %	60 %	20089805
552	NC_003552	TATCC	2	10	1108437	1108446	20 %	40 %	0 %	40 %	20089807
553	NC_003552	CAGCC	2	10	1109218	1109227	20 %	0 %	20 %	60 %	20089809
554	NC_003552	ATGGA	2	10	1109469	1109478	40 %	20 %	40 %	0 %	20089809
555	NC_003552	CAGTC	2	10	1110873	1110882	20 %	20 %	20 %	40 %	20089810
556	NC_003552	GGCAG	2	10	1112347	1112356	20 %	0 %	60 %	20 %	20089811
557	NC_003552	TCTTT	2	10	1113235	1113244	0 %	80 %	0 %	20 %	20089811
558	NC_003552	CAGTT	2	10	1114421	1114430	20 %	40 %	20 %	20 %	20089813
559	NC_003552	TACCC	2	10	1115330	1115339	20 %	20 %	0 %	60 %	20089814
560	NC_003552	GTACA	2	10	1123326	1123335	40 %	20 %	20 %	20 %	20089822
561	NC_003552	AATTC	2	10	1123346	1123355	40 %	40 %	0 %	20 %	20089822
562	NC_003552	TATCT	2	10	1124185	1124194	20 %	60 %	0 %	20 %	20089822
563	NC_003552	TTTGT	2	10	1124685	1124694	0 %	80 %	20 %	0 %	20089822
564	NC_003552	CGGAG	2	10	1126208	1126217	20 %	0 %	60 %	20 %	20089824
565	NC_003552	CTGAC	2	10	1127546	1127555	20 %	20 %	20 %	40 %	20089826
566	NC_003552	AAAAG	2	10	1128686	1128695	80 %	0 %	20 %	0 %	20089827
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573	NC_003552	TTACC	2	10	1147852	1147861	20 %	40 %	0 %	40 %	20089839
574	NC_003552	ACGAA	2	10	1150109	1150118	60 %	0 %	20 %	20 %	20089841
575	NC_003552	CAACA	2	10	1159761	1159770	60 %	0 %	0 %	40 %	20089847
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577	NC_003552	TGGGC	2	10	1166803	1166812	0 %	20 %	60 %	20 %	20089852
578	NC_003552	TGCGT	2	10	1166985	1166994	0 %	40 %	40 %	20 %	20089852
579	NC_003552	AGGTG	2	10	1168336	1168345	20 %	20 %	60 %	0 %	20089854
580	NC_003552	AGCTA	2	10	1170112	1170121	40 %	20 %	20 %	20 %	20089856
581	NC_003552	TTTCA	2	10	1170880	1170889	20 %	60 %	0 %	20 %	20089856
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588	NC_003552	TCCAT	2	10	1184054	1184063	20 %	40 %	0 %	40 %	20089868
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591	NC_003552	TCTGG	2	10	1197723	1197732	0 %	40 %	40 %	20 %	20089880
592	NC_003552	CATCT	2	10	1199871	1199880	20 %	40 %	0 %	40 %	20089881
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595	NC_003552	TGTCC	2	10	1204527	1204536	0 %	40 %	20 %	40 %	20089885
596	NC_003552	CTCCG	2	10	1207523	1207532	0 %	20 %	20 %	60 %	20089887
597	NC_003552	GGAGT	2	10	1210484	1210493	20 %	20 %	60 %	0 %	20089889
598	NC_003552	CTCCC	2	10	1218624	1218633	0 %	20 %	0 %	80 %	20089893
599	NC_003552	CTTTT	2	10	1221415	1221424	0 %	80 %	0 %	20 %	20089895
600	NC_003552	CATGG	2	10	1225930	1225939	20 %	20 %	40 %	20 %	20089898
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610	NC_003552	AATTC	2	10	1247065	1247074	40 %	40 %	0 %	20 %	20089917
611	NC_003552	TATCT	2	10	1247904	1247913	20 %	60 %	0 %	20 %	20089917
612	NC_003552	GTAAA	2	10	1252480	1252489	60 %	20 %	20 %	0 %	20089920
613	NC_003552	AATTT	2	10	1254573	1254582	40 %	60 %	0 %	0 %	20089923
614	NC_003552	TACTA	2	10	1255482	1255491	40 %	40 %	0 %	20 %	20089924
615	NC_003552	TTTTA	2	10	1255780	1255789	20 %	80 %	0 %	0 %	20089924
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617	NC_003552	TATTT	2	10	1257793	1257802	20 %	80 %	0 %	0 %	20089925
618	NC_003552	ATTTA	2	10	1258480	1258489	40 %	60 %	0 %	0 %	20089925
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620	NC_003552	ACTTT	2	10	1261113	1261122	20 %	60 %	0 %	20 %	20089927
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626	NC_003552	TTCCT	2	10	1279275	1279284	0 %	60 %	0 %	40 %	20089938
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