MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 4115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002944	GCCGC	2	10	612418	612427	0 %	0 %	40 %	60 %	41406685
502	NC_002944	CCGGC	2	10	612710	612719	0 %	0 %	40 %	60 %	41406685
503	NC_002944	GCGCC	2	10	613397	613406	0 %	0 %	40 %	60 %	41406686
504	NC_002944	GACAC	2	10	615989	615998	40 %	0 %	20 %	40 %	41406687
505	NC_002944	GCAGC	2	10	618567	618576	20 %	0 %	40 %	40 %	41406690
506	NC_002944	TCCAC	2	10	620832	620841	20 %	20 %	0 %	60 %	41406693
507	NC_002944	TTGGG	2	10	622348	622357	0 %	40 %	60 %	0 %	41406695
508	NC_002944	TGGTG	2	10	623112	623121	0 %	40 %	60 %	0 %	41406696
509	NC_002944	GCGGA	2	10	623696	623705	20 %	0 %	60 %	20 %	41406696
510	NC_002944	GGGCC	2	10	624095	624104	0 %	0 %	60 %	40 %	41406697
511	NC_002944	CCATC	2	10	624126	624135	20 %	20 %	0 %	60 %	41406697
512	NC_002944	GGTCG	2	10	626108	626117	0 %	20 %	60 %	20 %	41406699
513	NC_002944	CCGTG	2	10	631082	631091	0 %	20 %	40 %	40 %	41406704
514	NC_002944	CGCGG	2	10	631676	631685	0 %	0 %	60 %	40 %	41406705
515	NC_002944	CCCGA	2	10	632116	632125	20 %	0 %	20 %	60 %	41406705
516	NC_002944	CAGCT	2	10	633368	633377	20 %	20 %	20 %	40 %	41406706
517	NC_002944	CGGCG	2	10	635093	635102	0 %	0 %	60 %	40 %	41406708
518	NC_002944	TGCGC	2	10	635114	635123	0 %	20 %	40 %	40 %	41406708
519	NC_002944	CCGCC	2	10	635661	635670	0 %	0 %	20 %	80 %	41406708
520	NC_002944	GGTCG	2	10	636624	636633	0 %	20 %	60 %	20 %	41406709
521	NC_002944	GAAGC	2	10	638717	638726	40 %	0 %	40 %	20 %	41406711
522	NC_002944	CGGCA	2	10	639939	639948	20 %	0 %	40 %	40 %	41406712
523	NC_002944	GCCGC	2	10	640909	640918	0 %	0 %	40 %	60 %	41406713
524	NC_002944	CCGAT	2	10	643209	643218	20 %	20 %	20 %	40 %	41406715
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527	NC_002944	CCGGC	2	10	647948	647957	0 %	0 %	40 %	60 %	41406719
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529	NC_002944	CGGCA	2	10	648379	648388	20 %	0 %	40 %	40 %	41406719
530	NC_002944	CCTCG	2	10	648978	648987	0 %	20 %	20 %	60 %	41406719
531	NC_002944	CGGCG	2	10	650048	650057	0 %	0 %	60 %	40 %	41406722
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533	NC_002944	GCTCC	2	10	652059	652068	0 %	20 %	20 %	60 %	41406726
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535	NC_002944	GAGCT	2	10	653366	653375	20 %	20 %	40 %	20 %	41406727
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539	NC_002944	TTCGG	2	10	657800	657809	0 %	40 %	40 %	20 %	41406733
540	NC_002944	GTTCC	2	10	659484	659493	0 %	40 %	20 %	40 %	41406733
541	NC_002944	TGCGG	2	10	659847	659856	0 %	20 %	60 %	20 %	41406734
542	NC_002944	GTGCA	2	10	660518	660527	20 %	20 %	40 %	20 %	41406735
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544	NC_002944	TGCGC	2	10	660643	660652	0 %	20 %	40 %	40 %	41406735
545	NC_002944	CGGCC	2	10	664715	664724	0 %	0 %	40 %	60 %	41406739
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547	NC_002944	GGCCG	2	10	667671	667680	0 %	0 %	60 %	40 %	41406743
548	NC_002944	GCCCG	2	10	671020	671029	0 %	0 %	40 %	60 %	41406747
549	NC_002944	CCCCG	2	10	671352	671361	0 %	0 %	20 %	80 %	41406748
550	NC_002944	GCACG	2	10	671482	671491	20 %	0 %	40 %	40 %	41406748
551	NC_002944	GGCCG	2	10	671790	671799	0 %	0 %	60 %	40 %	41406748
552	NC_002944	GGCCT	2	10	672473	672482	0 %	20 %	40 %	40 %	41406749
553	NC_002944	CGGCC	2	10	672577	672586	0 %	0 %	40 %	60 %	41406749
554	NC_002944	GGTGG	2	10	673034	673043	0 %	20 %	80 %	0 %	41406749
555	NC_002944	GCGCC	3	15	673802	673816	0 %	0 %	40 %	60 %	41406750
556	NC_002944	GTGCT	2	10	674578	674587	0 %	40 %	40 %	20 %	41406751
557	NC_002944	CGGCC	2	10	682448	682457	0 %	0 %	40 %	60 %	41406758
558	NC_002944	CGCAT	2	10	684969	684978	20 %	20 %	20 %	40 %	41406761
559	NC_002944	TGCGC	2	10	692113	692122	0 %	20 %	40 %	40 %	41406768
560	NC_002944	AACGG	2	10	694750	694759	40 %	0 %	40 %	20 %	41406771
561	NC_002944	CCCGT	2	10	695636	695645	0 %	20 %	20 %	60 %	41406771
562	NC_002944	GCCGG	2	10	696752	696761	0 %	0 %	60 %	40 %	41406773
563	NC_002944	CGCCT	2	10	698423	698432	0 %	20 %	20 %	60 %	41406775
564	NC_002944	GCGCC	2	10	698464	698473	0 %	0 %	40 %	60 %	41406775
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600	NC_002944	ATGAC	2	10	742369	742378	40 %	20 %	20 %	20 %	41406816
601	NC_002944	TCGCC	2	10	742825	742834	0 %	20 %	20 %	60 %	41406816
602	NC_002944	CGGCC	2	10	743819	743828	0 %	0 %	40 %	60 %	41406818
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613	NC_002944	CGCGG	2	10	755805	755814	0 %	0 %	60 %	40 %	41406830
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615	NC_002944	GGCAC	2	10	758956	758965	20 %	0 %	40 %	40 %	41406833
616	NC_002944	GCCGC	2	10	759418	759427	0 %	0 %	40 %	60 %	41406834
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628	NC_002944	CGCGG	2	10	771339	771348	0 %	0 %	60 %	40 %	41406847
629	NC_002944	GAGCA	2	10	772124	772133	40 %	0 %	40 %	20 %	41406847
630	NC_002944	CCACG	2	10	773683	773692	20 %	0 %	20 %	60 %	41406849
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